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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1boz | ||||||
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タイトル | STRUCTURE-BASED DESIGN AND SYNTHESIS OF LIPOPHILIC 2,4-DIAMINO-6-SUBSTITUTED QUINAZOLINES AND THEIR EVALUATION AS INHIBITORS OF DIHYDROFOLATE REDUCTASE AND POTENTIAL ANTITUMOR AGENTS | ||||||
![]() | PROTEIN (DIHYDROFOLATE REDUCTASE) | ||||||
![]() | OXIDOREDUCTASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() regulation of removal of superoxide radicals / tetrahydrobiopterin biosynthetic process / Metabolism of folate and pterines / tetrahydrofolate metabolic process / response to methotrexate / sequence-specific mRNA binding / folic acid binding / axon regeneration / dihydrofolate metabolic process / G1/S-Specific Transcription ...regulation of removal of superoxide radicals / tetrahydrobiopterin biosynthetic process / Metabolism of folate and pterines / tetrahydrofolate metabolic process / response to methotrexate / sequence-specific mRNA binding / folic acid binding / axon regeneration / dihydrofolate metabolic process / G1/S-Specific Transcription / dihydrofolate reductase / dihydrofolate reductase activity / folic acid metabolic process / NADPH binding / tetrahydrofolate biosynthetic process / Tetrahydrobiopterin (BH4) synthesis, recycling, salvage and regulation / one-carbon metabolic process / mRNA regulatory element binding translation repressor activity / NADP binding / negative regulation of translation / mRNA binding / mitochondrion / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Gangjee, A. / Vidwans, A.P. / Vasudevan, A. / Queener, S.F. / Kisliuk, R.L. / Cody, V. / Li, R. / Galitsky, N. / Luft, J.R. / Pangborn, W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure-based design and synthesis of lipophilic 2,4-diamino-6-substituted quinazolines and their evaluation as inhibitors of dihydrofolate reductases and potential antitumor agents. 著者: Gangjee, A. / Vidwans, A.P. / Vasudevan, A. / Queener, S.F. / Kisliuk, R.L. / Cody, V. / Li, R. / Galitsky, N. / Luft, J.R. / Pangborn, W. #1: ![]() タイトル: Comparison of Ternary Complexes of Pneumocystis carinii and Wild-Type Human Dihydrofolate Reductase With a Novel Classical Antitumor Furo[2,3-d]pyrimidine Antifolate 著者: Cody, V. / Galitsky, N. / Luft, J.R. / Pangborn, W. / Gangjee, A. / Devraj, R. / Queener, S.F. / Blakley, R.L. #2: ![]() タイトル: Comparison of Two Independent Crystal Structures of Human Dihydrofolate Reductase Ternary Complexes Reduced with Nicotinamide Adenine Dinucleotide Phosphate and the Very Tight-Binding Inhibitor Pt523 著者: Cody, V. / Galitsky, N. / Luft, J.R. / Pangborn, W. / Rosowsky, A. / Blakley, R.L. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 56 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 40 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 536.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 552.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 21259.402 Da / 分子数: 1 / 変異: F31G / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-NDP / |
#3: 化合物 | ChemComp-PRD / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.61 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.93 % | |||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6.5 / 詳細: pH 6.5 | |||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 287 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | モノクロメーター: NI FILTER / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.1→53 Å / Num. obs: 9706 / % possible obs: 95 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.5 % / Rmerge(I) obs: 0.049 |
反射 シェル | 最高解像度: 2.1 Å / 冗長度: 2.5 % / Rmerge(I) obs: 0.125 / % possible all: 78 |
反射 | *PLUS % possible obs: 86.4 % / Rmerge(I) obs: 0.0496 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 2.1 Å / % possible obs: 63.6 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 19.34 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / σ(F): 2 / Rfactor obs: 0.202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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