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- PDB-1a34: SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 1a34
タイトルSATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS/RNA COMPLEX
要素
  • RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3')
  • RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')
  • SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS
キーワードVirus/RNA / WATER STRUCTURE / RNA / VIRUS ASSEMBLY / MACROMOLECULAR INTERACTIONS / SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS / Icosahedral virus / Virus-RNA COMPLEX
機能・相同性
機能・相同性情報


viral capsid / structural molecule activity
類似検索 - 分子機能
Satellite virus coat domain / Satellite virus coat domain superfamily / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE / RNA / Coat protein
類似検索 - 構成要素
生物種Satellite Tobacco Mosaic Virus (ウイルス)
手法X線回折 / 多重同系置換, 分子置換 / 解像度: 1.81 Å
データ登録者Larson, S.B. / Day, J. / Greenwood, A.J. / McPherson, A.
引用
ジャーナル: J.Mol.Biol. / : 1998
タイトル: Refined structure of satellite tobacco mosaic virus at 1.8 A resolution.
著者: Larson, S.B. / Day, J. / Greenwood, A. / McPherson, A.
#1: ジャーナル: Nature / : 1993
タイトル: Double-Helical RNA in Satellite Tobacco Mosaic Virus
著者: Larson, S.B. / Koszelak, S. / Day, J. / Greenwood, A. / Dodds, J.A. / McPherson, A.
#2: ジャーナル: J.Mol.Biol. / : 1993
タイトル: Three-Dimensional Structure of Satellite Tobacco Mosaic Virus at 2.9 A Resolution
著者: Larson, S.B. / Koszelak, S. / Day, J. / Greenwood, A. / Dodds, J.A. / McPherson, A.
#3: ジャーナル: Protein Sci. / : 1992
タイトル: Macromolecular Crystal Growth Experiments on International Microgravity Laboratory--1
著者: Day, J. / McPherson, A.
#4: ジャーナル: J.Mol.Biol. / : 1989
タイトル: Preliminary Analysis of Crystals of Satellite Tobacco Mosaic Virus
著者: Koszelak, S. / Dodds, J.A. / McPherson, A.
履歴
登録1998年1月28日登録サイト: BNL / 処理サイト: NDB
改定 1.01998年4月29日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12008年5月22日Group: Version format compliance
改定 1.22011年7月13日Group: Version format compliance
改定 1.32012年7月25日Group: Other / Source and taxonomy
改定 1.42019年7月17日Group: Data collection / Refinement description / カテゴリ: software
Item: _software.classification / _software.name / _software.version
改定 1.52024年2月7日Group: Data collection / Database references / Derived calculations
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_oper_list / struct_site
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_oper_list.name / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _pdbx_struct_oper_list.type / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.62024年4月3日Group: Refinement description / カテゴリ: pdbx_initial_refinement_model
改定 2.02024年10月16日Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary
カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / entity / ndb_struct_conf_na / ndb_struct_na_base_pair / ndb_struct_na_base_pair_step / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_entry_details / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_close_contact / struct_conn / struct_site
Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.comp_id / _pdbx_entry_details.has_protein_modification / _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id / _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 / _struct_site.details / _struct_site.pdbx_auth_comp_id

-
構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

-
集合体

登録構造単位
A: SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS
B: RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3')
C: RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)24,2185
ポリマ-23,7983
非ポリマー4202
3,027168
1
A: SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS
B: RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3')
C: RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')
ヘテロ分子
x 60


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)1,453,080300
ポリマ-1,427,865180
非ポリマー25,215120
3,243180
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
point symmetry operation59
2


  • 登録構造と同一
  • icosahedral asymmetric unit
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
3
A: SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS
B: RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3')
C: RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')
ヘテロ分子
x 5


  • icosahedral pentamer
  • 121 kDa, 15 ポリマー
分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)121,09025
ポリマ-118,98915
非ポリマー2,10110
27015
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
point symmetry operation4
4
A: SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS
B: RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3')
C: RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')
ヘテロ分子
x 6


  • icosahedral 23 hexamer
  • 145 kDa, 18 ポリマー
分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)145,30830
ポリマ-142,78618
非ポリマー2,52112
32418
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z1
point symmetry operation5
5


  • 登録構造と同一(異なる座標系)
  • icosahedral asymmetric unit, std point frame
タイプ名称対称操作
transform to point frame1
6
A: SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS
B: RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3')
C: RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')
ヘテロ分子
x 15


  • crystal asymmetric unit, crystal frame
  • 363 kDa, 45 ポリマー
分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)363,27075
ポリマ-356,96645
非ポリマー6,30430
81145
タイプ名称対称操作
identity operation1_555x,y,z2
point symmetry operation14
単位格子
Length a, b, c (Å)174.270, 191.770, 202.500
Angle α, β, γ (deg.)90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number23
Space group name H-MI222
対称性点対称性: (ヘルマン・モーガン記号: 532 / シェーンフリース記号: I (正20面体型対称))
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID
11
22
33
/ NCSアンサンブル:
ID
1
2
3

NCS oper:
IDCodeMatrix
1given(1), (1), (1)
2generate(0.5, 0.30901699, 0.80901699), (0.30901699, 0.80901699, -0.5), (-0.80901699, 0.5, 0.30901699)
3generate(-0.30901699, 0.80901699, 0.5), (0.80901699, 0.5, -0.30901699), (-0.5, 0.30901699, -0.80901699)
4generate(-0.30901699, 0.80901699, -0.5), (0.80901699, 0.5, 0.30901699), (0.5, -0.30901699, -0.80901699)
5generate(0.5, 0.30901699, -0.80901699), (0.30901699, 0.80901699, 0.5), (0.80901699, -0.5, 0.30901699)
6generate(-0.80901699, 0.5, 0.30901699), (0.5, 0.30901699, 0.80901699), (0.30901699, 0.80901699, -0.5)
7generate(-0.5, 0.30901699, -0.80901699), (-0.30901699, 0.80901699, 0.5), (0.80901699, 0.5, -0.30901699)
8generate(0.5, -0.30901699, -0.80901699), (-0.30901699, 0.80901699, -0.5), (0.80901699, 0.5, 0.30901699)
9generate(0.80901699, -0.5, 0.30901699), (0.5, 0.30901699, -0.80901699), (0.30901699, 0.80901699, 0.5)
10generate(1), (1), (1)
11generate(0.80901699, 0.5, 0.30901699), (0.5, -0.30901699, -0.80901699), (-0.30901699, 0.80901699, -0.5)
12generate(0.30901699, 0.80901699, 0.5), (0.80901699, -0.5, 0.30901699), (0.5, 0.30901699, -0.80901699)
13generate(1), (1), (1)
14generate(0.30901699, 0.80901699, -0.5), (-0.80901699, 0.5, 0.30901699), (0.5, 0.30901699, 0.80901699)
15generate(0.80901699, 0.5, -0.30901699), (-0.5, 0.30901699, -0.80901699), (-0.30901699, 0.80901699, 0.5)

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 1分子 A

#1: タンパク質 SATELLITE TOBACCO MOSAIC VIRUS / STMV


分子量: 17533.949 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Satellite Tobacco Mosaic Virus (ウイルス)
発現宿主: Nicotiana tabacum (タバコ) / 参照: UniProt: P17574

-
RNA鎖 , 2種, 2分子 BC

#2: RNA鎖 RNA (5'-R(P*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*AP*A)-3')


分子量: 3247.100 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成
#3: RNA鎖 RNA (5'-R(P*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*UP*U)-3')


分子量: 3016.700 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成

-
非ポリマー , 3種, 170分子

#4: 化合物 ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン


分子量: 96.063 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / : SO4
#5: 化合物 ChemComp-U5P / URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE / UMP


分子量: 324.181 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / : C9H13N2O9P
#6: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 168 / 由来タイプ: 天然 / : H2O

-
詳細

構成要素の詳細RNA CHAIN B HAS BEEN DESCRIBED BY AN ARBITRARY 10 NUCLEOTIDE CHAIN COMPOSED OF ADENINE BASES. ...RNA CHAIN B HAS BEEN DESCRIBED BY AN ARBITRARY 10 NUCLEOTIDE CHAIN COMPOSED OF ADENINE BASES. LIKEWISE CHAINS C AND D ARE URIDINES. THE TRUE SEQUENCE IS UNDOUBTEDLY DISORDERED, BUT THE GREATEST POPULATION IN THE RNA GENOME OF STMV OCCURS FOR ADENINE AND URIDINE BASES.
Has protein modificationN

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 20

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.42 Å3/Da / 溶媒含有率: 25 % / 解説: 8 SPACE-GROWN CRYSTALS AND 12 EARTH-GROWN CRYSTALS
結晶化手法: liquid diffusion in microgravity / pH: 6.5
詳細: PROTEIN WAS FOUR TIMES RECRYSTALLIZED FROM BULK SOLUTION BY ADDITION AF AMMONIUM SULFATE TO 15% SATURATION. SPACE CRYSTALS WERE GROWN BY LIQUID-LIQUID DIFFUSION IN A MICROGRAVITY ENVIRONMENT ...詳細: PROTEIN WAS FOUR TIMES RECRYSTALLIZED FROM BULK SOLUTION BY ADDITION AF AMMONIUM SULFATE TO 15% SATURATION. SPACE CRYSTALS WERE GROWN BY LIQUID-LIQUID DIFFUSION IN A MICROGRAVITY ENVIRONMENT OVER 12 DAYS ABOARD IML-I MISSION OF THE US SPACE SHUTTLE., pH 6.50, liquid diffusion in microgravity
溶液の組成
ID名称Crystal-IDSol-ID
1WATER11
2AMMONIUM SULFATE11
3WATER12
4AMMONIUM SULFATE1
結晶
*PLUS
結晶化
*PLUS
手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: Koszelak, S., (1989) J.Mol.Biol., 209, 323. / PH range low: 7.5 / PH range high: 6
溶液の組成
*PLUS
ID濃度一般名Crystal-IDSol-ID詳細
15-8 mg/mlvirus1drop
210 mMcacodylate1dropcan be replaced by phosphate or Tris buffer
410-20 %satammonium sulfate1reservoir
540 mMcacodylate1reservoir
3reservoir1drop0.010ml

-
データ収集

回折平均測定温度: 290 K
放射光源由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU RU200
検出器タイプ: SDMS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1992年2月1日 / 詳細: NONE
放射モノクロメーター: SUPPER GRAPHITE / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長相対比: 1
反射解像度: 1.81→30 Å / Num. obs: 271689 / % possible obs: 89 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 8.2 % / Biso Wilson estimate: 8.7 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.091 / Rsym value: 0.091
反射 シェル解像度: 1.81→1.94 Å / 冗長度: 2.1 % / Rsym value: 0.199 / % possible all: 63.9
反射
*PLUS
最低解像度: 9999 Å / % possible obs: 89 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 8.2 % / Num. measured all: 2239616

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
X-PLOR3.843精密化
BRICOGNE'SGENERATEモデル構築
INTERPOLATEモデル構築
TNT精密化
HEAVYモデル構築
SDMSDETECTOR SYSTEMデータ削減
SDMSDETECTOR SYSTEMデータスケーリング
HEAVY位相決定
BRICOGNE'SGENERATE位相決定
INTERPOLATE位相決定
TNT位相決定
精密化構造決定の手法: 多重同系置換, 分子置換
開始モデル: MODIFIED STNV

