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- EMDB-8128: Architecture of ovine respiratory supercomplex (I-III2-IV) confor... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-8128
タイトルArchitecture of ovine respiratory supercomplex (I-III2-IV) conformation loose
マップデータNone
試料
  • 複合体: Ovine respiratory supercomplex (I-III2-IV), conformation loose
    • 複合体: Respiratory complex IV
      • タンパク質・ペプチド: x 13種
    • 複合体: Respiratory complex III
      • タンパク質・ペプチド: x 11種
    • 複合体: Respiratory complex I
      • タンパク質・ペプチド: x 44種
機能・相同性
機能・相同性情報


: / : / regulation of oxidative phosphorylation / respiratory chain complex IV assembly / mitochondrial respirasome assembly / : / respiratory chain complex IV / cytochrome-c oxidase / respiratory chain complex III / oxidative phosphorylation ...: / : / regulation of oxidative phosphorylation / respiratory chain complex IV assembly / mitochondrial respirasome assembly / : / respiratory chain complex IV / cytochrome-c oxidase / respiratory chain complex III / oxidative phosphorylation / quinol-cytochrome-c reductase / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / quinol-cytochrome-c reductase activity / cytochrome-c oxidase activity / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / electron transport coupled proton transport / membrane => GO:0016020 / ATP synthesis coupled electron transport / metalloendopeptidase activity / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / electron transfer activity / mitochondrial inner membrane / oxidoreductase activity / copper ion binding / heme binding / ubiquitin protein ligase binding / proteolysis / nucleoplasm / metal ion binding
類似検索 - 分子機能
Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Single alpha-helix domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex, 6.4kD protein / Cytochrome c oxidase, subunit 8 / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs / Cytochrome c oxidase, subunit 8 superfamily / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs superfamily / : / Cytochrome oxidase c subunit VIII / Cytochrome c oxidase subunit VIc ...Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Single alpha-helix domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex, 6.4kD protein / Cytochrome c oxidase, subunit 8 / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs / Cytochrome c oxidase, subunit 8 superfamily / Mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc/VIIs superfamily / : / Cytochrome oxidase c subunit VIII / Cytochrome c oxidase subunit VIc / Cytochrome c oxidase subunit VIIa, metazoa / Cytochrome C oxidase, subunit VIIB / Cytochrome c oxidase subunit IV / Cytochrome C oxidase, subunit VIIB domain superfamily / Cytochrome c oxidase, subunit VIIa superfamily / Cytochrome C oxidase chain VIIB / Cytochrome c oxidase, subunit VIa, conserved site / Cytochrome c oxidase subunit VIa signature. / Cytochrome c oxidase, subunit VIa / Cytochrome c oxidase, subunit VIa superfamily / Cytochrome c oxidase subunit VIa / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8kDa, N-terminal / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8 kDa, N-terminal / Cytochrome c oxidase, subunit VIb / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding region signature. / Cytochrome c oxidase subunit VIIc / Cytochrome c oxidase subunit IV family / Cytochrome c oxidase, subunit VIb superfamily / Cytochrome c oxidase subunit VIIc superfamily / Cytochrome c oxidase subunit IV superfamily / Cytochrome c oxidase subunit VIIc / Cytochrome c oxidase subunit IV / Cytochrome c oxidase subunit 2, C-terminal / Cytochrome oxidase c subunit VIb / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI superfamily / Cytochrome c oxidase subunit Va / Cytochrome c oxidase subunit VII / Cytochrome c oxidase subunit VII / Globular protein, non-globular alpha/beta subunit / Cytochrome c oxidase, subunit Vb / Cytochrome c oxidase subunit III domain / Cytochrome c oxidase subunit Vb / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding domain profile. / Cytochrome c oxidase, subunit II / Cytochrome c oxidase, subunit Vb superfamily / Cytochrome b-c1 complex, subunit 6 / Cytochrome c oxidase subunit I domain / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / UcrQ family / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain / Cytochrome oxidase subunit II transmembrane region profile. / Cytochrome bc1 complex subunit Rieske, transmembrane domain superfamily / Cytochrome c oxidase subunit III / Cytochrome c oxidase subunit III-like / Cytochrome c oxidase, subunit III, 4-helical bundle / Cytochrome c oxidase subunit III / Heme-copper oxidase subunit III family profile. / Cytochrome c oxidase subunit III-like superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex 14kD subunit / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, transmembrane domain / Ubiquinol cytochrome reductase transmembrane region / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain superfamily / Cytochrome c/quinol oxidase subunit II / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase, UQCRX/QCR9 like / Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal / : / Cytochrome b / Cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulphur subunit / : / Cytochrome c1 / Cytochrome C1 family / Cytochrome c oxidase, subunit I, copper-binding site / Heme-copper oxidase catalytic subunit, copper B binding region signature. / Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain / Cytochrome oxidase subunit I profile. / : / Cytochrome b/b6, C-terminal / Cytochrome b(C-terminal)/b6/petD / Cytochrome b/b6 C-terminal region profile. / Peptidase M16, zinc-binding site / Insulinase family, zinc-binding region signature. / Cytochrome C oxidase subunit II, periplasmic domain / Cytochrome c oxidase subunit I / Cytochrome c oxidase-like, subunit I superfamily / Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I / Cytochrome b/b6, C-terminal domain superfamily / Cytochrome b/b6/petB / Cytochrome c oxidase subunit II-like C-terminal / Cytochrome oxidase subunit II copper A binding domain profile. / Rieske iron-sulphur protein, C-terminal
類似検索 - ドメイン・相同性
Cytochrome b-c1 complex subunit 6 / Cytochrome c oxidase subunit 3 / Cytochrome c oxidase subunit 1 / Cytochrome c oxidase subunit 2 / Cytochrome b / Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit / Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 ...Cytochrome b-c1 complex subunit 6 / Cytochrome c oxidase subunit 3 / Cytochrome c oxidase subunit 1 / Cytochrome c oxidase subunit 2 / Cytochrome b / Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit / Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / Complex III subunit 9 / Cytochrome c oxidase subunit 8 / Cytochrome c oxidase subunit / Cytochrome c oxidase subunit 4 / Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit 6C / cytochrome c1, heme protein, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Ovis aries (ヒツジ) / Sheep (ヒツジ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 6.7 Å
データ登録者Sazanov LA / Letts JA / Fiedorczuk K
引用ジャーナル: Nature / 年: 2016
タイトル: The architecture of respiratory supercomplexes.
著者: James A Letts / Karol Fiedorczuk / Leonid A Sazanov /
要旨: Mitochondrial electron transport chain complexes are organized into supercomplexes responsible for carrying out cellular respiration. Here we present three architectures of mammalian (ovine) ...Mitochondrial electron transport chain complexes are organized into supercomplexes responsible for carrying out cellular respiration. Here we present three architectures of mammalian (ovine) supercomplexes determined by cryo-electron microscopy. We identify two distinct arrangements of supercomplex CICIIICIV (the respirasome)-a major 'tight' form and a minor 'loose' form (resolved at the resolution of 5.8 Å and 6.7 Å, respectively), which may represent different stages in supercomplex assembly or disassembly. We have also determined an architecture of supercomplex CICIII at 7.8 Å resolution. All observed density can be attributed to the known 80 subunits of the individual complexes, including 132 transmembrane helices. The individual complexes form tight interactions that vary between the architectures, with complex IV subunit COX7a switching contact from complex III to complex I. The arrangement of active sites within the supercomplex may help control reactive oxygen species production. To our knowledge, these are the first complete architectures of the dominant, physiologically relevant state of the electron transport chain.
履歴
登録2016年3月19日-
ヘッダ(付随情報) 公開2016年10月5日-
マップ公開2016年10月5日-
更新2017年7月12日-
現状2017年7月12日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.11
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.11
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-5j7y
  • 表面レベル: 0.11
  • UCSF Chimeraによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_8128.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_8128.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 465.5 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈None
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.72 Å/pix.
x 496 pix.
= 853.12 Å		1.72 Å/pix.
x 496 pix.
= 853.12 Å		1.72 Å/pix.
x 496 pix.
= 853.12 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.72 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.094 / ムービー #1: 0.11
最小 - 最大-0.17258874 - 0.5524469
平均 (標準偏差)0.00002703683 (±0.016612468)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ496496496
Spacing496496496
セルA=B=C: 853.12 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.721.721.72
M x/y/z496496496
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z853.120853.120853.120
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ00-41
NX/NY/NZ737384
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS496496496
D min/max/mean-0.1730.5520.000

