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- EMDB-9220: Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S pr... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-9220
タイトルCryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome
マップデータThe complete map of state EC2 of substrate-engaged human proteasome, low pass-filtered to 3 Angstrom without amplitude correction
試料
  • 複合体: Proteasome
    • タンパク質・ペプチド: x 31種
  • タンパク質・ペプチド: x 2種
  • リガンド: x 3種
機能・相同性
機能・相同性情報


positive regulation of inclusion body assembly / Impaired BRCA2 translocation to the nucleus / Impaired BRCA2 binding to SEM1 (DSS1) / thyrotropin-releasing hormone receptor binding / modulation by host of viral transcription / meiosis I / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; オメガペプチターゼ / proteasome accessory complex / integrator complex / purine ribonucleoside triphosphate binding ...positive regulation of inclusion body assembly / Impaired BRCA2 translocation to the nucleus / Impaired BRCA2 binding to SEM1 (DSS1) / thyrotropin-releasing hormone receptor binding / modulation by host of viral transcription / meiosis I / 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; オメガペプチターゼ / proteasome accessory complex / integrator complex / purine ribonucleoside triphosphate binding / proteasome regulatory particle / positive regulation of proteasomal protein catabolic process / cytosolic proteasome complex / proteasome regulatory particle, lid subcomplex / proteasome-activating activity / proteasome regulatory particle, base subcomplex / metal-dependent deubiquitinase activity / negative regulation of programmed cell death / regulation of endopeptidase activity / protein K63-linked deubiquitination / Homologous DNA Pairing and Strand Exchange / Defective homologous recombination repair (HRR) due to BRCA1 loss of function / Defective HDR through Homologous Recombination Repair (HRR) due to PALB2 loss of BRCA1 binding function / Defective HDR through Homologous Recombination Repair (HRR) due to PALB2 loss of BRCA2/RAD51/RAD51C binding function / Resolution of D-loop Structures through Synthesis-Dependent Strand Annealing (SDSA) / Regulation of ornithine decarboxylase (ODC) / proteasome core complex / Resolution of D-loop Structures through Holliday Junction Intermediates / Cross-presentation of soluble exogenous antigens (endosomes) / : / K63-linked deubiquitinase activity / Somitogenesis / Impaired BRCA2 binding to RAD51 / myofibril / immune system process / proteasome binding / transcription factor binding / regulation of protein catabolic process / proteasome storage granule / Presynaptic phase of homologous DNA pairing and strand exchange / blastocyst development / general transcription initiation factor binding / polyubiquitin modification-dependent protein binding / NF-kappaB binding / endopeptidase activator activity / protein deubiquitination / proteasome assembly / positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly / proteasome endopeptidase complex / proteasome core complex, beta-subunit complex / proteasome core complex, alpha-subunit complex / threonine-type endopeptidase activity / mRNA export from nucleus / enzyme regulator activity / regulation of proteasomal protein catabolic process / SARS-CoV-1 targets host intracellular signalling and regulatory pathways / ERAD pathway / inclusion body / sarcomere / proteasome complex / Regulation of activated PAK-2p34 by proteasome mediated degradation / ciliary basal body / proteolysis involved in protein catabolic process / N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle / Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C / APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin / SCF-beta-TrCP mediated degradation of Emi1 / Asymmetric localization of PCP proteins / NIK-->noncanonical NF-kB signaling / Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D / AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA / TNFR2 non-canonical NF-kB pathway / stem cell differentiation / Vpu mediated degradation of CD4 / Assembly of the pre-replicative complex / Degradation of DVL / negative regulation of inflammatory response to antigenic stimulus / Ubiquitin Mediated Degradation of Phosphorylated Cdc25A / Dectin-1 mediated noncanonical NF-kB signaling / Cdc20:Phospho-APC/C mediated degradation of Cyclin A / lipopolysaccharide binding / Hh mutants are degraded by ERAD / Degradation of AXIN / Activation of NF-kappaB in B cells / Degradation of GLI1 by the proteasome / Hedgehog ligand biogenesis / Defective CFTR causes cystic fibrosis / G2/M Checkpoints / Negative regulation of NOTCH4 signaling / GSK3B and BTRC:CUL1-mediated-degradation of NFE2L2 / Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 / Vif-mediated degradation of APOBEC3G / double-strand break repair via homologous recombination / P-body / Hedgehog 'on' state / Regulation of RUNX3 expression and activity / Degradation of GLI2 by the proteasome / GLI3 is processed to GLI3R by the proteasome / FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis / MAPK6/MAPK4 signaling
類似検索 - 分子機能
: / Ubiquitin interaction motif / : / 26S proteasome regulatory subunit RPN7/PSMD6 C-terminal helix / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit Rpn12 / 26S proteasome regulatory subunit, C-terminal / Proteasome regulatory subunit C-terminal / DSS1/SEM1 / 26S proteasome regulatory subunit RPN5, C-terminal domain / : ...: / Ubiquitin interaction motif / : / 26S proteasome regulatory subunit RPN7/PSMD6 C-terminal helix / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit Rpn12 / 26S proteasome regulatory subunit, C-terminal / Proteasome regulatory subunit C-terminal / DSS1/SEM1 / 26S proteasome regulatory subunit RPN5, C-terminal domain / : / : / DSS1/SEM1 family / 26S proteasome regulatory subunit RPN5 C-terminal domain / 26S proteasome subunit RPN2, N-terminal domain / PSD13 N-terminal repeats / DSS1_SEM1 / 26S proteasome regulatory subunit Rpn6, N-terminal / 6S proteasome subunit Rpn6, C-terminal helix domain / 26S proteasome regulatory subunit RPN6 N-terminal domain / 26S proteasome subunit RPN6 C-terminal helix domain / 26S proteasome regulatory complex, non-ATPase subcomplex, Rpn2/Psmd1 subunit / 26S Proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 / 26S proteasome regulatory subunit RPN2, C-terminal / 26S proteasome regulatory subunit RPN2 C-terminal domain / 26S Proteasome non-ATPase regulatory subunit 7/8 / 26S proteasome regulatory complex, non-ATPase subcomplex, Rpn1 subunit / RPN1, N-terminal / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit RPN1, C-terminal / : / RPN1 N-terminal domain / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit RPN1 C-terminal / 26S proteasome regulatory subunit 7, OB domain / : / : / PSMD12/CSN4, N-terminal / 26S proteasome regulatory subunit Rpn7/COP9 signalosome complex subunit 1 / 26S proteasome regulatory subunit Rpn7, N-terminal / 26S proteasome subunit RPN7 / 26S Proteasome non-ATPase regulatory subunit 12/COP9 signalosome complex subunit 4 / Proteasome/cyclosome repeat / Proteasome/cyclosome repeat / Ubiquitin-interacting motif. / PCI/PINT associated module / : / von Willebrand factor type A domain / Proteasome subunit alpha 1 / HEAT repeats / Proteasomal ATPase OB C-terminal domain / Proteasomal ATPase OB C-terminal domain / CSN8/PSMD8/EIF3K / CSN8/PSMD8/EIF3K family / Rpn11/EIF3F, C-terminal / Maintenance of mitochondrial structure and function / : / motif in proteasome subunits, Int-6, Nip-1 and TRIP-15 / PCI domain / Proteasome component (PCI) domain / PCI domain profile. / Ubiquitin interacting motif / Ubiquitin-interacting motif (UIM) domain profile. / JAB1/Mov34/MPN/PAD-1 ubiquitin protease / Proteasome beta subunit, C-terminal / Proteasome beta subunits C terminal / Proteasome subunit beta 4 / Proteasome subunit beta 2 / Proteasome beta 3 subunit / Proteasome subunit alpha6 / Proteasome subunit alpha5 / Proteasome beta-type subunits signature. / Peptidase T1A, proteasome beta-subunit / Proteasome beta-type subunit, conserved site / Proteasome subunit A N-terminal signature / Proteasome alpha-type subunits signature. / Proteasome alpha-subunit, N-terminal domain / Proteasome subunit A N-terminal signature Add an annotation / von Willebrand factor (vWF) type A domain / : / Proteasome alpha-type subunit / Proteasome alpha-type subunit profile. / VWFA domain profile. / Proteasome B-type subunit / Proteasome beta-type subunit profile. / Proteasome subunit / Proteasome, subunit alpha/beta / von Willebrand factor, type A / AAA ATPase, AAA+ lid domain / AAA+ lid domain / ATPase, AAA-type, conserved site / AAA-protein family signature. / JAB/MPN domain / JAB1/MPN/MOV34 metalloenzyme domain / MPN domain / MPN domain profile. / Nucleophile aminohydrolases, N-terminal / von Willebrand factor A-like domain superfamily / ATPase family associated with various cellular activities (AAA) / ATPase, AAA-type, core / Armadillo-like helical / Tetratricopeptide-like helical domain superfamily / Armadillo-type fold
類似検索 - ドメイン・相同性
Proteasome 26S subunit, ATPase 6 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 / Proteasome subunit alpha type-7 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 / 26S proteasome regulatory subunit 6A / Proteasome subunit beta type-1 / Proteasome subunit alpha type-1 / Proteasome subunit alpha type-2 ...Proteasome 26S subunit, ATPase 6 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 / Proteasome subunit alpha type-7 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 / 26S proteasome regulatory subunit 6A / Proteasome subunit beta type-1 / Proteasome subunit alpha type-1 / Proteasome subunit alpha type-2 / Proteasome subunit alpha type-3 / Proteasome subunit alpha type-4 / Proteasome subunit alpha type-5 / Proteasome subunit beta type-4 / Proteasome subunit beta type-6 / Proteasome subunit beta type-5 / 26S proteasome regulatory subunit 7 / 26S proteasome regulatory subunit 6B / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 / Proteasome subunit beta type-3 / Proteasome subunit beta type-2 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 / 26S proteasome complex subunit SEM1 / Proteasome subunit alpha type-6 / 26S proteasome regulatory subunit 4 / 26S proteasome regulatory subunit 8 / 26S proteasome regulatory subunit 10B / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 / Proteasome subunit beta type-7 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 / 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト) / Saccharomyces cerevisiae RM11-1a (パン酵母)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.6 Å
データ登録者Mao YD
資金援助 中国, 米国, 3件
OrganizationGrant number国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)11774012 中国
National Institutes of Health/National Human Genome Research Institute (NIH/NHGRI)GM43601 米国
National Natural Science Foundation of China (NSFC)91530321 中国
引用ジャーナル: Nature / 年: 2019
タイトル: Cryo-EM structures and dynamics of substrate-engaged human 26S proteasome.
著者: Yuanchen Dong / Shuwen Zhang / Zhaolong Wu / Xuemei Li / Wei Li Wang / Yanan Zhu / Svetla Stoilova-McPhie / Ying Lu / Daniel Finley / Youdong Mao /
要旨: The proteasome is an ATP-dependent, 2.5-megadalton molecular machine that is responsible for selective protein degradation in eukaryotic cells. Here we present cryo-electron microscopy structures of ...The proteasome is an ATP-dependent, 2.5-megadalton molecular machine that is responsible for selective protein degradation in eukaryotic cells. Here we present cryo-electron microscopy structures of the substrate-engaged human proteasome in seven conformational states at 2.8-3.6 Å resolution, captured during breakdown of a polyubiquitylated protein. These structures illuminate a spatiotemporal continuum of dynamic substrate-proteasome interactions from ubiquitin recognition to substrate translocation, during which ATP hydrolysis sequentially navigates through all six ATPases. There are three principal modes of coordinated hydrolysis, featuring hydrolytic events in two oppositely positioned ATPases, in two adjacent ATPases and in one ATPase at a time. These hydrolytic modes regulate deubiquitylation, initiation of translocation and processive unfolding of substrates, respectively. Hydrolysis of ATP powers a hinge-like motion in each ATPase that regulates its substrate interaction. Synchronization of ATP binding, ADP release and ATP hydrolysis in three adjacent ATPases drives rigid-body rotations of substrate-bound ATPases that are propagated unidirectionally in the ATPase ring and unfold the substrate.
履歴
登録2018年10月16日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年11月21日-
マップ公開2018年11月21日-
更新2019年12月18日-
現状2019年12月18日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.0055
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（半径に従い着色）
  • 表面レベル: 0.0055
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6msh
  • 表面レベル: 0.0055
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_9220.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_9220.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 824 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈The complete map of state EC2 of substrate-engaged human proteasome, low pass-filtered to 3 Angstrom without amplitude correction
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.69 Å/pix.
x 600 pix.
= 411. Å		0.69 Å/pix.
x 600 pix.
= 411. Å		0.69 Å/pix.
x 600 pix.
= 411. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.685 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.006 / ムービー #1: 0.0055
最小 - 最大-0.0058405558 - 0.01586143
平均 (標準偏差)0.0000791737 (±0.0010505029)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ600600600
Spacing600600600
セルA=B=C: 411.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z0.6850.6850.685
M x/y/z600600600
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z411.000411.000411.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ240240240
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS600600600
D min/max/mean-0.0060.0160.000

