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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lsn | ||||||
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タイトル | THERMAL STABILITY DETERMINANTS OF CHICKEN EGG-WHITE LYSOZYME CORE MUTANTS: HYDROPHOBICITY, PACKING VOLUME AND CONSERVED BURIED WATER MOLECULES | ||||||
![]() | HEN EGG WHITE LYSOZYME | ||||||
![]() | HYDROLASE(O-GLYCOSYL) | ||||||
機能・相同性 | ![]() Lactose synthesis / Antimicrobial peptides / Neutrophil degranulation / beta-N-acetylglucosaminidase activity / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium ...Lactose synthesis / Antimicrobial peptides / Neutrophil degranulation / beta-N-acetylglucosaminidase activity / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / defense response to bacterium / endoplasmic reticulum / extracellular space / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Holland, D.R. / Shih, P. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Thermal stability determinants of chicken egg-white lysozyme core mutants: hydrophobicity, packing volume, and conserved buried water molecules. 著者: Shih, P. / Holland, D.R. / Kirsch, J.F. #1: ![]() タイトル: Structural and Thermodynamic Analysis of Compensating Mutations within the Core of Chicken Egg White Lysozyme 著者: Wilson, K.P. / Malcolm, B.A. / Matthews, B.W. #2: ![]() タイトル: Ancestral Lysozymes Reconstructed, Neutrality Tested, and Thermostability Linked to Hydrocarbon Packing 著者: Malcolm, B.A. / Wilson, K.P. / Matthews, B.W. / Kirsch, J.F. / Wilson, A.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 40.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 28 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14314.176 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
構成要素の詳細 | STRUCTURAL DIFFERENCES BETWEEN WILDTYPE AND THE MUTANT MODELS ARE CONFINED TO THE REGION AROUND THE ...STRUCTURAL |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.05 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.09 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 4.4 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 最高解像度: 1.9 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.9 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: t_angle_d / Dev ideal: 2.2 |