SEQUENCE ADVISORY NOTICE: DIFFERENCE BETWEEN SWISS-PROT AND PDB SEQUENCE. SWISS-PROT ENTRY NAME: ...SEQUENCE ADVISORY NOTICE: DIFFERENCE BETWEEN SWISS-PROT AND PDB SEQUENCE. SWISS-PROT ENTRY NAME: RFN1_FUSMO SWISS-PROT RESIDUE PDB SEQRES NAME NUMBER NAME CHAIN SEQ/INSERT CODE SER 32 THR 32 THR 36 SER 36
-
実験情報
-
実験
実験
手法: X線回折
-
試料調製
結晶
マシュー密度: 2.56 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.93 %
結晶化
*PLUS
温度: 20 ℃ / pH: 3.5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法
溶液の組成
*PLUS
ID
濃度
一般名
Crystal-ID
Sol-ID
1
10mg/ml
protein
1
drop
2
30mM
Nacitrate
1
drop
3
20 %(v/v)
MPD
1
reservoir
-
データ収集
放射
散乱光タイプ: x-ray
放射波長
相対比: 1
反射
*PLUS
最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. obs: 5602 / Rmerge(I) obs: 0.07
-
解析
ソフトウェア
名称: PROLSQ / 分類: 精密化
精密化
解像度: 2→6 Å / Rfactor obs: 0.168 / σ(F): 1
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 2→6 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
773
0
24
46
843
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
Dev ideal target
X-RAY DIFFRACTION
p_bond_d
0.018
0.02
X-RAY DIFFRACTION
p_angle_d
0.039
0.03
X-RAY DIFFRACTION
p_angle_deg
X-RAY DIFFRACTION
p_planar_d
0.04
0.05
X-RAY DIFFRACTION
p_hb_or_metal_coord
X-RAY DIFFRACTION
p_mcbond_it
0.846
1.5
X-RAY DIFFRACTION
p_mcangle_it
1.404
2
X-RAY DIFFRACTION
p_scbond_it
1.739
2
X-RAY DIFFRACTION
p_scangle_it
2.726
2.5
X-RAY DIFFRACTION
p_plane_restr
0.014
0.02
X-RAY DIFFRACTION
p_chiral_restr
0.156
0.15
X-RAY DIFFRACTION
p_singtor_nbd
0.16
0.3
X-RAY DIFFRACTION
p_multtor_nbd
0.196
0.3
X-RAY DIFFRACTION
p_xhyhbond_nbd
0.214
0.3
X-RAY DIFFRACTION
p_xyhbond_nbd
X-RAY DIFFRACTION
p_planar_tor
2.3
2
X-RAY DIFFRACTION
p_staggered_tor
15.7
15
X-RAY DIFFRACTION
p_orthonormal_tor
21.8
20
X-RAY DIFFRACTION
p_transverse_tor
X-RAY DIFFRACTION
p_special_tor
精密化
*PLUS
最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 6 Å / Num. reflection obs: 5331 / σ(F): 1 / Rfactor obs: 0.168