- PDB-1dl4: THE SOLUTION STRUCTURE OF A BAY-REGION 1S-BENZ[A]ANTHRACENE OXIDE... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 1dl4
タイトル
THE SOLUTION STRUCTURE OF A BAY-REGION 1S-BENZ[A]ANTHRACENE OXIDE ADDUCT AT THE N6 POSITION OF ADENINE OF AN OLIGODEOXYNUCLEOTIDE CONTAINING THE HUMAN N-RAS CODON 61 SEQUENCE
要素
DNA (5'-D(*CP*GP*GP*AP*CP*(BZA)AP*AP*GP*AP*AP*G)-3')
BORGIAS, B.A., THOMAS, P.D., LI, H., KUMAR, A., ANDTONELLI, M.
精密化
MARDIGRAS
3
BORGIAS, B.A., THOMAS, P.D., LI, H., KUMAR, A., ANDTONELLI, M.
iterativematrixrelaxation
精密化
手法: NOE-restrained MOLECULAR DYNAMICS, SIMULATED ANNEALING ソフトェア番号: 1 詳細: THE STRUCTURE IS BASED ON A TOTAL OF 477 NOE-DERIVED DISTANCE CONSTRAINTS, 80 EMPIRICAL SUGAR PUCKER RESTRAINTS, 32 BACKBONE ANGLE DIHEDRAL RESTRAINTS, AND 18 EMPIRICAL PLANARITY RESTRAINTS.
代表構造
選択基準: lowest energy
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 7 / 登録したコンフォーマーの数: 1