登録情報 データベース : PDB / ID : 1e9l 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル The crystal structure of novel mammalian lectin Ym1 suggests a saccharide binding site 要素YM1 SECRETORY PROTEIN 詳細 キーワード MACROPHAGE SECRETORY PROTEIN / INFLAMMATION / LECTIN / INDUCIBLE / SECRETORY機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
rough endoplasmic reticulum lumen / beta-N-acetylhexosaminidase activity / beta-N-acetylhexosaminidase / N-acetyl-beta-D-galactosaminidase activity / chitin catabolic process / chitin binding / polysaccharide catabolic process / nuclear envelope / cytoplasmic vesicle / carbohydrate binding ... rough endoplasmic reticulum lumen / beta-N-acetylhexosaminidase activity / beta-N-acetylhexosaminidase / N-acetyl-beta-D-galactosaminidase activity / chitin catabolic process / chitin binding / polysaccharide catabolic process / nuclear envelope / cytoplasmic vesicle / carbohydrate binding / inflammatory response / extracellular region / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 Chitinase A; domain 3 - #10 / Chitinase insertion domain superfamily / Chitinase II / Glyco_18 / Glycosyl hydrolases family 18 (GH18) domain profile. / Glycoside hydrolase family 18, catalytic domain / Glycosyl hydrolases family 18 / Chitinase A; domain 3 / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily ... Chitinase A; domain 3 - #10 / Chitinase insertion domain superfamily / Chitinase II / Glyco_18 / Glycosyl hydrolases family 18 (GH18) domain profile. / Glycoside hydrolase family 18, catalytic domain / Glycosyl hydrolases family 18 / Chitinase A; domain 3 / Glycosidases / Glycoside hydrolase superfamily / TIM Barrel / Roll / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 2-amino-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / Chitinase-like protein 3 類似検索 - 構成要素生物種 MUS MUSCULUS (ハツカネズミ)手法 X線回折 / 多重同系置換・異常分散 / 解像度 : 2.5 Å 詳細データ登録者 Hsiao, C.D. / Sun, Y.J. 引用ジャーナル : J.Biol.Chem. / 年 : 2001タイトル : The Crystal Structure of a Novel Mammalian Lectin, Ym1, Suggests a Saccharide Binding Site著者 : Sun, Y.J. / Chang, N.C. / Hung, S.I. / Chang, A.C. / Chou, C.C. / Hsiao, C.D. 履歴 登録 2000年10月21日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2001年3月1日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年5月8日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 2.0 2019年5月22日 Group : Atomic model / Data collection ... Atomic model / Data collection / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ : atom_site / pdbx_database_proc ... atom_site / pdbx_database_proc / pdbx_database_status / refine / struct_conn Item : _pdbx_database_status.recvd_author_approval / _refine.pdbx_ls_cross_valid_method / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag改定 2.1 2020年7月1日 Group : Advisory / Data collection ... Advisory / Data collection / Derived calculations / Other カテゴリ : chem_comp / pdbx_database_status ... chem_comp / pdbx_database_status / pdbx_validate_close_contact / struct_conn / struct_conn_type Item : _chem_comp.type / _pdbx_database_status.status_code_sf改定 2.2 2020年7月29日 Group : Data collection / Derived calculations / Structure summaryカテゴリ : chem_comp / entity ... chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_site / struct_site_gen Item : _chem_comp.name / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation
すべて表示 表示を減らす Remark 700 SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "A" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW ... SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "A" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 8-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 9-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL.