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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bsl | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF ALKANAL MONOOXYGENASE BETA CHAIN | ||||||
要素 | BACTERIAL LUCIFERASE | ||||||
キーワード | FLAVOPROTEIN / PHOTOPROTEIN / LUMINESCENCE / OXIDOREDUCTASE / MONOOXYGENASE / FMN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 bacterial luciferase / alkanal monooxygenase (FMN-linked) activity / bioluminescence / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Vibrio harveyi (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.95 Å | ||||||
データ登録者 | Rayment, I. / Holden, H.M. / Thoden, J.B. / Baldwin, T.O. | ||||||
引用 | ジャーナル: Protein Sci. / 年: 1997 タイトル: Structure of the beta 2 homodimer of bacterial luciferase from Vibrio harveyi: X-ray analysis of a kinetic protein folding trap. 著者: Thoden, J.B. / Holden, H.M. / Fisher, A.J. / Sinclair, J.F. / Wesenberg, G. / Baldwin, T.O. / Rayment, I. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1996 タイトル: The 1.5-A Resolution Crystal Structure of Bacterial Luciferase in Low Salt Conditions 著者: Fisher, A.J. / Thompson, T.B. / Thoden, J.B. / Baldwin, T.O. / Rayment, I. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bsl.cif.gz | 160.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bsl.ent.gz | 126.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bsl.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1bsl_validation.pdf.gz | 379.5 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1bsl_full_validation.pdf.gz | 419.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1bsl_validation.xml.gz | 18.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1bsl_validation.cif.gz | 33.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bs/1bsl ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bs/1bsl | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36384.684 Da / 分子数: 2 / 断片: BETA SUBUNIT / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Vibrio harveyi (バクテリア) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P07739, bacterial luciferase #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.73 Å3/Da / 溶媒含有率: 54.98 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: SIEMENS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1995年6月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 55442 / % possible obs: 93.7 % / 冗長度: 2.2 % / Rmerge(I) obs: 0.041 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.95 Å / 最低解像度: 30 Å / Num. measured all: 125700 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.95 Å / % possible obs: 85.1 % / Num. unique obs: 6873 / Num. measured obs: 9563 / Rmerge(I) obs: 0.18 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.95→30 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.95→30 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor all: 0.188 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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