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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fer | ||||||
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タイトル | STRUCTURE AT PH 6.5 OF FERREDOXIN I FROM AZOTOBACTER VINELANDII AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | FERREDOXIN I | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSFER(IRON-SULFUR PROTEIN) | ||||||
機能・相同性 | ![]() 3 iron, 4 sulfur cluster binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / electron transfer activity / DNA binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Merritt, E.A. / Stout, G.H. / Turley, S. / Sieker, L.C. / Jensen, L.H. / Orme-Johnson, W.H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure at pH 6.5 of ferredoxin I from Azotobacter vinelandii at 2.3 A resolution. 著者: Merritt, E.A. / Stout, G.H. / Turley, S. / Sieker, L.C. / Jehsen, L.H. / Orme-Johnson, W.H. #1: ![]() タイトル: Structure of Ferredoxin I from Azotobacter Vinelandii 著者: Stout, G.H. / Turley, S. / Sieker, L.C. / Jensen, L.H. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX HELIX ASSIGNMENTS WERE BASED ON ANALYSIS USING PROGRAM *DSSP* OF W. KABSCH AND C. SANDER. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 35.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 24.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12059.530 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P00214 |
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#2: 化合物 | ChemComp-F3S / |
#3: 化合物 | ChemComp-SF4 / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 59.77 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 277 K / pH: 6.5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / 最低解像度: 30 Å / Num. obs: 7099 / Rmerge(I) obs: 3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.17 / 最高解像度: 2.3 Å | ||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.3 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection obs: 6986 / Rfactor obs: 0.17 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 22.5 Å2 | ||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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