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Ovine respiratory supercomplex (I-III2-IV), conformation loose

全体名称: Ovine respiratory supercomplex (I-III2-IV), conformation loose
要素
  • 複合体: Ovine respiratory supercomplex (I-III2-IV), conformation loose
    • 複合体: Respiratory complex IV
      • タンパク質・ペプチド: COX1
      • タンパク質・ペプチド: COX2
      • タンパク質・ペプチド: COX3
      • タンパク質・ペプチド: COX4
      • タンパク質・ペプチド: COX5A
      • タンパク質・ペプチド: COX5B
      • タンパク質・ペプチド: COX6A2
      • タンパク質・ペプチド: COX6C
      • タンパク質・ペプチド: COX7A
      • タンパク質・ペプチド: COX7B
      • タンパク質・ペプチド: COX8B
      • タンパク質・ペプチド: COX6B1
      • タンパク質・ペプチド: COX7C
    • 複合体: Respiratory complex III
      • タンパク質・ペプチド: Complex III 6.4 kDa
      • タンパク質・ペプチド: Complex III 7.2 kDa
      • タンパク質・ペプチド: Complex III 8 kDa
      • タンパク質・ペプチド: Complex III 14 kDa
      • タンパク質・ペプチド: Complex III 11 kDa
      • タンパク質・ペプチド: Complex III Core 1
      • タンパク質・ペプチド: Complex III Core 2
      • タンパク質・ペプチド: Complex III Cytochrome b
      • タンパク質・ペプチド: Complex III Cytochrome c1
      • タンパク質・ペプチド: Complex III Rieske
      • タンパク質・ペプチド: Complex III QP-C
    • 複合体: Respiratory complex I
      • タンパク質・ペプチド: 10 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 13 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 15 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 18 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 24 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 30 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 39 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 42 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 49 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 51 kDa
      • タンパク質・ペプチド: 75 kDa
      • タンパク質・ペプチド: AGGG
      • タンパク質・ペプチド: ASHI
      • タンパク質・ペプチド: B8
      • タンパク質・ペプチド: B9
      • タンパク質・ペプチド: B12
      • タンパク質・ペプチド: B13
      • タンパク質・ペプチド: B14
      • タンパク質・ペプチド: B14.5A
      • タンパク質・ペプチド: B14.5B
      • タンパク質・ペプチド: B14.7
      • タンパク質・ペプチド: B15
      • タンパク質・ペプチド: B16.6
      • タンパク質・ペプチド: B17
      • タンパク質・ペプチド: B17.2
      • タンパク質・ペプチド: B18
      • タンパク質・ペプチド: B22
      • タンパク質・ペプチド: ESSS
      • タンパク質・ペプチド: KFYI
      • タンパク質・ペプチド: MNLL
      • タンパク質・ペプチド: MWFE
      • タンパク質・ペプチド: ND1
      • タンパク質・ペプチド: ND2
      • タンパク質・ペプチド: ND3
      • タンパク質・ペプチド: ND4
      • タンパク質・ペプチド: ND4L
      • タンパク質・ペプチド: ND5
      • タンパク質・ペプチド: ND6
      • タンパク質・ペプチド: PDSW
      • タンパク質・ペプチド: PGIV
      • タンパク質・ペプチド: PSST
      • タンパク質・ペプチド: SDAP
      • タンパク質・ペプチド: SGDH
      • タンパク質・ペプチド: TYKY

+
超分子 #1: Ovine respiratory supercomplex (I-III2-IV), conformation loose

超分子名称: Ovine respiratory supercomplex (I-III2-IV), conformation loose
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
由来(天然)生物種: Ovis aries (ヒツジ)
分子量理論値: 1.0 MDa

+
超分子 #2: Respiratory complex IV

超分子名称: Respiratory complex IV / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#13 / 詳細: Monomer
由来(天然)生物種: Ovis aries (ヒツジ)

+
超分子 #3: Respiratory complex III

超分子名称: Respiratory complex III / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #14-#24 / 詳細: Dimer
由来(天然)生物種: Ovis aries (ヒツジ)

+
超分子 #4: Respiratory complex I

超分子名称: Respiratory complex I / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #25-#68 / 詳細: Monomer
由来(天然)生物種: Ovis aries (ヒツジ)

+
分子 #1: COX1

分子名称: COX1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO
配列文字列: MFINRWLFST NHKDIGTLYL LFGAWAGMVG TALSLLIRAE LGQPGTLLGD DQIYNVIVTA HAFVMIFFM VMPIMIGGFG NWLVPLMIGA PDMAFPRMNN MSFWLLPPSF LLLLASSMVE A GAGTGWTV YPPLAGNLAH AGASVDLTIF SLHLAGVSSI LGAINFITTI ...文字列:
MFINRWLFST NHKDIGTLYL LFGAWAGMVG TALSLLIRAE LGQPGTLLGD DQIYNVIVTA HAFVMIFFM VMPIMIGGFG NWLVPLMIGA PDMAFPRMNN MSFWLLPPSF LLLLASSMVE A GAGTGWTV YPPLAGNLAH AGASVDLTIF SLHLAGVSSI LGAINFITTI INMKPPAMSQ YQ TPLFVWS VLITAVLLLL SLPVLAAGIT MLLTDRNLNT TFFDPAGGGD PILYQHLFWF FGH PEVYIL ILPGFGMISH IVTYYSGKKE PFGYMGMVWA MMSIGFLGFI VWAHHMFTVG MDVD TRAYF TSATMIIAIP TGVKVFSWLA TLHGGNIKWS PAMMWALGFI FLFTVGGLTG IVLAN SSLD IVLHDTYYVV AHFHYVLSMG AVFAIMGGFV HWFPLFSGYT LNDTWAKIHF AIMFVG VNM TFFPQHFLGL SGMPRRYSDY PDAYTMWNTI SSMGSFISLT AVMLMIFIIW EAFASKR EV LTVDLTTTNL EWLNGCPPPY HTFEEPTYVN LK

