登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ket |
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タイトル | The crystal structure of dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase (RmlB) from Streptococcus suis with thymidine diphosphate bound |
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要素 | dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase |
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キーワード | LYASE / Rossmann fold |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
dTDP-glucose 4,6-dehydratase / UDP-L-rhamnose synthase activity / UDP-glucose 4,6-dehydratase activity / UDP-rhamnose biosynthetic process / flavonol biosynthetic process / dTDP-glucose 4,6-dehydratase activity / auxin export across the plasma membrane / dTDP-rhamnose biosynthetic process / lipopolysaccharide biosynthetic process / extracellular polysaccharide biosynthetic process類似検索 - 分子機能 dTDP-glucose 4,6-dehydratase / GDP-mannose 4,6 dehydratase / NAD(P)-binding domain / UDP-galactose 4-epimerase, domain 1 / UDP-galactose 4-epimerase; domain 1 / NAD dependent epimerase/dehydratase family / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Rossmann fold ...dTDP-glucose 4,6-dehydratase / GDP-mannose 4,6 dehydratase / NAD(P)-binding domain / UDP-galactose 4-epimerase, domain 1 / UDP-galactose 4-epimerase; domain 1 / NAD dependent epimerase/dehydratase family / NAD(P)-binding Rossmann-like Domain / NAD(P)-binding domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / THYMIDINE-5'-DIPHOSPHATE / dTDP-glucose 4,6-dehydratase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Streptococcus suis (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.8 Å |
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データ登録者 | Allard, S.T.M. / Beis, K. / Giraud, M.-F. / Hegeman, A.D. / Gross, J.W. / Whitfield, C. / Graninger, M. / Messner, P. / Allen, A.G. / Naismith, J.H. |
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引用 | ジャーナル: Structure / 年: 2002 タイトル: Toward a structural understanding of the dehydratase mechanism. 著者: Allard, S.T. / Beis, K. / Giraud, M.F. / Hegeman, A.D. / Gross, J.W. / Wilmouth, R.C. / Whitfield, C. / Graninger, M. / Messner, P. / Allen, A.G. / Maskell, D.J. / Naismith, J.H. |
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履歴 | 登録 | 2001年11月17日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2002年1月25日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月27日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年8月16日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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