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- EMDB-53100: Structure of P. furiosus 70S ribosome in RsmB deleted strain -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-53100
タイトルStructure of P. furiosus 70S ribosome in RsmB deleted strain
マップデータComposite cryo-EM map of P. furiosus 70S RsmB deleted strain
試料
  • 複合体: P. furiosus 70S
    • RNA: x 3種
    • タンパク質・ペプチド: x 60種
  • リガンド: x 2種
キーワードRNA modification / cryo-EM / ribosome
機能・相同性
機能・相同性情報


ribonuclease P activity / tRNA 5'-leader removal / ribosomal large subunit biogenesis / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of SSU-rRNA / rRNA processing / large ribosomal subunit / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly ...ribonuclease P activity / tRNA 5'-leader removal / ribosomal large subunit biogenesis / maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of SSU-rRNA / rRNA processing / large ribosomal subunit / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / small ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / RNA binding / zinc ion binding / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein L14e / : / Small zinc finger protein HVO_2753-like, zinc-binding pocket / Small zinc finger protein HVO_2753-like / Small zinc finger protein HVO_2753-like, Zn-binding pocket / Ribosomal protein L14, KOW motif / Ribosomal protein L40e, archaeal / Ribosomal protein S9, archaeal / Ribosomal protein S13, archaeal / Ribosomal protein S17, archaeal ...Ribosomal protein L14e / : / Small zinc finger protein HVO_2753-like, zinc-binding pocket / Small zinc finger protein HVO_2753-like / Small zinc finger protein HVO_2753-like, Zn-binding pocket / Ribosomal protein L14, KOW motif / Ribosomal protein L40e, archaeal / Ribosomal protein S9, archaeal / Ribosomal protein S13, archaeal / Ribosomal protein S17, archaeal / Ribosomal protein S6e, archaeal / Ribosomal protein S4, archaeal / Ribosomal protein S12, archaea / Ribosomal protein S3, archaeal / 30S ribosomal protein S3Ae / : / Ribosomal protein S7, archaeal / Ribosomal protein S19e, archaeal / Ribosomal protein S11, archaeal / Ribosomal protein S2, archaeal / Ribosomal protein S14, type Z, archaeal / Ribosomal protein S8e, archaeal / Ribosomal protein L15e, archaeal / Ribosomal protein L19e, archaeal / Ribosomal protein L30, archaeal / Ribosomal protein L6P, archaea / Ribosomal protein L14P, archaeal / Ribosomal protein L21e, archaeal / Ribosomal protein L18e, archaea / Ribosomal protein L10e, archaea / Ribosomal protein L3, archaeal / Ribosomal protein L4, archaea / Ribosomal protein L5, archaeal / Ribosomal protein L32e, archaeal / : / Ribosomal protein L7Ae, archaea / Ribosomal protein L30e / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein L23 / : / Ribosomal protein L2, archaeal-type / metallochaperone-like domain / Zinc finger, C2H2 type / TRASH domain / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein S19e signature. / zinc finger / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Ribosomal protein L19/L19e conserved site / Ribosomal protein L19e signature. / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / : / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein L18/L18-A/B/e, conserved site / Ribosomal protein L18e signature. / 50S ribosomal protein L18Ae/60S ribosomal protein L20 and L18a / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein L30e signature 1. / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e / Ribosomal_L40e / Ribosomal protein L40e / Ribosomal protein L40e superfamily / Ribosomal protein L35Ae, conserved site / : / Ribosomal protein L35Ae signature. / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L39e, conserved site / Ribosomal protein L39e signature. / Ribosomal protein L30e signature 2. / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S4e signature. / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S8e, conserved site / Ribosomal protein S8e signature. / Ribosomal protein S19e / : / Ribosomal protein S19e / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / 60S ribosomal protein L19 / Ribosomal S17
類似検索 - ドメイン・相同性
Zn-ribbon RNA-binding protein / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 ...Zn-ribbon RNA-binding protein / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Small ribosomal subunit protein eS1 / Large ribosomal subunit protein eL43 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Small ribosomal subunit protein eS4 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein eL19 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Large ribosomal subunit protein eL18 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein eL37 / Small ribosomal subunit protein eS19 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Large ribosomal subunit protein eL40 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Large ribosomal subunit protein eL8 / Small ribosomal subunit protein eS8 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Small ribosomal subunit protein eS32 / Large ribosomal subunit protein eL15 / C2H2-type domain-containing protein / Large ribosomal subunit protein eL34 / Large ribosomal subunit protein eL14 / Small ribosomal subunit protein eS6 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Large ribosomal subunit protein eL20 / Small ribosomal subunit protein eS24 / Small ribosomal subunit protein eS27 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Large ribosomal subunit protein uL16
類似検索 - 構成要素
生物種Pyrococcus furiosus (古細菌)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.67 Å
データ登録者Matzov D / Georgeson J / Westhof E / Schwartz S / Shalev-Benami M
資金援助European Union, 1件
OrganizationGrant number国
iNEXT-Discovery24433European Union
引用ジャーナル: Cell / 年: 2025
タイトル: Pan-modification profiling facilitates a cross-evolutionary dissection of the thermoregulated ribosomal epitranscriptome.
著者: Miguel A Garcia-Campos / Joe Georgeson / Ronit Nir / Robert Reichelt / Kristin A Fluke / Donna Matzov / Vinithra Iyer / Brett W Burkhart / Lauren Lui / Anatoly Kustanovich / Felix Grünberger ...著者: Miguel A Garcia-Campos / Joe Georgeson / Ronit Nir / Robert Reichelt / Kristin A Fluke / Donna Matzov / Vinithra Iyer / Brett W Burkhart / Lauren Lui / Anatoly Kustanovich / Felix Grünberger / Supuni Thalalla-Gamage / Shereen A Howpay-Manage / Milan Gerovac / Nicolas Alexandre / Yuko Nobe / Jakub S Nowak / Manoj Perera / Alexander Apostle / Shiyue Fang / Sebastian Glatt / Ghil Jona / Sébastien Ferreira-Cerca / Jörg Vogel / Masato Taoka / Jordan L Meier / Eric Westhof / Thomas J Santangelo / Dina Grohmann / Moran Shalev-Benami / Schraga Schwartz /
要旨: Ribosomal RNA (rRNA) constitutes the core of ribosomes and is extensively chemically modified. Technical challenges have precluded systematically dissecting rRNA modifications and their dynamics. We ...Ribosomal RNA (rRNA) constitutes the core of ribosomes and is extensively chemically modified. Technical challenges have precluded systematically dissecting rRNA modifications and their dynamics. We develop Pan-Mod-seq, permitting inference of 16 distinct modifications across dozens of samples in parallel. We applied Pan-Mod-seq to RNA from 14 species spanning all domains of life, cultured under highly diverse conditions. While dynamic modifications are rare in mesophiles, in extreme hyperthermophiles, ∼50% of modifications are dynamic. We dissect the biogenesis and function of a conserved module of tandem mC-acC modifications, co-induced at high temperatures, via enzymes intrinsically regulated by temperature and required for growth at higher temperatures. Cryo-electron microscopy (cryo-EM) structures of ribosomes from wild-type (WT) and enzyme-deficient archaea reveal recurrent molecular interactions through which they confer structural stability, and biophysical studies demonstrate their synergistic thermostabilizing role. Our findings systematically dissect rRNA modification plasticity and pave the way for surveying the rRNA epitranscriptome in health and disease.
履歴
登録2025年3月11日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年11月5日-
マップ公開2025年11月5日-
更新2025年11月5日-
現状2025年11月5日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_53100.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_53100.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 343 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Composite cryo-EM map of P. furiosus 70S RsmB deleted strain
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.99 Å/pix.
x 448 pix.
= 443.52 Å		0.99 Å/pix.
x 448 pix.
= 443.52 Å		0.99 Å/pix.
x 448 pix.
= 443.52 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.99 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.0083
最小 - 最大-1.4506245 - 2.600215
平均 (標準偏差)-0.00007525871 (±0.07425329)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ448448448
Spacing448448448
セルA=B=C: 443.52002 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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追加マップ: Composite cryo-EM map of P. furiosus 70S RsmB deleted strain

ファイルemd_53100_additional_1.map
注釈Composite cryo-EM map of P. furiosus 70S RsmB deleted strain
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : P. furiosus 70S

全体名称: P. furiosus 70S
要素
  • 複合体: P. furiosus 70S
    • RNA: 16S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS2
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS3
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS1
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS4
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS4
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS5
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS6
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS7
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS8
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS8
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS9
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS10
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS11
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS12
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS13
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS14
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS15
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS17
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS17
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS19
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS19
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS24
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS27
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS28
    • タンパク質・ペプチド: Zn-ribbon RNA-binding protein
    • RNA: 23S rRNA
    • RNA: 5S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL2
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL3
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL4
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL5
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL6
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL8
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL16
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL13
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL14
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL14
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL15
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL15
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL18
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL18
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL19
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL21
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL22
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL23
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL24
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL24
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL29
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL30
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL30
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL31
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL32
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL34
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL33
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL37
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL43
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL39
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL40
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL42
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein eL20
    • タンパク質・ペプチド: C2H2-type domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein eS32
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: water

+
超分子 #1: P. furiosus 70S

超分子名称: P. furiosus 70S / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#59, #61-#63, #60
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)

+
分子 #1: 16S rRNA

分子名称: 16S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 488.596781 KDa
配列文字列: AUUC(4AC)GG(OMU)UG AUCCUG(5MC)CGG AGGCCACUGC UAUGGGGGUC (4AC)GACUAAGCC A(OMU)GCGAGUCA AGGGGGCGU CCCUUCUGGG ACGCCAC(4AC)GG CGGACGGCUC AGUAACACGU CGGUAAC(OMC)UA CCCUCGGGAG GGG GAUAAC CC(4AC) ...文字列:
AUUC(4AC)GG(OMU)UG AUCCUG(5MC)CGG AGGCCACUGC UAUGGGGGUC (4AC)GACUAAGCC A(OMU)GCGAGUCA AGGGGGCGU CCCUUCUGGG ACGCCAC(4AC)GG CGGACGGCUC AGUAACACGU CGGUAAC(OMC)UA CCCUCGGGAG GGG GAUAAC CC(4AC)GGGAAAC UGGGGCUAAU CCCCCAUAGG CCUGGGGUAC UGGAAGGUCC CCAGGCCGAA AGGGAGCCGU AAGGCUC(4AC)G CC(4AC)GAGGAUG GG(5MC)(4AC)GGCGGC (LHH)GAUUAGGUA GUUGGUGGGG UAACGGCCCA C CAAGC(4AC)GA AGAUCGGUAC GGGC(4AC)GUGAG AGCGGGAGCC (4AC)GGAGAUGGA CACUGAGACA CG(OMG)GUC CAG GCCCUACGGG GCGCAG(5MC)AGG CGCGA(A2M)ACCU C(4AC)GCAAUGCG GGAAAC(4AC)GCG ACGGGGGGAC C CCCAGUGC (4AC)GUGCCUCUG GCACGGCUUU UCCGGAGUGU AAAAAGCUCC GGGAAUAAGG (OMG)CUG(OMG)GCAAG G(5MC)(4AC)GGUGG(5MC) AGCCGCC(G7M)CG GUAAUACCGG CGGCC(4AC)GAGU GGU(OMG)GCCACU AUUAUUG GG CCUAAAGCGG C(4AC)GUAGC(4AC)(OMG)G GCC(4AC)GUAAGU CCCUGGCGAA AUCCCACGGC UCAAC(4AC)GU G GGGCUCGCUG GGGAUACUGC GGGCCUUGGG AC(4AC)GGGAGAG GC(4AC)GGGGGUA CCCC(4AC)GGGGU AGG (OMG)GUGAA AUCCUAUAAU CCCGGGG(OMG)GA CCGCCAGUGG (5MC)GAAGG(5MC)GCC (4AC)GGCUGGAAC GGGU C(4AC)GAC GGUGAGGGC(4AC) GAAGGCCAGG GGAGCGAAC(4AC) GGAUUAGAUA CCCGGG(4SU)AGU C(4AC) (OMU)GGCUGU AAAGGA(OMU)GCG GGCUAGGUGU CGGGCGAGCU UCGAGCUCGC CCGGUGC(4AC)GU (A2M)GGGAAG C(4AC) GUUAAG(OMC)C(4AC)G C(4AC)GCCUGGGG AGUACGGC(4AC)G CAA(OMG)G(5MC)UGAA ACUUAAAGGA AUUGGCGGG GGAGCACUAC AAGGGGUGGA GCGUGCGGUU UAAUUGGAUU (5MC)AACGCCGGG AACCUCAC(4AC)G GGG G(5MC)GACG GCAGGAUGAA GGCCAGGCUG AAGGUCUUGC CGGACGCGCC GAGAGGA(OMG)GU GCAUGGC(5MC)GC CG UCAGCUC GUA(OMC)(4AC)GUGAG GCGUCCACUU AAGUGUGGUA ACGAGCGAGA CCCGCGCCCC CAGUUGCCAG UCCCU CCCG CUCGGGAGGG AGGCAC(5MU)CUG G(OMG)GGGACUGC CGGCGAUAAG CCGGAGGAAG GGGCGGGCGA CGGUAGGU C AG(OMU)AUGCCCC GAAACCCC(4AC)G GGCUACA(5MC)GC G(OMC)GCUACAAU GGGCGGGACA AUGGGACCCG ACC (OMC)(4AC)GAAA GGGGAAGGGA AUCCCCUAAA CC(4AC)GCCCUCA GUUCGGAU(OMC)G CGGGCUGCAA CUCGCCCG C GUGAAGCUGG AAUCCCUAGU ACC(4AC)GCGUGU CAUCAUCGCG CGGCGAAUAC GUCCCUGCUC CUUGCACACA C (5MC)G(OMC)C(A1I59)G(OMU)C A(OMC)UCCACCCG AGCGGAGUCC GGGUGAGGCC UGAUCUCCUU CGGGAGGUCA GGUCGAGCC CGGGCUCCGU GAGGGGGGAG AAGUCGUA(MA6)C AAGGUAGC(4AC)G UAGGGG(MA6)(MA6)CC UACGG (5MC)UCG AUCACCUCCU

+
分子 #27: 23S rRNA

分子名称: 23S rRNA / タイプ: rna / ID: 27 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 996.45025 KDa
配列文字列: GGGGCUAGGA CGCUAAGC(4AC)G CC(4AC)GGUGGAU GGCUCGGCUC GGGGCGC(4AC)GA CGAA(OMG)GGCGU GGCA AGCUG CGAUAAGCCC (4AC)GGCGAGGCG CAGGCAGC(4AC)G UCGAACCGGG GAUUCC(4AC)GAA UGGGACCUCC (4AC)GCGGCUUA ...文字列:
GGGGCUAGGA CGCUAAGC(4AC)G CC(4AC)GGUGGAU GGCUCGGCUC GGGGCGC(4AC)GA CGAA(OMG)GGCGU GGCA AGCUG CGAUAAGCCC (4AC)GGCGAGGCG CAGGCAGC(4AC)G UCGAACCGGG GAUUCC(4AC)GAA UGGGACCUCC (4AC)GCGGCUUA UGCCGCACUC CGGGGUUUAU CCC(4AC)GGAGGG GGAACGCGGG GAAUUGAAAC AUCUUAGUAC C (4AC)GCAGGAA AAGAAA(OMG)CAA AAGCGAUGC(4AC) GUGAGUAGGG GCGAC(4AC)GAAA ACGGCAGAGG GCAAAC UGA ACCCCGGGCC GACGAGGUUC GGGGGAUGUG GGGUUGUAGG GCCCCCGUAU GAGACCCUCG CGGGUGAAG(5MC) (4AC)GAAGUC(4AC)G CUGGAACGCG GCGC(4AC)GGAGA GGGUGAUAGC CC(4AC)GUAGGCG UAAGCCCGCA GGGUC UCGG GGGACCCUGA GUAC(4AC)GUCGG UUGGAUAUC(4AC) GGCGGGAAGC UGGGAGGCA(OMU) CGGCUCCCAA CCCU AAAUA CGUCC(4AC)GAGA C(4AC)GAUAGCGA ACUAGUA(OMC)(LHH)G UG(A2M)GGGAAAG CUGAAAAGCA CCC (4AC)GG(OMG)AG GGGGGUGAAA AGAGCCUGAA ACCGGGCGGC GAUAGGAGGG UGCGGCC(4AC)GA AAGGAAUGAG CC UCCCCGA AGGAAACCGC GGCGACGCGG GAGUACGAGG GGAGGGGACC GGGGUUGCAC (4AC)GUCCGUCUU GAAACACGG GGCAGGGAGU UCGCGGC(4AC)GU GGCGAGGUUA AGGGGGUUAA GCCC(4AC)GUAGC (4AC)GCAGGGAAA C(4AC)GA CAUGC CCGCAGCCGG GCUUAUGCCC GGUGAGGGGC GGGGUGCGAA AGCGCC(4AC)GGA GUCACGGCCG CGAGACCC (OMG) AAACCGGUCG AUCUAGCCCG GGGCAGGGUG AA(OMG)UCCCUCA ACCGAGG(OMG)(A2M)U GGAGGCC(4AC)G CUAGGGGUGC UG(A2M)UGUGCA(OMG) (5MU)UCGCUCC(4AC)G UGACCCCGGG CUAGGGGUGA AA(OMG)(OMG)CC AA(OMU) CGAGGC(4AC)GGA GAU(A2M)GCUGGU UCC(4AC)GC(4AC)GAA UCAUCCCGCA GGAUGGCCUC CC(4AC) GGAGGU AGGCGGUGGG GUAGAGCACU GAUUGGAGGU GCAGGGGGCG AAAGCCCCCG GCCUCCUGUC AAACUC(4AC)GAA CCCAC(4AC)GC(4AC) GC(4AC)GUAGAUG GGGGGAGUAG GGUGGCGGUG UAAG(OMC)(4AC)GUCC AC(4AC)GAGA GG GGAACAACCC AGAC(4AC)GGGGU UAAGGCCCCA AAGUGC(4AC)GGC UAAGUGUUAC UCCAAAGGGU GUCC(4AC)G GGC CUUAGACAGC GGGGAGGUAG GCUUAGAAGC AGCCAUCCUU UAAAGAGUGC GUAACAGCUC ACCCGUCGAG GUCCGGG GC CC(4AC)GAAAAUG GACGGGGCUC AAGCCGGC(4AC)G C(4AC)GAGACCCC GGCGCACGGA CCGAUUGGUC CGUGAU CGG GUAGGCGGGC GUG(5MC)(4AC)GGUGG CGUAGAAGC(4AC) GGGCCGUAAG GUC(4AC)GGUGGA GC(4AC)GCCG GU AUCGCGGAUC CUGCCGGGAG UAGCAGCGUA GUCGGGUGAG AAUCC(4AC)GAC(LHH) GC(4AC)GGAGGGG CCAGGG UUC CACGGCAAUG GUCGUCAGC(4AC) GUGGGUUAG(OMU) (OMC)GGUCCUAAC CC(4AC)GCC(4AC)GUA ACUCGGC GC GGGGGAAAGG GAAACGGGUU UAUAUUCC(4AC)G UAC(4AC)GCGGG(OMG) GUAGGUGCGG CAACGCAAGC C(4AC) GGAGGGU GACGCCUCGG GGUAGGCGGA C(4AC)GGCCGAUG AGGCCGGCUA AGCGUAUAAG CC(4AC)GGGGAGU GC (4AC)GUAAUG GCGAGAACCG GGUGAAAGCG CGAAUGGCCC CCCCGUUAGG GGGGUUCCGC (4AC)GAUCCCUGG GGCCC GUGA AAAGCCCUCC GGGAAUUC(4AC)G AUCCCC(4AC)GCG ACCGUAC(4AC)GA GAAC(4AC)GACAC AGGUGCCCCU GGGUGAGAA GCCUAAGGCG UGUCGGGGGA AACC(4AC)GGC(4AC)G AGGGAACU(OMC)G GCAAACUGGC CC(4AC)GU AACU UCGGGAGAAG GGGUGCCUGC GGGUGCGUAA CC(4AC)GCAGGUC GCAGUGACUA G(OMG)GGGGCC(4AC)G A (OMC)UGUUUAA UAAAAACACA GGUCCCAGCU AGCC(4AC)GAAAG GGUUUGUACU GGG(OMG)C(4AC)GACG CCUGC (5MC)CAG UGCCGGUAUG UGAAGCCCGG GUACAAC(4AC)GG GUGAAGCAC(4AC) G(OMG)UAAAC(OMG)GC GGGGGU AAC UAUAACCCUC UUAAGGUAG(OMC) GAAAUUC(5MC)UU GUCGGUUAAA UGCCGAC(5MC)UG CAUGAAUGGC GUAAC GAG(OMG) UCCC(4AC)GCUGU (OMC)CCCGGCCGG GGCC(4AC)GGCGA AACCUCUGCC UGGCGCGCAU GCCAGGGACC CC(4AC)GGUGGG AA(OMG)CGAAGAC CCCAUGGAGC UUUACUGCAG CCUGC(4AC)GUUG CCACACGGCG GGGGGUGCG CAGCGUAGGC GGGAGGCGUC GAAGCCCGGC CUCCGGGUCG GGUGGAGCCG UCCAUGAGAC ACCGCCCACU CCCCGCUGUG UGGCUAACC CCCGAAAGGG GGGACAGCGG UAGGUGGGCA GUUUGGCUG(OMG) GGCGGCACGC CUC(4AC)GAAAAG GUA UC(OMG)GAG GCGCCC(5MU)AAG GUCGGCUCAG GCGGGUCAGG AAUC(4AC)GC(4AC)GU AGAGUGCAAG GGCAAAAG C (4AC)GGCCUGACU GGACC(4AC)GUAA CAGAGGCGGG UCCAGCCC(4AC)G AAAGGGUGGC CU(A2M)GCGAACC CCU GUGCCU CCC(4AC)GGUGGG GGCCAGG(OMG)AU GACAGAAAAG C(OMU)AC(OMC)CUGG(OMG) GA(4SU)AACAGAG UCGUCUCGG GCGAGAGCCC AUAUCGACCC (4AC)GAGG(OMC)UUGC UACCU(5MC)GCUG UCGGCUCUUC CCAUCCUGG CCCUGCAGCA GGGGCCAAGG GUGGGGGUGU UCACCCAUUA AAG(OMG)GGAACG UGAGCUGGG(UR3) UUAGACCGUC GU GAGACAG GUCGGAUGCU AUCUA(OMC)CGGG GGUGUUGGC(4AC) GCCUGAG(OMG)GG AAGGUGCCCC UAGUACGAGA G GAACAGGG UGC(4AC)GCGGCC UCUGGUCUA(OMC) (4AC)GGUUGUCCU CC(4AC)GGGCAUC GCCGGGCAGC UACGC (4AC)GCA GC(4AC)GAUAAGG CCUGAAAGCA UCUAAGGC(4AC)G AAGCGGCCCC CGAAAAUAGG CGGCCGUUCC CUGG CGCUU GGGCCUGGGC GACCGGCCCA UUGCCAGGGA CGAGGGCUCG GGUAGAAGAC C(4AC)GGUUGAUA GGGCGGG (OMG)A UGUAAGCGGG AAGGGUCAAC (4AC)GACC(4AC)GCUU AGUC(4AC)GCCGC CCCUAAUCGC C(4AC)GAGGUC C UGCCCCU

+
分子 #28: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 28 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 40.589266 KDa
配列文字列:
GGUACGGCGG CCAUAGCGGG GGGGCCACAC C(4AC)GGUCUCAU UUCGAACCCG GAAGUUAAGC CCCCCAGCGA UCCCGG UUG UACUGCCCUC (4AC)GAGAGGGGG CGGGAAGCCG GGGACGC(4AC)GC CGGCCA

+
分子 #2: Small ribosomal subunit protein uS2

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 23.039861 KDa
配列文字列: MADEYLVPLD QYLAAGVHIG TQQKTKDMKK FIYRVRQDGL YVLDVRKTDE RLKVAGKFLA KFEPQSILAV SVRLYGQKPV KKFGEVTGA RAIPGRFLPG TMTNPAVKNF FEPDVLIVTD PRADHQAMRE AVEIGIPIVA LVDTENLLSY VDLAIPTNNK G RKALALIY ...文字列:
MADEYLVPLD QYLAAGVHIG TQQKTKDMKK FIYRVRQDGL YVLDVRKTDE RLKVAGKFLA KFEPQSILAV SVRLYGQKPV KKFGEVTGA RAIPGRFLPG TMTNPAVKNF FEPDVLIVTD PRADHQAMRE AVEIGIPIVA LVDTENLLSY VDLAIPTNNK G RKALALIY WILAREILYN RGEIQSREDF KIPVEEFEMK IVRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #3: Small ribosomal subunit protein uS3

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 23.464352 KDa
配列文字列: MAIERYFIRE AVREMLIDEF LEKELRRAGY GGLDIKKTPL GTKVIIFAAN PGYVIGRGGR RIRELTRILE KQFGLENPQI EVEEIKNPY LNAKVQAVRL AQALERGIHF RRAAYAALRA IMNNGARGVE IRLSGKLTGE RAKSIRFYQG YLAKVGNPAE T LVSKGYAQ ...文字列:
MAIERYFIRE AVREMLIDEF LEKELRRAGY GGLDIKKTPL GTKVIIFAAN PGYVIGRGGR RIRELTRILE KQFGLENPQI EVEEIKNPY LNAKVQAVRL AQALERGIHF RRAAYAALRA IMNNGARGVE IRLSGKLTGE RAKSIRFYQG YLAKVGNPAE T LVSKGYAQ ALLKLGVIGV KVAIMPPGAR LPDEIEIIEK PVEEEVVSNE AE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #4: Small ribosomal subunit protein eS1

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 22.984107 KDa
配列文字列: MAAKRATTTR DKWKLKQWYI IYAPDFFGGV EVGLTPADDP EKVLNRVVEV TLKDVTGDFT KSHVKLYFQV YDVKGQNAYT KFKGMKLAR SYIRSLVRRK TTRIDGIFNI TTKDGYKLRV MAMAIAMRRI QTSQERAIRK IMQEIIYKKA EELNFKDFVL E SVNGKIAA ...文字列:
MAAKRATTTR DKWKLKQWYI IYAPDFFGGV EVGLTPADDP EKVLNRVVEV TLKDVTGDFT KSHVKLYFQV YDVKGQNAYT KFKGMKLAR SYIRSLVRRK TTRIDGIFNI TTKDGYKLRV MAMAIAMRRI QTSQERAIRK IMQEIIYKKA EELNFKDFVL E SVNGKIAA EIAKEAKKIY PLRKAEIRKI KVLEEPQVIA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1

