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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1la8 | ||||||||||||||||||||
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タイトル | Solution structure of the DNA hairpin 13-mer CGCGGTGTCCGCG | ||||||||||||||||||||
![]() | 5'-D(*![]() DNA / Hairpin / three base loop | 機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / Molecular Dynamics using a simulated annealing protocol | Model type details | minimized average | ![]() Weisenseel, J.P. / Reddy, G.R. / Marnett, L.J. / Stone, M.P. | ![]() ![]() タイトル: Structure of the 1,N(2)-propanodeoxyguanosine adduct in a three-base DNA hairpin loop derived from a palindrome in the Salmonella typhimurium hisD3052 gene. 著者: Weisenseel, J.P. / Reddy, G.R. / Marnett, L.J. / Stone, M.P. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 15.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 10.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 235.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 235.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 1.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 1.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3984.572 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: This Synthetic DNA sequence was derived from the hisD3052 gene of salmonella typhimurium. |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M |
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放射波長 | 相対比: 1 |
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 500 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Molecular Dynamics using a simulated annealing protocol ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 1 |