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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1klo | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THREE CONSECUTIVE LAMININ-TYPE EPIDERMAL GROWTH FACTOR-LIKE (LE) MODULES OF LAMININ GAMMA1 CHAIN HARBORING THE NIDOGEN BINDING SITE | ||||||
![]() | LAMININ | ||||||
![]() | GLYCOPROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() laminin-1 complex / laminin-10 complex / tissue morphogenesis / hair follicle cell proliferation / regulation of basement membrane organization / hemidesmosome assembly / glycosphingolipid binding / positive regulation of integrin-mediated signaling pathway / tissue development / hair cell differentiation ...laminin-1 complex / laminin-10 complex / tissue morphogenesis / hair follicle cell proliferation / regulation of basement membrane organization / hemidesmosome assembly / glycosphingolipid binding / positive regulation of integrin-mediated signaling pathway / tissue development / hair cell differentiation / protein complex involved in cell-matrix adhesion / extracellular matrix structural constituent / hair follicle morphogenesis / positive regulation of muscle cell differentiation / positive regulation of cell adhesion / basement membrane / extracellular matrix disassembly / synaptic cleft / substrate adhesion-dependent cell spreading / animal organ morphogenesis / axon guidance / neuromuscular junction / neuron projection development / cell migration / chromatin organization / gene expression / protein-containing complex assembly / collagen-containing extracellular matrix / cell adhesion / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Stetefeld, J. / Mayer, U. / Timpl, R. / Huber, R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of three consecutive laminin-type epidermal growth factor-like (LE) modules of laminin gamma1 chain harboring the nidogen binding site. 著者: Stetefeld, J. / Mayer, U. / Timpl, R. / Huber, R. #1: ![]() タイトル: Two Non-Contiguous Regions Contribute to Nidogen Binding to a Single Egf-Like Motif of the Laminin Gamma 1 Chain 著者: Poschl, E. / Fox, J.W. / Block, D. / Mayer, U. / Timpl, R. #2: ![]() タイトル: A Single Egf-Like Motif of Laminin is Responsible for High Affinity Nidogen Binding 著者: Mayer, U. / Nischt, R. / Poschl, E. / Mann, K. / Fukuda, K. / Gerl, M. / Yamada, Y. / Timpl, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 54 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 39.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 362.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 364.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17141.363 Da / 分子数: 1 断片: GAMMA-1 CHAIN, THREE CONSECUTIVE LAMININ-TYPE EPIDERMAL GROWTH FACTOR-LIKE (LE) MODULES 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.33 Å3/Da / 溶媒含有率: 71.59 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 4.1 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 22 ℃ / pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / Num. obs: 17012 / % possible obs: 91.4 % / Num. measured all: 29004 / Rmerge(I) obs: 0.07 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.1→6 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→6 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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