ソフトウェア | 名称 | バージョン | 分類 |
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d*TREK | V.4.7データ削減 | X-PLOR | | モデル構築 | SHELXL-97 | | 精密化 | d*TREK | V. 4.7データスケーリング | X-PLOR | | 位相決定 | | |
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精密化 | 解像度: 1.7→20 Å / Num. parameters: 1979 / Num. restraintsaints: 1758 / 交差検証法: A POSTERIORI / σ(F): 0 / σ(I): 0 / 立体化学のターゲット値: G.PARKINSON ET AL.
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
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Rfree | 0.243 | 290 | 5 % | RANDOM |
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Rwork | 0.195 | - | - | - |
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all | 0.195 | 5659 | - | - |
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obs | 0.194 | 5598 | 96.3 % | - |
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: SHELXL SWAT OPTION |
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Refine analyze | Num. disordered residues: 0 / Occupancy sum hydrogen: 0 / Occupancy sum non hydrogen: 491 |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→20 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 406 | 7 | 78 | 491 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
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X-RAY DIFFRACTION | s_bond_d0.008 | X-RAY DIFFRACTION | s_angle_d0.024 | X-RAY DIFFRACTION | s_similar_dist | X-RAY DIFFRACTION | s_from_restr_planes0.074 | X-RAY DIFFRACTION | s_zero_chiral_vol | X-RAY DIFFRACTION | s_non_zero_chiral_vol | X-RAY DIFFRACTION | s_anti_bump_dis_restr0.003 | X-RAY DIFFRACTION | s_rigid_bond_adp_cmpnt | X-RAY DIFFRACTION | s_similar_adp_cmpnt0.052 | X-RAY DIFFRACTION | s_approx_iso_adps | | | | | | | | | | |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: SHELXL-97 / 分類: refinement |
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精密化 | *PLUS σ(F): 0 / % reflection Rfree: 5 % / Rfactor Rwork: 0.194 |
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溶媒の処理 | *PLUS |
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原子変位パラメータ | *PLUS |
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拘束条件 | *PLUS Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
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X-RAY DIFFRACTION | s_bond_d0.007 | X-RAY DIFFRACTION | s_plane_restr0.074 | | |
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