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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gdd | ||||||
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タイトル | TERTIARY AND QUATERNARY STRUCTURAL CHANGES IN GIA1 INDUCED BY GTP HYDROLYSIS | ||||||
![]() | GI ALPHA 1 | ||||||
![]() | SIGNAL TRANSDUCTION PROTEIN / GTP-ASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() Extra-nuclear estrogen signaling / Adenylate cyclase inhibitory pathway / Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion / ADP signalling through P2Y purinoceptor 12 / GTPase activating protein binding / negative regulation of synaptic transmission / G alpha (i) signalling events / positive regulation of protein localization to cell cortex / regulation of cAMP-mediated signaling / D2 dopamine receptor binding ...Extra-nuclear estrogen signaling / Adenylate cyclase inhibitory pathway / Adrenaline,noradrenaline inhibits insulin secretion / ADP signalling through P2Y purinoceptor 12 / GTPase activating protein binding / negative regulation of synaptic transmission / G alpha (i) signalling events / positive regulation of protein localization to cell cortex / regulation of cAMP-mediated signaling / D2 dopamine receptor binding / G protein-coupled serotonin receptor binding / regulation of mitotic spindle organization / cellular response to forskolin / G protein-coupled receptor binding / G-protein beta/gamma-subunit complex binding / adenylate cyclase-modulating G protein-coupled receptor signaling pathway / GDP binding / heterotrimeric G-protein complex / cell cortex / midbody / cell cycle / G protein-coupled receptor signaling pathway / cell division / GTPase activity / centrosome / GTP binding / magnesium ion binding / protein-containing complex / nucleus / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Mixon, M.B. / Sprang, S.R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Tertiary and quaternary structural changes in Gi alpha 1 induced by GTP hydrolysis. 著者: Mixon, M.B. / Lee, E. / Coleman, D.E. / Berghuis, A.M. / Gilman, A.G. / Sprang, S.R. #1: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary Crystallographic Studies of Gi Alpha 1 and Mutants of Gi Alpha 1 in the GTP and Gdp-Bound States 著者: Coleman, D.E. / Lee, E. / Mixon, M.B. / Linder, M.E. / Berghuis, A.M. / Gilman, A.G. / Sprang, S.R. #2: ![]() タイトル: Structures of Active Conformations of Gi Alpha 1 and the Mechanism of GTP Hydrolysis 著者: Coleman, D.E. / Berghuis, A.M. / Lee, E. / Linder, M.E. / Gilman, A.G. / Sprang, S.R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 79.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 59.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 464.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 470 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 40267.836 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: INACTIVE FORM / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-GDP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.15 Å3/Da / 溶媒含有率: 60.97 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 8 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 110 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995年4月12日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.2→20 Å / Num. obs: 23024 / % possible obs: 95 % / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 1.2 % / Rmerge(I) obs: 0.052 |
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.052 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / 最低解像度: 2.3 Å / % possible obs: 70.6 % / Rmerge(I) obs: 0.412 / Mean I/σ(I) obs: 2.4 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→6 Å / σ(F): 1
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原子変位パラメータ | Biso mean: 38 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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