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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lu8 | ||||||
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タイトル | Solution structure of GsMTx-4 | ||||||
![]() | venom toxin peptide MTx4 | ||||||
![]() | TOXIN / Triple stranded antiparellel beta-sheet / inhibitory cystine knot | ||||||
機能・相同性 | ![]() ion channel inhibitor activity / potassium channel regulator activity / sodium channel regulator activity / toxin activity / defense response to bacterium / lipid binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry simulated annealing | ||||||
![]() | Jung, H.J. / Lee, C.W. / Earm, Y.E. / Kim, J.I. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of GsMTx-4, a peptide blocker of cation-selective stretch-activated channels 著者: Jung, H.J. / Lee, C.W. / Earm, Y.E. / Kim, J.I. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 219.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 189.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 341.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 484 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 20.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 31.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4107.934 Da / 分子数: 1 / 断片: residues 1-34 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: This peptide was synthesized chemically. / 参照: GenBank: 32309340, UniProt: Q7YT39*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: Additional comments about the NMR refinement can be placed here, e.g.The structures are based on a total of 630 restraints, 591 are NOE-derived distance constraints, 27 dihedral angle ...Text: Additional comments about the NMR refinement can be placed here, e.g.The structures are based on a total of 630 restraints, 591 are NOE-derived distance constraints, 27 dihedral angle restraints, 12 distance restraints from hydrogen bonds, and 9 distance restraints from disulfide bonds. This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
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試料調製
詳細 | 内容: 10mM GsMTx-4 / 溶媒系: 90% H2O/10% D2O |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 3.5 / 圧: ambient / 温度: 288 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: The submitted confomer models are those with the lowest energy, the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |