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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1hp3 | ||||||
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タイトル | C-TERMINAL TRUNCATION OF OMEGA-ATRACOTOXIN-HV2A (CT-HV2A) | ||||||
![]() | OMEGA-ATRACOTOXIN-HV2A | ||||||
![]() | TOXIN / Cystine knot | ||||||
機能・相同性 | Omega-atracotoxin, conserved site-2 / Omega-atracotoxin (ACTX) type 2 family signature. / Magi 5 toxic peptide / Magi 5 toxic peptide family / sodium channel inhibitor activity / calcium channel inhibitor activity / toxin activity / extracellular region / Omega-hexatoxin-Hv2a![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / Torsion angle dynamics, dynamical simulated annealing | ||||||
![]() | Wang, X.-H. / King, G.F. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Discovery and structure of a potent and highly specific blocker of insect calcium channels 著者: Wang, X.-H. / Connor, M. / Wilson, D. / Wilson, H.I. / Nicholson, G.M. / Smith, R. / Shaw, D. / Mackay, J.P. / Alewood, P.F. / Christie, M.J. / King, G.F. #1: ![]() タイトル: Discovery and characterization of a family of insecticidal neurotoxins with a rare vicinal disulfide bridge. 著者: Wang, X.-H. / Connor, M. / Smith, R. / Maciejewski, M.W. / Howden, M.E.H. / Nicholson, G.M. #2: ![]() タイトル: The structure of a novel insecticidal neurotoxin, omega-atracotoxin-HV1, from the venom of an Australian funnel web spider. 著者: Fletcher, J.I. / Smith, R. / O'Donoghue, S.I. / Nilges, M. / Connor, M. / Howden, M.E. / Christie, M.J. / King, G.F. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 179.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 147.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3383.948 Da / 分子数: 1 / 断片: N-TERMINAL (RESIDUES 1-32) / 由来タイプ: 合成 詳細: This sequence does not occur naturally. The peptide was chemically synthesized using standard t-Boc chemistry, and oxidized/folded in a glutathione redox buffer. 参照: UniProt: P82852 |
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Has protein modification | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear NMR techniques. |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 0.005 / pH: 4.71 / 圧: 1 atm / 温度: 296 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M |
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放射波長 | 相対比: 1 |
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Torsion angle dynamics, dynamical simulated annealing ソフトェア番号: 1 詳細: The structures are based on a total of 345 NOE-derived distance restraints, 21 dihedral-angle restraints, plus 22 restraints defining 11 hydrogen bonds. | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |