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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1hem | |||||||||
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タイトル | STRUCTURAL AND THERMODYNAMIC ANALYSIS OF COMPENSATING MUTATIONS WITHIN THE CORE OF CHICKEN EGG WHITE LYSOZYME | |||||||||
![]() | HEN EGG WHITE LYSOZYME | |||||||||
![]() | HYDROLASE(O-GLYCOSYL) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Lactose synthesis / Antimicrobial peptides / Neutrophil degranulation / beta-N-acetylglucosaminidase activity / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium ...Lactose synthesis / Antimicrobial peptides / Neutrophil degranulation / beta-N-acetylglucosaminidase activity / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / defense response to bacterium / endoplasmic reticulum / extracellular space / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Wilson, K.P. / Malcolm, B.A. / Matthews, B.W. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural and thermodynamic analysis of compensating mutations within the core of chicken egg white lysozyme. 著者: Wilson, K.P. / Malcolm, B.A. / Matthews, B.W. #1: ![]() タイトル: Ancestral Lysozymes Reconstructed, Neutrality Tested, and Thermostability Linked to Hydrocarbon Packing 著者: Malcolm, B.A. / Wilson, K.P. / Matthews, B.W. / Kirsch, J.F. / Wilson, A.C. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 37.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 28 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14345.188 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.15 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 4.4 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | Ambient pressure: 101 kPa / 平均測定温度: 298 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: OSCILLATION CAMERA / 検出器: FILM / 詳細: Kodak No-Screen X-ray film |
放射 | モノクロメーター: graphite / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray / 波長: 1.5418 Å |
放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor obs: 0.14 / 最高解像度: 1.8 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / Num. reflection obs: 8336 / Rfactor obs: 0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: t_angle_d / Dev ideal: 2.2 |