[English] 日本語
Yorodumi- PDB-4nia: Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined at room temperature to 1.8... -
+
Open data
-
Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 4nia | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Satellite Tobacco Mosaic Virus Refined at room temperature to 1.8 A Resolution using NCS Restraints | ||||||
Components |
| ||||||
Keywords | VIRUS/RNA / Double-helix RNA / Protein-RNA complex / Swiss Jelly-roll beta barrel / icosahedral virus / VIRUS-RNA complex | ||||||
| Function / homology | Function and homology information | ||||||
| Biological species | Satellite tobacco mosaic virus Satellite Tobacco Mosaic Virus | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 1.82 Å | ||||||
Authors | Larson, S.B. / Day, J.S. / McPherson, A. | ||||||
Citation | Journal: Acta Crystallogr.,Sect.D / Year: 2014Title: Satellite tobacco mosaic virus refined to 1.4 angstrom resolution. Authors: Larson, S.B. / Day, J.S. / McPherson, A. #1: Journal: J.Mol.Biol. / Year: 1998Title: Refined structure of satellite tobacco mosaic virus at 1.8 A resolution. Authors: Larson, S.B. / Day, J. / Greenwood, A. / McPherson, A. #2: Journal: J.Mol.Biol. / Year: 1993 Title: Three-dimensional structure of satellite tobacco mosaic virus at 2.9 A resolution. Authors: Larson, S.B. / Koszelak, S. / Day, J. / Greenwood, A. / Dodds, J.A. / McPherson, A. #3: Journal: Nature / Year: 1993 Title: Double-helical RNA in satellite tobacco mosaic virus. Authors: Larson, S.B. / Koszelak, S. / Day, J. / Greenwood, A. / Dodds, J.A. / McPherson, A. #4: Journal: Protein Sci. / Year: 1992 Title: Macromolecular crystal growth experiments on International Microgravity Laboratory--1. Authors: Day, J. / McPherson, A. #5: Journal: J.Mol.Biol. / Year: 1989 Title: Preliminary analysis of crystals of satellite tobacco mosaic virus. Authors: Koszelak, S. / Dodds, J.A. / McPherson, A. | ||||||
| History |
| ||||||
| Remark 200 | AUTHOR USED THE SF DATA FROM ENTRY 1A34. |
-
Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
|---|
-
Downloads & links
-
Download
| PDBx/mmCIF format | 4nia.cif.gz | 700.9 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb4nia.ent.gz | 580.6 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 4nia.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ni/4nia ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ni/4nia | HTTPS FTP |
|---|
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 4oq8C ![]() 4oq9C ![]() 1a34S S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
|---|---|
| Similar structure data |
-
Links
-
Assembly
| Deposited unit | ![]()
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | ![]()
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Unit cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Components on special symmetry positions |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
|
Movie
Controller
Components
About Yorodumi



Satellite tobacco mosaic virus
X-RAY DIFFRACTION
Citation










PDBj


