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- EMDB-52048: Mouse mitoribosome large subunit assembly intermediate bound to N... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-52048
タイトルMouse mitoribosome large subunit assembly intermediate bound to NSUN4, METRF4, MRM2, GTPBP7 and MALSU1-L0R8F8-mt-ACP complex, State D (SAMC knock-out)
マップデータ
試料
  • 複合体: Assembly intermediate of the mitoribosome large subunit
    • RNA: x 1種
    • タンパク質・ペプチド: x 57種
  • RNA: x 1種
  • リガンド: x 5種
キーワードmitochondria / ribosome / large subunit / assembly intermediate
機能・相同性
機能・相同性情報


Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / mRNA (cytidine-5-)-methyltransferase activity / regulation of respiratory system process / mitochondrial RNA catabolic process / regulation of mitochondrial translation / negative regulation of mitochondrial translation / mitochondrial large ribosomal subunit assembly / rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity / Protein lipoylation ...Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / mRNA (cytidine-5-)-methyltransferase activity / regulation of respiratory system process / mitochondrial RNA catabolic process / regulation of mitochondrial translation / negative regulation of mitochondrial translation / mitochondrial large ribosomal subunit assembly / rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity / Protein lipoylation / Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation / Complex I biogenesis / positive regulation of mitochondrial translation / rRNA import into mitochondrion / Respiratory electron transport / mitochondrial transcription / mitochondrial translational termination / : / mitochondrial translational elongation / ribonuclease III activity / translation release factor activity, codon nonspecific / Mitochondrial protein degradation / camera-type eye development / mitochondrial [2Fe-2S] assembly complex / iron-sulfur cluster assembly complex / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial fission / mitochondrial large ribosomal subunit binding / peptidyl-tRNA hydrolase / rRNA methylation / mitochondrial ribosome / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ / mitochondrial small ribosomal subunit / peptidyl-tRNA hydrolase activity / mitochondrial translation / [2Fe-2S] cluster assembly / protein targeting to mitochondrion / iron-sulfur cluster assembly / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / proton motive force-driven mitochondrial ATP synthesis / respiratory chain complex I / RNA processing / rescue of stalled ribosome / aerobic respiration / 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの / ribosome assembly / cellular response to leukemia inhibitory factor / ribosomal large subunit biogenesis / cytosolic ribosome assembly / fatty acid biosynthetic process / rRNA processing / cell junction / double-stranded RNA binding / heart development / 5S rRNA binding / double-stranded DNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / mitochondrial inner membrane / rRNA binding / nuclear body / structural constituent of ribosome / mitochondrial matrix / translation / protein domain specific binding / ribonucleoprotein complex / nucleotide binding / GTPase activity / apoptotic process / regulation of DNA-templated transcription / GTP binding / nucleolus / mitochondrion / RNA binding / nucleoplasm / metal ion binding / nucleus / plasma membrane / cytosol
類似検索 - 分子機能
GTPase, MTG1 / Mitochondrial termination factor repeats / Transcription termination factor, mitochondrial/chloroplastic / MTERF superfamily, mitochondrial/chloroplastic / mTERF / MIEF1-MP, LYR domain / : / Ribosomal RNA large subunit methyltransferase E / Protein Iojap/ribosomal silencing factor RsfS / Ribosomal silencing factor during starvation ...GTPase, MTG1 / Mitochondrial termination factor repeats / Transcription termination factor, mitochondrial/chloroplastic / MTERF superfamily, mitochondrial/chloroplastic / mTERF / MIEF1-MP, LYR domain / : / Ribosomal RNA large subunit methyltransferase E / Protein Iojap/ribosomal silencing factor RsfS / Ribosomal silencing factor during starvation / SAM-dependent methyltransferase RsmB/NOP2-type / RNA (C5-cytosine) methyltransferase / : / 16S rRNA methyltransferase RsmB/F / SAM-dependent MTase RsmB/NOP-type domain profile. / : / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L55 superfamily / : / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / Ribosomal protein S30, mitochondrial / Ribosomal protein L53, mitochondrial / 39S ribosomal protein L53/MRP-L53 / 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S32 / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Ribosomal protein L28/L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Mitochondrial ribosomal protein L28 / Ribosomal protein 63, mitochondrial / Growth arrest/ DNA-damage-inducible protein-interacting protein 1 / Ribosomal protein L35, mitochondrial / Ribosomal protein L51, mitochondrial / Growth arrest and DNA-damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Mitochondrial ribosomal subunit / Mitochondrial ribosome protein 63 / Ribosomal protein L37/S30 / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 domain superfamily / : / : / Mitochondrial 28S ribosomal protein S30 (PDCD9) / 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / Mitoribosomal protein mL52 / : / MRPL44, double-stranded RNA binding domain / : / MRPL44 dsRNA-binding domain / Large ribosomal subunit protein mL44, endonuclease domain / GTP-binding protein, orthogonal bundle domain superfamily / : / Large ribosomal subunit protein bL9m C-terminal domain / Tim44-like domain / Tim44-like domain / Tim44 / : / : / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal subunit 39S / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / : / Mitochondrial ribosomal protein L27 / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / Phosphatidylethanolamine-binding protein, eukaryotic / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein / PEBP-like superfamily / Circularly permuted (CP)-type guanine nucleotide-binding (G) domain / Circularly permuted (CP)-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. / Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily / TGS-like / TGS domain profile. / TGS / Peptide chain release factor class I / RF-1 domain / Ribonuclease III, endonuclease domain superfamily / 50S ribosome-binding GTPase / GTP binding domain / Double stranded RNA-binding domain (dsRBD) profile. / Double-stranded RNA-binding domain / Complex 1 LYR protein domain / Complex 1 protein (LYR family) / : / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Ribosomal protein/NADH dehydrogenase domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Beta-grasp domain superfamily / Acyl carrier protein (ACP) / NTF2-like domain superfamily / NUDIX hydrolase-like domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Predicted gene, 55359 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein uL22m / Transcription termination factor 4, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein mL38 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein mL62 ...Predicted gene, 55359 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein uL22m / Transcription termination factor 4, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein mL38 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein mL62 / Mitochondrial ribosome-associated GTPase 1 / Large ribosomal subunit protein mL50 / Large ribosomal subunit protein mL37 / Large ribosomal subunit protein mL66 / Large ribosomal subunit protein bL36m / Large ribosomal subunit protein bL34m / Large ribosomal subunit protein bL27m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein bL9m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein uL15m / Large ribosomal subunit protein mL42 / Large ribosomal subunit protein mL54 / rRNA methyltransferase 2, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein mL51 / Large ribosomal subunit protein uL24m / Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein uL11m / Large ribosomal subunit protein mL63 / Large ribosomal subunit protein bL20m / Large ribosomal subunit protein uL18m / Large ribosomal subunit protein bL35m / Large ribosomal subunit protein mL41 / Large ribosomal subunit protein bL33m / Acyl carrier protein, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein mL64 / Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1 / Large ribosomal subunit protein mL44 / 5-cytosine rRNA methyltransferase NSUN4 / Large ribosomal subunit protein mL55 / Large ribosomal subunit protein mL65 / Large ribosomal subunit protein mL45 / Large ribosomal subunit protein mL52 / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein mL53 / Large ribosomal subunit protein uL14m / Large ribosomal subunit protein bL21m / Large ribosomal subunit protein uL13m / Large ribosomal subunit protein bL19m / Large ribosomal subunit protein uL2m / Large ribosomal subunit protein uL30m / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein bL32m / Large ribosomal subunit protein uL4m / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein mL39 / Large ribosomal subunit protein mL40
類似検索 - 構成要素
生物種Mus musculus (ハツカネズミ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.91 Å
データ登録者Singh V / Glasgow R / Amunts A / Freyer C / Wredenberg A
資金援助 スウェーデン, デンマーク, 3件
OrganizationGrant number国
Swedish Research Council スウェーデン
Novo Nordisk Foundation デンマーク
Knut and Alice Wallenberg Foundation スウェーデン
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2025
タイトル: The mitochondrial methylation potential gates mitoribosome assembly.
著者: Ruth I C Glasgow / Vivek Singh / Lucía Peña-Pérez / Alissa Wilhalm / Marco F Moedas / David Moore / Florian A Rosenberger / Xinping Li / Ilian Atanassov / Mira Saba / Miriam Cipullo / ...著者: Ruth I C Glasgow / Vivek Singh / Lucía Peña-Pérez / Alissa Wilhalm / Marco F Moedas / David Moore / Florian A Rosenberger / Xinping Li / Ilian Atanassov / Mira Saba / Miriam Cipullo / Joanna Rorbach / Anna Wedell / Christoph Freyer / Alexey Amunts / Anna Wredenberg /
要旨: S-adenosylmethionine (SAM) is the principal methyl donor in cells and is essential for mitochondrial gene expression, influencing RNA modifications, translation, and ribosome biogenesis. Using direct ...S-adenosylmethionine (SAM) is the principal methyl donor in cells and is essential for mitochondrial gene expression, influencing RNA modifications, translation, and ribosome biogenesis. Using direct long-read RNA sequencing in mouse tissues and embryonic fibroblasts, we show that processing of the mitochondrial ribosomal gene cluster fails in the absence of mitochondrial SAM, leading to an accumulation of unprocessed precursors. Proteomic analysis of ribosome fractions revealed these precursors associated with processing and assembly factors, indicating stalled biogenesis. Structural analysis by cryo-electron microscopy demonstrated that SAM-dependent methylation is required for peptidyl transferase centre formation during mitoribosome assembly. Our findings identify a critical role for SAM in coordinating mitoribosomal RNA processing and large subunit maturation, linking cellular methylation potential to mitochondrial translation capacity.
履歴
登録2024年11月8日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年6月18日-
マップ公開2025年6月18日-
更新2025年7月16日-
現状2025年7月16日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

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ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_52048.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 600.7 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

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その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.85 Å/pix.
x 540 pix.
= 456.986 Å		0.85 Å/pix.
x 540 pix.
= 456.986 Å		0.85 Å/pix.
x 540 pix.
= 456.986 Å

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投影像

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断面 (1/2)

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ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.84627 Å
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ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.006
最小 - 最大-0.02057847 - 0.058474112
平均 (標準偏差)-0.000037506386 (±0.0017128428)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ540540540
Spacing540540540
セルA=B=C: 456.9858 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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追加マップ: #1

ファイルemd_52048_additional_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_52048_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_52048_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Assembly intermediate of the mitoribosome large subunit

全体名称: Assembly intermediate of the mitoribosome large subunit
要素
  • 複合体: Assembly intermediate of the mitoribosome large subunit
    • RNA: 16S rRNA (1584-MER)
    • タンパク質・ペプチド: 5-cytosine rRNA methyltransferase NSUN4
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL2m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL3m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL4m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL9m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL11m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL13m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL14m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL15m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL17m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL18m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL19m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL20m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL21m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL22m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL23m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL24m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL27m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL28m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL29m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL30m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL32m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL33m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL34m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL35m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL36m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL38
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL39
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL43
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL44
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL45
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL46
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL48
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL49
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL50
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL51
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL52
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL53
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL63
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL62
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL64
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL66
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL65
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1
    • タンパク質・ペプチド: Predicted gene, 55359
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL37
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL40
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL41
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL42
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL55
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL16m
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL10m
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosome-associated GTPase 1
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein mL54
    • タンパク質・ペプチド: rRNA methyltransferase 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Transcription termination factor 4, mitochondrial
  • RNA: tRNA-Phe (68-MER)
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
  • リガンド: water

+
超分子 #1: Assembly intermediate of the mitoribosome large subunit

超分子名称: Assembly intermediate of the mitoribosome large subunit
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0
含まれる分子: #1, #25, #3-#6, #8-#11, #13-#24, #26-#55, #12, #7, #56-#59
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)

+
分子 #1: 16S rRNA (1584-MER)

分子名称: 16S rRNA (1584-MER) / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 508.601906 KDa
配列文字列: AACUAAUCCU AGCCCUAGCC CUACACAAAU AUAAUUAUAC UAUUAUAUAA AUCAAAACAU UUAUCCUACU AAAAGUAUUG GAGAAAGAA AUUCGUACAU CUAGGAGCUA UAGAACUAGU ACCGCAAGGG AAAGAUGAAA GACUAAUUAA AAGUAAGAAC A AGCAAAGA ...文字列:
AACUAAUCCU AGCCCUAGCC CUACACAAAU AUAAUUAUAC UAUUAUAUAA AUCAAAACAU UUAUCCUACU AAAAGUAUUG GAGAAAGAA AUUCGUACAU CUAGGAGCUA UAGAACUAGU ACCGCAAGGG AAAGAUGAAA GACUAAUUAA AAGUAAGAAC A AGCAAAGA UUAAACCUUG UACCUUUUGC AUAAUGAACU AACUAGAAAA CUUCUAACUA AAAGAAUUAC AGCUAGAAAC CC CGAAACC AAACGAGCUA CCUAAAAACA AUUUUAUGAA UCAACUCGUC UAUGUGGCAA AAUAGUGAGA AGAUUUUUAG GUA GAGGUG AAAAGCCUAA CGAGCUUGGU GAUAGCUGGU UACCCAAAAA AUGAAUUUAA GUUCAAUUUU AAACUUGCUA AAAA AACAA CAAAAUCAAA AAGUAAGUUU AGAUUAUAGC CAAAAGAGGG ACAGCUCUUC UGGAACGGAA AAAACCUUUA AUAGU GAAU AAUUAACAAA ACAGCUUUUA ACCAUUGUAG GCCUAAAAGC AGCCACCAAU AAAGAAAGCG UUCAAGCUCA ACAUAA AAU UUCAAUUAAU UCCAUAAUUU ACACCAACUU CCUAAACUUA AAAUUGGGUU AAUCUAUAAC UUUAUAGAUG CAACACU GU UAGUAUGAGU AACAAGAAUU CCAAUUCUCC AGGCAUACGC GUAUAACAAC UCGGAUAACC AUUGUUAGUU AAUCAGAC U AUAGGCAAUA AUCACACUAU AAAUAAUCCA CCUAUAACUU CUCUGUUAAC CCAACACCGG AAUGCCUAAA GGAAAGAUC CAAAAAGAUA AAAGGAACUC GGCAAACAAG AACCCCGCCU GUUUACCAAA AACAUCACCU CUAGCAUUAC AAGUAUUAGA GGCACUGCC UGCCCAGUGA CUAAAGUUUA ACGGCCGCGG UAUCCUGACC GUGCAAAGGU AGCAUAAUCA CUUGUUCCUU A AUUAGGGA CUAGCAUGAA CGGCUAAACG AGGGUCCAAC UGUCUCUUAU CUUUAAUCAG UGAAAUUGAC CUUUCAGUGA AG AGGCUGA AAUAUAAUAA UAAGACGAGA AGACCCUAUG GAGCUUAAAU UAUAUAACUU AUCUAUUUAA UUUAUUAAAC CUA AUGGCC CAAAAACUAU AGUAUAAGUU UGAAAUUUCG GUUGGGGUGA CCUCGGAGAA UAAAAAAUCC UCCGAAUGAU UAUA ACCUA GACUUACAAG UCAAAGUAAA AUCAACAUAU CUUAUUGACC CAGAUAUAUU UUGAUCAACG GACCAAGUUA CCCUA GGGA UAACAGCGCA AUCCUAUUUA AGAGUUCAUA UCGACAAUUA GGGUUUACGA CCUCGAUGUU GGAUCAGGAC AUCCCA AUG GUGUAGAAGC UAUUAAUGGU UCGUUUGUUC AACGAUUAAA GUCCUACGUG AUC(PSU)GAGUUC AGACCGGAGC AAU CCAGGU CGGUUUCUAU CUAUUUACGA UUUCUCCCAG UACGAAAGGA CAAGAGAAAU AGAGCCACCU UACAAAUAAG CGCU CUCAA CUUAAUUUAU GAAUAAAAUC UAAAUAAAAU AUAUACGUAC ACCCUCUAAC CUAGAGAAGG UUA

GENBANK: GENBANK: AB049357.1

+
分子 #2: tRNA-Phe (68-MER)

分子名称: tRNA-Phe (68-MER) / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 21.862076 KDa
配列文字列:
GUUAAUGUAG CUUAAUAACA AAGCAAAGCA CUGAAAAUGC UUAGAUGGAU AAUUGUAUCC CAUAAACA

GENBANK: GENBANK: AB049357.1

+
分子 #3: Large ribosomal subunit protein uL2m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL2m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 27.168541 KDa
配列文字列: AKFVSWKSRT KYTVKPVKMR KSGGRDHTGR IRVHGIGGGH KQNYRMIDFL RFRPEKEKAP EPFEEKVVVV RYDPCRSADI ALVAGGSRK RWIIATENMK AGDTILNSNH IGRMAVAAQE GDAHPLGALP VGTLINNVES EPGRGAQYIR AAGTCGVLLR K VNGTAIIQ ...文字列:
AKFVSWKSRT KYTVKPVKMR KSGGRDHTGR IRVHGIGGGH KQNYRMIDFL RFRPEKEKAP EPFEEKVVVV RYDPCRSADI ALVAGGSRK RWIIATENMK AGDTILNSNH IGRMAVAAQE GDAHPLGALP VGTLINNVES EPGRGAQYIR AAGTCGVLLR K VNGTAIIQ LPSKRQMQVL ESCTATVGRV SNVNHNQRVI GKAGRNRWLG KRPNSGLWQR KGGWAGRKIR PLPPMKSYVK LP SAAAQN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2m

+
分子 #4: Large ribosomal subunit protein uL3m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL3m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 34.843762 KDa
配列文字列: LHSKSSTWWD EHLSEENLSF VKQLVSDENK TQLTSKLNPL KDEPWPLHPW EPGSFRVGLI ALKLGMMPLW TKDGQKHAVT LLQVQDCHV LKYTPKEDHN GKIAALTVGG KTVSRFYKPD SRLEFYRDLG LPPKQIHKIF HVTDNAVIKP GTPLYAAHFR P GQYVDVTA ...文字列:
LHSKSSTWWD EHLSEENLSF VKQLVSDENK TQLTSKLNPL KDEPWPLHPW EPGSFRVGLI ALKLGMMPLW TKDGQKHAVT LLQVQDCHV LKYTPKEDHN GKIAALTVGG KTVSRFYKPD SRLEFYRDLG LPPKQIHKIF HVTDNAVIKP GTPLYAAHFR P GQYVDVTA KTIGKGFQGV MKRWGFKGQP ASHGQTKTHR RPGAISTGDI ARVWPGTKMP GRMGNQNRTV YGLKVWRVNT KH NIIYVNG SVPGHKNCLV KIKDSTLPAY KDSCKNLPFP TYFPDGDEEE LPEDLFDESV WQPSEPSITF A

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3m

+
分子 #5: Large ribosomal subunit protein uL4m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL4m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 28.410777 KDa
配列文字列: DPVLRKCELR IPVHRRPVQA WVESLRGFEQ ERIGLAELHP DVFATAPRLD IVHQVAIWQR NFRRISYANT KTRAEVSGGG RKPWQQKGS GRARHGSIRS PLWRGGGVAH GPRGPTSYYY MLPMKVRALG LKVALTVKLM QDDLHIVDSL ELPTADPQYL T ELAQYRHW ...文字列:
DPVLRKCELR IPVHRRPVQA WVESLRGFEQ ERIGLAELHP DVFATAPRLD IVHQVAIWQR NFRRISYANT KTRAEVSGGG RKPWQQKGS GRARHGSIRS PLWRGGGVAH GPRGPTSYYY MLPMKVRALG LKVALTVKLM QDDLHIVDSL ELPTADPQYL T ELAQYRHW GSSVLLVDLT HEEMPKNVVA ATSGLNSFNL IPAVGLNVYS MLKHQTLVLT LPSVAFLEDK LLWQDSRYTP LY PFRLPYS DFP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4m

+
分子 #6: Large ribosomal subunit protein bL9m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL9m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 11.058809 KDa
配列文字列:
TVIVERWWKV PLAGEGRKPH LHRRHRVYKL VEDTKHRPKD NLELILTQSV DEIGVRGDLV SVKKSVGRNK LLSQGLAVYA SPENRKLFE EEKSLR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9m

+
分子 #7: Large ribosomal subunit protein uL10m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL10m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 29.438631 KDa
配列文字列: MAAAVAGILR GGLPPRAAWL PTLQTVRHGS KAVTRHWRVM HFQRQKLMAI TEYIPPKPAI NPRCLPPPPK PPKEESGLVR LLRQDIVAV FRDNRMIAVC QNVALSAEDK LLLRHQLRKH KIFIKVFPSQ VLKPFLENSK YRNLLPLFVG HNLLLVSEEP K VKEMVRVL ...文字列:
MAAAVAGILR GGLPPRAAWL PTLQTVRHGS KAVTRHWRVM HFQRQKLMAI TEYIPPKPAI NPRCLPPPPK PPKEESGLVR LLRQDIVAV FRDNRMIAVC QNVALSAEDK LLLRHQLRKH KIFIKVFPSQ VLKPFLENSK YRNLLPLFVG HNLLLVSEEP K VKEMVRVL KSVPFLPLLG GCVDDTILSR QGLVDYAKLP SLDQLQGQLV GGLTHLMAQT RYLLQHQPVQ LTSLLDQYVK EQ NEGDCAT SANEKLHPPD PAPDA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10m

+
分子 #8: Large ribosomal subunit protein uL11m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL11m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 18.852955 KDa
配列文字列:
GVIRSIVRAG QAIPGPPLGP ILGQRGVSIN QFCKEFNEKT KDIKEGIPLP TKIFIKPDRT FELKIGQPTV SYFLKAAAGI EKGARHTGK EVAGLVSLKH VYEIACVKAK DDAFAMQDVP LSSVVRSIIG SARSLGIRVV KDLSAEELEA FQKERAVFLA A QKEADLAA QAEAAKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11m

+
分子 #9: Large ribosomal subunit protein uL13m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL13m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 20.576689 KDa
配列文字列:
SSFSRAPQQW ATFARMWYLL DGKMQPPGKL AVIASNKLQG LNKPVYHQLS DCGDHVVIIN TRHIAFSGNK WEQKVYSSHT GYPGGFRQV TAAQLHRKDP VAIVKLAIYG MLPKNLHRRT MMQRLHLFPD EDIPEDILKN LVEELPQPRR VPKRLDEYTQ E EIEAFPRV WTPPDDFRM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13m

+
分子 #10: Large ribosomal subunit protein uL14m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL14m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 12.751924 KDa
配列文字列:
AVQKMTRVRV VDNSALGSTP YHRPPRCIHV YNKSGVGKVG DQILLAIRGQ KKKALIVGHR MPGSRMTPKF DSNNVVLIED NGNPVGTRI KIPIPTSLRR REGEYSKVLA IAQNFV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14m

+
分子 #11: Large ribosomal subunit protein uL15m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL15m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 32.846996 KDa
配列文字列: GTSLDLLRSL PRVSLANLKP SPNSRKRERR PRDRRRGRKC GRGHKGERQR GTRPRLGFEG GQTPFYIRIP KYGFNEGHSF RHQYQPLSL RRLQYLIDLG RVDPTQPIDL TQLVNGRGVT IQPLKRDYGV QLVEEGADTF QAKINIEVQL ASELAIAAIE K NGGVVTTA ...文字列:
GTSLDLLRSL PRVSLANLKP SPNSRKRERR PRDRRRGRKC GRGHKGERQR GTRPRLGFEG GQTPFYIRIP KYGFNEGHSF RHQYQPLSL RRLQYLIDLG RVDPTQPIDL TQLVNGRGVT IQPLKRDYGV QLVEEGADTF QAKINIEVQL ASELAIAAIE K NGGVVTTA FYDPRSLEIL CKPIPFFLRG QPIPKRMLPP ESLVPYYTDA KNRGYLADPA KFPEARLELA MKFGYVLPDI TK DELFRML SARKDPRQIF FGLAPGWVVN MADKKILKPT DENLLKYYSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15m

+
分子 #12: Large ribosomal subunit protein uL16m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL16m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 25.582947 KDa
配列文字列: LKTLLPVPTF ENVSIPERSK LKFVERVPLV PKVRREPKNL KDIRGPSTEA TDFTEGNFAI LALGGGYLHW GHFEMMRLTI NRFMDPKNM FAIWRVPAPF KPITRKGVGQ RMGGGKGAID HYVTPVKTGC LVVEMGGRCE FEEVKGILNQ VAHKLPFPAK A VSRKTLER ...文字列:
LKTLLPVPTF ENVSIPERSK LKFVERVPLV PKVRREPKNL KDIRGPSTEA TDFTEGNFAI LALGGGYLHW GHFEMMRLTI NRFMDPKNM FAIWRVPAPF KPITRKGVGQ RMGGGKGAID HYVTPVKTGC LVVEMGGRCE FEEVKGILNQ VAHKLPFPAK A VSRKTLER MHQNQREREL NNQNPWTFEH IATANMFGIR KFLSPYDLTQ KGRYWGKFYM PKRV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16m

+
分子 #13: Large ribosomal subunit protein bL17m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL17m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 17.908711 KDa
配列文字列:
ISHGRVYRRL GLGPESRIHL LRNLLTGLVR HERIEATWAR ADEMRGYAEK LIDYGKLGDT NERAMRMADF WLTEKDLIPK LFKVLAPRF QGQNGNYTRM LQIPNRKEQD RAKMAVIEYK GNYLPPLPLP HRDSNLTLLN QLLLGLQQDL HHNQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17m

+
分子 #14: Large ribosomal subunit protein uL18m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL18m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 16.407738 KDa
配列文字列:
KENEAVAPEF TNRNPRNLEL LGVARKERGW ATVWPNREFW HRLRVVKTQH HVEAFVEHLN GQVVVSASTR EWAIKKHLYS TRNVVACES IGRVLAQRCL EAGINFMVYQ PTPWEASSDS IKRLQNAMTE SGVMLREPRR IY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18m

+
分子 #15: Large ribosomal subunit protein bL19m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL19m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 25.467525 KDa
配列文字列: RFLSPEFIPP RGRTNPLKFK IERKDMLDRR KVLPIPEFYV GSILRVTTAD PYASGKTSQF LGICIKRSGN GLGATFTLRN TIEGQGVEI CFELYNPRIQ EIQVVKLEKR LDDNLLYLRD ALPEYSTFDV NMKPVPQEAC QEVPVNKLKV KMKPKPWSKR W ERPNFNIK ...文字列:
RFLSPEFIPP RGRTNPLKFK IERKDMLDRR KVLPIPEFYV GSILRVTTAD PYASGKTSQF LGICIKRSGN GLGATFTLRN TIEGQGVEI CFELYNPRIQ EIQVVKLEKR LDDNLLYLRD ALPEYSTFDV NMKPVPQEAC QEVPVNKLKV KMKPKPWSKR W ERPNFNIK GIRFDLALTE EQMKEAQKWN KPWIEFDMMR EYDTSKIEAA LWEEIEASK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19m

+
分子 #16: Large ribosomal subunit protein bL20m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL20m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 16.482396 KDa
配列文字列:
LRNRLTDRYW RVQEVLKHAQ HFRGRKNRCY RLAVRAVTRA FVKCTKARRL KKRNLRTLWI NRITAASQEH GLKYPAFIVN LIKCQVELN RKVLVDLAIY EPKTFKSLAA LAKRRQQEGF AAALGDGKEP EGIFSRVVQY H

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20m

+
分子 #17: Large ribosomal subunit protein bL21m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL21m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 18.457645 KDa
配列文字列:
YPQGYVPKTS LSSPPWQEVV LPDPVEETRH HAEVVKRVNE LIATGQYGRL FAVVHFASHQ WKVTAEDLIL IENELDIKCG ERIRLEKVL LVGADNFTLL GKPLLRKELV RVEATVIEKT ESWPKINMKF RKRKNFRKKK IIVNPQTILR INTIEIAPRL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21m

+
分子 #18: Large ribosomal subunit protein uL22m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL22m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 19.504783 KDa
配列文字列:
ISRKWEKKNK IVYPPQLPGE PRRPAEIYHC RRQIKYSKDK MWYLAKMIRG MSIDQALAQL EFNDKKGAQI IKEVLLEAQD MAVRDHNVE FRSNLHIAES TSGRGQCLKR IRYHGRGRFG IMEKVYCHYF VKLVEGPPPP PEVPKTAVDH AKDYIQQLRS R TIIHTL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22m

+
分子 #19: Large ribosomal subunit protein uL23m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL23m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 17.014408 KDa
配列文字列:
ARNVLYPLYQ LGGPQLRVFR TNFFIQLVRP GTAQPEDTVQ FRIPMEMTRV DLRNYLEQIY NVPVAAVRTR VQHGSNRRRD HKNVRIKKP DYKVAYVQLA HGQTFTFPDL FPEKDPRSPE PLEEELPQQR QSSDLRCPGI PSWFGL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23m

+
分子 #20: Large ribosomal subunit protein uL24m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL24m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 24.016381 KDa
配列文字列: ASKATSSPFY RYGMSRPGSI ADKRKNPPWS RRRPVVVEPI SDEDWHLFCG DMVEILEGKD AGKQGKVVQV VRQRNWVVLE GLNTHYRYI GRTKDHRGTM IASEAPLLHH QVKLVDPVDR KPTEIQWRFT EAGERVRVST RSGRIIPKPE FPRADGIVPE T WTDGPKDT ...文字列:
ASKATSSPFY RYGMSRPGSI ADKRKNPPWS RRRPVVVEPI SDEDWHLFCG DMVEILEGKD AGKQGKVVQV VRQRNWVVLE GLNTHYRYI GRTKDHRGTM IASEAPLLHH QVKLVDPVDR KPTEIQWRFT EAGERVRVST RSGRIIPKPE FPRADGIVPE T WTDGPKDT SVEDALERTY VPRLKTLEED VMEAMGIQET RRFKKVYWY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24m

+
分子 #21: Large ribosomal subunit protein bL27m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL27m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 11.264118 KDa
配列文字列:
KHYGIKKMEG HYVHAGNILG TQRQFRWHPG AHVGLGRNKC LYALEEGIVR YTKDVYVPNP KNTEAVDLVT SLPKGAVLYK TFVHVVPAK PEGTFKLVDM L

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27m

+
分子 #22: Large ribosomal subunit protein bL28m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL28m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 28.613078 KDa
配列文字列: PLHRYPVHLW QKLRLRQGIC ARLPAHFLRS LEEERTPTPV HYKPHGTKFK INPKNGQRER VEDVPIPVHY PPESQQGLWG GEGLILGYR YANNDKLSKR VKKVWKPQLF TRELYSEILD KKFTVTVTMR TLDLIDEAYG FDFYILKTPK EDLGSKFGMD L KRGMLLRL ...文字列:
PLHRYPVHLW QKLRLRQGIC ARLPAHFLRS LEEERTPTPV HYKPHGTKFK INPKNGQRER VEDVPIPVHY PPESQQGLWG GEGLILGYR YANNDKLSKR VKKVWKPQLF TRELYSEILD KKFTVTVTMR TLDLIDEAYG FDFYILKTPK EDLGSKFGMD L KRGMLLRL ARQDPHLHPE NPERRAAIYD KYRSFVIPEA EAEWVGLTLE EALEKQRLLE EKDPVPLFKV YVEELVQRLQ EQ VL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28m

+
分子 #23: Large ribosomal subunit protein uL29m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL29m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 21.602121 KDa
配列文字列:
GLEEFFDDPK NWGEEKVKSG ASWTCQQLRN KSNEDLHKLW YVLLKERNML LTLEQEAKRQ RLPMPSPERL EKVVDSMDNV DKVVQERED ALRLLQTGQE KPRPGAWRRD IFGRIVWHKF KQWPIPWYLN KRYNRRRFFA MPYVDRFIRL RIEKHARIEA R KRSLQKKK EKILHAKF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29m

+
分子 #24: Large ribosomal subunit protein uL30m

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL30m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 14.040479 KDa
配列文字列:
KFTKSRIPDK VFQPKPEDHE KYGGDPQNPH KLHIVTRIRS TKRRPYWEKD TIKMLGLQKA HSPQIHKNIP SVNAKLKVVK HLIRIQPLK LPQGLPTEET MSSTCLKSTG ELVVQWHLKP VE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30m

+
分子 #25: 5-cytosine rRNA methyltransferase NSUN4

分子名称: 5-cytosine rRNA methyltransferase NSUN4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 38.58 KDa
配列文字列: QFTASRLALQ NFDMTYSVQF GDLWPSIRVS LLSEQKYGAL VNNFAAWDSV SAKLEQLSAK DFVSEAISHQ KLEPESGLSP TPSLDCSPN LRCFTFSRGD VSRFPPARLG SLGLMDYYLM DAASLLPVLA LGLQHGDTVL DLCAAPGGKT LALLQTGCCR N LAANDLST ...文字列:
QFTASRLALQ NFDMTYSVQF GDLWPSIRVS LLSEQKYGAL VNNFAAWDSV SAKLEQLSAK DFVSEAISHQ KLEPESGLSP TPSLDCSPN LRCFTFSRGD VSRFPPARLG SLGLMDYYLM DAASLLPVLA LGLQHGDTVL DLCAAPGGKT LALLQTGCCR N LAANDLST SRTGRLQKVL HSYVPQDIRE GNQVRVTSWD GRKWGELEGD TYDRVLVDVP CTTDRHSLHE EENNIFQRSR KK ERQMLPM LQVQLLAAGL LATKPGGHVV YSTCSLSHLQ NEYVVQGAIE LLANQYNIKV QVEDLSHFRK LFMDTFCFFP SCQ VGELVI PNLMVNFGPM YFCKLHRLP

UniProtKB: 5-cytosine rRNA methyltransferase NSUN4

+
分子 #26: Large ribosomal subunit protein bL32m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL32m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 12.61867 KDa
配列文字列:
AAPKNRRTIE VNRCRRRNPQ KLIKIKNNID ICPECGHLKQ KHVLCGYCYE KVRQETTKIR QQIGAQEGGP FRAPSVETMV LYTGEKPSE KDQGKRIVER NIKRPSWFT

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32m

+
分子 #27: Large ribosomal subunit protein bL33m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL33m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 6.079277 KDa
配列文字列:
KTILVKLVSQ AGTGFSFNHK RSRLREKLSL LHYDPIVNKK VLFVEQKKIR SL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33m

+
分子 #28: Large ribosomal subunit protein bL34m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL34m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 5.420406 KDa
配列文字列:
RARGNEYQPS NIKRKHKHGW VRRLSTPAGV QVILRRMLKG RKSLSH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34m

+
分子 #29: Large ribosomal subunit protein bL35m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL35m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 11.703934 KDa
配列文字列:
LTYCSTRKGK RKTVKSVVHR FLRLHSGLWL RRKAGYKKKL WKKSTARKKR LREFVFCSKT QSKLLDKMTT SFWKRRNWYA GDPYQMYHD RTNLRV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35m

+
分子 #30: Large ribosomal subunit protein bL36m

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL36m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 4.623698 KDa
配列文字列:
FKTKGVIKKR CKDCYKVKRR GRWFILCKTN PKHKQRQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36m

+
分子 #31: Large ribosomal subunit protein mL38

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 40.115195 KDa
配列文字列: ERLEKYRSFE RYRRRAEQEA RAPHWWRTYR EHFVKETDPK DKIDIGLPPP RVSRTQKLLE RKHFLRELRA NVEEERAARL RTASIPLEA VRAEWERTCG PYHKQRLAEY YGLYRDLFHG ATFVPWVPLH VAYAVGEEDL IPVYHGNEVT PTEASRAPEV T YEADKDSL ...文字列:
ERLEKYRSFE RYRRRAEQEA RAPHWWRTYR EHFVKETDPK DKIDIGLPPP RVSRTQKLLE RKHFLRELRA NVEEERAARL RTASIPLEA VRAEWERTCG PYHKQRLAEY YGLYRDLFHG ATFVPWVPLH VAYAVGEEDL IPVYHGNEVT PTEASRAPEV T YEADKDSL WTLLFINLDG HLLEPDAEYV HWLLTNIPSN RVAEGQETCP YLPPFPARGS GFHRFAFLLF KQDKPINFSE DT RPSPCYQ LAQRTFRTFD FYKRHQEAMT PAGLAFFQCR WDDSVTHTFH QLLDMREPVF EFVRPPPYHP KQKRFPHEQP LRY LDRYRD SHEPTYGIY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL38

+
分子 #32: Large ribosomal subunit protein mL39

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 33.902 KDa
配列文字列: SPTELTEMRN DLFNREKSRQ LSLTPRTEKI EVKHVGKTDP GTVFVMNKNI STPYSCAMHL SEWYCSKSIL ALVDGQPWDM YKPLTKSCE IKFLTFKDPD PKEVNKAYWR SCAMMLGCVI ERAFKDDYVV SLVRAPEVPV IAGAFCYDVT LDKRLDEWMP T KENLRSFT ...文字列:
SPTELTEMRN DLFNREKSRQ LSLTPRTEKI EVKHVGKTDP GTVFVMNKNI STPYSCAMHL SEWYCSKSIL ALVDGQPWDM YKPLTKSCE IKFLTFKDPD PKEVNKAYWR SCAMMLGCVI ERAFKDDYVV SLVRAPEVPV IAGAFCYDVT LDKRLDEWMP T KENLRSFT KDAHALIYRD LPFETLDVDA RVALEIFQHN KYKVDFIEEK ASQNPERIVK LHRIGDFIDV SEGPLIPRTS VC FQYEVSA VHNLNPSQPN LIRRFQGLSL PTHLRAQFTI WDKLVERSRK MVTED

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL39

+
分子 #33: Large ribosomal subunit protein mL43

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 16.787055 KDa
配列文字列:
TGRGTSSRFL TSVLHNGLGR YVQQLQRLSL SLSRDAPSSR GAREFVEREV TDFARRNPGV VVYVNPRPCA MPRIVAEYLN GAVREENVN SKSVEEIKSL VQKLADQSGL DVIRIRKPFH TDNPSIQGQW HPFTNKRTAL HGLRPRELR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL43

+
分子 #34: Large ribosomal subunit protein mL44

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL44 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 33.030918 KDa
配列文字列: VKKGFRAAFR FQKELERWRL LRCPPPPVRR SEKPNWDYHA EVQAFGSRLQ ETFSLDLLKT AFINSCYIKS EEAKRQSLGI EKEAALLNL KDNQELFEQG LSFSHRCLTQ FLEDEFPDLP AEGTESLVSF LTGEAVVCHV ARNLAVEQLT LSAEFPVPLP V LRQTFFAV ...文字列:
VKKGFRAAFR FQKELERWRL LRCPPPPVRR SEKPNWDYHA EVQAFGSRLQ ETFSLDLLKT AFINSCYIKS EEAKRQSLGI EKEAALLNL KDNQELFEQG LSFSHRCLTQ FLEDEFPDLP AEGTESLVSF LTGEAVVCHV ARNLAVEQLT LSAEFPVPLP V LRQTFFAV IGALLQSSGP ERAALFIRDF LITQMTGKEL FEMWTVVNPM GLLVEELKKR NISAPESRLT RQSGSTTALP LY FVGLYCD RKLIAEGPGE TVLVAEEEAA RVALRKLYGF TENRRPWDYS KPK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL44

+
分子 #35: Large ribosomal subunit protein mL45

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 35.463863 KDa
配列文字列: MAAPVPRGLS SLYRTLGWWS RQPILVTQST TVVQVKTKSR FRPPTPEPKY KTEKEFLEYA RKAGLVIPQE RLERPIHLAC TAGIFDPYV PPEGDARMSS LSKEGLTQRT ERLRKNAASQ LAIRKIREFD ANFKTKDFPE KAKDIFIEAH LCLNNSDHDR L HTLVTEHC ...文字列:
MAAPVPRGLS SLYRTLGWWS RQPILVTQST TVVQVKTKSR FRPPTPEPKY KTEKEFLEYA RKAGLVIPQE RLERPIHLAC TAGIFDPYV PPEGDARMSS LSKEGLTQRT ERLRKNAASQ LAIRKIREFD ANFKTKDFPE KAKDIFIEAH LCLNNSDHDR L HTLVTEHC FPDMVWDLKY KTVRWGFVES LEPAQVVHVR CSGLVNQSNM YGQVTVRLHT RQTLAIYDRF GRLMYGQEDV PK DVLEYVV FERHLMNPYG SWRMHAKIVP AWAPPKQPIL KTLMIPGPQL KPWEEYEETQ GEAQKPQLA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL45

+
分子 #36: Large ribosomal subunit protein mL46

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL46 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 32.175697 KDa
配列文字列: MAAPVGRTLL GLARGWRQLD RFWAGSSRGL SLEAASSSSR SPWRLSGALC LQRPPLITKA LTPLQEEMAG LLQQIEVERS LYSDHELRA LDEAQRLAKK KADLYDEEQE QGITLAQDLE DMWEQAFLQF RPGARETEAD KKNDRTSLHR KLDRNLVLLV R EKLGDQDV ...文字列:
MAAPVGRTLL GLARGWRQLD RFWAGSSRGL SLEAASSSSR SPWRLSGALC LQRPPLITKA LTPLQEEMAG LLQQIEVERS LYSDHELRA LDEAQRLAKK KADLYDEEQE QGITLAQDLE DMWEQAFLQF RPGARETEAD KKNDRTSLHR KLDRNLVLLV R EKLGDQDV WMLPQVEWQP GETLRGTAER ILATLSENNM EAKFLGNAPC GHYKFKFPKA IQTESDLGVK VFFFKALLLT GD FVQAGKK SRHVWASKEE LGDYLQPKYL AQVRRFLLDS DGLSCL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL46

+
分子 #37: Large ribosomal subunit protein mL48

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL48 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 14.725786 KDa
配列文字列:
DYEYGVLNIH LTAYDMSLAE SYAQYVHRLC NRLSIKVEES YAMPTKTMEV MRLPDQGNKM VLDSVLTTHE RVVQISGLSA TFAEIFLEV LQSNLPEGVR LSVREHTEED FKGRFKARPE LEELLAKLN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL48

+
分子 #38: Large ribosomal subunit protein mL49

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL49 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 15.412722 KDa
配列文字列:
NPGFVESVDE YQFVERLLPP TKIPEPPKHK HYPTPSGWQP PRDPLPSLPY FVRRSRMHNI PVYKEITHGN RQMTLIRKVE GDIWALQKD VEEFLSPLLG KTPITQVNEV TGTLRIKGYF DEQLKAWLLE KGF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL49

+
分子 #39: Large ribosomal subunit protein mL50

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL50 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 12.412153 KDa
配列文字列:
VLVCPPLRSR AYTPPSDLQS RLESHIKEVL GSSLPNNWQD ISLDDGHMKF RLLAGLADGL GHAVPNSRLH QMCRVRDVLD FYNVPVQDK SKFDELVASN LPPNLKISWS Y

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL50

+
分子 #40: Large ribosomal subunit protein mL51

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL51 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 11.744813 KDa
配列文字列:
AFVRLTLPPP KVVDRWNEKR ALFGVYDNIG ILGNFEKHPK ELIKGPVWLR GWRGNELQRC VRKKKFVGNR MFIEDLHNLN KRISYLYKH FNRHGKYR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL51

+
分子 #41: Large ribosomal subunit protein mL52

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL52 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 13.681875 KDa
配列文字列:
MAALGTWLSS VRRLHCSVVA RAGGQWRLQQ GLAANPSGYG PLTELPDWSF ADGRPAPPMK GQLRRKAQRE KLARRVVLLT QEMDAGIQA WKLRQQKLQE ERKKEHDLKP KGTLLRSPLP NQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL52

+
分子 #42: Large ribosomal subunit protein mL53

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL53 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 12.756635 KDa
配列文字列:
MAAALARLGL RPVKLVRVQF CPFEKNVEST RTFLQTVSSE KVRATNLNCS VIADVRHDGS EPCVDVLFGD GYRLIMRGAH LTTQEMLSA LASHIRDRNA AAASAPGADK VAPGTSTRR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL53

+
分子 #43: Large ribosomal subunit protein mL63

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL63 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 9.126356 KDa
配列文字列:
RTVSFQAKES MIRRLEVEAE NHYWLSMPYM TAEQECGHAA ERRAQAFEAI KAAATSKFPK HRYIADQLDH LNISKKWS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL63

+
分子 #44: Large ribosomal subunit protein mL62

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL62 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: peptidyl-tRNA hydrolase
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 17.573988 KDa
配列文字列:
TFQSIYSLDK LYPESKGADT AWKVPEHAKQ ASSYIPLDRL SISYCRSSGP GGQNVNKVNS KAEVRFHLAS ADWIEEPVRQ KIALTHKNK INKAGELVLT SESSRYQFRN LAECLQKIRD MIAEASQVPK EPSKEDARLQ RLRIEKMNRE RLRQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL62

+
分子 #45: Large ribosomal subunit protein mL64

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL64 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 16.082307 KDa
配列文字列:
YRAPPPPRRR PGPHSPDPEN LLTPRWQLTP RYVAKQFGRH GAISGVPPAS LWPTPEQLRE LEAEEQEWYP SLATMQESLR LQQQALEAR RQAREQRIAE CMAKMPQMIE NWRKQKRERW EKIQADKERR ARLQAE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL64

+
分子 #46: Large ribosomal subunit protein mL66

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL66 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 22.36351 KDa
配列文字列: MAALRRLVSG CGRQLQAFLA GPAATGWLWL PARGLREVVK IQEGKTTVIE GRITETPKAT PDPPNPSGQC PICRWNLKHK YTYEDVLLL SQFIRPYGGM LPRRVTGLCR EEHRKIEECV KMAHRAGLLP NHRPQLPEGC LPKDKPKLNR YLTRWAPKSV K PIYKKGHR ...文字列:
MAALRRLVSG CGRQLQAFLA GPAATGWLWL PARGLREVVK IQEGKTTVIE GRITETPKAT PDPPNPSGQC PICRWNLKHK YTYEDVLLL SQFIRPYGGM LPRRVTGLCR EEHRKIEECV KMAHRAGLLP NHRPQLPEGC LPKDKPKLNR YLTRWAPKSV K PIYKKGHR WNKVGMAVGS PLLKDNVCYS RRPLKMMH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL66

+
分子 #47: Large ribosomal subunit protein mL65

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL65 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 43.897328 KDa
配列文字列: VARYPPIVAS MTADSKAARQ RRVQRWQATV HAAPSVDEKI RILTKMQFKK YVVHPQISAL NADRWYQSFT KTVFVSGLPP APALSPPPP SLDLAALRAA VCDCILQEQV YVRRRRPRSL FDRRQALASS ILDQVVRTLV NLLAPLNPVL STAALDCKRS V DFYWLRGE ...文字列:
VARYPPIVAS MTADSKAARQ RRVQRWQATV HAAPSVDEKI RILTKMQFKK YVVHPQISAL NADRWYQSFT KTVFVSGLPP APALSPPPP SLDLAALRAA VCDCILQEQV YVRRRRPRSL FDRRQALASS ILDQVVRTLV NLLAPLNPVL STAALDCKRS V DFYWLRGE ERIPAGHRKG HIDALRYQIN DKPHNQIRIS KQLPEFVPLD YSIPTEIPVM KCKPDKLPLF RRQYENSIFT GS KTADPCC YGHTQFHLIP DRLKRERLIR QNQAEQVEAV FRANAIASLF AWTGAQAMYQ GFWSEADVTR PFVSQAVITD GKY FSFFCY QLNTLALTVQ ADQNNPRKNL CWGSQSQPLY ETVEDNDVKG FDDGTLLQIV HFLLNKPR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL65

+
分子 #48: Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1

分子名称: Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 14.705924 KDa
配列文字列:
KFDIDMLVSL LRQENARDIC VIQVPPEMRY TDYFVIGSGT STRHLHAMVH YLVKMYKHLK CRSDPYVKIE GKDADDWLCV DFGSMVIHL MLPETRETYE LEKLWTLRSF DDQLAQIAAE TLPEDF

UniProtKB: Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1

+
分子 #49: Predicted gene, 55359

分子名称: Predicted gene, 55359 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 8.31365 KDa
配列文字列:
APWSREAVLC LYRALLRQGR ELRYTDRDFY FASIRREFRK NQKLENLEAR EKQLEKGLVF LHSKLGGLI

UniProtKB: Predicted gene, 55359

+
分子 #50: Acyl carrier protein, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 9.131536 KDa
配列文字列:
LTLDGIKDRV LYVLKLYDKI DPEKLSVNSH FMKDLGLDSL DQVEIIMAME DEFGFEIPDI DAEKLMCPQE IVDYIADKK

UniProtKB: Acyl carrier protein, mitochondrial

+
分子 #51: Large ribosomal subunit protein mL37

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 45.66548 KDa
配列文字列: AYEWGVRSTR KPEPRPLDRV YEIPGLEPIT YEGKKHFVPW LARPIFPPWE RGWNDPRFHR AAPIHEQTLY KEEPCYIFHQ RCRLLEGMK QALWLTKTKL IEGLPKKVLS LVDDPANHIE NQEQRVLDII SHARLWHSTE DIPKRETYCP LIVDSLIQLC K SQILKHPS ...文字列:
AYEWGVRSTR KPEPRPLDRV YEIPGLEPIT YEGKKHFVPW LARPIFPPWE RGWNDPRFHR AAPIHEQTLY KEEPCYIFHQ RCRLLEGMK QALWLTKTKL IEGLPKKVLS LVDDPANHIE NQEQRVLDII SHARLWHSTE DIPKRETYCP LIVDSLIQLC K SQILKHPS LARRTSAQNC TLATTWNRES LLLQVRGTSS TILSAKDPLP VIASREEVEA TRSHVLETFY PISPTIDLQE CH VYEVKDD TGFQEGYPYP HPHTLYFLEK ANLRPQRFLP EQLRAKMLLF AFANALAQAR LLYGNTAKVL EQPIVVQSVG TDG RVFQFL VLQLNTTDLA SSEGVKNLVW TDSDQLLYRH FWCRPVIKKK VVVEPVGPVD FQPETFRKFL ALYLHGVV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL37

