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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lmz | ||||||
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タイトル | Solution Structure of 3-Methyladenine DNA Glycosylase I (TAG) | ||||||
![]() | 3-methyladenine DNA glycosylase I (TAG) | ||||||
![]() | HYDROLASE / helix-hairpin-helix superfamily / DNA glycosylase / enzyme / TAG / 3-methyladenine / solution structure / NMR spectroscopy | ||||||
機能・相同性 | ![]() DNA-3-methyladenine glycosylase I / DNA-3-methyladenine glycosylase activity / base-excision repair / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / Structures were calculated from an extended strand using CNS 1.1, and refined using XPLOR-NIH 1.1.2 | ||||||
![]() | Drohat, A.C. / Kwon, K. / Krosky, D.J. / Stivers, J.T. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: 3-Methyladenine DNA glycosylase I is an unexpected helix-hairpin-helix superfamily member. 著者: Drohat, A.C. / Kwon, K. / Krosky, D.J. / Stivers, J.T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 1.4 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 348.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 572 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 105.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 133.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21138.135 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 100 mM NaCl / pH: 6.6 / 圧: 1 atm / 温度: 293 K | ||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||||||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Structures were calculated from an extended strand using CNS 1.1, and refined using XPLOR-NIH 1.1.2 ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with acceptable covalent geometry,structures with the least restraint violations,structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 25 |