[English] 日本語
Yorodumi- PDB-4nia: Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined at room temperature to 1.8... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4nia | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined at room temperature to 1.8 A Resolution using NCS Restraints | ||||||
Components |
| ||||||
Keywords | VIRUS/RNA / Double-helix RNA / Protein-RNA complex / Swiss Jelly-roll beta barrel / icosahedral virus / VIRUS-RNA complex | ||||||
Function / homology | Function and homology information | ||||||
Biological species | Satellite tobacco mosaic virus Satellite Tobacco Mosaic Virus | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.82 Å | ||||||
Authors | Larson, S.B. / Day, J.S. / McPherson, A. | ||||||
Citation | Journal: Acta Crystallogr.,Sect.D / Year: 2014 Title: Satellite tobacco mosaic virus refined to 1.4 angstrom resolution. Authors: Larson, S.B. / Day, J.S. / McPherson, A. #1: Journal: J.Mol.Biol. / Year: 1998 Title: Refined structure of satellite tobacco mosaic virus at 1.8 A resolution. Authors: Larson, S.B. / Day, J. / Greenwood, A. / McPherson, A. #2: Journal: J.Mol.Biol. / Year: 1993 Title: Three-dimensional structure of satellite tobacco mosaic virus at 2.9 A resolution. Authors: Larson, S.B. / Koszelak, S. / Day, J. / Greenwood, A. / Dodds, J.A. / McPherson, A. #3: Journal: Nature / Year: 1993 Title: Double-helical RNA in satellite tobacco mosaic virus. Authors: Larson, S.B. / Koszelak, S. / Day, J. / Greenwood, A. / Dodds, J.A. / McPherson, A. #4: Journal: Protein Sci. / Year: 1992 Title: Macromolecular crystal growth experiments on International Microgravity Laboratory--1. Authors: Day, J. / McPherson, A. #5: Journal: J.Mol.Biol. / Year: 1989 Title: Preliminary analysis of crystals of satellite tobacco mosaic virus. Authors: Koszelak, S. / Dodds, J.A. / McPherson, A. | ||||||
History |
| ||||||
Remark 200 | AUTHOR USED THE SF DATA FROM ENTRY 1A34. |
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 4nia.cif.gz | 700.9 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb4nia.ent.gz | 580.6 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 4nia.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ni/4nia ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ni/4nia | HTTPS FTP |
---|
-Related structure data
Related structure data | 4oq8C 4oq9C 1a34S S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
---|---|
Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Components on special symmetry positions |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
|