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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1cgo | ||||||||||||
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タイトル | CYTOCHROME C' | ||||||||||||
要素 | CYTOCHROME C | ||||||||||||
キーワード | ELECTRON TRANSPORT (CYTOCHROME) | ||||||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 electron transport chain / periplasmic space / electron transfer activity / iron ion binding / heme binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | Alcaligenes sp. (バクテリア) | ||||||||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 1.8 Å | ||||||||||||
データ登録者 | Dobbs, A.J. / Faber, H.R. / Anderson, B.F. / Baker, E.N. | ||||||||||||
引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.D / 年: 1996 タイトル: Three-dimensional structure of cytochrome c' from two Alcaligenes species and the implications for four-helix bundle structures. 著者: Dobbs, A.J. / Anderson, B.F. / Faber, H.R. / Baker, E.N. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1993 タイトル: Atomic Structure of a Cytochrome C' with an Unusual Ligand-Controlled Dimer Dissociation at 1.8 Angstroms Resolution 著者: Ren, Z. / Meyer, T.E. / Mcree, D.E. #2: ジャーナル: J.Biochem.(Tokyo) / 年: 1992 タイトル: Three-Dimensional Structure of Ferricytochrome C' from Rhodospirillum Rubrum at 2.8 Angstroms Resolution 著者: Yasui, M. / Harada, S. / Kai, Y. / Kasai, N. / Kusunoki, M. / Matsura, Y. #3: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1985 タイトル: Structure of Ferricytochrome C' from Rhodospirillum Molischianum at 1.67 Angstroms 著者: Finzel, B.C. / Weber, P.C. / Hardman, K.D. / Salemme, F.R. #4: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1981 タイトル: Crystallographic Structure of Rhodospirillum Molischianum Ferricytochrome C' at 2.5 Angstroms Resolution 著者: Weber, P.C. / Howard, A. / Xoung, N.H. / Salemme, F.R. #5: ジャーナル: Biochem.J. / 年: 1973 タイトル: The Amino Acid Sequence of Cytochrome C' from Alcaligenes Sp. N.C.I.B. 11015 著者: Ambler, R.P. | ||||||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1cgo.cif.gz | 35.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1cgo.ent.gz | 27 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1cgo.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1cgo_validation.pdf.gz | 800.5 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1cgo_full_validation.pdf.gz | 803.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1cgo_validation.xml.gz | 8.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1cgo_validation.cif.gz | 11.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cg/1cgo ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cg/1cgo | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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詳細 | SYMMETRY THE CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS PRESENTED BELOW GENERATE THE SUBUNITS OF THE POLYMERIC MOLECULE. APPLIED TO RESIDUES: PCA 1 .. HEM 128 SYMMETRY OPERATION TO GENERATE THE SECOND MOLECULE OF THE DIMERIC PARTICLE SYMMETRY1 1 -1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 SYMMETRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 SYMMETRY3 1 0.000000 0.000000 -1.000000 90.55000 |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13645.469 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Alcaligenes sp. (バクテリア) / 参照: UniProt: P00138 |
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#2: 化合物 | ChemComp-HEC / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.83 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.59 % |
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-データ収集
放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: Photon Factory / ビームライン: BL-6A / 波長: 1.04 |
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検出器 | 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1990年11月28日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.04 Å / 相対比: 1 |
反射 | 冗長度: 5.2 % / Rmerge(I) obs: 0.075 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.8→20 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→20 Å
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