+
分子 #52: Large ribosomal subunit protein mL40

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 8.402414 KDa
配列文字列:
EHSPEESERR ALLLKRWALF KQQEHEMERD AIRSMLEAQQ EALEELKLES AELYAEAIKR DTSLFPFEKE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL40

+
分子 #53: Large ribosomal subunit protein mL41

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 15.284592 KDa
配列文字列:
MGFLTAVTQG LVRGADRMSK WTSKRGPRTF TKSRGAKKTG IYTSDRKFVQ IKEMVPEFVV PDLTGFKLKP YVNYRAPAGI DTPLTAKAL FQETVAPAIE KDFKEGTFDA NNLEKYGFEP TQEGKLFQLY PKNFPR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL41

+
分子 #54: Large ribosomal subunit protein mL42

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 16.521848 KDa
配列文字列:
MAAAVKWAIS NRTIWKHLLP IQNGALSSAC HKSTYSSLPD DYNCQVDLAL TADGRTIVCY HPSVDIPYEH TKPIPQPDLL HNNEETHEQ ILKAKLEVRK SKQLEQGPMI EQLSKVFYTT KHRWYPHGQY HNRRKKLNPP RDR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL42

+
分子 #55: Large ribosomal subunit protein mL55

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL55 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 15.15264 KDa
配列文字列:
MPLAILLSLL RHCGVRAALP TPRHLHTSPW RADCSRASLT RLRRQAYARL YPVLLVKQDG STIHIRYREP RRMLAMPLDL DALSPEERR ARFRKREAQL QQKREEEPEV VDSFDTERYK QFWTKTKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL55

+
分子 #56: Mitochondrial ribosome-associated GTPase 1

分子名称: Mitochondrial ribosome-associated GTPase 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 36.732039 KDa
配列文字列: MRLWPQAWGA VRGAWRECFP LQGHDVARWF PGHMAKGLKK MQSSLKSVDC VIEVHDARIP FSGRNPLFQE LLGLKPHLLV LNKMDLADL TEQQKIVQRL EEKGLSNVLF TNCVKDENIK QIVPKVMELI RCSYRYHRAE TPEYCIMVVG VPNVGKSSLI N SLRRQHLR ...文字列:
MRLWPQAWGA VRGAWRECFP LQGHDVARWF PGHMAKGLKK MQSSLKSVDC VIEVHDARIP FSGRNPLFQE LLGLKPHLLV LNKMDLADL TEQQKIVQRL EEKGLSNVLF TNCVKDENIK QIVPKVMELI RCSYRYHRAE TPEYCIMVVG VPNVGKSSLI N SLRRQHLR TGKAARVGGE PGITRAVTSR IQVCERPLVF LLDTPGVLAP RIESVETGLK LALCGTVLDH LVGEETMADY LL YTLNRHG LFGYVQHYAL ASACDQIEWV LKNVAIKLRK TRKVKVLTGT GNVNVIQPDY AMAARDFLRT FRSGLLGQVM LDR DIIPAC

UniProtKB: Mitochondrial ribosome-associated GTPase 1

+
分子 #57: Large ribosomal subunit protein mL54

分子名称: Large ribosomal subunit protein mL54 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 15.450881 KDa
配列文字列:
MAAAHLLRAS RVWARWHPRA LPVLRRPGGF SIREYAKKPV GKGGKGGVAA EALKDPEVCT DPTQLTTHAM GVNIYKEGQD VALKADSEY PTWLFQVNLG PPKKLEELEP ESREYWRLLR KQNIWRHNRL SKNKKL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL54

+
分子 #58: rRNA methyltransferase 2, mitochondrial

分子名称: rRNA methyltransferase 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 27.18973 KDa
配列文字列: MAGHLKLVGV PLKVRRLHTA VCHYRGRTGA EHLWLTRHLK DPFVKAAKVE SYRCRSAFKL LEMNEKHQIL RPGLRVLDCG AAPGAWSQV AVQRVNATGA DSSSPVGFVL GVDLLHIFPL AGATFLCPAD VTDPRTFQKI LELLPSRRAD VILSDMAPNA T GIRDLDHD ...文字列:
MAGHLKLVGV PLKVRRLHTA VCHYRGRTGA EHLWLTRHLK DPFVKAAKVE SYRCRSAFKL LEMNEKHQIL RPGLRVLDCG AAPGAWSQV AVQRVNATGA DSSSPVGFVL GVDLLHIFPL AGATFLCPAD VTDPRTFQKI LELLPSRRAD VILSDMAPNA T GIRDLDHD KLISLCLTLV DMAVDILHPG GTLLCKTWAG SKSHLLQKRL TQEFQSTRVV KPEASRKESS EVYLLATQYR GG KGTRRP

UniProtKB: rRNA methyltransferase 2, mitochondrial

+
分子 #59: Transcription termination factor 4, mitochondrial

分子名称: Transcription termination factor 4, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 40.30618 KDa
配列文字列: MASLGRQVPE WHRLLALSWA CLVRQTPHLR EQKQMSPSLS CKLTTVPGRG SFQEFSSITP QKYMQEPENR TRLVQCLHEE QKPCVDPES LEPEKVIRSL QDMGFAEAHI HSLFSIQPSV HPQQLLGIVS ELLLLGLNPE PVFNALKKNP QLLKLSSMQM K RRSSYLRK ...文字列:
MASLGRQVPE WHRLLALSWA CLVRQTPHLR EQKQMSPSLS CKLTTVPGRG SFQEFSSITP QKYMQEPENR TRLVQCLHEE QKPCVDPES LEPEKVIRSL QDMGFAEAHI HSLFSIQPSV HPQQLLGIVS ELLLLGLNPE PVFNALKKNP QLLKLSSMQM K RRSSYLRK LGLGEGKLKR VLSVCPEVFT MHQRDIDRVV KVLREKCLFT AQHITDVLHR CPTVLQEDPN ELEYKFQYAY FR MGLTHLD IVRTNFLQYS ITKIKQRHIY LERLGRYQTP DKKGQTQIPN PSLRNILRVS EAEFLARTAC SSVEEFQVFK KLL DQEEEE ESESHASEEE EEEEEEEELL

UniProtKB: Transcription termination factor 4, mitochondrial

+
分子 #60: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 105 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #61: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #62: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 1 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #63: S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE

分子名称: S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE / タイプ: ligand / ID: 63 / コピー数: 1 / 式: SAH
分子量理論値: 384.411 Da
Chemical component information

ChemComp-SAH:
S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE / S-アデノシルホモシステイン

+
分子 #64: water

分子名称: water / タイプ: ligand / ID: 64 / コピー数: 1 / 式: HOH
分子量理論値: 18.015 Da
Chemical component information

ChemComp-HOH:
WATER

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 40.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.4 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

7o9m

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.91 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 97203
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る