+
分子 #2: COX2

分子名称: COX2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: MAYPMQLGFQ DATSPIMEEL LHFHDHTLMI VFLISSLVLY IISLMLTTKL THTSTMDAQE VETIWTILP AIILIMIALP SLRILYMMDE INNPSLTVKT MGHQWYWSYE YTDYEDLSFD S YMIPTSEL KPGELRLLEV DNRVVLPMEM TVRMLISSED VLPSWAVPSL ...文字列:
MAYPMQLGFQ DATSPIMEEL LHFHDHTLMI VFLISSLVLY IISLMLTTKL THTSTMDAQE VETIWTILP AIILIMIALP SLRILYMMDE INNPSLTVKT MGHQWYWSYE YTDYEDLSFD S YMIPTSEL KPGELRLLEV DNRVVLPMEM TVRMLISSED VLPSWAVPSL GLKTDAIPGR LN QTTLMST RPGLFYGQCS EICGSNHSFM PIVLELVPLK YFEKWSASML

+
分子 #3: COX3

分子名称: COX3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: THQTHAYHMV NPSPWPLTGA LSALLMTSGL IMWFHFNSTA LLTLGLTTNM LTMYQWWRDV IRESTFQGH HTPAVQKGLR YGMILFIISE VLFFTGFFWA FYHSSLAPTP ELGGCWPPTG I HPLNPLEV PLLNTSVLLA SGVSITWAHH SLMEGNRYHM LQALFITIAL ...文字列:
THQTHAYHMV NPSPWPLTGA LSALLMTSGL IMWFHFNSTA LLTLGLTTNM LTMYQWWRDV IRESTFQGH HTPAVQKGLR YGMILFIISE VLFFTGFFWA FYHSSLAPTP ELGGCWPPTG I HPLNPLEV PLLNTSVLLA SGVSITWAHH SLMEGNRYHM LQALFITIAL GVYFTLLQAS EY YEAPFTI SDGVYGSTFF VATGFHGLHV IIGSTFLIVC FFRQLKFHFT SSHHFGFEAA AWY WHFVDV VWLFLYMSIY WWGS

+
分子 #4: COX4

分子名称: COX4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AHGSVVKSED YALPSYVDRR DYPLPDVAHV KNLSASQKAL KEKEKASWSS LSIDEKVELY RLKFKESFA EMNRSTNEWK TVVGAAMFFI GFTALLLIWE KHYVYGPIPH TFEEEWVAKQ T KRMLDMKV APVQGFSAKW DYDKNEWKK

+
分子 #5: COX5A

分子名称: COX5A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
SHGSHETDEE FDARWVTYFN KPDIDAWELR KGMNTLVGYD LVPEPKIIDA ALRACRRLND FASAVRILE VVKDKAGPHK EIYPYVIQEL RPTLNELGIS TPEELGLDKV

+
分子 #6: COX5B

分子名称: COX5B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
ASGGGVPTDE EQATGLEREV MLAARKGQDP YNILAPKATS GTKEDPNLVP SISNKRIVGC ICEEDNSTV IWFWLHKGEA QRCPSCGTHY KLVPHQLAH

+
分子 #7: COX6A2

分子名称: COX6A2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
ASAAKGEHGG TGARTWRFLT FALALPSVAL CTLNSWLHSG HRERPEFIPY HHLRIRTKPF SWGDGNHTF FHNPRVNPLP TGYEKP

+
分子 #8: COX6C

分子名称: COX6C / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
STALAKPQMR GLLAKRLRFH IVGAFMVSLG FATFYKFAVA EKRKKAYADF YRNYDSMKDF EEMRKAGIF QSAK

+
分子 #9: COX7A

分子名称: COX7A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
LENRVAEKQK LFQEDNGLPV HLKGGATDNI LYRVTMTLCL GGTLYSLYCL GWASFPHKK

+
分子 #10: COX7B

分子名称: COX7B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
IHQKRAPDFH DKYGNAVLAS GATFHVAVWI YTATQIGIEW NPSPVGRVTP KEWREQ

+
分子 #11: COX8B

分子名称: COX8B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
ITAKPAKTPT SPKEQAIGLS VTFLSFLLPA GWVLYHLDNY KKSSAA

+
分子 #12: COX6B1

分子名称: COX6B1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AEDIQTKIKN YQTAPFDSRF PNQNQTRNCW QNYLDFHRCE KAMTAKGGDV SVCEWYRRVY KSLCPISWV STWDDRRAEG TFPGKI

+
分子 #13: COX7C

分子名称: COX7C / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
SHYEEGPGKN IPFSVENKWR LLAMMTLFFG SGFAAPFFIV RHQLLKK

+
分子 #14: Complex III 6.4 kDa

分子名称: Complex III 6.4 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MLTRFLGPRY RQLARNWVPT ASLWGAVGAV GLVWATDWRL ILDWVPYING KFKKDD

+
分子 #15: Complex III 7.2 kDa

分子名称: Complex III 7.2 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AAPTLTARLY SLLFRRTSTF ALTIVVGALF FERAFDQGAD AIYEHINEGK LWKHIKHKYE NKE

+
分子 #16: Complex III 8 kDa

分子名称: Complex III 8 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MLSVAARSGP FAPVLSATSR GVAGALRPLV QAAVPATSES PVLDLKRSVL CRESLRGQAA GRPLVASVG LNVPASVRY

+
分子 #17: Complex III 14 kDa

分子名称: Complex III 14 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AGRPAVSASS KWLEGIRKWY YNAAGFNKLG LMRDDTIHEN DDVKEAIRRL PENLYNDRVF RIKRALDLS MRQQILPKEQ WTKYEEDKFY LEPYLKEVIR ERKEREEWAK K

+
分子 #18: Complex III 11 kDa

分子名称: Complex III 11 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
GDPKEEEEEE EELVDPLTTV REQCEQLEKC VKARERLELC DERVSSRSQT EEDCTEELFD FLHARDHCV AHKLFNSLK

+
分子 #19: Complex III Core 1

分子名称: Complex III Core 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: TATYAQALQS VPETQVSQLD NGLRVASEQS SQPTCTVGVW IDAGSRYETE KNNGAGYFVE HLAFKGTKN RPGNALEKEV ESMGAHLNAY STREHTAYYI KALSKDLPKA VELLADIVQN C SLEDSQIE KERDVILQEL QENDTSMRDV VFNYLHATAF QGTPLAQSVE ...文字列:
TATYAQALQS VPETQVSQLD NGLRVASEQS SQPTCTVGVW IDAGSRYETE KNNGAGYFVE HLAFKGTKN RPGNALEKEV ESMGAHLNAY STREHTAYYI KALSKDLPKA VELLADIVQN C SLEDSQIE KERDVILQEL QENDTSMRDV VFNYLHATAF QGTPLAQSVE GPSENVRKLS RA DLTEYLS RHYKAPRMVL AAAGGLEHRQ LLDLAQKHFS GLSGTYDEDA VPTLTPCRFT GSE IRHRED GLPLAHVAIA VEGPGWANPD NVALQVANAI IGHYDCTYGG GMHLSSPLAS VAVT NKLCQ SFQTFNICYA DTGLLGAHFV CDHMSIDDMM FVLQGQWMRL CTSATESEVV RGKNL LRNA LVSHLDGTTP VCEDIGRSLL TYGRRIPLAE WESRIAEVDA RVVREVCSKY FYDQCP AVA GFGPIEQLPD YNRIRSGMFW LRF

+
分子 #20: Complex III Core 2

分子名称: Complex III Core 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: SLKVAPKAKA TAAPAGVPQH PQDLEFTRLP NGLVIASLEN YAPASRIGLF IKAGSRYENF NNLGTSHLL RLASSLTTKG ASSFKITRGI EAVGGKLSVT STRENMAYTV ECLRDDVDIL M EFLLNVTT APEFRRWEVA ALQSQLRIDK AVAFQNPQAH VIENLHAAAY ...文字列:
SLKVAPKAKA TAAPAGVPQH PQDLEFTRLP NGLVIASLEN YAPASRIGLF IKAGSRYENF NNLGTSHLL RLASSLTTKG ASSFKITRGI EAVGGKLSVT STRENMAYTV ECLRDDVDIL M EFLLNVTT APEFRRWEVA ALQSQLRIDK AVAFQNPQAH VIENLHAAAY RNALANSLYC PD YRIGKVT PDELHDYVQN HFTSARMALI GLGVSHPVLK QVAEQFLNIR GGLGLSGAKA KYR GGEIRE QNGDSLVHAA LVAESAAIGS AEANAFSVLQ HVLGAGPHVK RGSNATSSLY QAVA KGVHQ PFDVSAFNAS YSDSGLFGFY TISQAASAGD VIKAAYNQVK TIAQGNLSNP DVQAA KNKL KAGYLMSVES SEGFLDEVGC QALAAGSYTP PSTVLQQIDA VADADVINAA KKFVSG RKS MAASGNLGHT PFIDEL

+
分子 #21: Complex III Cytochrome b

分子名称: Complex III Cytochrome b / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: MINIRKTHPL MKIVNNAFID LPAPSNISSW WNFGSLLGIC LILQILTGLF LAMHYTPDTT TAFSSVTHI CRDVNYGWII RYMHANGASM FFICLFMHVG RGLYYGSYTF LETWNIGVIL L FATMATAF MGYVLPWGQM SFWGATVITN LLSAIPYIGT NLVEWIWGGF ...文字列:
MINIRKTHPL MKIVNNAFID LPAPSNISSW WNFGSLLGIC LILQILTGLF LAMHYTPDTT TAFSSVTHI CRDVNYGWII RYMHANGASM FFICLFMHVG RGLYYGSYTF LETWNIGVIL L FATMATAF MGYVLPWGQM SFWGATVITN LLSAIPYIGT NLVEWIWGGF SVDKATLTRF FA FHFISPF IIAALAMVHL LFLHETGSNN PTGIPSDTDK IPFHPYYTIK DILGAILLIL ILM LLVLFT PDLLGDPDNY TPANPLNTPP HIKPEWYFLF AYAILRSIPN KLGGVLALIL SILV LVIMP LLHTSKQRSM MFRPISQCMF WILVADLLTL TWIGGQPVEH PYIIIGQLAS IMYFL IILV MMPVASIIEN NLLKW

+
分子 #22: Complex III Cytochrome c1

分子名称: Complex III Cytochrome c1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: SDLELHPPSY PWSHRGLLSS LDHTSIRRGF QVYKQVCSSC HSMDYVAYRH LVGVCYTEDE AKALAEEVE VQDGPNEDGE MFMRPGKLSD YFPKPYPNPE AARAANNGAL PPDLSYIVRA R HGGEDYVF SLLTGYCEPP TGVSLREGLY FNPYFPGQAI GMAPPIYNEV ...文字列:
SDLELHPPSY PWSHRGLLSS LDHTSIRRGF QVYKQVCSSC HSMDYVAYRH LVGVCYTEDE AKALAEEVE VQDGPNEDGE MFMRPGKLSD YFPKPYPNPE AARAANNGAL PPDLSYIVRA R HGGEDYVF SLLTGYCEPP TGVSLREGLY FNPYFPGQAI GMAPPIYNEV LEFDDGTPAT MS QVAKDVC TFLRWAAEPE HDHRKRMGLK MLLMMGLLLP LVYAMKRHKW SVLKSRKLAY RPP K

+
分子 #23: Complex III Rieske

分子名称: Complex III Rieske / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: SHTDIKVPDF SDYRRPEVLD STKSSKESSE ARKGFSYLIT ATTTVGVAYA AKNVVSQFVS SMSASADVL AMSKIEIKLS DIPEGKNMAF KWRGKPLFVR HRTKKEIDQE AAVEVSQLRD P QHDLERVK KPEWVILIGV CTHLGCVPIA NAGDFGGYYC PCHGSHYDAS ...文字列:
SHTDIKVPDF SDYRRPEVLD STKSSKESSE ARKGFSYLIT ATTTVGVAYA AKNVVSQFVS SMSASADVL AMSKIEIKLS DIPEGKNMAF KWRGKPLFVR HRTKKEIDQE AAVEVSQLRD P QHDLERVK KPEWVILIGV CTHLGCVPIA NAGDFGGYYC PCHGSHYDAS GRIRKGPAPL NL EVPSYEF TSDDMVIVG

+
分子 #24: Complex III QP-C

分子名称: Complex III QP-C / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
GRQFGHLTRV RHVITYSLSP FEQRAFPHYF SKGIPNVLRR TRACILRVAP PFVVFYLVYT WGTQEFEKS KRKNPAAYEN DK

+
分子 #25: 10 kDa

分子名称: 10 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
SAESGKNEKG LPPNPKKQSP PKKPASAAPT EPFDNTTYKN LQHHDYSTYT FLDLNLDLSK FRMPQPSSG RESPRH

+
分子 #26: 13 kDa

分子名称: 13 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
GVRTSPTGEK VTHTGQVYDD EDYRRVRFVG RQKEVNENFA IDLIAEQPVS QVGSRVISCD GGGGALGHP RVYINLDKET KTGTCGYCGL QFRQQHH

+
分子 #27: 15 kDa

分子名称: 15 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
PFFDVQKKLG VDLDHWMTIQ SAEQPHRIPA RCHAFEKEWI ECAHGIGSIR AEKECKIEFE DFRECLLRQ KTMKRLNAIK RQRDKLIKEG KYTPPPHHSG QEDLRP

+
分子 #28: 18 kDa

分子名称: 18 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AQDQTRDTQL ITVDEKLDIT TLTGVPEEHI KTRKARIFVP ARNNMQSGVN NTKKWKMEFD TRERWENPL MGWASTADPL SNLVLTFSTK EDAIAFAEKN GWSYDVEERK VPKPKSKSYG A NFSWNKRT RVSTK

+
分子 #29: 24 kDa

分子名称: 24 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: GAGGALFVHR DTPKNNPETP FDFTPENYKR IEAIVKNYPE GHKAAAVLPV LDLAQRQNGW LPISAMNKV AEILQVPPMR VYEVATFYTM YNRKPVGKYH IQVCTTTPCM LRNSDSILEA I QKKLGIKV GETTPDKLFT LIEVECLGAC VNAPMVQIND NYYEDLTPKD ...文字列:
GAGGALFVHR DTPKNNPETP FDFTPENYKR IEAIVKNYPE GHKAAAVLPV LDLAQRQNGW LPISAMNKV AEILQVPPMR VYEVATFYTM YNRKPVGKYH IQVCTTTPCM LRNSDSILEA I QKKLGIKV GETTPDKLFT LIEVECLGAC VNAPMVQIND NYYEDLTPKD IEEIIDELKA GK IPKPGPR SGRFSCEPAG GLTSLTEPPK GPGFGVQAGL

+
分子 #30: 30 kDa

分子名称: 30 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: ESASADTRPT VRPRNDVAHK QLSAFGEYVA EILPKYVQQV QVSCFSELEI CIHPDGVIPV LTFLRDHSN AQFKSLADLT AVDIPTRQNR FEIVYNLLSL RFNSRIRVKT YTDELTPVES S VSVYKAAN WYEREIWDMF GVFFANHPDL RRILTDYGFE GHPFRKDFPL ...文字列:
ESASADTRPT VRPRNDVAHK QLSAFGEYVA EILPKYVQQV QVSCFSELEI CIHPDGVIPV LTFLRDHSN AQFKSLADLT AVDIPTRQNR FEIVYNLLSL RFNSRIRVKT YTDELTPVES S VSVYKAAN WYEREIWDMF GVFFANHPDL RRILTDYGFE GHPFRKDFPL SGYVELRYDD EV KRVVAEP VELAQEFRKF DLNSPWEAFP AYRQPPESLK LEAGDKKPEA K

+
分子 #31: 39 kDa

分子名称: 39 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: LHHAVIPHGK GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVNHLGR MGSQVIVPYR CEPYDTMHLR PMGDLGQII FMDWNGRDKD SIRRAVEHSN VVINLVGREW ETKNFDFEDV FVKIPQAIAQ V SKEAGVEK FIHISHLNAD IKSSSKYLRN KAVGEKEVRE TFPEATIIKP ...文字列:
LHHAVIPHGK GGRSSVSGIV ATVFGATGFL GRYLVNHLGR MGSQVIVPYR CEPYDTMHLR PMGDLGQII FMDWNGRDKD SIRRAVEHSN VVINLVGREW ETKNFDFEDV FVKIPQAIAQ V SKEAGVEK FIHISHLNAD IKSSSKYLRN KAVGEKEVRE TFPEATIIKP ADIFGREDRF LN YFANIRW FGGVPLISLG KKTVKQPVYI VDVTKGIINA IKDPDARGKT FAFVGPNRYL LFD LVQYVF AVAHRPFLPY PMPHFAYRWI GRLFEISPFE PWTTRDKVER IHTTDRTLPH LPGL EDLGV QATPLELKAI EVLRRHRTYR LSSEIEDVQP AKTVPASGP

+
分子 #32: 42 kDa

分子名称: 42 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: LQYGPLAYIL GEKTTKKMTE NSKLITVDGN ICSGKSKLAK EVAEKLGLKH FPEAGIHYAD STTGDGKPL PVRFSGNCSL EKFYDDPKSN DGNSYRLQAW LYASRLLQYA DALEHLLSTG Q GVVLERSI YSDFVFLEAM YRQGFIRKQC VDHYNQVKKV TVCEYLPPHV ...文字列:
LQYGPLAYIL GEKTTKKMTE NSKLITVDGN ICSGKSKLAK EVAEKLGLKH FPEAGIHYAD STTGDGKPL PVRFSGNCSL EKFYDDPKSN DGNSYRLQAW LYASRLLQYA DALEHLLSTG Q GVVLERSI YSDFVFLEAM YRQGFIRKQC VDHYNQVKKV TVCEYLPPHV VIYVDVPVSE VQ SRIQKKG NPHEMKITSA YLQDIENVYK GTFLPEMSEK CEVLQYSAWE AEDAEKVVED IQY LKYDKG PWLDQDDRKL HNLRMLVQDK LEVLNYTSIP VFLPEVTIGA HQSDRVFQEF TELP GRKYR AGYNEDVGDK WIWLK

+
分子 #33: 49 kDa

分子名称: 49 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: ARQWQPDVEW AEQYGGAVMY PTKETAHWKP PPWNDVDPPK DTLVSNLTLN FGPQHPAAHG VLRLVMELS GEMVRKCDPH IGLLHRGTEK LIEYKTYLQA LPYFDRLDYV SMMCNEQAYS L AVEKLLNI QPPPRAQWIR VLFGEITRLL NHIMAVTTHA LDIGAMTPFF ...文字列:
ARQWQPDVEW AEQYGGAVMY PTKETAHWKP PPWNDVDPPK DTLVSNLTLN FGPQHPAAHG VLRLVMELS GEMVRKCDPH IGLLHRGTEK LIEYKTYLQA LPYFDRLDYV SMMCNEQAYS L AVEKLLNI QPPPRAQWIR VLFGEITRLL NHIMAVTTHA LDIGAMTPFF WMFEEREKMF EF YERVSGA RMHAAYVRPG GVHQDLPLGL MDDIYEFSKN FSLRIDELEE MLTNNRIWRN RTV DIGVVT AEDALNYGFS GVMLRGSGIQ WDLRKTQPYD VYDQVEFDVP IGSRGDCYDR YLCR VEEMR QSIRIISQCL NKMPPGEIKV DDAKVSPPKR AEMKTSMESL IHHFKLYTEG YQVPP GATY TAIEAPKGEF GVYLVSDGSS RPYRCKIKAP GFAHLAGLDK MSKGHMLADV VAIIGT QDI VFGEVDR

+
分子 #34: 51 kDa

分子名称: 51 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV E GCLVGGRA MGARAAYIYI RGEFYNEASN LQVAIREAYE AGLIGKNACG ...文字列:
SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV E GCLVGGRA MGARAAYIYI RGEFYNEASN LQVAIREAYE AGLIGKNACG SGYDFDVFVV RG AGAYICG EETALIESIE GKQGKPRLKP PFPADVGVFG CPTTVANVET VAVSPTICRR GGA WFASFG RERNSGTKLF NISGHVNNPC TVEEEMSVPL KELIEKHAGG VTGGWDNLLA VIPG GSSTP LIPKSVCETV LMDFDALIQA QTGLGTAAVI VMDRSTDIVK AIARLIEFYK HESCG QCTP CREGVDWMNK VMARFVRGDA RPAEIDSLWE ISKQIEGHTI CALGDGAAWP VQGLIR HFR PELEERMQRF AQQHQARQAA S

+
分子 #35: 75 kDa

分子名称: 75 kDa / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: TATAASNLIE VFVDGQSVMV EPGTTVLQAC EKVGMQIPRF CYHERLSVAG NCRMCLVEIE KAPKVVAAC AMPVMKGWNI LTNSEKTKKA REGVMEFLLA NHPLDCPICD QGGECDLQDQ S MMFGSDRS RFLEGKRAVE DKNIGPLVKT IMTRCIQCTR CIRFASEIAG ...文字列:
TATAASNLIE VFVDGQSVMV EPGTTVLQAC EKVGMQIPRF CYHERLSVAG NCRMCLVEIE KAPKVVAAC AMPVMKGWNI LTNSEKTKKA REGVMEFLLA NHPLDCPICD QGGECDLQDQ S MMFGSDRS RFLEGKRAVE DKNIGPLVKT IMTRCIQCTR CIRFASEIAG VDDLGTTGRG ND MQVGTYI EKMFMSELSG NIIDICPVGA LTSKPYAFTA RPWETRKTES IDVMDAVGSN IVV STRTGE VMRILPRMHE DINEEWISDK TRFAYDGLKR QRLTEPMVRN EKGLLTHTTW EDAL SRVAG MLQSCQGNDV AAIAGGLVDA EALIALKDLL NRVDSDTLCT EEVFPTAGAG TDLRS NYLL NTTIAGVEEA DVVLLVGTNP RFEAPLFNAR IRKSWLHNDL KVALIGSPVD LTYRYD HLG DSPKILQDIA SGSHPFSQVL QEAKKPMVVL GSSALQRNDG AAILAAVSNI AQKIRTS SG VTGDWKVMNI LHRIASQVAA LDLGYKPGVE AIRKNPPKML FLLGADGGCV TRQDLPKD C FIVYQGHHGD VGAPIADVIL PGAAYTEKSA TYVNTEGRAQ QTKVAVMPPG LAREDWKII RALSEIAGMT LPYDTLDQVR NRLEEVSPNL VRYDDVEGAN YFQQASELSK LVNQQLLADP LVPPQLTIK DFYMTDSISR ASQTMAKCVK AVTEGAHAVE EPSIC

+
分子 #36: AGGG

分子名称: AGGG / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AGGGAHIEPR YRQFPQLTRS QVIQAEFFSA TMWFWILWRF WHDSDAVLGH FPYPDPSQWT DEELGIPPDD ED

+
分子 #37: ASHI

分子名称: ASHI / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
ASHITKDMLP GPYPKTPEER AAAAKKYNMR VEDYEPYPDD GMGYGDYPKL PDRSQQERDP WYDWDHPDLR LNWGEPMHWD LDMYIRNRVD TSPTPVNWNL MCKHLFGFVA FMLFMFWVGE TYPTYQPVGP KQYPYNNLYL ERGGDPNKEP EPVVHYEI

+
分子 #38: B8

分子名称: B8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AAAAAIRGVR GKLGLREIRI HLCQRSPGSQ GVRDFIEKRY VELKKANPDL PILIRECSDV QPKLWARYAF GQEKNVSLNN FSADQVTRAL ENVLSSKA

+
分子 #39: B9

分子名称: B9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
APRVAAFLKN VWAKEPVLVA SFAIAGLAVI LPTLSPYTKY SLMINRATPY NYPVPLRDDG NMPDVPSHPQ DPQGPSLEWL KRL

+
分子 #40: B12

分子名称: B12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AHGHGHEHGP SKMELPDYKQ WKIEGTPLET VQEKLAARGL RDPWGRNEAW RYMGGFANNV SFVGALLKGF KWGFAAFVVA VGAEYYLESQ KKDKKHH

+
分子 #41: B13

分子名称: B13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AGLLKKTTGL VGLAVCETPH ERLKILYTKI LDVLGHIPKN AAYRKYTEQI TNEKLSIVKA EPDVKKLEEQ LQGGQIEEVI LQAENELSLA RKMIQWKPWE PLVEEPPASQ WKWPI

+
分子 #42: B14

分子名称: B14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AASGLRQAAV AASTSVKPIF SRDMNEAKRR VRELYRAWYR EVPNTVHLFQ LDISVKQGRD KVREMFKKNA HVTDPRVVDL LVIKGKMELE ETINVWKQRT HVMRFFHETE APRPKDFLSK FYVGHDP

+
分子 #43: B14.5A

分子名称: B14.5A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
ASATRLIQGL RNWASGRDLQ AKLQLRYQEI SKRTQPPPKL PVGPSHRLSN NYYCARDGRR EAMPPSIVMS SQKVLVAGKP AESSAVAASE KKAVSPAPPI KRWELSQDEP YL

+
分子 #44: B14.5B

分子名称: B14.5B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MMTGRQARAP LQFLPDEARS LPPPKLTDPR LAYIGFLGYC SGLIDNAIRR RPVLSAGLHR QFLYITSFVF VGYYLLKRQD YMYAVRDHDM FSYIKSHPED FPEKDKKTYR EVFEEFHPVR

+
分子 #45: B14.7

分子名称: B14.7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AKTLLHQYWD IPEGTECHRK TYAATSIGGA SGLVVSAYSV ALKTPTSFLE GVARTGRYTF TAAAIGAIFG LTSCISAQVR EKPDDPLNYL IGGCAGGLTL GARTRSYGIG AAACAYMGLT AALVKMGQLE GWKVFAEPKV

+
分子 #46: B15

分子名称: B15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
SFPKYEPSRL ASLPTTLDPA EYDISSETRK AQAERLAIRS RLKREYQLQY NDPSRRGVVE DPALIRWTCA RSANVYPNFR PNTKTSLLGA LFGIGPLIFW YYVFKTDRDR KEKLIQEGKL DRTFNISY

+
分子 #47: B16.6

分子名称: B16.6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AASKVKQDMP PVGGYGPIDY KRNLPRRGLS GYSMFAVGIG ALLFGYWSMM RWNRERRRLQ IEDFEARIAL MPLLQAEKDR RVLQMLRENL EEEATIMKDV PGWKVGESVF HTTRWVTPMM GELYGLRTGE EILSSTYGFI WYT

+
分子 #48: B17

分子名称: B17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
SGYTPDEKLR LQQLRELRRR WLKDQELSPR EPVLPPRRVS PVERFWNKFL QDGALWKDVI YKTYRHSIFA FTHVLIPVWI IHYYLKYHVT TKPYTIVEKK PRIFPGDTIL ETGEVIPPMK EFPDQHH

+
分子 #49: B17.2

分子名称: B17.2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MELLQVLKRG LQQVSGHGGL RGYLRVLFRA NDVRVGTLVG EDKYGNKYYE DNKQFFGRHR WVIYTTEMNG KNTFWDVDGS MVPPEWHRWL HCMTDDPPTV KPPTARKFIW TNHKFNLSGT PQQYVPYSTT RKKIQEWVPP STPYK

+
分子 #50: B18

分子名称: B18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
GAHLARRYLG DASVEPEPLR MPTFPPDYGF PERKEREMVA TQQEMNDAQL VLQQRDYCAH YLIRFLKCKR DSFPNFLACK HEQHDWDYCE HLDYVKRMKE FERERRLLQR KKRREQREAD MAKGLGPGEV APEVAL

+
分子 #51: B22

分子名称: B22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
AFLPSAAYLT HQQKVLQLYK RALRHLESRC VHRDKYRYFA CLLRARFDEH KNEKDMVKAT QLLREAEKEF WHGQHPQPYI FPESPGGTSY ERYECYKVPE WCLDDWHPSE KAMYPDYFAK REQWKKLRRE SWEREVKQLQ EETPVGGPRT EALPPARKQG DLPPLWWHIV TRPRERPM

+
分子 #52: ESSS

分子名称: ESSS / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
ESSSSRAVIA PSTLAGKRPS EPTLRWQEDP EPEDENLYEK NPDSHGYDKD PAVDVWNMRV VFFFGFSIVL VLGSTFVAYL PDYRMQEWAR REAERLVKYR EAHGLPLMES NCFDPSKIQL PEDED

+
分子 #53: KFYI

分子名称: KFYI / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
KFYIQEPPHG SPNWLKVGLT LGTSAFLWIY LIKQHNEDVL EYKRRNGLE

+
分子 #54: MNLL

分子名称: MNLL / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MNLLQVVRDH WIHVLVPVGF VFGYYLDRKN DEKLAAFRNK SLLYKRELKP NEEVTWK

+
分子 #55: MWFE

分子名称: MWFE / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MDGGVGRPLG PGGCLRVGNT EIRPRQSFLL PKSGDLRNET RPEPYSTLEK RVAHYSYQWY LMERDRRVSG VNRYYVSKGL ENID

+
分子 #56: ND1

分子名称: ND1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: MFMINVLTLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQFRKGPNVV GPYGLLQPIA DAIKLFIKEP LRPATSSISM FILAPILALT LALTMWIPLP MPYPLINMNL GVLFMLAMSS LAVYSILWSG WASNSKYALI GALRAVAQTI SYEVTLAIIL LSVLLMNGSF TLSTLIITQE ...文字列:
MFMINVLTLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQFRKGPNVV GPYGLLQPIA DAIKLFIKEP LRPATSSISM FILAPILALT LALTMWIPLP MPYPLINMNL GVLFMLAMSS LAVYSILWSG WASNSKYALI GALRAVAQTI SYEVTLAIIL LSVLLMNGSF TLSTLIITQE QVWLIFPAWP LAMMWFISTL AETNRAPFDL TEGESELVSG FNVEYAAGPF ALFFMAEYAN IIMMNIFTTT LFLGAFHNPY MPELYTINFT IKSLLLSITF LWIRASYPRF RYDQLMHLLW KNFLPLTLAL CMWHVSLPIL LSSIPPQT

+
分子 #57: ND2

分子名称: ND2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: MNPIILIIIL MTVMLGTIIV MISTHWLLIW IGFEMNMLAI IPIMMKKHNP RATEASTKYF LTQSTASMLL MMAIIINLMF SGQWTVMKLF NPMASMLMTM ALAMKLGMAP FHFWVPEVTQ GIPLSSGLIL LTWQKLAPMS VLYQILPSIN LDLILTLSIL SITIGGWGGL ...文字列:
MNPIILIIIL MTVMLGTIIV MISTHWLLIW IGFEMNMLAI IPIMMKKHNP RATEASTKYF LTQSTASMLL MMAIIINLMF SGQWTVMKLF NPMASMLMTM ALAMKLGMAP FHFWVPEVTQ GIPLSSGLIL LTWQKLAPMS VLYQILPSIN LDLILTLSIL SITIGGWGGL NQTQLRKIMA YSSIAHMGWM TAVLLYNPTM TLLNLIIYII MTSTMFTLFM ANSTTTTLSL SHTWNKAPIM TILVLITLLS MGGLPPLSGF MPKWMIIQEM TKNDSIILPT LMAITALLNL YFYMRLTYST ALTMFPSTNN MKMKWQFPTT KRMTLLPTMT VLSTMLLPLT PILSILE

+
分子 #58: ND3

分子名称: ND3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MNLMITLLTN FTLATLLVTI AFWLPQLNVY SEKTSPYECG FDPMGSARLP FSMKFFLVAI TFLLFDLEIA LLLPLPWASQ TTNLNTMLTM ALLLIFLLAV SLAYEWTQKG LEWTE

+
分子 #59: ND4

分子名称: ND4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: MLKYIIPTMM LMPLTWLSKN SMIWINTTLH SLLISLTSLL LLNQFGDNSL NFSLTFFSDS LSTPLLILTM WLLPLMLMAS QHHLSKENLA RKKLFISMLI LLQLFLIMTF TATELIFFYI MFEATLVPTL IIITRWGNQT ERLNAGLYFL FYTLAGSLPL LVALIYIQNT ...文字列:
MLKYIIPTMM LMPLTWLSKN SMIWINTTLH SLLISLTSLL LLNQFGDNSL NFSLTFFSDS LSTPLLILTM WLLPLMLMAS QHHLSKENLA RKKLFISMLI LLQLFLIMTF TATELIFFYI MFEATLVPTL IIITRWGNQT ERLNAGLYFL FYTLAGSLPL LVALIYIQNT MGSLNFLILQ YWVQPMPNSW SNTFMWLACM MAFMVKMPLY GLHLWLPKAH VEAPIAGSMV LAAILLKLGG YGMMRITLLL NPITDFMAYP FIMLSLWGMI MTSSICLRQT DLKSLIAYSS VSHMALVIVA ILIQTPWSYM GATALMIAHG LTSSMLFCLA NSNYERVHSR TMILARGLQT LLPLMAAWWL LASLTNLALP PSINLIGELF VVMSTFSWSN ITIILMGLNM VITALYSLYM LITTQRGKHT HHINNILPSF TRENALMSLH MLPLLLLSLN PKIILGPLY

+
分子 #60: ND4L

分子名称: ND4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MSLVYMNIMM AFTVSLTGLL MYRSHLMSSL LCLEGMMLSL FILATLMILN SHFTLASMMP IILLVFAACE AALGLSLLVM VSNTYGTDYV QNLNLLQC

+
分子 #61: ND5

分子名称: ND5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列: MNLFSSLTLV TLILLTMPIA AINFNTHKFT NYPLYVKTTI SCAFITSMIP TMMFIHTGQE MIISNWHWLT IQTLKLSLSF KMDFFSMMFV PVALFVTWSI MEFSMWYMHS DPNINQFFKY LLLFLITMLI LVTANNLFQL FIGWEGVGIM SFLLIGWWYG RTDANTAALQ ...文字列:
MNLFSSLTLV TLILLTMPIA AINFNTHKFT NYPLYVKTTI SCAFITSMIP TMMFIHTGQE MIISNWHWLT IQTLKLSLSF KMDFFSMMFV PVALFVTWSI MEFSMWYMHS DPNINQFFKY LLLFLITMLI LVTANNLFQL FIGWEGVGIM SFLLIGWWYG RTDANTAALQ AILYNRIGDI GFILAMAWFL INLNTWDLQQ IFMLNPNDSN LPLMGLILAA TGKSAQFGLH PWLPSAMEGP TPVSALLHSS TMVVAGIFLL IRFYPLTENN KFGQSIMLCL GAMTTLFTAM CALTQNDIKK IIAFSTSSQL GLMMVTIGIN QPHLAFLHIC THAFFKAMLF MCSGSIIHSL NDEQDIRKMG GLFKAMPFTT TALIIGSLAL TGMPFLTGFY SKDLIIESAN TSYTNAWALL MTLVATSFTA IYSTRIIFFA LLGQPRFPTL ININENNPFL INSIKRLLIG SLFAGFIISN NIPPMTIPQM TMPHYLKMTA LTVTILGFIL ALEISNTTHY LKFNYPSNTF KFSNLLGYYP TIMHRLTPYM NLTMSQKSAS SLLDLIWLET ILPKTISLAQ MKMSTTITSQ KGLIKLYFLS FLITILISTT LLNFHE

+
分子 #62: ND6

分子名称: ND6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
MMTYIVFILS IIFVMGFVGF SSKPSPIYGG LGLIVSGGVG CGIVLNFGGS FLGLMVFLIY LGGMMVVFGY TTAMATEQYP EVWVSNKVVL GTFITGLLME FLMVYYVLKD KEVEIVFKFN GMGDWVIYDT GDSGFFSEEA MGIAALYSYG TWLVIVTGWS LLIGVVVIME ITRGN

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分子 #63: PDSW

分子名称: PDSW / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
PDSWDKDVYP EPPRRTPAPS PQTSLPNPIT YLTKAFDLLV DRPVTLVREF IERQHAKNKY YYYHREFRRV PDITECHEKD VLCMFEAEMQ WKRDYKVDQE IVNIIQERLK ACQQREGESH RQNCAKELQQ FTQVVKAYQD RYHDLGAHYS ARKCLAKQKQ RMLAERKATK EAAAA

+
分子 #64: PGIV

分子名称: PGIV / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
PGIVELPSLE DLKVQEVKVS SSVLKAAAHH YGAQCDKPNK EFMLCRWEEK DPRRCLEEGK LVNQCALEFF RQIKRHCAEP FTEYWTCIDY SGLQLFRRCR KEQAQFDKCV LDKLGWVRPD LGELSKVTKV KTDRPLPENP YHSRARPEPN PEVEGDLKPA RHGSRLFFWT M

+
分子 #65: PSST

分子名称: PSST / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
PSSTQPAVSQ ARAVVPKPAA LPSSRGEYVV AKLDDLINWA RRSSLWPMTF GLACCAVEMM HMAAPRYDMD RFGVVFRASP RQSDVMIVAG TLTNKMAPAL RKVYDQMPEP RYVVSMGSCA NGGGYYHYSY SVVRGCDRIV PVDIYVPGCP PTAEALLYGI LQLQKKIKRE KRLRIWYRR

+
分子 #66: SDAP

分子名称: SDAP / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
SDAPPLTLEG IKDRVLYVLK LYDKIDPEKL SVNSHFMKDL GLDSLDQVEI IMAMEDEFGF EIPDIDAEKL MCPQEIVDYI ADKKDVYE

+
分子 #67: SGDH

分子名称: SGDH / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
SGDHGKRLFI IKPSGFYDKR FLKLLRFYIL LTGIPVVIGI TLINVFIGEA ELAEIPEGYV PEHWEYFKHP ISRWIARTFF DAPEKNYERT MAILQIESEK AELRLKELEV RRLMRAKGDG PWFQYPTIDK ALIDHSPKAT PDN

+
分子 #68: TYKY

分子名称: TYKY / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
配列文字列:
TYKYVNLREP SMDMKSVTDR AAQTLLWTEL IRGLGMTLSY LFREPATINY PFEKGPLSPR FRGEHALRRY PSGEERCIAC KLCEAVCPAQ AITIEAEPRA DGSRRTTRYD IDMTKCIYCG FCQEACPVDA IVEGPNFEFS TETHEELLYN KEKLLNNGDK WEAEIAANIQ ADYLYR

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度2.0 mg/mL
緩衝液pH: 7.7
構成要素:
濃度式名称
100.0 mMNaCl
20.0 mMHEPES
0.1 %Digitonin
グリッドモデル: Quantifoil R0.6/1 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 雰囲気: AIR
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV / 詳細: Blotted 32 seconds.
詳細Single particles dispersed in digitonin

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / デジタル化 - サイズ - 横: 4096 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4096 pixel / デジタル化 - サンプリング間隔: 14.0 µm / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-32 / 撮影したグリッド数: 3 / 実像数: 1608 / 平均露光時間: 4.0 sec. / 平均電子線量: 34.0 e/Å2
詳細: Images were collected in movie mode with 17 frames per second.
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 倍率（補正後）: 81395 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 5.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.0 µm / 倍率（公称値）: 47000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 67650
CTF補正ソフトウェア - 名称: Gctf
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 6.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4) / 使用した粒子像数: 13910
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-5j7y:
Architecture of loose respirasome

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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