+
分子 #5: Small ribosomal subunit protein uS4

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 21.38191 KDa
配列文字列:
MGDPKRQRKK YETPPHPWIK ERLDRERVLM DKYELKNKKE LWKHETQLKN FRRRARRLLA ARGKQAEIER EQLLARLKRL GLLPEDAVL DDVLSLTIED ILERRLQTIV YKKGLARTMR QARQLIVHGH IEVNGQIIRS PSYLVLKEEE DTITYARTSP F ANPQHPER MMIEKAKQGG EA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #6: Small ribosomal subunit protein eS4

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 28.197023 KDa
配列文字列: MARKGPKRHL KRLAAPTSWY IERKAYKWAV RPRPGPHNMR TSIPLLYIVR DYLGYAKTAR EARKILNEGK FLVDGRVRKD YKFPVGIMD VVSIPETGEH YRVLPNRIGK LILHPISEDE AFIKPLRIRN KRMIKGARVQ LNFHDGTNHI VSIAEKDNYF T SYTVLMKV ...文字列:
MARKGPKRHL KRLAAPTSWY IERKAYKWAV RPRPGPHNMR TSIPLLYIVR DYLGYAKTAR EARKILNEGK FLVDGRVRKD YKFPVGIMD VVSIPETGEH YRVLPNRIGK LILHPISEDE AFIKPLRIRN KRMIKGARVQ LNFHDGTNHI VSIAEKDNYF T SYTVLMKV PEREILEVLP FEKGAYVFVT QGKNVARKGR IVEIKRFPMG WPDVVTIEDE EGELFDTLKE YAFVVGTDKP KI SLP

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS4

+
分子 #7: Small ribosomal subunit protein uS5

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 26.590891 KDa
配列文字列: MSQEWKEYAK RVLDEWEPKT KLGMMVKEGQ ITDIHEIFRR GYQIKEPEII DVLLPEVNAR ENQEVLDIAL TVRMTDSGRR VRFRVLAAV GNRDGYVGLG IGHGKEVGIA IRKAINYAKL NIIEIKRGCG SWECRCRRPH SVPFAVEGKE GSVRVRLIPG P RGLGLVIG ...文字列:
MSQEWKEYAK RVLDEWEPKT KLGMMVKEGQ ITDIHEIFRR GYQIKEPEII DVLLPEVNAR ENQEVLDIAL TVRMTDSGRR VRFRVLAAV GNRDGYVGLG IGHGKEVGIA IRKAINYAKL NIIEIKRGCG SWECRCRRPH SVPFAVEGKE GSVRVRLIPG P RGLGLVIG DVGKKILRLA GVQDVWSQTF GETRTTVNFA KAVFNALYNT NRVAISPEMI ERYGIVVGRA MPTTFTLE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #8: Small ribosomal subunit protein eS6

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 14.00233 KDa
配列文字列:
MATFKLVISD PKSGIAKQVE ITGAETEKLI GKRIGDQIPA KELNINLNEL FGKEFPEDVK LEIRGGTDKD GFPMRPDIHG PRRVRVLLS KGPGFRPKEK GERRKKTVRG NTISPEIVQV NVKLVY

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS6

+
分子 #9: Small ribosomal subunit protein uS7

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 24.701791 KDa
配列文字列: MAKPLNERFF IPHEIKVMGR WSTEDVEVRD PSLKPYINLE PRLLPHTHGR HAKKHFGKAN VHIVERLINK IMRSGGSHYK VAGHFMRRE HRSLNSKKVK AYEVVKEAFK IIEQRTGKNP IQVLVWAIEN AAPREDTTSV MFGGIRYHVA VDISPMRRLD V ALRNIALG ...文字列:
MAKPLNERFF IPHEIKVMGR WSTEDVEVRD PSLKPYINLE PRLLPHTHGR HAKKHFGKAN VHIVERLINK IMRSGGSHYK VAGHFMRRE HRSLNSKKVK AYEVVKEAFK IIEQRTGKNP IQVLVWAIEN AAPREDTTSV MFGGIRYHVA VDISPMRRLD V ALRNIALG ASAKCYRNKM SFAEALAEEI ILAANKDPKS YAYSKKLEIE RIAESSR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #10: Small ribosomal subunit protein uS8

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 14.684174 KDa
配列文字列:
MTLLDPLANA LSHITNSERV GKREVYIKPA SKLIGEVLRV MQKYGYIGEF EFIDDGRAGV YRVQLLGRIN KAGAIKPRFP VKVSEFEKW EKRFLPAFEF GILIVSTSQG VMSHKEAIEK GIGGRLIAYV Y

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #11: Small ribosomal subunit protein eS8

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 14.293733 KDa
配列文字列:
MAIWQGRSLK KPSGGRIVLA RKKRKRELGR EPSNTRVAEQ DKRKIIRTYG GNRKVRLTAA AYANVFDKSG KGRKVRIIRV IENPANRQF ARRNIITKGA IIETEIGKAK VTSRPGQDGV VNAILLEE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS8

+
分子 #12: Small ribosomal subunit protein uS9

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 15.317932 KDa
配列文字列:
MRIIQTTGKR KTAIARAVIR EGKGRVRING KPVEIIEPEI ARFTILEPLI LAGEEIWNSV DIDVKVEGGG FMGQAEAARM AIARALVEW TGDMSLKEKF MKYDRTMLVG DPRRTEPHKP NRSTKGPRAK RQKSYR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #13: Small ribosomal subunit protein uS10

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 11.769689 KDa
配列文字列:
MQKARIKIAS TNVRSLDEVA NQIKQIAERT GVRMSGPIPL PTKRIRITTR KSPDGEGSAT FDRWELRVHK RLIDIEADER AMRQIMRIR VPEDVTIEIE LIS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #14: Small ribosomal subunit protein uS11

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 14.75695 KDa
配列文字列:
MSEEQVNIKK KEKWGIAHIY SSFNNTIIHI TDITGAETIS RWSGGMVVKA DRDEPSPYAA MLAARRAAEE ALEKGIVGVH IRVRAPGGS KSKTPGPGAQ AAIRALARAG LKIGRVEDVT PIPHDGTRPK GGRRGRRV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #15: Small ribosomal subunit protein uS12

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 16.477621 KDa
配列文字列:
MPGKKAPNGE FAGRKLKLKR KKFRWSDIRY KRRVLRLKEK SDPLEGAPQA RGIVLEKIAV EAKQPNSGMR KAVRVQLIKN GKVVTAFCP GDGAIKFIDE HDEVIIEGIG GPKGGSMGDI PGIRYKVVKV NRVSLKELVK GRKEKPRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #16: Small ribosomal subunit protein uS13

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 16.948904 KDa
配列文字列:
MANFRHIVRV AGVDLDGNKQ LRWALTAIKG IGINFATMVC RVAGLDPFMK AGYLTDEQVK KIEEILADPV AHGIPRWAVN RPKDYETGR DLHLITAKLD MAIREDIMRL RRIRAYRGIR HELGLPVRGQ RTRSNFRRGQ TVGVSRKKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #17: Small ribosomal subunit protein uS14

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 6.634046 KDa
配列文字列:
MAKADYNKRK PRKFGKGARR CIRCGQYGPI IRIQGLMLCR HCFREVAPKL GFRKYE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #18: Small ribosomal subunit protein uS15

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 18.640025 KDa
配列文字列:
MARMHARKRG KSGSKRPPRT APPIWVEYTV EEIENLVVKL RKEGYSTAMI GTILRDQYGI PSVKLFKDPD NPNRNLTITR ILEKHGLAP EIPEDLMFLI RRAVNLRKHL EQHPKDLHSM RGLQLIESKI RRLVKYYKRK GKLPKNWRYD PETAKLLVR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #19: Small ribosomal subunit protein uS17

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 13.296521 KDa
配列文字列:
MMRDIGLRVQ PPAEKCDDPK CPWHGNLKIH GRVFEGIVVS DKPRKTVTVE RQYYFYLNKY ERYELRRSKI HAHNPPCINA KVGDKVLIA ETRPLSKTKH FVVVAVLERA EERR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #20: Small ribosomal subunit protein eS17

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 7.942465 KDa
配列文字列:
MGKIRQGFIK RVARELVNKY PNEFTTDFEH NKKKVQELTN VTSKKIRNRI AGYVTKLVRM KMEGKIL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17

+
分子 #21: Small ribosomal subunit protein uS19

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 15.357399 KDa
配列文字列:
MARKEFRYRG YTLEQLMNMS LEELARLFPA RQRRSLKRGL TPEQKKLLRK IRLAKKGKYK KPIRTHCRDM IILPEMVGLT IYVHNGKEF VPVEIKPEMI GHYLGEFAPT RKKVEHGAPG VGATRSSMFV AVK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #22: Small ribosomal subunit protein eS19

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 17.394236 KDa
配列文字列:
MATVYDVPGD LLVERVAQRL KEIPEIKPPE WAPFVKTGRH KERLPEQEDW WYYRVASILR RVYLDGPVGI ERLRTYYGGR KNRGHAPEK FYKAGGSIIR KALQQLEAAG FVEKVPGKGR VITPKGRSFL DKIATELKKE LEEIIPELKK Y

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS19

+
分子 #23: Small ribosomal subunit protein eS24

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 11.698564 KDa
配列文字列:
MEIRIKEIKE NKLIGRKEIY FEIYHPGEPT PSRKDVKGKL VAMLDLNPET TVIQYIRSYF GSYISKGYAK AYDSKERMLY IEPEYILIR DGLIEKKEGE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS24

+
分子 #24: Small ribosomal subunit protein eS27

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 6.888388 KDa
配列文字列:
MAKPIIPMPR SRFLRVKCID CGNEQIVFSH PATKVRCLIC GATLVEPTGG KGIVKAKILE VLE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS27

+
分子 #25: Small ribosomal subunit protein eS28

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 8.116332 KDa
配列文字列:
MAEDEGYPAE VIEIIGRTGT TGDVTQVKVR ILEGRDKGRV IRRNVRGPVR IGDILILRET EREAREIKSR R

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28

+
分子 #26: Zn-ribbon RNA-binding protein

分子名称: Zn-ribbon RNA-binding protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 6.824008 KDa
配列文字列:
MVEMKFEIPV CTSCGREITP REHATHFICP NCGEAVIWRC ESCRVLAKPY KCPNCGWEGP

UniProtKB: Zn-ribbon RNA-binding protein

+
分子 #29: Large ribosomal subunit protein uL2

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 26.085379 KDa
配列文字列: MGKSLIQQRR GKGSPTFKSP SHRFRGAVKY IPLNYTQEKT LRGVVEEIMH DPGRTAPVAR VKFENGIEKL IIAPEGLLVG QEIYIGPDA PIAVGNTLPL AKIPEGTYVY NIEGIPGDGG KYVRAGGTYA LVVSREPDKV IVQLPSGELK AFNPMCRATI G VVAGGGRL ...文字列:
MGKSLIQQRR GKGSPTFKSP SHRFRGAVKY IPLNYTQEKT LRGVVEEIMH DPGRTAPVAR VKFENGIEKL IIAPEGLLVG QEIYIGPDA PIAVGNTLPL AKIPEGTYVY NIEGIPGDGG KYVRAGGTYA LVVSREPDKV IVQLPSGELK AFNPMCRATI G VVAGGGRL EKPLVKAGKA YYKYKARNKF WPTPRGVKMN AVNHPFGGKE HHPGKPTTTS RRAPPGRKVG HIAARRTGRR K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #30: Large ribosomal subunit protein uL3

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 41.465969 KDa
配列文字列: MGKVHRPRRG SLGFSPRKRA KSIVPRIRSW PKETEVRMLG FAGYKAGMTH ILMIDDEPGL TNGKEIFMPV TIIETPPLRV FGIRAYRMG YLGLETATEV IVPDFPLDNY PAKERKGKPK PKMTFYKLLE RRIATLPKNY TQEMFEQKLG QLEDMIKEGE I VDVRAIVA ...文字列:
MGKVHRPRRG SLGFSPRKRA KSIVPRIRSW PKETEVRMLG FAGYKAGMTH ILMIDDEPGL TNGKEIFMPV TIIETPPLRV FGIRAYRMG YLGLETATEV IVPDFPLDNY PAKERKGKPK PKMTFYKLLE RRIATLPKNY TQEMFEQKLG QLEDMIKEGE I VDVRAIVA TQPWVIKLKK KPEVMEYAIG GTSVEEKFNY IKEKLGKELR VGEVLKEGEL LDVIAVTKGK GTQGPVKRWG IK LRAHKDS KGRRKVGSIG PWHPARVMWT VPMAGQMGFH HRTELNKRLI AIGENGKLKL DENTEIEITP KGGFPHYGIV RSD FMMIAG SVPGAIKRII RVRPAIRPPK KKPPVQRPQI TYVSVESKQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #31: Large ribosomal subunit protein uL4

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 28.765779 KDa
配列文字列: MKVKVFDLNG QPVGEIELPK VFFTPFRPDL IRRAVIASWT HRIQPQGRDP MAGKRRVTEN IGKGHSMARV ERLKTPPRYA AFVPFARGG RRTHPPKVEK IIWEDINKKE KRLALMSAIA ATANYDLVRA RGHIIDNVPQ LPLIVVDDLQ KVQKTRETRE I FKKLGIWD ...文字列:
MKVKVFDLNG QPVGEIELPK VFFTPFRPDL IRRAVIASWT HRIQPQGRDP MAGKRRVTEN IGKGHSMARV ERLKTPPRYA AFVPFARGG RRTHPPKVEK IIWEDINKKE KRLALMSAIA ATANYDLVRA RGHIIDNVPQ LPLIVVDDLQ KVQKTRETRE I FKKLGIWD DIVRAKEKSG VRAGKGKMRG RRYKKAKGPL IVVGKNEGIV LGARNHPGVD VVVVDNLGVE HLAPGTHPGR LT VWTVSAI ERLRELYG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #32: Large ribosomal subunit protein uL5

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 21.269877 KDa
配列文字列:
MAVEIPNKEQ ILADWEAHPM RRPRIEKVTI NIGVGESGER LTKAEIMLQQ LTGQKPIRRK AKKTNRDFGI RRGEPIAVKV TLRGPKAYE LLKRLLAAVD NRLKASSFDE HGNVCFGIEE HINIPGVEYD PEIGIFGMDV CVTLERPGFR VARRKRKRAK I PTRHKLTK EEGMVYMMEE FGVEIVEG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #33: Large ribosomal subunit protein uL6

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 20.891189 KDa
配列文字列:
MPVDAWIREE VEIPEGVEVT VEGYKVKVKG PKGELEREFF WPGIQIFTED GNVVIYKDFP RRKDVAIART FAAHIRNMIK GVTEGFTYK LKVVYSHFPI SVKVQGDEVI IENFLGEKAP RKAKILPGVT VKVRGQEIIV EGIDKEAVGQ TAANIEQATR I TKWDRRIF QDGIYIVEKA GKPITF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #34: Large ribosomal subunit protein eL8

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 13.414664 KDa
配列文字列:
MAKPSYVKFE VPKELAEKAL QAVEIARDTG KIRKGTNETT KAVERGQAKL VIIAEDVDPE EIVAHLPPLC EEKEIPYIYV PSKKELGAA AGIEVAAASV AIIEPGKARD LVEEIAMKVK ELMK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL8

+
分子 #35: Large ribosomal subunit protein uL16

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 20.974361 KDa
配列文字列:
MALRPAKIDR YVDKPAYTRR EYIRGAPGPK ITIFDMGNPA GDFEFEVSLH TAEPVQIRQN ALEAARQQVN RYLQKNVGRS NYHFKIRVY PFQVLRENPM ATGRKADRYG NGMRRPFGKP IGLAARLKKD QKILSIRVNR QHLKFAIEGA RRAAMKFPCK C YYRIYDKE GNDVTTKILS QSL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #36: Large ribosomal subunit protein uL13

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 16.345384 KDa
配列文字列:
MRIINAEGLI LGRLASKVAK MLLEGEEVVI VNAEKAVITG NRDVIFKKYK QRTELRTLTN PRRGPFYPKR SDEIVRRTIR GMLPWKTDR GRKAFKRLKV YVGIPKEFQG KELETIIEAH VSRLSRPKYV TVGEVAKFLG GKF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #37: Large ribosomal subunit protein uL14

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 15.264866 KDa
配列文字列:
MAKKGAGATR GVSAVRPTRA LPVGAYLTVA DNSGAKVIQI IGVVEYHGTR RRLASAGVGD MVVATVKKGR PDMRHQVVRA VIIRQRKEY RRLDGMRVKF EDNAAVIVTP EGVPRGTEIR GPVAREAAER WVRIGSIASI IV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #38: Large ribosomal subunit protein eL14

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 8.979659 KDa
配列文字列:
MPAIDVGRIA VVIAGRRAGQ KVVVVDIIDK NFVLVTGAGL NKVKRRRMNI KHIEPLPQKI DIPRGASDEE VRAALEKAGI SLA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL14

+
分子 #39: Large ribosomal subunit protein uL15

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 16.439346 KDa
配列文字列:
MIRRRKKVRK LRGSHTHGWG CKKKHRGGGS KGGRGMAGTG KRNKSKWTWT IKYAPDHLGK RGFSRPPEVQ REVRVVNLKF IDEHLDELM QMGIAYEEGG KIIVDVTQFA DKVLGTGKLT RPLVIKARAF SPKAEEKIKA AGGEAVLV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #40: Large ribosomal subunit protein eL15

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 22.644896 KDa
配列文字列: MGMYKYIREA WKSPKKSYVG ELLKQRMIKW RREPVVVRIE RPTRLDRARA LGYQAKQGYV IVRVRVRKGG RKRPRWKGGR KPSKMGQVK YSPKKSLQWI AEEKAARKFP NLEVLNSYWV GEDGMYKWFE VIMVDPHHPV IKSDPKIAWI ALKHHKGRVF R GLTSAGKK ...文字列:
MGMYKYIREA WKSPKKSYVG ELLKQRMIKW RREPVVVRIE RPTRLDRARA LGYQAKQGYV IVRVRVRKGG RKRPRWKGGR KPSKMGQVK YSPKKSLQWI AEEKAARKFP NLEVLNSYWV GEDGMYKWFE VIMVDPHHPV IKSDPKIAWI ALKHHKGRVF R GLTSAGKK GRGLRNKGKG AEKVRPSIRA NEGKGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL15

+
分子 #41: Large ribosomal subunit protein uL18

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 23.233869 KDa
配列文字列: MAHGPRYRVP FRRRREGKTN YRKRLKLLKS GKPRLVVRKS LNHHIAQIIV YDPKGDRTLV SAHTRELIRD FGWKGHCGNT PSAYLLGLL IGYKAKQAGI EEAILDIGLH PPVRGSSVFA VLKGAVDAGL NVPHSPEIFP DEYRIRGEHI AEYAKMLKEQ D EEKFRRQF ...文字列:
MAHGPRYRVP FRRRREGKTN YRKRLKLLKS GKPRLVVRKS LNHHIAQIIV YDPKGDRTLV SAHTRELIRD FGWKGHCGNT PSAYLLGLL IGYKAKQAGI EEAILDIGLH PPVRGSSVFA VLKGAVDAGL NVPHSPEIFP DEYRIRGEHI AEYAKMLKEQ D EEKFRRQF GGYLVKGLDP EKLPEHFEEV KARIIEKFEG EGARE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #42: Large ribosomal subunit protein eL18

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 13.758037 KDa
配列文字列:
MKRTGPTDPN LRRLIRYLRK KSNEYGVKIW KDVAWRLERP RRQRAEVNVS KINRYANDGE MIVVPGSVLG AGKLEKKVIV AAWKFSETA RRKIIEAGGE AITIEELIER NPTGSGVRIM E

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL18

+
分子 #43: Large ribosomal subunit protein eL19

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 17.9206 KDa
配列文字列:
MNTLKMQRRI AAEILKCGEN RIWIDPERID DVASAITRED IKRLIKEGVI KKKPIKGQSR YRAKIRHEQK KKGRHRGPGS RKGKKTARM GKKELWIKTI RALRKELRKL KAQKKIDRKT YRMLYIRAKG GQFKNKHQLY LFLEEHGLLK K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL19

