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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1e8u | ||||||
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タイトル | Structure of the multifunctional paramyxovirus hemagglutinin-neuraminidase | ||||||
![]() | HEMAGGLUTININ-NEURAMINIDASE | ||||||
![]() | HYDROLASE / SIALIDASE / NEURAMINIDASE / HEMAGGLUTININ | ||||||
機能・相同性 | ![]() exo-alpha-(2->3)-sialidase activity / exo-alpha-(2->6)-sialidase activity / exo-alpha-(2->8)-sialidase activity / exo-alpha-sialidase / host cell surface receptor binding / symbiont entry into host cell / viral envelope / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Crennell, S. / Takimoto, T. / Portner, A. / Taylor, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of the Multifunctional Paramyxovirus Hemagglutinin-Neuraminidase 著者: Crennell, S. / Takimoto, T. / Portner, A. / Taylor, G. #1: ジャーナル: Virology / 年: 2000 タイトル: Crystallization of Newcastle Disease Virus Hemagglutinin-Neuraminidase Glycoprotein 著者: Takimoto, T. / Taylor, G.L. / Crennell, S.J. / Scroggs, R.A. / Portner, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 187.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 152.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.9883, 0.1436, -0.052), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 49856.910 Da / 分子数: 2 / 断片: HEAD DOMAIN, RESIDUES 124-577 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() #2: 化合物 | #3: 糖 | #4: 糖 | ChemComp-NAG / #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.85 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.91 % |
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結晶化 | pH: 4.6 / 詳細: pH 4.60 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.934 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2→30 Å / Num. obs: 75784 / % possible obs: 97 % / 冗長度: 3.7 % / Rmerge(I) obs: 0.071 / Rsym value: 0.071 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 282836 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 98 % / Rmerge(I) obs: 0.258 |
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解析
ソフトウェア | 名称: CNS / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→6 Å
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拘束条件 |
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