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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ltw | ||||||
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タイトル | RECOMBINANT SPERM WHALE MYOGLOBIN 29W MUTANT (OXY) | ||||||
![]() | MYOGLOBIN | ||||||
![]() | OXYGEN TRANSPORT / MYOGLOBIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() nitrite reductase activity / 酸化還元酵素; 他の含窒素化合物が電子供与する / sarcoplasm / 酸化還元酵素; 過酸化物を電子受容体にする; ペルオキシダーゼ / removal of superoxide radicals / oxygen carrier activity / oxygen binding / peroxidase activity / heme binding / extracellular exosome / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Li, T. / Olson, J.S. / Phillips Jr., G.N. | ||||||
![]() | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 1996 タイトル: Perturbation of the Fe-O2 Bond by Nearby Residues in Heme Pocket: Observation of Vfe-O2 Raman Bands for Oxymyoglobin Mutants 著者: Hirota, S. / Li, T. / Phillips Jr., G.N. / Olson, J.S. / Mukai, M. / Kitagawa, T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 47 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 32.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 791.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 793 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 13.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17438.215 Da / 分子数: 1 / 変異: INITIATOR MET, L29W, D122N / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-HEM / |
#4: 化合物 | ChemComp-OXY / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
配列の詳細 | THIS STRUCTURE HAS THREE DIFFERENCES RELATIVE TO THE NATIVE SPERM WHALE PROTEIN: AN INITIATOR ...THIS STRUCTURE HAS THREE DIFFERENCE |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.24 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 9 / 詳細: pH 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: unknown / pH: 7.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 295 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.6→30 Å / Num. obs: 17658 / % possible obs: 71.3 % / Observed criterion σ(I): 2 / Rmerge(I) obs: 0.087 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.7→5 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→5 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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