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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1d1f | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF LACTAM-BRIDGED C-TERMINAL ANALOGUE-III OF NEUROPEPTIDE Y | ||||||
要素 | C-TERMINAL ANALOGUE OF NEUROPEPTIDE Y, A POTENT Y2 RECEPTOR AGONIST | ||||||
キーワード | NEUROPEPTIDE / LACTAM-BRIDGED / HELIX | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Yao, S. / Norton, R.S. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2002 タイトル: Stabilization of the helical structure of Y2-selective analogues of neuropeptide Y by lactam bridges. 著者: Yao, S. / Smith-White, M.A. / Potter, E.K. / Norton, R.S. #1: ジャーナル: To be Published タイトル: Helical structure and self-association in a 13-residue neuropeptide Y Y2 receptor agonist: relationship to biological activity 著者: Barnham, K.J. / Catalfamo, F. / Pallaghy, P.K. / Howlett, G.J. / Norton, R.S. #2: ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 1996 タイトル: Solution structure of human neuropeptide Y 著者: Monks, S.A. / Karagianis, G. / Howlett, G.J. / Norton, R.S. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1d1f.cif.gz | 91.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1d1f.ent.gz | 70.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1d1f.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1d1f_validation.pdf.gz | 344.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1d1f_full_validation.pdf.gz | 441.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1d1f_validation.xml.gz | 6.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1d1f_validation.cif.gz | 10.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d1/1d1f ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d1/1d1f | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1776.055 Da / 分子数: 1 / 断片: C-TERMINAL ANALOGUE / 変異: L24A, I28K, T32E / 由来タイプ: 合成 / 詳細: CHEMICALLY SYNTHESIZED |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING STANDARD 2D HOMONUCLEAR TECHNIQUES |
-試料調製
詳細 | 内容: 4.0 MG IN 0.6ML H2O CONTAINING 30% TFE-D3 (BY VOLUME) |
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試料状態 | pH: 5 / 圧: 1 atm / 温度: 308 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: THE STRUCTURE WAS CALCULATED USING A TOTAL OF 114 UPPER BOUND DISTANCE RESTRAINTS AND 9 BACKBONE DIHEDRAL ANGLE CONSTRAINTS | ||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |