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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1imd | ||||||
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タイトル | STRUCTURAL STUDIES OF METAL BINDING BY INOSITOL MONOPHOSPHATASE: EVIDENCE FOR TWO-METAL ION CATALYSIS | ||||||
![]() | INOSITOL MONOPHOSPHATASE | ||||||
![]() | HYDROLASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() D-galactose 1-phosphate phosphatase / inositol monophosphate phosphatase activity / Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol / lithium ion binding / inositol biosynthetic process / inositol-phosphate phosphatase / inositol monophosphate 3-phosphatase activity / inositol monophosphate 4-phosphatase activity / inositol monophosphate 1-phosphatase activity / inositol metabolic process ...D-galactose 1-phosphate phosphatase / inositol monophosphate phosphatase activity / Synthesis of IP2, IP, and Ins in the cytosol / lithium ion binding / inositol biosynthetic process / inositol-phosphate phosphatase / inositol monophosphate 3-phosphatase activity / inositol monophosphate 4-phosphatase activity / inositol monophosphate 1-phosphatase activity / inositol metabolic process / phosphatidylinositol biosynthetic process / phosphate-containing compound metabolic process / phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process / manganese ion binding / magnesium ion binding / signal transduction / protein homodimerization activity / identical protein binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Bone, R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural studies of metal binding by inositol monophosphatase: evidence for two-metal ion catalysis. 著者: Bone, R. / Frank, L. / Springer, J.P. / Atack, J.R. #1: ![]() タイトル: Cdna Cloning of Human and Rat Brain Myo-Inositol Monophosphatase. Expression and Characterization of the Human Recombinant Enzyme 著者: Mcallister, G. / Whiting, P. / Hammond, E.A. / Knowles, M.R. / Atack, J.R. / Bailey, F.J. / Maigetter, R. / Ragan, C.I. #2: ![]() タイトル: Structure of Inositol Monophosphatase, the Putative Target of Lithium Therapy 著者: Bone, R. / Springer, J.P. / Atack, J.R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 109.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 90.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 388.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 399.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: TYR A 62 - PRO A 63 OMEGA = 211.14 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 2: CIS PROLINE - PRO A 186 3: PHE B 102 - PRO B 103 OMEGA = 211.75 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 4: CIS PROLINE - PRO B 186 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 30219.781 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() #2: 化合物 | ChemComp-MN / #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.7 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.49 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.5 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / 最低解像度: 8 Å / % possible obs: 95 % / Rmerge(I) obs: 0.083 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.6→8 Å / Rfactor Rwork: 0.188 / Rfactor obs: 0.188 / σ(F): 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.6→8 Å
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拘束条件 |
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