解像度: 1.81→30 Å / Rfactor Rfree error: 0.003 / Data cutoff high absF: 100000 / Data cutoff low absF: 0.1 / Isotropic thermal model: INDIVIDUAL RESTRAINED / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 4
詳細: THE RMS DEVIATIONS LISTED ABOVE ARE FOR THE PROTEIN. RMS DEVIATIONS FOR THE DOUBLE HELICAL RNA ARE THE FOLLOWING: BONDS: 0.021 ANGLES: 3.06 DIHEDRAL ANGLES: 11.12 IMPROPER ANGLES: 2.05 MEAN B ...詳細: THE RMS DEVIATIONS LISTED ABOVE ARE FOR THE PROTEIN. RMS DEVIATIONS FOR THE DOUBLE HELICAL RNA ARE THE FOLLOWING: BONDS: 0.021 ANGLES: 3.06 DIHEDRAL ANGLES: 11.12 IMPROPER ANGLES: 2.05 MEAN B FOR RNA IS 99.1 AND FOR ALL NON- HYDROGEN ATOMS THE MEAN B IS 37.6. NCS RESTRAINTS WERE APPLIED TO THE RNA BACKBONE ONLY. THREE GROUPS WERE DEFINED: GROUP 1, NUCLEOTIDES 1002 - 1006 AND 1102 - 1106; GROUP 2, 1001, 1007 AND 1101, 1107; GROUP 3, 1000, 1008, 1009 AND 1100, 1108, 1109.
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.184 3277 1.5 %RANDOM
Rwork0.179 ---
obs-215809 71.8 %-
原子変位パラメータBiso mean: 14.6 Å2
Refine analyze
FreeObs
Luzzati coordinate error0.19 Å0.18 Å
Luzzati d res low-5 Å
Luzzati sigma a0.17 Å0.16 Å
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 1.81→30 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数1137 422 18 168 1745
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target
X-RAY DIFFRACTIONx_bond_d0.009
X-RAY DIFFRACTIONx_bond_d_na
X-RAY DIFFRACTIONx_bond_d_prot
X-RAY DIFFRACTIONx_angle_d
X-RAY DIFFRACTIONx_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTIONx_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTIONx_angle_deg1.8
X-RAY DIFFRACTIONx_angle_deg_na
X-RAY DIFFRACTIONx_angle_deg_prot
X-RAY DIFFRACTIONx_dihedral_angle_d17.77
X-RAY DIFFRACTIONx_dihedral_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTIONx_dihedral_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTIONx_improper_angle_d1.39
X-RAY DIFFRACTIONx_improper_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTIONx_improper_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTIONx_mcbond_it1.851.5
X-RAY DIFFRACTIONx_mcangle_it3.342
X-RAY DIFFRACTIONx_scbond_it2.782
X-RAY DIFFRACTIONx_scangle_it4.472.5
Refine LS restraints NCS
Ens-IDDom-IDRefine-IDRms dev Biso 2)Rms dev position (Å)Weight Biso Weight position
11X-RAY DIFFRACTION0.310.471100
22X-RAY DIFFRACTION0.30.51230
33X-RAY DIFFRACTION0.510.8735
LS精密化 シェル解像度: 1.81→1.9 Å / Rfactor Rfree error: 0.01 / Total num. of bins used: 6
Rfactor反射数%反射
Rfree0.215 199 1.4 %
Rwork0.204 13835 -
obs--71.8 %
Xplor file
Refine-IDSerial noParam fileTopol file
X-RAY DIFFRACTION1PARAMSBLW.PROTOPSBL.PRO
X-RAY DIFFRACTION2DNA-RNA-ALLH3NEW.PARAMDNA-RNA-ALLH.TOP
X-RAY DIFFRACTION3PARAM19.SOL
X-RAY DIFFRACTION4PARAM.HBN
ソフトウェア
*PLUS
名称: X-PLOR / バージョン: 3.843 / 分類: refinement
精密化
*PLUS
最高解像度: 1.81 Å / 最低解像度: 30 Å / σ(F): 4 / % reflection Rfree: 1.5 % / Rfactor obs: 0.179
溶媒の処理
*PLUS
原子変位パラメータ
*PLUS
Biso mean: 14.6 Å2
拘束条件
*PLUS
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target
X-RAY DIFFRACTIONx_dihedral_angle_d
X-RAY DIFFRACTIONx_dihedral_angle_deg17.77
X-RAY DIFFRACTIONx_improper_angle_d
X-RAY DIFFRACTIONx_improper_angle_deg1.39
X-RAY DIFFRACTIONx_mcbond_it1.851.5
X-RAY DIFFRACTIONx_scbond_it2.782
X-RAY DIFFRACTIONx_mcangle_it3.342
X-RAY DIFFRACTIONx_scangle_it4.472.5
LS精密化 シェル
*PLUS
% reflection Rfree: 1.4 %

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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