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添付データ

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追加マップ: The complete map of state EC2 of substrate-engaged...

ファイルemd_9220_additional_1.map
注釈The complete map of state EC2 of substrate-engaged human proteasome, low pass-filtered to 3.5 Angstrom with amplitude correction with a B-factor of -30
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: Unfiltered, uncorrected raw EC2 map of complete holoenzyme

ファイルemd_9220_additional_2.map
注釈Unfiltered, uncorrected raw EC2 map of complete holoenzyme
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Proteasome

全体名称: Proteasome
要素
  • 複合体: Proteasome
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome complex subunit SEM1
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 6B
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 10B
    • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 6A
    • タンパク質・ペプチド: substrate
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-6
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-2
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-4
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-7
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-5
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-1
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit alpha type-3
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-6
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-7
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-3
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-2
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-5
    • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-1
  • タンパク質・ペプチド: 26S proteasome regulatory subunit 4
  • タンパク質・ペプチド: Proteasome subunit beta type-4
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
  • リガンド: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE

+
超分子 #1: Proteasome

超分子名称: Proteasome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#13, #15-#32
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
分子 #1: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 105.958234 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MITSAAGIIS LLDEDEPQLK EFALHKLNAV VNDFWAEISE SVDKIEVLYE DEGFRSRQFA ALVASKVFYH LGAFEESLNY ALGAGDLFN VNDNSEYVET IIAKCIDHYT KQCVENADLP EGEKKPIDQR LEGIVNKMFQ RCLDDHKYKQ AIGIALETRR L DVFEKTIL ...文字列:
MITSAAGIIS LLDEDEPQLK EFALHKLNAV VNDFWAEISE SVDKIEVLYE DEGFRSRQFA ALVASKVFYH LGAFEESLNY ALGAGDLFN VNDNSEYVET IIAKCIDHYT KQCVENADLP EGEKKPIDQR LEGIVNKMFQ RCLDDHKYKQ AIGIALETRR L DVFEKTIL ESNDVPGMLA YSLKLCMSLM QNKQFRNKVL RVLVKIYMNL EKPDFINVCQ CLIFLDDPQA VSDILEKLVK ED NLLMAYQ ICFDLYESAS QQFLSSVIQN LRTVGTPIAS VPGSTNTGTV PGSEKDSDSM ETEEKTSSAF VGKTPEASPE PKD QTLKMI KILSGEMAIE LHLQFLIRNN NTDLMILKNT KDAVRNSVCH TATVIANSFM HCGTTSDQFL RDNLEWLARA TNWA KFTAT ASLGVIHKGH EKEALQLMAT YLPKDTSPGS AYQEGGGLYA LGLIHANHGG DIIDYLLNQL KNASNDIVRH GGSLG LGLA AMGTARQDVY DLLKTNLYQD DAVTGEAAGL ALGLVMLGSK NAQAIEDMVG YAQETQHEKI LRGLAVGIAL VMYGRM EEA DALIESLCRD KDPILRRSGM YTVAMAYCGS GNNKAIRRLL HVAVSDVNDD VRRAAVESLG FILFRTPEQC PSVVSLL SE SYNPHVRYGA AMALGICCAG TGNKEAINLL EPMTNDPVNY VRQGALIASA LIMIQQTEIT CPKVNQFRQL YSKVINDK H DDVMAKFGAI LAQGILDAGG HNVTISLQSR TGHTHMPSVV GVLVFTQFWF WFPLSHFLSL AYTPTCVIGL NKDLKMPKV QYKSNCKPST FAYPAPLEVP KEKEKEKVST AVLSITAKAK KKEKEKEKKE EEKMEVDEAE KKEEKEKKKE PEPNFQLLDN PARVMPAQL KVLTMPETCR YQPFKPLSIG GIIILKDTSE DIEELVEPVA AHGPKIEEEE QEPEPPEPFE YIDD

+
分子 #2: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 60.935297 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: KQEGSARRRG ADKAKPPPGG GEQEPPPPPA PQDVEMKEEA ATGGGSTGEA DGKTAAAAAE HSQRELDTVT LEDIKEHVKQ LEKAVSGKE PRFVLRALRM LPSTSRRLNH YVLYKAVQGF FTSNNATRDF LLPFLEEPMD TEADLQFRPR TGKAASTPLL P EVEAYLQL ...文字列:
KQEGSARRRG ADKAKPPPGG GEQEPPPPPA PQDVEMKEEA ATGGGSTGEA DGKTAAAAAE HSQRELDTVT LEDIKEHVKQ LEKAVSGKE PRFVLRALRM LPSTSRRLNH YVLYKAVQGF FTSNNATRDF LLPFLEEPMD TEADLQFRPR TGKAASTPLL P EVEAYLQL LVVIFMMNSK RYKEAQKISD DLMQKISTQN RRALDLVAAK CYYYHARVYE FLDKLDVVRS FLHARLRTAT LR HDADGQA TLLNLLLRNY LHYSLYDQAE KLVSKSVFPE QANNNEWARY LYYTGRIKAI QLEYSEARRT MTNALRKAPQ HTA VGFKQT VHKLLIVVEL LLGEIPDRLQ FRQPSLKRSL MPYFLLTQAV RTGNLAKFNQ VLDQFGEKFQ ADGTYTLIIR LRHN VIKTG VRMISLSYSR ISLADIAQKL QLDSPEDAEF IVAKAIRDGV IEASINHEKG YVQSKEMIDI YSTREPQLAF HQRIS FCLD IHNMSVKAMR FPPKSYNKDL ESAEERRERE QQDLEFAKEM AEDDDDSFP

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分子 #3: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 52.979359 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MADGGSERAD GRIVKMEVDY SATVDQRLPE CAKLAKEGRL QEVIETLLSL EKQTRTASDM VSTSRILVAV VKMCYEAKEW DLLNENIML LSKRRSQLKQ AVAKMVQQCC TYVEEITDLP IKLRLIDTLR MVTEGKIYVE IERARLTKTL ATIKEQNGDV K EAASILQE ...文字列:
MADGGSERAD GRIVKMEVDY SATVDQRLPE CAKLAKEGRL QEVIETLLSL EKQTRTASDM VSTSRILVAV VKMCYEAKEW DLLNENIML LSKRRSQLKQ AVAKMVQQCC TYVEEITDLP IKLRLIDTLR MVTEGKIYVE IERARLTKTL ATIKEQNGDV K EAASILQE LQVETYGSME KKERVEFILE QMRLCLAVKD YIRTQIISKK INTKFFQEEN TEKLKLKYYN LMIQLDQHEG SY LSICKHY RAIYDTPCIQ AESEKWQQAL KSVVLYVILA PFDNEQSDLV HRISGDKKLE EIPKYKDLLK LFTTMELMRW STL VEDYGM ELRKGSLESP ATDVFGSTEE GEKRWKDLKN RVVEHNIRIM AKYYTRITMK RMAQLLDLSV DESEAFLSNL VVNK TIFAK VDRLAGIINF QRPKDPNNLL NDWSQKLNSL MSLVNKTTHL IAKEEMIHNL Q

+
分子 #4: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 47.526688 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAAAAVVEFQ RAQSLLSTDR EASIDILHSI VKRDIQENDE EAVQVKEQSI LELGSLLAKT GQAAELGGLL KYVRPFLNSI SKAKAARLV RSLLDLFLDM EAATGQEVEL CLECIEWAKS EKRTFLRQAL EARLVSLYFD TKRYQEALHL GSQLLRELKK M DDKALLVE ...文字列:
MAAAAVVEFQ RAQSLLSTDR EASIDILHSI VKRDIQENDE EAVQVKEQSI LELGSLLAKT GQAAELGGLL KYVRPFLNSI SKAKAARLV RSLLDLFLDM EAATGQEVEL CLECIEWAKS EKRTFLRQAL EARLVSLYFD TKRYQEALHL GSQLLRELKK M DDKALLVE VQLLESKTYH ALSNLPKARA ALTSARTTAN AIYCPPKLQA TLDMQSGIIH AAEEKDWKTA YSYFYEAFEG YD SIDSPKA ITSLKYMLLC KIMLNTPEDV QALVSGKLAL RYAGRQTEAL KCVAQASKNR SLADFEKALT DYRAELRDDP IIS THLAKL YDNLLEQNLI RVIEPFSRVQ IEHISSLIKL SKADVERKLS QMILDKKFHG ILDQGEGVLI IFDEPPVDKT YEAA LETIQ NMSKVVDSLY NKAKKLT

