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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ble | ||||||
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タイトル | PHOSPHOENOLPYRUVATE-DEPENDENT PHOSPHOTRANSFERASE SYSTEM | ||||||
![]() | FRUCTOSE PERMEASE | ||||||
![]() | PHOSPHOTRANSFERASE / SUGAR TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() protein-Npi-phosphohistidine-D-fructose phosphotransferase / protein-N(PI)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase activity / phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system / kinase activity / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Schauder, S. / Schirmer, T. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the IIB subunit of a fructose permease (IIBLev) from Bacillus subtilis. 著者: Schauder, S. / Nunn, R.S. / Lanz, R. / Erni, B. / Schirmer, T. #1: ![]() タイトル: Levanase Operon of Bacillus Subtilis Includes a Fructose-Specific Phosphotransferase System Regulating the Expression of the Operon 著者: Martin-Verstraete, I. / Debarbouille, M. / Klier, A. / Rapoport, G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 42.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 30.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18241.139 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: P26380, protein-Npi-phosphohistidine-sugar phosphotransferase |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.79 Å3/Da / 溶媒含有率: 56 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 9 / 詳細: pH 9.0 | |||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: drop solution was mixed with an equal volume of reservoir solution | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 293 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995年12月2日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.87 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.9→20 Å / Num. obs: 4889 / % possible obs: 97.7 % / Observed criterion σ(I): 3 / 冗長度: 3.5 % / Biso Wilson estimate: 61.6 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.054 |
反射 シェル | 解像度: 2.9→3 Å / 冗長度: 3.6 % / Rmerge(I) obs: 0.288 / % possible all: 96.7 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 96.7 % / Mean I/σ(I) obs: 2.5 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 詳細: EXCEPT FOR THE ACTIVE LOOP RESIDUE PHE 13, ALL MAIN CHAIN ATOMS ARE WITHIN THE ALLOWED REGIONS OF THE RAMACHANDRAN PLOT.
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原子変位パラメータ | Biso mean: 64.5 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→20 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.9→3.03 Å / Total num. of bins used: 8
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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