分子量: 3595.477 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: T6-3'-THIOFORMACETAL IN THE DNA STRAND
#2: RNA鎖
DNA (5'-D(*(TCP)P*TP*GP*CP*GP*C)-3')
分子量: 3873.416 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: T6-3'-THIOFORMACETAL IN THE DNA STRAND
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
NOESY
1
2
1
DQF-COSY
NMR実験の詳細
Text: IONIC_STRENGTH: 0.1 M NACL, 10 MM PO4 PRESSURE: 1 SOLVENT SYSTEM: AQUEOUS THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING PROTON-PROTON AND PROTON-PHOSPHOROUS 1D AND 2D NMR SPECTROSCOPY.
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試料調製
試料状態
Conditions-ID
pH
温度 (K)
1
7.0
298K
2
7.0
288K
結晶化
*PLUS
手法: other / 詳細: NMR
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NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ: Bruker AMX II / 製造業者: Bruker / モデル: AMX II / 磁場強度: 600 MHz
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解析
ソフトウェア
名称
分類
X-PLOR
モデル構築
X-PLOR
精密化
X-PLOR
位相決定
NMR software
名称
開発者
分類
X-PLOR
BRUNGER
精密化
X-PLOR
構造決定
精密化
手法: SIMULATED ANNEALING, MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS, RELAXATION MATRIX REFINEMENT ソフトェア番号: 1 詳細: 1. GENERATE DISTANCE RESTRAINTS USING MARDIGRAS PROGRAM FROM T. JAMES' LAB. 2. MODEL BUILDING T. JAMES' LAB.USING QUANTA. 3. RANDOMIZE STRUCTURES BY DYNAMICS SIMULATIONS. 4. ITERATIVE ...詳細: 1. GENERATE DISTANCE RESTRAINTS USING MARDIGRAS PROGRAM FROM T. JAMES' LAB. 2. MODEL BUILDING T. JAMES' LAB.USING QUANTA. 3. RANDOMIZE STRUCTURES BY DYNAMICS SIMULATIONS. 4. ITERATIVE CALCULATIONS. 5. FINAL RELAXATION MATRIX REFINEMENT.