+
分子 #5: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 45.592285 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MPLENLEEEG LPKNPDLRIA QLRFLLSLPE HRGDAAVRDE LMAAVRDNNM APYYEALCKS LDWQIDVDLL NKMKKANEDE LKRLDEELE DAEKNLGESE IRDAMMAKAE YLCRIGDKEG ALTAFRKTYD KTVALGHRLD IVFYLLRIGL FYMDNDLITR N TEKAKSLI ...文字列:
MPLENLEEEG LPKNPDLRIA QLRFLLSLPE HRGDAAVRDE LMAAVRDNNM APYYEALCKS LDWQIDVDLL NKMKKANEDE LKRLDEELE DAEKNLGESE IRDAMMAKAE YLCRIGDKEG ALTAFRKTYD KTVALGHRLD IVFYLLRIGL FYMDNDLITR N TEKAKSLI EEGGDWDRRN RLKVYQGLYC VAIRDFKQAA ELFLDTVSTF TSYELMDYKT FVTYTVYVSM IALERPDLRE KV IKGAEIL EVLHSLPAVR QYLFSLYECR YSVFFQSLAV VEQEMKKDWL FAPHYRYYVR EMRIHAYSQL LESYRSLTLG YMA EAFGVG VEFIDQELSR FIAAGRLHCK IDKVNEIVET NRPDSKNWQY QETIKKGDLL LNRVQKLSRV INM

+
分子 #6: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 37.086441 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MPELAVQKVV VHPLVLLSVV DHFNRIGKVG NQKRVVGVLL GSWQKKVLDV SNSFAVPFDE DDKDDSVWFL DHDYLENMYG MFKKVNARE RIVGWYHTGP KLHKNDIAIN ELMKRYCPNS VLVIIDVKPK DLGLPTEAYI SVEEVHDDGT PTSKTFEHVT S EIGAEEAE ...文字列:
MPELAVQKVV VHPLVLLSVV DHFNRIGKVG NQKRVVGVLL GSWQKKVLDV SNSFAVPFDE DDKDDSVWFL DHDYLENMYG MFKKVNARE RIVGWYHTGP KLHKNDIAIN ELMKRYCPNS VLVIIDVKPK DLGLPTEAYI SVEEVHDDGT PTSKTFEHVT S EIGAEEAE EVGVEHLLRD IKDTTVGTLS QRITNQVHGL KGLNSKLLDI RSYLEKVATG KLPINHQIIY QLQDVFNLLP DV SLQEFVK AFYLKTNDQM VVVYLASLIR SVVALHNLIN NKIANRDAEK KEGQEKEESK KDRKEDKEKD KDKEKSDVKK EEK KEKK

+
分子 #7: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 42.995359 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MKDVPGFLQQ SQNSGPGQPA VWHRLEELYT KKLWHQLTLQ VLDFVQDPCF AQGDGLIKLY ENFISEFEHR VNPLSLVEII LHVVRQMTD PNVALTFLEK TREKVKSSDE AVILCKTAIG ALKLNIGDLQ VTKETIEDVE EMLNNLPGVT SVHSRFYDLS S KYYQTIGN ...文字列:
MKDVPGFLQQ SQNSGPGQPA VWHRLEELYT KKLWHQLTLQ VLDFVQDPCF AQGDGLIKLY ENFISEFEHR VNPLSLVEII LHVVRQMTD PNVALTFLEK TREKVKSSDE AVILCKTAIG ALKLNIGDLQ VTKETIEDVE EMLNNLPGVT SVHSRFYDLS S KYYQTIGN HASYYKDALR FLGCVDIKDL PVSEQQERAF TLGLAGLLGE GVFNFGELLM HPVLESLRNT DRQWLIDTLY AF NSGNVER FQTLKTAWGQ QPDLAANEAQ LLRKIQLLCL MEMTFTRPAN HRQLTFEEIA KSAKITVNEV ELLVMKALSV GLV KGSIDE VDKRVHMTWV QPRVLDLQQI KGMKDRLEFW CTDVKSMEML VEHQAHDILT

+
分子 #8: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 40.78159 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MVLESTMVCV DNSEYMRNGD FLPTRLQAQQ DAVNIVCHSK TRSNPENNVG LITLANDCEV LTTLTPDTGR ILSKLHTVQP KGKITFCTG IRVAHLALKH RQGKNHKMRI IAFVGSPVED NEKDLVKLAK RLKKEKVNVD IINFGEEEVN TEKLTAFVNT L NGKDGTGS ...文字列:
MVLESTMVCV DNSEYMRNGD FLPTRLQAQQ DAVNIVCHSK TRSNPENNVG LITLANDCEV LTTLTPDTGR ILSKLHTVQP KGKITFCTG IRVAHLALKH RQGKNHKMRI IAFVGSPVED NEKDLVKLAK RLKKEKVNVD IINFGEEEVN TEKLTAFVNT L NGKDGTGS HLVTVPPGPS LADALISSPI LAGEGGAMLG LGASDFEFGV DPSADPELAL ALRVSMEEQR QRQEEEARRA AA ASAAEAG IATTGTEDSD DALLKMTISQ QEFGRTGLPD LSSMTEEEQI AYAMQMSLQG AEFGQAESAD IDASSAMDTS EPA KEEDDY DVMQDPEFLQ SVLENLPGVD PNNEAIRNAM GSLASQATKD GKKDKKEEDK K

+
分子 #9: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 加水分解酵素; プロテアーゼ; ペプチド結合加水分解酵素; オメガペプチターゼ
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 34.488824 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: DRLLRLGGGM PGLGQGPPTD APAVDTAEQV YISSLALLKM LKHGRAGVPM EVMGLMLGEF VDDYTVRVID VFAMPQSGTG VSVEAVDPV FQAKMLDMLK QTGRPEMVVG WYHSHPGFGC WLSGVDINTQ QSFEALSERA VAVVVDPIQS VKGKVVIDAF R LINANMMV ...文字列:
DRLLRLGGGM PGLGQGPPTD APAVDTAEQV YISSLALLKM LKHGRAGVPM EVMGLMLGEF VDDYTVRVID VFAMPQSGTG VSVEAVDPV FQAKMLDMLK QTGRPEMVVG WYHSHPGFGC WLSGVDINTQ QSFEALSERA VAVVVDPIQS VKGKVVIDAF R LINANMMV LGHEPRQTTS NLGHLNKPSI QALIHGLNRH YYSITINYRK NELEQKMLLN LHKKSWMEGL TLQDYSEHCK HN ESVVKEM LELAKNYNKA VEEEDKMTPE QLAIKNVGKQ DPKRHLEEHV DVLMTSNIVQ CLAAMLDTVV FK

+
分子 #10: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 39.536676 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: FIKGRAPRAP PRERRRATRG GLRQVVAPPR ALGSTSRPHF RRASVCRRRC RKSGGLLAAS RKMAAAAVNG AAGFSSSGPA ATSGAVLQA ATGMYEQLKG EWNRKSPNLS KCGEELGRLK LVLLELNFLP TTGTKLTKQQ LILARDILEI GAQWSILRKD I PSFERYMA ...文字列:
FIKGRAPRAP PRERRRATRG GLRQVVAPPR ALGSTSRPHF RRASVCRRRC RKSGGLLAAS RKMAAAAVNG AAGFSSSGPA ATSGAVLQA ATGMYEQLKG EWNRKSPNLS KCGEELGRLK LVLLELNFLP TTGTKLTKQQ LILARDILEI GAQWSILRKD I PSFERYMA QLKCYYFDYK EQLPESAYMH QLLGLNLLFL LSQNRVAEFH TELERLPAKD IQTNVYIKHP VSLEQYLMEG SY NKVFLAK GNIPAESYTF FIDILLDTIR DEIAGCIEKA YEKILFTEAT RILFFNTPKK MTDYAKKRGW VLGPNNYYSF ASQ QQKPED TTIPSTELAK QVIEYARQLE MIV

+
分子 #11: 26S proteasome complex subunit SEM1

分子名称: 26S proteasome complex subunit SEM1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 8.284611 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MSEKKQPVDL GLLEEDDEFE EFPAEDWAGL DEDEDAHVWE DNWDDDNVED DFSNQLRAEL EKHGYKMETS

+
分子 #12: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2

分子名称: 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 98.425414 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEEGGRDKAP VQPQQSPAAA PGGTDEKPSG KERRDAGDKD KEQELSEEDK QLQDELEMLV ERLGEKDTSL YRPALEELRR QIRSSTTSM TSVPKPLKFL RPHYGKLKEI YENMAPGENK RFAADIISVL AMTMSGEREC LKYRLVGSQE ELASWGHEYV R HLAGEVAK ...文字列:
MEEGGRDKAP VQPQQSPAAA PGGTDEKPSG KERRDAGDKD KEQELSEEDK QLQDELEMLV ERLGEKDTSL YRPALEELRR QIRSSTTSM TSVPKPLKFL RPHYGKLKEI YENMAPGENK RFAADIISVL AMTMSGEREC LKYRLVGSQE ELASWGHEYV R HLAGEVAK EWQELDDAEK VQREPLLTLV KEIVPYNMAH NAEHEACDLL MEIEQVDMLE KDIDENAYAK VCLYLTSCVN YV PEPENSA LLRCALGVFR KFSRFPEALR LALMLNDMEL VEDIFTSCKD VVVQKQMAFM LGRHGVFLEL SEDVEEYEDL TEI MSNVQL NSNFLALARE LDIMEPKVPD DIYKTHLENN RFGGSGSQVD SARMNLASSF VNGFVNAAFG QDKLLTDDGN KWLY KNKDH GMLSAAASLG MILLWDVDGG LTQIDKYLYS SEDYIKSGAL LACGIVNSGV RNECDPALAL LSDYVLHNSN TMRLG SIFG LGLAYAGSNR EDVLTLLLPV MGDSKSSMEV AGVTALACGM IAVGSCNGDV TSTILQTIME KSETELKDTY ARWLPL GLG LNHLGKGEAI EAILAALEVV SEPFRSFANT LVDVCAYAGS GNVLKVQQLL HICSEHFDSK EKEEDKDKKE KKDKDKK EA PADMGAHQGV AVLGIALIAM GEEIGAEMAL RTFGHLLRYG EPTLRRAVPL ALALISVSNP RLNILDTLSK FSHDADPE V SYNSIFAMGM VGSGTNNARL AAMLRQLAQY HAKDPNNLFM VRLAQGLTHL GKGTLTLCPY HSDRQLMSQV AVAGLLTVL VSFLDVRNII LGKSHYVLYG LVAAMQPRML VTFDEELRPL PVSVRVGQAV DVVGQAGKPK TITGFQTHTT PVLLAHGERA ELATEEFLP VTP

+
分子 #13: 26S proteasome regulatory subunit 7

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 48.700805 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MPDYLGADQR KTKEDEKDDK PIRALDEGDI ALLKTYGQST YSRQIKQVED DIQQLLKKIN ELTGIKESDT GLAPPALWDL AADKQTLQS EQPLQVARCT KIINADSEDP KYIINVKQFA KFVVDLSDQV APTDIEEGMR VGVDRNKYQI HIPLPPKIDP T VTMMQVEE ...文字列:
MPDYLGADQR KTKEDEKDDK PIRALDEGDI ALLKTYGQST YSRQIKQVED DIQQLLKKIN ELTGIKESDT GLAPPALWDL AADKQTLQS EQPLQVARCT KIINADSEDP KYIINVKQFA KFVVDLSDQV APTDIEEGMR VGVDRNKYQI HIPLPPKIDP T VTMMQVEE KPDVTYSDVG GCKEQIEKLR EVVETPLLHP ERFVNLGIEP PKGVLLFGPP GTGKTLCARA VANRTDACFI RV IGSELVQ KYVGEGARMV RELFEMARTK KACLIFFDEI DAIGGARFDD GAGGDNEVQR TMLELINQLD GFDPRGNIKV LMA TNRPDT LDPALMRPGR LDRKIEFSLP DLEGRTHIFK IHARSMSVER DIRFELLARL CPNSTGAEIR SVCTEAGMFA IRAR RKIAT EKDFLEAVNK VIKSYAKFSA TPRYMTYN

+
分子 #14: 26S proteasome regulatory subunit 4

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 49.260504 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MGQSQSGGHG PGGGKKDDKD KKKKYEPPVP TRVGKKKKKT KGPDAASKLP LVTPHTQCRL KLLKLERIKD YLLMEEEFIR NQEQMKPLE EKQEEERSKV DDLRGTPMSV GTLEEIIDDN HAIVSTSVGS EHYVSILSFV DKDLLEPGCS VLLNHKVHAV I GVLMDDTD ...文字列:
MGQSQSGGHG PGGGKKDDKD KKKKYEPPVP TRVGKKKKKT KGPDAASKLP LVTPHTQCRL KLLKLERIKD YLLMEEEFIR NQEQMKPLE EKQEEERSKV DDLRGTPMSV GTLEEIIDDN HAIVSTSVGS EHYVSILSFV DKDLLEPGCS VLLNHKVHAV I GVLMDDTD PLVTVMKVEK APQETYADIG GLDNQIQEIK ESVELPLTHP EYYEEMGIKP PKGVILYGPP GTGKTLLAKA VA NQTSATF LRVVGSELIQ KYLGDGPKLV RELFRVAEEH APSIVFIDEI DAIGTKRYDS NSGGEREIQR TMLELLNQLD GFD SRGDVK VIMATNRIET LDPALIRPGR IDRKIEFPLP DEKTKKRIFQ IHTSRMTLAD DVTLDDLIMA KDDLSGADIK AICT EAGLM ALRERRMKVT NEDFKKSKEN VLYKKQEGTP EGLYL

+
分子 #15: 26S proteasome regulatory subunit 8

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 44.852121 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MELEEGKAGS GLRQYYLSKI EELQLIVNDK SQNLRRLQAQ RNELNAKVRL LREELQLLQE QGSYVGEVVR AMDKKKVLVK VHPEGKFVV DVDKNIDIND VTPNCRVALR NDSYTLHKIL PNKVDPLVSL MMVEKVPDST YEMIGGLDKQ IKEIKEVIEL P VKHPELFE ...文字列:
MELEEGKAGS GLRQYYLSKI EELQLIVNDK SQNLRRLQAQ RNELNAKVRL LREELQLLQE QGSYVGEVVR AMDKKKVLVK VHPEGKFVV DVDKNIDIND VTPNCRVALR NDSYTLHKIL PNKVDPLVSL MMVEKVPDST YEMIGGLDKQ IKEIKEVIEL P VKHPELFE ALGIAQPKGV LLYGPPGTGK TLLARAVAHH TDCTFIRVSG SELVQKFIGE GARMVRELFV MAREHAPSII FM DEIDSIG SSRLEGGSGG DSEVQRTMLE LLNQLDGFEA TKNIKVIMAT NRIDILDSAL LRPGRIDRKI EFPPPNEEAR LDI LKIHSR KMNLTRGINL RKIAELMPGA SGAEVKGVCT EAGMYALRER RVHVTQEDFE MAVAKVMQKD SEKNMSIKKL WK

+
分子 #16: 26S proteasome regulatory subunit 6B

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 6B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 47.426141 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEEIGILVEK AQDEIPALSV SRPQTGLSFL GPEPEDLEDL YSRYKKLQQE LEFLEVQEEY IKDEQKNLKK EFLHAQEEVK RIQSIPLVI GQFLEAVDQN TAIVGSTTGS NYYVRILSTI DRELLKPNAS VALHKHSNAL VDVLPPEADS SIMMLTSDQK P DVMYADIG ...文字列:
MEEIGILVEK AQDEIPALSV SRPQTGLSFL GPEPEDLEDL YSRYKKLQQE LEFLEVQEEY IKDEQKNLKK EFLHAQEEVK RIQSIPLVI GQFLEAVDQN TAIVGSTTGS NYYVRILSTI DRELLKPNAS VALHKHSNAL VDVLPPEADS SIMMLTSDQK P DVMYADIG GMDIQKQEVR EAVELPLTHF ELYKQIGIDP PRGVLMYGPP GCGKTMLAKA VAHHTTAAFI RVVGSEFVQK YL GEGPRMV RDVFRLAKEN APAIIFIDEI DAIATKRFDA QTGADREVQR ILLELLNQMD GFDQNVNVKV IMATNRADTL DPA LLRPGR LDRKIEFPLP DRRQKRLIFS TITSKMNLSE EVDLEDYVAR PDKISGADIN SICQESGMLA VRENRYIVLA KDFE KAYKT VIKKDEQEHE FYK

+
分子 #17: 26S proteasome regulatory subunit 10B

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 10B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 45.867027 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAIPGIPYER RLLIMADPRD KALQDYRKKL LEHKEIDGRL KELREQLKEL TKQYEKSEND LKALQSVGQI VGEVLKQLTE EKFIVKATN GPRYVVGCRR QLDKSKLKPG TRVALDMTTL TIMRYLPREV DPLVYNMSHE DPGNVSYSEI GGLSEQIREL R EVIELPLT ...文字列:
MAIPGIPYER RLLIMADPRD KALQDYRKKL LEHKEIDGRL KELREQLKEL TKQYEKSEND LKALQSVGQI VGEVLKQLTE EKFIVKATN GPRYVVGCRR QLDKSKLKPG TRVALDMTTL TIMRYLPREV DPLVYNMSHE DPGNVSYSEI GGLSEQIREL R EVIELPLT NPELFQRVGI IPPKGCLLYG PPGTGKTLLA RAVASQLDCN FLKVVSSSIV DKYIGESARL IREMFNYARD HQ PCIIFMD EIDAIGGRRF SEGTSADREI QRTLMELLNQ MDGFDTLHRV KMIMATNRPD TLDPALLRPG RLDRKIHIDL PNE QARLDI LKIHAGPITK HGEIDYEAIV KLSDGFNGAD LRNVCTEAGM FAIRADHDFV VQEDFMKAVR KVADSKKLES KLDY KPV

+
分子 #18: 26S proteasome regulatory subunit 6A

分子名称: 26S proteasome regulatory subunit 6A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 49.266457 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MNLLPNIESP VTRQEKMATV WDEAEQDGIG EEVLKMSTEE IIQRTRLLDS EIKIMKSEVL RVTHELQAMK DKIKENSEKI KVNKTLPYL VSNVIELLDV DPNDQEEDGA NIDLDSQRKG KCAVIKTSTR QTYFLPVIGL VDAEKLKPGD LVGVNKDSYL I LETLPTEY ...文字列:
MNLLPNIESP VTRQEKMATV WDEAEQDGIG EEVLKMSTEE IIQRTRLLDS EIKIMKSEVL RVTHELQAMK DKIKENSEKI KVNKTLPYL VSNVIELLDV DPNDQEEDGA NIDLDSQRKG KCAVIKTSTR QTYFLPVIGL VDAEKLKPGD LVGVNKDSYL I LETLPTEY DSRVKAMEVD ERPTEQYSDI GGLDKQIQEL VEAIVLPMNH KEKFENLGIQ PPKGVLMYGP PGTGKTLLAR AC AAQTKAT FLKLAGPQLV QMFIGDGAKL VRDAFALAKE KAPSIIFIDE LDAIGTKRFD SEKAGDREVQ RTMLELLNQL DGF QPNTQV KVIAATNRVD ILDPALLRSG RLDRKIEFPM PNEEARARIM QIHSRKMNVS PDVNYEELAR CTDDFNGAQC KAVC VEAGM IALRRGATEL THEDYMEGIL EVQAKKKANL QYYA

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分子 #19: substrate

分子名称: substrate / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae RM11-1a (パン酵母)
分子量理論値: 1.890321 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli K-12 (大腸菌)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)

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分子 #20: Proteasome subunit alpha type-6

分子名称: Proteasome subunit alpha type-6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 27.301262 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: SRGSSAGFDR HITIFSPEGR LYQVEYAFKA INQGGLTSVA VRGKDCAVIV TQKKVPDKLL DSSTVTHLFK ITENIGCVMT GMTADSRSQ VQRARYEAAN WKYKYGYEIP VDMLCKRIAD ISQVYTQNAE MRPLGCCMIL IGIDEEQGPQ VYKCDPAGYY C GFKATAAG ...文字列:
SRGSSAGFDR HITIFSPEGR LYQVEYAFKA INQGGLTSVA VRGKDCAVIV TQKKVPDKLL DSSTVTHLFK ITENIGCVMT GMTADSRSQ VQRARYEAAN WKYKYGYEIP VDMLCKRIAD ISQVYTQNAE MRPLGCCMIL IGIDEEQGPQ VYKCDPAGYY C GFKATAAG VKQTESTSFL EKKVKKKFDW TFEQTVETAI TCLSTVLSID FKPSEIEVGV VTVENPKFRI LTEAEIDAHL VA LAERD

+
分子 #21: Proteasome subunit alpha type-2

分子名称: Proteasome subunit alpha type-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 25.796338 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: AERGYSFSLT TFSPSGKLVQ IEYALAAVAG GAPSVGIKAA NGVVLATEKK QKSILYDERS VHKVEPITKH IGLVYSGMGP DYRVLVHRA RKLAQQYYLV YQEPIPTAQL VQRVASVMQE YTQSGGVRPF GVSLLICGWN EGRPYLFQSD PSGAYFAWKA T AMGKNYVN ...文字列:
AERGYSFSLT TFSPSGKLVQ IEYALAAVAG GAPSVGIKAA NGVVLATEKK QKSILYDERS VHKVEPITKH IGLVYSGMGP DYRVLVHRA RKLAQQYYLV YQEPIPTAQL VQRVASVMQE YTQSGGVRPF GVSLLICGWN EGRPYLFQSD PSGAYFAWKA T AMGKNYVN GKTFLEKRYN EDLELEDAIH TAILTLKESF EGQMTEDNIE VGICNEAGFR RLTPTEVKDY LAAIA

+
分子 #22: Proteasome subunit alpha type-4

分子名称: Proteasome subunit alpha type-4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.394648 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: SRRYDSRTTI FSPEGRLYQV EYAMEAIGHA GTCLGILAND GVLLAAERRN IHKLLDEVFF SEKIYKLNED MACSVAGITS DANVLTNEL RLIAQRYLLQ YQEPIPCEQL VTALCDIKQA YTQFGGKRPF GVSLLYIGWD KHYGFQLYQS DPSGNYGGWK A TCIGNNSA ...文字列:
SRRYDSRTTI FSPEGRLYQV EYAMEAIGHA GTCLGILAND GVLLAAERRN IHKLLDEVFF SEKIYKLNED MACSVAGITS DANVLTNEL RLIAQRYLLQ YQEPIPCEQL VTALCDIKQA YTQFGGKRPF GVSLLYIGWD KHYGFQLYQS DPSGNYGGWK A TCIGNNSA AAVSMLKQDY KEGEMTLKSA LALAIKVLNK TMDVSKLSAE KVEIATLTRE NGKTVIRVLK QKEVEQLIKK HE EEEAKAE REKKEKEQKE KDK

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分子 #23: Proteasome subunit alpha type-7

分子名称: Proteasome subunit alpha type-7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 27.798695 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: SYDRAITVFS PDGHLFQVEY AQEAVKKGST AVGVRGRDIV VLGVEKKSVA KLQDERTVRK ICALDDNVCM AFAGLTADAR IVINRARVE CQSHRLTVED PVTVEYITRY IASLKQRYTQ SNGRRPFGIS ALIVGFDFDG TPRLYQTDPS GTYHAWKANA I GRGAKSVR ...文字列:
SYDRAITVFS PDGHLFQVEY AQEAVKKGST AVGVRGRDIV VLGVEKKSVA KLQDERTVRK ICALDDNVCM AFAGLTADAR IVINRARVE CQSHRLTVED PVTVEYITRY IASLKQRYTQ SNGRRPFGIS ALIVGFDFDG TPRLYQTDPS GTYHAWKANA I GRGAKSVR EFLEKNYTDE AIETDDLTIK LVIKALLEVV QSGGKNIELA VMRRDQSLKI LNPEEIEKYV AEIEKEKEEN EK KKQKKAS

+
分子 #24: Proteasome subunit alpha type-5

分子名称: Proteasome subunit alpha type-5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 26.304779 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: FLTRSEYDRG VNTFSPEGRL FQVEYAIEAI KLGSTAIGIQ TSEGVCLAVE KRITSPLMEP SSIEKIVEID AHIGCAMSGL IADAKTLID KARVETQNHW FTYNETMTVE SVTQAVSNLA LQFGEEDADP GAMSRPFGVA LLFGGVDEKG PQLFHMDPSG T FVQCDARA ...文字列:
FLTRSEYDRG VNTFSPEGRL FQVEYAIEAI KLGSTAIGIQ TSEGVCLAVE KRITSPLMEP SSIEKIVEID AHIGCAMSGL IADAKTLID KARVETQNHW FTYNETMTVE SVTQAVSNLA LQFGEEDADP GAMSRPFGVA LLFGGVDEKG PQLFHMDPSG T FVQCDARA IGSASEGAQS SLQEVYHKSM TLKEAIKSSL IILKQVMEEK LNATNIELAT VQPGQNFHMF TKEELEEVIK DI

+
分子 #25: Proteasome subunit alpha type-1

分子名称: Proteasome subunit alpha type-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 30.150277 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: QLSKVKFRNQ YDNDVTVWSP QGRIHQIEYA MEAVKQGSAT VGLKSKTHAV LVALKRAQSE LAAHQKKILH VDNHIGISIA GLTADARLL CNFMRQECLD SRFVFDRPLP VSRLVSLIGS KTQIPTQRYG RRPYGVGLLI AGYDDMGPHI FQTCPSANYF D CRAMSIGA ...文字列:
QLSKVKFRNQ YDNDVTVWSP QGRIHQIEYA MEAVKQGSAT VGLKSKTHAV LVALKRAQSE LAAHQKKILH VDNHIGISIA GLTADARLL CNFMRQECLD SRFVFDRPLP VSRLVSLIGS KTQIPTQRYG RRPYGVGLLI AGYDDMGPHI FQTCPSANYF D CRAMSIGA RSQSARTYLE RHMSEFMECN LNELVKHGLR ALRETLPAEQ DLTTKNVSIG IVGKDLEFTI YDDDDVSPFL EG LEERPQR KAQPAQPADE PAEKADEPME H

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分子 #26: Proteasome subunit alpha type-3

分子名称: Proteasome subunit alpha type-3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 28.338057 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: SSIGTGYDLS ASTFSPDGRV FQVEYAMKAV ENSSTAIGIR CKDGVVFGVE KLVLSKLYEE GSNKRLFNVD RHVGMAVAGL LADARSLAD IAREEASNFR SNFGYNIPLK HLADRVAMYV HAYTLYSAVR PFGCSFMLGS YSVNDGAQLY MIDPSGVSYG Y WGCAIGKA ...文字列:
SSIGTGYDLS ASTFSPDGRV FQVEYAMKAV ENSSTAIGIR CKDGVVFGVE KLVLSKLYEE GSNKRLFNVD RHVGMAVAGL LADARSLAD IAREEASNFR SNFGYNIPLK HLADRVAMYV HAYTLYSAVR PFGCSFMLGS YSVNDGAQLY MIDPSGVSYG Y WGCAIGKA RQAAKTEIEK LQMKEMTCRD IVKEVAKIIY IVHDEVKDKA FELELSWVGE LTNGRHEIVP KDIREEAEKY AK ESLKEED ESDDDNM

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分子 #27: Proteasome subunit beta type-6

分子名称: Proteasome subunit beta type-6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 25.246455 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: AATLLAARGA GPAPAWGPEA FTPDWESREV STGTTIMAVQ FDGGVVLGAD SRTTTGSYIA NRVTDKLTPI HDRIFCCRSG SAADTQAVA DAVTYQLGFH SIELNEPPLV HTAASLFKEM CYRYREDLMA GIIIAGWDPQ EGGQVYSVPM GGMMVRQSFA I GGSGSSYI ...文字列:
AATLLAARGA GPAPAWGPEA FTPDWESREV STGTTIMAVQ FDGGVVLGAD SRTTTGSYIA NRVTDKLTPI HDRIFCCRSG SAADTQAVA DAVTYQLGFH SIELNEPPLV HTAASLFKEM CYRYREDLMA GIIIAGWDPQ EGGQVYSVPM GGMMVRQSFA I GGSGSSYI YGYVDATYRE GMTKEECLQF TANALALAME RDGSSGGVIR LAAIAESGVE RQVLLGDQIP KFAVATLPPA

