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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ecn | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF ERYTHROCRUORIN IN DIFFERENT LIGAND STATES REFINED AT 1.4 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | ERYTHROCRUORIN (CYANO MET) | ||||||
![]() | OXYGEN TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() hemoglobin complex / oxygen carrier activity / oxygen binding / heme binding / extracellular region / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Steigemann, W. / Weber, E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of erythrocruorin in different ligand states refined at 1.4 A resolution. 著者: Steigemann, W. / Weber, E. #1: ![]() タイトル: The Structure of Oxy-Erythrocruorin at 1.4 Angstroms Resolution 著者: Weber, E. / Steigemann, W. / Jones, T.A. / Huber, R. #2: ![]() タイトル: The Atomic Structure of Erythrocruorin in the Light of the Chemical Sequence and its Comparison with Myoglobin 著者: Huber, R. / Epp, O. / Steigemann, W. / Formanek, H. #3: ![]() タイトル: Structures of Deoxy-and Carbomonoxy-Erythrocruorin 著者: Huber, R. / Epp, O. / Formanek, H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 42.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 29.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 480.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 485.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUE PRO 74 IS A CIS-PROLINE. 2: AN OCCUPANCY OF 0.0 DENOTES ATOMS THAT HAVE NOT BEEN LOCALIZED IN THE ELECTRON DENSITY. 3: IN THE CYANO MET STRUCTURE TWO ALTERNATE LOCATIONS HAVE BEEN FOUND FOR THE CATALYTIC RESIDUES HIS 58 AND ILE 62. THE PRESENCE OF THIS HALF OCCUPIED WATER MOLECULE THAT IS BOUND TO THE CN-LIGAND ...3: IN THE CYANO MET STRUCTURE TWO ALTERNATE LOCATIONS HAVE BEEN FOUND FOR THE CATALYTIC RESIDUES HIS 58 AND ILE 62. THE PRESENCE OF THIS HALF OCCUPIED WATER MOLECULE THAT IS BOUND TO THE CN-LIGAND CORRESPONDS TO THE USUAL CONFORMATION WHERE THE HISTIDINE POINTS OUT TO THE SOLVENT. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14800.792 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-CYN / |
#3: 化合物 | ChemComp-HEM / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.05 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.9 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: other詳細: Braun, V., (1968) Hoppe Seylers Z Physiol Chem., 349, 197. |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.34 Å / Num. all: 46076 / Num. obs: 25946 / Rmerge(I) obs: 0.086 |
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解析
精密化 | 最高解像度: 1.4 Å | ||||||||||||
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.4 Å
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 7.8 Å / Rfactor obs: 0.191 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |