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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bwm | ||||||
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タイトル | A SINGLE-CHAIN T CELL RECEPTOR | ||||||
要素 | PROTEIN (ALPHA-BETA T CELL RECEPTOR (TCR) (D10)) | ||||||
キーワード | IMMUNE SYSTEM / IMMUNOGLOBULIN / IMMUNORECEPTOR | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / molecular dynamics | ||||||
データ登録者 | Hare, B.J. / Wyss, D.F. / Reinherz, E.L. / Wagner, G. | ||||||
引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 1999 タイトル: Structure, specificity and CDR mobility of a class II restricted single-chain T-cell receptor. 著者: Hare, B.J. / Wyss, D.F. / Osburne, M.S. / Kern, P.S. / Reinherz, E.L. / Wagner, G. #1: ジャーナル: To be Published タイトル: Application of Automated NOE Assignment to Three-dimensional Structure Refinement of a 28 kD Single-chain T Cell Receptor 著者: Hare, B.J. / Wagner, G. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bwm.cif.gz | 1.1 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bwm.ent.gz | 910.3 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bwm.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1bwm_validation.pdf.gz | 351 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1bwm_full_validation.pdf.gz | 544.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1bwm_validation.xml.gz | 84.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1bwm_validation.cif.gz | 109.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bw/1bwm ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bw/1bwm | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 26970.664 Da / 分子数: 1 / 断片: VARIABLE DOMAINS FROM ALPHA AND BETA CHAINS / 変異: C415S / 由来タイプ: 組換発現 詳細: 27-RESIDUE HYDROPHILIC LINKER CONNECTS C TERMINUS OF BETA DOMAIN WITH N TERMINUS OF ALPHA DOMAIN 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 解説: SYNTHETIC GENE CONNECTS ALPHA AND BETA DOMAINS / プラスミド: PET11A / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli 細胞内の位置 (発現宿主): CYTOPLASMIC INCLUSION BODIES 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) 参照: GenBank: U83243, GenBank: U83242, UniProt: Q5R1G1*PLUS |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TRIPLE RESONANCE NMR SPECTROSCOPY ON UNIFORM 13C, 15N, AND FRACTIONALLY 2H-LABELED SINGLE-CHAIN TCR |
-試料調製
試料状態 | イオン強度: 20 mM SODIUM ACETATE / pH: 5 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: NO NOE DISTANCE VIOLATION GREATER THAN 0.5 A, NO DIHEDRAL VIOLATION GREATER THAN 5 DEGREES 計算したコンフォーマーの数: 80 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |