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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-8533 | |||||||||
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タイトル | MalE MalFGK2 Apo | |||||||||
![]() | MalE MalFGK2 Apo | |||||||||
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機能・相同性 | ![]() ABC-type maltose transporter / ABC-type maltose transporter activity / negative regulation of maltose transport / enzyme IIA-maltose transporter complex / negative regulation of transmembrane transport / maltose transport complex / maltose transport / maltodextrin transmembrane transport / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex, substrate-binding subunit-containing / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex ...ABC-type maltose transporter / ABC-type maltose transporter activity / negative regulation of maltose transport / enzyme IIA-maltose transporter complex / negative regulation of transmembrane transport / maltose transport complex / maltose transport / maltodextrin transmembrane transport / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex, substrate-binding subunit-containing / ATP-binding cassette (ABC) transporter complex / DNA-binding transcription factor binding / DNA damage response / ATP hydrolysis activity / ATP binding / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / ネガティブ染色法 / 解像度: 21.0 Å | |||||||||
![]() | Fabre L / Bao H / Innes J / Duong F / Rouiller I | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Negative Stain Single-particle EM of the Maltose Transporter in Nanodiscs Reveals Asymmetric Closure of MalK and Catalytic Roles of ATP, MalE, and Maltose. 著者: Lucien Fabre / Huan Bao / James Innes / Franck Duong / Isabelle Rouiller / ![]() 要旨: The MalE-MalFGK complex is one of the best characterized members of the large and ubiquitous family of ATP-binding cassette (ABC) transporters. It is composed of a membrane-spanning heterodimer, ...The MalE-MalFGK complex is one of the best characterized members of the large and ubiquitous family of ATP-binding cassette (ABC) transporters. It is composed of a membrane-spanning heterodimer, MalF-MalG; a homodimeric ATPase, MalK; and a periplasmic maltose receptor, MalE. Opening and closure of MalK is coupled to conformational changes in MalF-MalG and the alternate exposition of the substrate-binding site to either side of the membrane. To further define this alternate access mechanism and the impact of ATP, MalE, and maltose on the conformation of the transporter during the transport cycle, we have reconstituted MalFGK in nanodiscs and analyzed its conformations under 10 different biochemical conditions using negative stain single-particle EM. EM map results (at 15-25 Å resolution) indicate that binding of ATP to MalK promotes an asymmetric, semi-closed conformation in accordance with the low ATPase activity of MalFGK In the presence of MalE, the MalK dimer becomes fully closed, gaining the ability to hydrolyze ATP. In the presence of ADP or maltose, MalE·MalFGK remains essentially in a semi-closed symmetric conformation, indicating that release of these ligands is required for the return to the initial state. Taken together, this structural information provides a rationale for the stimulation of MalK ATPase activity by MalE as well as by maltose. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 5 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.2 KB 13.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 70.5 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | MalE MalFGK2 Apo | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.23 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : MalE-x-MalFGK2 Apo
全体 | 名称: MalE-x-MalFGK2 Apo |
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要素 |
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-超分子 #1: MalE-x-MalFGK2 Apo
超分子 | 名称: MalE-x-MalFGK2 Apo / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 詳細: Maltose Transporter MalFGK2 in complex with MalE in absence of nucleotide |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() 組換プラスミド: pBAD22 |
-実験情報
-構造解析
手法 | ネガティブ染色法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 0.05 mg/mL | ||||||||||||||||||
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緩衝液 | pH: 8 構成要素:
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染色 | タイプ: NEGATIVE / 材質: Uranyl Formate / 詳細: Freshly prepared 1.5% uranyl formate (pH 5) | ||||||||||||||||||
グリッド | メッシュ: 400 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 雰囲気: AIR | ||||||||||||||||||
詳細 | MalFGK2 reconstituted in nanodiscs at a molar ratio MalFGK2:MSP1D1:lipid (DOPC)of 1:3:60. MalE cross-linked to MalFGK2. Complex incubated with ADP. |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TECNAI F20 |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN ULTRASCAN 4000 (4k x 4k) 平均電子線量: 20.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 倍率(補正後): 134010 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1.4 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.7 µm |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: SIDE ENTRY, EUCENTRIC |
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai F20 / 画像提供: FEI Company |