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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lmc | |||||||||
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タイトル | THE CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN BULGECIN, A BACTERIAL METABOLITE, AND LYSOZYME FROM THE RAINBOW TROUT | |||||||||
![]() | LYSOZYME | |||||||||
![]() | HYDROLASE (O-GLYCOSYL) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / extracellular space 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Karlsen, S. / Hough, E. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of a complex between bulgecin, a bacterial metabolite, and lysozyme from the rainbow trout. 著者: Karlsen, S. / Hough, E. #1: ![]() タイトル: The Crystal Structures of Three Complexes between Chitooligosaccharides and Lysozyme from the Rainbow Trout 著者: Karlsen, S. / Hough, E. #2: ![]() タイトル: The Refined Crystal Structure of Lysozyme from Rainbow Trout (Oncorhynchus Mykiss) 著者: Karlsen, S. / Eliassen, B.E. / Hansen, L.K. / Larsen, R.L. / Riise, B.W. / Smalaas, A.O. / Hough, E. / Grinde, B. #3: ![]() タイトル: Structures of Bulgecins, Bacterial Metabolites with Bulge-Inducing Activity 著者: Shinagawa, S. / Kasahara, F. / Wada, Y. / Harada, S. / Asai, M. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 28.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14303.068 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-BUL / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.22 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.78 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 Å |
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検出器 | タイプ: ENRAF-NONIUS FAST / 検出器: DIFFRACTOMETER / 日付: 1994年3月17日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 10895 / % possible obs: 86.1 % / Observed criterion σ(I): 3 / Rmerge(I) obs: 0.059 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 14.68 Å / Rmerge(I) obs: 0.059 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / σ(F): 3 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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