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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aig | ||||||
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タイトル | PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER FROM RHODOBACTER SPHAEROIDES IN THE D+QB-CHARGE SEPARATED STATE | ||||||
![]() | (PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER ...) x 3 | ||||||
![]() | PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER / INTEGRAL MEMBRANE PROTEIN / CHARGE SEPARATED | ||||||
機能・相同性 | ![]() : / plasma membrane-derived chromatophore membrane / plasma membrane light-harvesting complex / bacteriochlorophyll binding / photosynthetic electron transport in photosystem II / photosynthesis, light reaction / : / membrane => GO:0016020 / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Stowell, M.H.B. / Mcphillips, T.M. / Soltis, S.M. / Rees, D.C. / Abresch, E. / Feher, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Light-induced structural changes in photosynthetic reaction center: implications for mechanism of electron-proton transfer. 著者: Stowell, M.H. / McPhillips, T.M. / Rees, D.C. / Soltis, S.M. / Abresch, E. / Feher, G. #1: ![]() タイトル: The Bacterial Photosynthetic Reaction Center as a Model for Membrane Proteins 著者: Rees, D.C. / Komiya, H. / Yeates, T.O. / Allen, J.P. / Feher, G. #2: ![]() タイトル: Structure and Function of Bacterial Photosynthetic Reaction Centres 著者: Feher, G. / Allen, J.P. / Okamura, M.Y. / Rees, D.C. #3: ![]() タイトル: Structure of the Reaction Center from Rhodobacter Sphaeroides R-26: Protein-Cofactor (Quinones and Fe2+) Interactions 著者: Allen, J.P. / Feher, G. / Yeates, T.O. / Komiya, H. / Rees, D.C. #4: ![]() タイトル: Structure of the Reaction Center from Rhodobacter Sphaeroides R-26 and 2.4.1: Symmetry Relations and Sequence Comparisons between Different Species 著者: Komiya, H. / Yeates, T.O. / Rees, D.C. / Allen, J.P. / Feher, G. #5: ![]() タイトル: Structure of the Reaction Center from Rhodobacter Sphaeroides R-26 and 2.4.1: Protein-Cofactor (Bacteriochlorophyll, Bacteriopheophytin, and Carotenoid) Interactions 著者: Yeates, T.O. / Komiya, H. / Chirino, A. / Rees, D.C. / Allen, J.P. / Feher, G. #6: ![]() タイトル: Structure of the Reaction Center from Rhodobacter Sphaeroides R-26: Membrane-Protein Interactions 著者: Yeates, T.O. / Komiya, H. / Rees, D.C. / Allen, J.P. / Feher, G. #7: ![]() タイトル: Structure of the Reaction Center from Rhodobacter Sphaeroides R-26: The Cofactors 著者: Allen, J.P. / Feher, G. / Yeates, T.O. / Komiya, H. / Rees, D.C. #8: ![]() タイトル: Structure of the Reaction Center from Rhodobacter Sphaeroides R-26: The Protein Subunits 著者: Allen, J.P. / Feher, G. / Yeates, T.O. / Komiya, H. / Rees, D.C. #9: ![]() タイトル: Structural Homology of Reaction Centers from Rhodopseudomonas Sphaeroides and Rhodopseudomonas Viridis as Determined by X-Ray Diffraction 著者: Allen, J.P. / Feher, G. / Yeates, T.O. / Rees, D.C. / Deisenhofer, J. / Michel, H. / Huber, R. #10: ![]() タイトル: Crystallization of Reaction Center from Rhodopseudomonas Sphaeroides: Preliminary Characterization 著者: Allen, J.P. / Feher, G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 362.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 293.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 51 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 68.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
-PHOTOSYNTHETIC REACTION CENTER ... , 3種, 6分子 LNMOHP
#1: タンパク質 | 分子量: 31346.389 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 34398.543 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() #3: タンパク質 | 分子量: 28137.398 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() |
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-非ポリマー , 5種, 104分子 








#4: 化合物 | ChemComp-BCL / #5: 化合物 | ChemComp-BPH / #6: 化合物 | ChemComp-U10 / #7: 化合物 | #8: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-詳細
非ポリマーの詳細 | ELECTRON DENSITY FOR THE UBIQUINONE-10 MOLECULES IS WEAK BEYOND THE C16 CARBON OF QB IN MOLECULE 1 ...ELECTRON DENSITY FOR THE UBIQUINONE |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.64 Å3/Da / 溶媒含有率: 66 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 8 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法詳細: Allen, J.P., (1994) Proteins. Struct. Funct. Genet., 20, 283. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 77 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1996年3月1日 / 詳細: BENT |
放射 | モノクロメーター: SI(111) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.08 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.6→30 Å / Num. obs: 74104 / % possible obs: 88 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.1 % / Rsym value: 0.085 / Net I/σ(I): 14.3 |
反射 シェル | 解像度: 2.6→2.72 Å / Mean I/σ(I) obs: 2.6 / Rsym value: 0.16 / % possible all: 86 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 203621 / Rmerge(I) obs: 0.085 |
反射 シェル | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.16 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.6→30 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.6→2.72 Å / Rfactor Rfree error: 0.016 / Total num. of bins used: 8
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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