+
分子 #44: Large ribosomal subunit protein eL21

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 11.371449 KDa
配列文字列:
MVQKAHSFRR KTRKKLSKHP RRRGLPPLTR FLQEFEVGQR VHIVIEPSYH KGMPDPRFHG RTGTVVGKRG EAYIVEIKDG SKVKTLFIH PVHLRPQK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL21

+
分子 #45: Large ribosomal subunit protein uL22

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 17.679818 KDa
配列文字列:
MAKRFGYSFQ NFDPKRMARA SARDLRISPK LAVEVCRELR GMMLNDALRY LDDVIALKRP VPLKRYNDSQ GHKPGKGFGP GRYPVKVAK AIKKVLLNVK NNAVQKGLDP DKLKIIHIAA HKGPVLRGWY PRAFGRATPF NEQTTHIEVV VEEIRR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #46: Large ribosomal subunit protein uL23

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 9.893677 KDa
配列文字列:
MDPYKVIIRP VVTEKAISLI EKENKLTFIV DRRATKQDIK RAVEEIFNVK VEKVNTLITP RGEKKAYVKL KPEYSASEVA ARLGLF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #47: Large ribosomal subunit protein uL24

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 14.364969 KDa
配列文字列:
MKISSKQPRK QRKFLYNAPL HVRQKLMSAP LSRELREKYK VRNLPVRVGD KVRIMRGDYK GHEGKVVEVD LKRYRIYVEG ATLRKTNGT EVFYPIHPSN VMIIELNLED EKRKKIIERR AG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #48: Large ribosomal subunit protein eL24

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 7.938257 KDa
配列文字列:
MARWNVCSYC GKPFEPGTGK MYVRNDGRVL FFCSRKCERY YFMGRNPRKL KWTKAYQEAR LQRGGE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL24

+
分子 #49: Large ribosomal subunit protein uL29

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 8.54929 KDa
配列文字列:
MKPSEIREMS IEEIDAKIRE LRLQLAKERG LLTMGTSLEN PMVIRNLRRD IARLLTIKKE KLREREKGKV KK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #50: Large ribosomal subunit protein uL30

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 17.745029 KDa
配列文字列:
MAKLAVIRIR GRVNVKRPVR DTLAMLRLHR VNHCVIVDDT PSYLGMLQKA KDYITWGEIN AETLAKLIRK RGRLIGNKPV TDEYVKEKL GMTIEEFAQK VVNGEMSLKD LPNLKPVFRL HPPRGGFRGS KKRSFKEGGA LGYRGEKINE LIERML

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #51: Large ribosomal subunit protein eL30

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 10.727576 KDa
配列文字列:
MDLAFELRKA METGKVVLGS NETIRLAKTG GAKLIIVAKN APKEIKDDIY YYAKLSDIPV YEFEGTSVEL GTLLGKPFVV ASLAIVDPG ESKILAIAKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL30

+
分子 #52: Large ribosomal subunit protein eL31

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 11.083242 KDa
配列文字列:
MAIKAGEEVI FTVPIKKIKK IVPRWKRAPR AVKFVREFVA RHAKAQEVII DPKVNEKIWE RGIEKPPSKL RVKVKVEEEK REGEETVRI AYVTLA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL31

+
分子 #53: Large ribosomal subunit protein eL32

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 15.576629 KDa
配列文字列:
MDEKEFKRLL RVRARLKRKK PRFLRQEWWR YPKFKNDPKW RRPKGIDSKM RLKLKGKPRS PSIGWSSPKL VRGLHPSGYE EVLVHNVKE LEALDPKRQA ARIAHTVGKK KRIEIIKRAE ELGIKVLNPR V

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL32

+
分子 #54: Large ribosomal subunit protein eL34

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 10.677132 KDa
配列文字列:
MKPMYRSRSW RRKYVRTPGG RVVIHFERKK PKIAHCAMCG RPLNGIPRGR PVEMRKLPKT KKRPERPMPH LCPRCMRKVM KEQIRAQLS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL34

+
分子 #55: Large ribosomal subunit protein eL33

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 9.75556 KDa
配列文字列:
MRIKGVVLSY RRSKENQHNN VMIIKPLDVN SREEASKLIG RLVLWKSPSG KILKGKIVRV HGTKGAVRAR FEKGLPGQAL GDYVEIV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL33

+
分子 #56: Large ribosomal subunit protein eL37

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 7.245577 KDa
配列文字列:
MGSGTATFGK RNSTPTHIRC RRCGRVSYNV KKGYCAACGF GRSRRLRKYR WSKKWKKKKN AH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL37

+
分子 #57: Large ribosomal subunit protein eL43

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 8.956689 KDa
配列文字列:
MSGTKKVGSA GRFGARYGLK IRRRVAAVEA KMRQKHTCPV CGRKAVKRIS TGIWQCQKCG ATFAGGAYLP VTPAGKAVRR ITE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL43

+
分子 #58: Large ribosomal subunit protein eL39

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 6.323784 KDa
配列文字列:
MARNKPLAKK LRLAKALKQN RRVPVWVIVK TNRRVLTHPK RRYWRRTKLK E

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL39

+
分子 #59: Large ribosomal subunit protein eL40

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 5.858063 KDa
配列文字列:
MARFPEAEAR IFKKYVCLRC GATNPWGAKK CRKCGYKRLR PKAKEPRGGG R

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL40

+
分子 #60: Small ribosomal subunit protein eS32

分子名称: Small ribosomal subunit protein eS32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 5.023395 KDa
配列文字列:
MKRRPRKWKK KGRMRWKWIK KRIRRLKRQR KKERGLI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS32

+
分子 #61: Large ribosomal subunit protein eL42

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 11.234449 KDa
配列文字列:
MKYPKQIRTY CPFCKKHTIH KVERVKKRPR SELSAGQRRF RRILKGYGGF PRPKPEGREK PVKKLDLRFR CTECGKAHTR GRGFRVKKF ELVEG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL42

+
分子 #62: Large ribosomal subunit protein eL20

分子名称: Large ribosomal subunit protein eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 9.350005 KDa
配列文字列:
MKVKVFRVHG YFEKNGRKFK FTKEYRGIKE EDVKELVYSD IGSKHKVKRN KIFIKEIKEI RPEEAEDIVV RRLSLEL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL20

+
分子 #63: C2H2-type domain-containing protein

分子名称: C2H2-type domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pyrococcus furiosus (古細菌)
分子量理論値: 7.597191 KDa
配列文字列:
MVKLKAIIVK DRDGEEFLRC PRCGMVFKRR KDYTKHVNKA HGWLFGRGKP KGKRLQKKYL KASQ

UniProtKB: C2H2-type domain-containing protein

+
分子 #64: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 64 / コピー数: 13 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #65: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 65 / コピー数: 1501 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 1.01 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

4v6u

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.67 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC / 使用した粒子像数: 91960
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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