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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1a2o | ||||||
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タイトル | STRUCTURAL BASIS FOR METHYLESTERASE CHEB REGULATION BY A PHOSPHORYLATION-ACTIVATED DOMAIN | ||||||
![]() | CHEB METHYLESTERASE | ||||||
![]() | BACTERIAL CHEMOTAXIS / ADAPTATION / SERINE HYDROLASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() protein-glutamate methylesterase / protein-glutamate methylesterase activity / protein-glutamine glutaminase activity / protein-glutamine glutaminase / phosphorelay response regulator activity / chemotaxis / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Djordjevic, S. / Goudreau, P.N. / Xu, Q. / Stock, A.M. / West, A.H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural basis for methylesterase CheB regulation by a phosphorylation-activated domain. 著者: Djordjevic, S. / Goudreau, P.N. / Xu, Q. / Stock, A.M. / West, A.H. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 147.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 116.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1chdS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper:
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 37598.852 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 細胞内の位置: CYTOPLASM / プラスミド: PME30 / Cell (発現宿主): HB101 / 細胞内の位置 (発現宿主): CYTOPLASM / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.87 Å3/Da / 溶媒含有率: 57.17 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6.5 / 詳細: pH 6.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: used to seeding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1997年1月1日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: NI FILTER / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.4→15 Å / Num. obs: 32281 / % possible obs: 96.9 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3 % / Biso Wilson estimate: 38.4 Å2 / Rsym value: 0.054 / Net I/σ(I): 7.5 |
反射 シェル | 解像度: 2.4→2.46 Å / 冗長度: 3.1 % / Mean I/σ(I) obs: 4.1 / Rsym value: 0.163 / % possible all: 98.5 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 97667 / Rmerge(I) obs: 0.054 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1CHD 解像度: 2.4→10 Å / 交差検証法: FREE R / σ(F): 0
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原子変位パラメータ | Biso mean: 23.7 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: REFMAC / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Num. reflection all: 32281 / Rfactor all: 0.222 / Rfactor Rfree: 0.288 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |