登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lkm |
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タイトル | Crystal structure of Desulfovibrio vulgaris rubrerythrin all-iron(III) form |
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要素 | Rubrerythrin all-iron(III) form |
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キーワード | ELECTRON TRANSPORT / Rubrerythrin / oxidized form / diiron / four-helix bundle / rubredoxin-like |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
oxidoreductase activity / iron ion binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 : / Rubrerythrin, rubredoxin-like domain / Rubrerythrin, diiron-binding domain / Rubrerythrin / Rubrerythrin, domain 2 - #10 / Rubredoxin-like domain / Rubredoxin-like domain profile. / Rubrerythrin, domain 2 / Ferritin, core subunit, four-helix bundle / Ferritin ...: / Rubrerythrin, rubredoxin-like domain / Rubrerythrin, diiron-binding domain / Rubrerythrin / Rubrerythrin, domain 2 - #10 / Rubredoxin-like domain / Rubredoxin-like domain profile. / Rubrerythrin, domain 2 / Ferritin, core subunit, four-helix bundle / Ferritin / Ferritin-like diiron domain / Ferritin-like diiron domain profile. / Ferritin-like / Single Sheet / Ferritin-like superfamily / Up-down Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Desulfovibrio vulgaris (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.69 Å |
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データ登録者 | Jin, S. / Kurtz Jr., D.M. / Liu, Z.J. / Rose, J. / Wang, B.C. |
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引用 | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2002 タイトル: X-ray Crystal Structures of Reduced Rubrerythrin and its Azide Adduct: A Structure-Based Mechanism for a Non-Heme DiIron Peroxidase 著者: Jin, S. / Kurtz Jr., D.M. / Liu, Z.J. / Rose, J. / Wang, B.C. |
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履歴 | 登録 | 2002年4月25日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2002年9月18日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月28日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Derived calculations / Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年8月16日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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