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分子 #28: Proteasome subunit beta type-7

分子名称: Proteasome subunit beta type-7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.869223 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: AAVSVYAPPV GGFSFDNCRR NAVLEADFAK RGYKLPKVRK TGTTIAGVVY KDGIVLGADT RATEGMVVAD KNCSKIHFIS PNIYCCGAG TAADTDMTTQ LISSNLELHS LSTGRLPRVV TANRMLKQML FRYQGYIGAA LVLGGVDVTG PHLYSIYPHG S TDKLPYVT ...文字列:
AAVSVYAPPV GGFSFDNCRR NAVLEADFAK RGYKLPKVRK TGTTIAGVVY KDGIVLGADT RATEGMVVAD KNCSKIHFIS PNIYCCGAG TAADTDMTTQ LISSNLELHS LSTGRLPRVV TANRMLKQML FRYQGYIGAA LVLGGVDVTG PHLYSIYPHG S TDKLPYVT MGSGSLAAMA VFEDKFRPDM EEEEAKNLVS EAIAAGIFND LGSGSNIDLC VISKNKLDFL RPYTVPNKKG TR LGRYRCE KGTTAVLTEK ITPLEIEVLE ETVQTMDTS

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分子 #29: Proteasome subunit beta type-3

分子名称: Proteasome subunit beta type-3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.841701 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: SIMSYNGGAV MAMKGKNCVA IAADRRFGIQ AQMVTTDFQK IFPMGDRLYI GLAGLATDVQ TVAQRLKFRL NLYELKEGRQ IKPYTLMSM VANLLYEKRF GPYYTEPVIA GLDPKTFKPF ICSLDLIGCP MVTDDFVVSG TCAEQMYGMC ESLWEPNMDP D HLFETISQ ...文字列:
SIMSYNGGAV MAMKGKNCVA IAADRRFGIQ AQMVTTDFQK IFPMGDRLYI GLAGLATDVQ TVAQRLKFRL NLYELKEGRQ IKPYTLMSM VANLLYEKRF GPYYTEPVIA GLDPKTFKPF ICSLDLIGCP MVTDDFVVSG TCAEQMYGMC ESLWEPNMDP D HLFETISQ AMLNAVDRDA VSGMGVIVHI IEKDKITTRT LKARMD

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分子 #30: Proteasome subunit beta type-2

分子名称: Proteasome subunit beta type-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.864277 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEYLIGIQGP DYVLVASDRV AASNIVQMKD DHDKMFKMSE KILLLCVGEA GDTVQFAEYI QKNVQLYKMR NGYELSPTAA ANFTRRNLA DCLRSRTPYH VNLLLAGYDE HEGPALYYMD YLAALAKAPF AAHGYGAFLT LSILDRYYTP TISRERAVEL L RKCLEELQ ...文字列:
MEYLIGIQGP DYVLVASDRV AASNIVQMKD DHDKMFKMSE KILLLCVGEA GDTVQFAEYI QKNVQLYKMR NGYELSPTAA ANFTRRNLA DCLRSRTPYH VNLLLAGYDE HEGPALYYMD YLAALAKAPF AAHGYGAFLT LSILDRYYTP TISRERAVEL L RKCLEELQ KRFILNLPTF SVRIIDKNGI HDLDNISFPK QGS

+
分子 #31: Proteasome subunit beta type-5

分子名称: Proteasome subunit beta type-5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 28.379053 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: ALASVLERPL PVNQRGFFGL GGRADLLDLG PGSLSDGLSL AAPGWGVPEE PGIEMLHGTT TLAFKFRHGV IVAADSRATA GAYIASQTV KKVIEINPYL LGTMAGGAAD CSFWERLLAR QCRIYELRNK ERISVAAASK LLANMVYQYK GMGLSMGTMI C GWDKRGPG ...文字列:
ALASVLERPL PVNQRGFFGL GGRADLLDLG PGSLSDGLSL AAPGWGVPEE PGIEMLHGTT TLAFKFRHGV IVAADSRATA GAYIASQTV KKVIEINPYL LGTMAGGAAD CSFWERLLAR QCRIYELRNK ERISVAAASK LLANMVYQYK GMGLSMGTMI C GWDKRGPG LYYVDSEGNR ISGATFSVGS GSVYAYGVMD RGYSYDLEVE QAYDLARRAI YQATYRDAYS GGAVNLYHVR ED GWIRVSS DNVADLHEKY SGSTP

+
分子 #32: Proteasome subunit beta type-1

分子名称: Proteasome subunit beta type-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 26.391201 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: LSSTAMYSAP GRDLGMEPHR AAGPLQLRFS PYVFNGGTIL AIAGEDFAIV ASDTRLSEGF SIHTRDSPKC YKLTDKTVIG CSGFHGDCL TLTKIIEARL KMYKHSNNKA MTTGAIAAML STILYSRRFF PYYVYNIIGG LDEEGKGAVY SFDPVGSYQR D SFKAGGSA ...文字列:
LSSTAMYSAP GRDLGMEPHR AAGPLQLRFS PYVFNGGTIL AIAGEDFAIV ASDTRLSEGF SIHTRDSPKC YKLTDKTVIG CSGFHGDCL TLTKIIEARL KMYKHSNNKA MTTGAIAAML STILYSRRFF PYYVYNIIGG LDEEGKGAVY SFDPVGSYQR D SFKAGGSA SAMLQPLLDN QVGFKNMQNV EHVPLSLDRA MRLVKDVFIS AAERDVYTGD ALRICIVTKE GIREETVSLR KD

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分子 #33: Proteasome subunit beta type-4

分子名称: Proteasome subunit beta type-4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: proteasome endopeptidase complex
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.099986 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: EAFLGSRSGL WAGGPAPGQF YRIPSTPDSF MDPASALYRG PITRTQNPMV TGTSVLGVKF EGGVVIAADM LGSYGSLARF RNISRIMRV NNSTMLGASG DYADFQYLKQ VLGQMVIDEE LLGDGHSYSP RAIHSWLTRA MYSRRSKMNP LWNTMVIGGY A DGESFLGY ...文字列:
EAFLGSRSGL WAGGPAPGQF YRIPSTPDSF MDPASALYRG PITRTQNPMV TGTSVLGVKF EGGVVIAADM LGSYGSLARF RNISRIMRV NNSTMLGASG DYADFQYLKQ VLGQMVIDEE LLGDGHSYSP RAIHSWLTRA MYSRRSKMNP LWNTMVIGGY A DGESFLGY VDMLGVAYEA PSLATGYGAY LAQPLLREVL EKQPVLSQTE ARDLVERCMR VLYYRDARSY NRFQIATVTE KG VEIEGPL STETNWDIAH MISGFE

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分子 #34: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 34 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #35: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 35 / コピー数: 3 / 式: ATP
分子量理論値: 507.181 Da
Chemical component information

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM

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分子 #36: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 36 / コピー数: 1 / 式: ADP
分子量理論値: 427.201 Da
Chemical component information

ChemComp-ADP:
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / ADP, エネルギー貯蔵分子*YM

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
グリッド詳細: unspecified
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 44.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 71651
初期 角度割当タイプ: COMMON LINE
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る