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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1dja | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF BETA-LACTAMASE PRECURSOR, K73H MUTANT, AT 298K | ||||||
![]() | BETA-LACTAMASE | ||||||
![]() | HYDROLASE / ANTIBIOTIC RESISTANCE / PLASMID / TRANSPOSABLE ELEMENT | ||||||
機能・相同性 | ![]() beta-lactam antibiotic catabolic process / beta-lactamase activity / beta-lactamase / response to antibiotic 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Chen, C.C.H. / Herzberg, O. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure and kinetics of the beta-lactamase mutants S70A and K73H from Staphylococcus aureus PC1. 著者: Chen, C.C. / Smith, T.J. / Kapadia, G. / Wasch, S. / Zawadzke, L.E. / Coulson, A. / Herzberg, O. #1: ![]() タイトル: An Engineered Staphylococcus Aureus Pc1 Beta-Lactamase that Hydrolyses Third-Generation Cephalosporins 著者: Zawadzke, L.E. / Smith, T.J. / Herzberg, O. #2: ![]() タイトル: Refined Crystal Structure of Beta-Lactamase from Staphylococcus Aureus Pc1 at 2.0 著者: Herzberg, O. #3: ![]() タイトル: Bacterial Resistance to Beta-Lactam Antibiotics. Crystal Structure of Beta-Lactamase from Staphylococcus Aureus Pc1 at 2.5 A Resolution 著者: Herzberg, O. / Moult, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 65.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 47.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 365.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 368.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 28983.375 Da / 分子数: 1 / 変異: A30M, K73H / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: PC1 / 解説: INDUCIBLE TRC PROMOTER / 遺伝子: BLAZ / プラスミド: PTS32 / 遺伝子 (発現宿主): BLAZ / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.03 Å3/Da / 溶媒含有率: 65 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 8 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: drop consists of equal volume of protein and reservoir solutions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 298 K |
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放射光源 | 波長: 1.5418 |
検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1995年11月6日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 21589 / % possible obs: 79 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.9 % / Rmerge(I) obs: 0.067 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / Num. measured all: 61878 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 44 % / Num. unique obs: 1971 / Num. measured obs: 3897 / Rmerge(I) obs: 0.218 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.9→8 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→8 Å
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拘束条件 |
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