+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1drk | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | PROBING PROTEIN-PROTEIN INTERACTIONS: THE RIBOSE-BINDING PROTEIN IN BACTERIAL TRANSPORT AND CHEMOTAXIS | ||||||
![]() | D-RIBOSE-BINDING PROTEIN | ||||||
![]() | BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() D-ribose transmembrane transport / monosaccharide binding / positive chemotaxis / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex, substrate-binding subunit-containing / outer membrane-bounded periplasmic space / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Mowbray, S.L. / Bjorkman, A.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Probing protein-protein interactions. The ribose-binding protein in bacterial transport and chemotaxis. 著者: Bjorkman, A.J. / Binnie, R.A. / Zhang, H. / Cole, L.B. / Hermodson, M.A. / Mowbray, S.L. #1: ![]() タイトル: The 1.7 Angstroms X-Ray Structure of the Periplasmic Ribose Receptor from Escherichia Coli 著者: Mowbray, S.L. / Cole, L.B. #2: ![]() タイトル: Functional Mapping of the Surface of Escherichia Coli Ribose-Binding Protein: Mutations which Affect Chemotaxis and Transport 著者: Binnie, R.A. / Zhang, H. / Mowbray, S. / Hermodson, M.A. #3: ![]() タイトル: Preliminary X-Ray Data for the Periplasmic Ribose Receptor from Escherichia Coli 著者: Mahendroo, M. / Cole, L.B. / Mowbray, S.L. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 81 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 62.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 429.6 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 430.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 28509.396 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
---|---|
#2: 糖 | ChemComp-RIP / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.31 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.76 % | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
---|---|
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 7.5 Å / Num. obs: 17203 / % possible obs: 95 % / Observed criterion σ(I): 1 / Num. measured all: 72070 / Rmerge(I) obs: 0.061 |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 解像度: 2→7.5 Å / σ(F): 1 /
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→7.5 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 26.1 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
|