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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gnw | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF GLUTATHIONE S-TRANSFERASE | ||||||
![]() | GLUTATHIONE S-TRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE / HERBICIDE DETOXIFICATION | ||||||
機能・相同性 | ![]() response to oomycetes / camalexin binding / quercitrin binding / salicylic acid binding / toxin catabolic process / auxin-activated signaling pathway / glutathione binding / plasmodesma / apoplast / plant-type vacuole ...response to oomycetes / camalexin binding / quercitrin binding / salicylic acid binding / toxin catabolic process / auxin-activated signaling pathway / glutathione binding / plasmodesma / apoplast / plant-type vacuole / chloroplast stroma / response to zinc ion / glutathione transferase / glutathione transferase activity / response to cadmium ion / response to cold / glutathione metabolic process / chloroplast / defense response / peroxidase activity / protein domain specific binding / intracellular membrane-bounded organelle / endoplasmic reticulum / plasma membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Reinemer, P. / Prade, L. / Hof, P. / Neuefeind, T. / Huber, R. / Palme, K. / Bartunik, H.D. / Bieseler, B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Three-dimensional structure of glutathione S-transferase from Arabidopsis thaliana at 2.2 A resolution: structural characterization of herbicide-conjugating plant glutathione S- ...タイトル: Three-dimensional structure of glutathione S-transferase from Arabidopsis thaliana at 2.2 A resolution: structural characterization of herbicide-conjugating plant glutathione S-transferases and a novel active site architecture. 著者: Reinemer, P. / Prade, L. / Hof, P. / Neuefeind, T. / Huber, R. / Zettl, R. / Palme, K. / Schell, J. / Koelln, I. / Bartunik, H.D. / Bieseler, B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 124.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 99.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 21.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 29.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24031.371 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() プラスミド: PET3A / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-GTX / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.7 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.38 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: ENRAF-NONIUS FAST / 検出器: DIFFRACTOMETER / 日付: 1994 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 23438 / % possible obs: 88.9 % / 冗長度: 4.6 % / Rmerge(I) obs: 0.094 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 9999 Å |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 2.23 Å / % possible obs: 46.2 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→8 Å /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 19.5 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.19 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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LS精密化 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 2.22 Å / Rfactor obs: 0.289 |