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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1kdf | ||||||
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タイトル | NORTH-ATLANTIC OCEAN POUT ANTIFREEZE PROTEIN TYPE III ISOFORM HPLC12 MUTANT, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | ||||||
![]() | ANTIFREEZE PROTEIN | ||||||
![]() | ANTIFREEZE PROTEIN / ICE BINDING PROTEIN / THERMAL HYSTERESIS PROTEIN / GLYCOPROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / DG_SUB_EMBED, DGSA, 精密化 | ||||||
![]() | Sonnichsen, F.D. / Deluca, C.I. / Davies, P.L. / Sykes, B.D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Refined solution structure of type III antifreeze protein: hydrophobic groups may be involved in the energetics of the protein-ice interaction. 著者: Sonnichsen, F.D. / DeLuca, C.I. / Davies, P.L. / Sykes, B.D. #1: ![]() タイトル: Structure-Function Relationship in the Globular Type III Antifreeze Protein: Identification of a Cluster of Surface Residues Required for Binding to Ice 著者: Chao, H. / Sonnichsen, F.D. / Deluca, C.I. / Sykes, B.D. / Davies, P.L. #2: ![]() タイトル: The Nonhelical Structure of Antifreeze Protein Type III 著者: Sonnichsen, F.D. / Sykes, B.D. / Chao, H. / Davies, P.L. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 19.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 11.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 246.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 246.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7525.890 Da / 分子数: 1 / 変異: INS(M0), P64A, P65A, INS(K66, D67, E68, L69) / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: TYPE III ISOFORM HPLC 12, QAE-COMPONENT / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
試料状態 | pH: 7.6 / 温度: 298 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITY / 製造業者: Varian / モデル: UNITY / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DG_SUB_EMBED, DGSA, 精密化 / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: AVERAGE / 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |