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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1huw | ||||||
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タイトル | THE CRYSTAL STRUCTURE OF AFFINITY-MATURED HUMAN GROWTH HORMONE AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | HUMAN GROWTH HORMONE | ||||||
![]() | HORMONE | ||||||
機能・相同性 | ![]() growth hormone receptor complex / bone maturation / prolactin receptor binding / positive regulation of growth / animal organ development / : / positive regulation of multicellular organism growth / positive regulation of glucose transmembrane transport / positive regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway / growth hormone receptor binding ...growth hormone receptor complex / bone maturation / prolactin receptor binding / positive regulation of growth / animal organ development / : / positive regulation of multicellular organism growth / positive regulation of glucose transmembrane transport / positive regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway / growth hormone receptor binding / growth hormone receptor signaling pathway / Prolactin receptor signaling / cell surface receptor signaling pathway via JAK-STAT / Synthesis, secretion, and deacylation of Ghrelin / Growth hormone receptor signaling / positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein / response to nutrient levels / positive regulation of MAP kinase activity / cytokine activity / endosome lumen / positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT / growth factor activity / hormone activity / cytokine-mediated signaling pathway / response to estradiol / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / extracellular space / extracellular region / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Ultsch, M.H. / Somers, W.S. / Kossiakoff, A.A. / De Vos, A.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The crystal structure of affinity-matured human growth hormone at 2 A resolution. 著者: Ultsch, M.H. / Somers, W. / Kossiakoff, A.A. / de Vos, A.M. #1: ![]() タイトル: Affinity Maturation of Human Growth Hormone by Monovalent Phage Display 著者: Lowman, H.B. / Wells, J.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 43.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 33.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 363.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 366.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21986.627 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.29 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.5 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.4 Å / 最低解像度: 8 Å / Num. obs: 6630 / % possible obs: 97.3 % / Num. measured all: 16335 / Rmerge(I) obs: 0.069 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.4 Å / 最低解像度: 2.48 Å / % possible obs: 94.1 % / Num. unique obs: 626 / Num. measured obs: 1167 / Rmerge(I) obs: 0.144 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / Rfactor Rwork: 0.185 / Rfactor obs: 0.185 / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.4 Å / 最低解像度: 8 Å / Num. reflection all: 12423 / Num. reflection obs: 11341 / σ(F): 2 / Rfactor all: 0.199 / Rfactor obs: 0.185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 2.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LS精密化 シェル | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 2.07 Å / Num. reflection Rfree: 4151 / Rfactor obs: 0.298 |