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万見
- EMDB-51403: Structure of replicating Nipah Virus RNA Polymerase Complex - RNA... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-51403
タイトルStructure of replicating Nipah Virus RNA Polymerase Complex - RNA-bound state
マップデータComposite map
試料
  • 複合体: Nipah Virus RdRp Complex in actively replicating state.
    • 複合体: Nipah Virus RdRp Complex
      • タンパク質・ペプチド: Phosphoprotein
      • タンパク質・ペプチド: RNA-directed RNA polymerase L
    • 複合体: RNA
      • RNA: RNA (5'-R(P*AP*CP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*A)-3')
      • RNA: RNA (5'-R(P*CP*CP*CP*UP*UP*GP*UP*UP*UP*GP*GP*U)-3')
  • リガンド: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION
キーワードRNA Polymerase / Nipah Virus / negative strand RNA Virus / VIRAL PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


negative stranded viral RNA transcription / NNS virus cap methyltransferase / GDP polyribonucleotidyltransferase / negative stranded viral RNA replication / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; リン含有酸無水物に作用 / virion component / molecular adaptor activity / mRNA 5'-cap (guanine-N7-)-methyltransferase activity / host cell cytoplasm / symbiont-mediated suppression of host innate immune response ...negative stranded viral RNA transcription / NNS virus cap methyltransferase / GDP polyribonucleotidyltransferase / negative stranded viral RNA replication / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; リン含有酸無水物に作用 / virion component / molecular adaptor activity / mRNA 5'-cap (guanine-N7-)-methyltransferase activity / host cell cytoplasm / symbiont-mediated suppression of host innate immune response / RNA-directed RNA polymerase / RNA-directed RNA polymerase activity / GTPase activity / ATP binding
類似検索 - 分子機能
Phosphoprotein P region PNT disordered / Phosphoprotein P region PNT disordered / Paramyxovirus structural protein P/V, N-terminal domain / Paramyxovirus structural protein V/P N-terminus / Phosphoprotein P soyouz module / N-terminal region of Paramyxovirinae phosphoprotein (P) / RNA-directed RNA polymerase, paramyxovirus / P/V phosphoprotein, paramyxoviral / Paramyxovirus P/V phosphoprotein C-terminal / Mononegavirales RNA-directed RNA polymerase catalytic domain ...Phosphoprotein P region PNT disordered / Phosphoprotein P region PNT disordered / Paramyxovirus structural protein P/V, N-terminal domain / Paramyxovirus structural protein V/P N-terminus / Phosphoprotein P soyouz module / N-terminal region of Paramyxovirinae phosphoprotein (P) / RNA-directed RNA polymerase, paramyxovirus / P/V phosphoprotein, paramyxoviral / Paramyxovirus P/V phosphoprotein C-terminal / Mononegavirales RNA-directed RNA polymerase catalytic domain / Mononegavirus L protein 2-O-ribose methyltransferase / Mononegavirales mRNA-capping domain V / RNA-directed RNA polymerase L, C-terminal / Mononegavirales RNA dependent RNA polymerase / Mononegavirales mRNA-capping region V / RdRp of negative ssRNA viruses with non-segmented genomes catalytic domain profile. / Mononegavirus L protein 2'-O-ribose methyltransferase domain profile. / Ribosomal RNA methyltransferase, FtsJ domain / FtsJ-like methyltransferase
類似検索 - ドメイン・相同性
RNA-directed RNA polymerase L / Phosphoprotein
類似検索 - 構成要素
生物種Henipavirus nipahense (ウイルス)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.8 Å
データ登録者Sala F / Ditter K / Dybkov O / Urlaub H / Hillen HS
資金援助 ドイツ, 2件
OrganizationGrant number国
German Research Foundation (DFG)SFB1565 ドイツ
German Research Foundation (DFG)SFB1190 ドイツ
引用ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2019
タイトル: Macromolecular structure determination using X-rays, neutrons and electrons: recent developments in Phenix.
著者: Dorothee Liebschner / Pavel V Afonine / Matthew L Baker / Gábor Bunkóczi / Vincent B Chen / Tristan I Croll / Bradley Hintze / Li Wei Hung / Swati Jain / Airlie J McCoy / Nigel W Moriarty / ...著者: Dorothee Liebschner / Pavel V Afonine / Matthew L Baker / Gábor Bunkóczi / Vincent B Chen / Tristan I Croll / Bradley Hintze / Li Wei Hung / Swati Jain / Airlie J McCoy / Nigel W Moriarty / Robert D Oeffner / Billy K Poon / Michael G Prisant / Randy J Read / Jane S Richardson / David C Richardson / Massimo D Sammito / Oleg V Sobolev / Duncan H Stockwell / Thomas C Terwilliger / Alexandre G Urzhumtsev / Lizbeth L Videau / Christopher J Williams / Paul D Adams /
要旨: Diffraction (X-ray, neutron and electron) and electron cryo-microscopy are powerful methods to determine three-dimensional macromolecular structures, which are required to understand biological ...Diffraction (X-ray, neutron and electron) and electron cryo-microscopy are powerful methods to determine three-dimensional macromolecular structures, which are required to understand biological processes and to develop new therapeutics against diseases. The overall structure-solution workflow is similar for these techniques, but nuances exist because the properties of the reduced experimental data are different. Software tools for structure determination should therefore be tailored for each method. Phenix is a comprehensive software package for macromolecular structure determination that handles data from any of these techniques. Tasks performed with Phenix include data-quality assessment, map improvement, model building, the validation/rebuilding/refinement cycle and deposition. Each tool caters to the type of experimental data. The design of Phenix emphasizes the automation of procedures, where possible, to minimize repetitive and time-consuming manual tasks, while default parameters are chosen to encourage best practice. A graphical user interface provides access to many command-line features of Phenix and streamlines the transition between programs, project tracking and re-running of previous tasks.
履歴
登録2024年8月22日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年3月5日-
マップ公開2025年3月5日-
更新2025年3月19日-
現状2025年3月19日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_51403.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_51403.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 421.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Composite map
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.83 Å/pix.
x 480 pix.
= 400.32 Å		0.83 Å/pix.
x 480 pix.
= 400.32 Å		0.83 Å/pix.
x 480 pix.
= 400.32 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.834 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.00578
最小 - 最大-0.0031530913 - 0.04150228
平均 (標準偏差)0.000037105106 (±0.0006126362)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ480480480
Spacing480480480
セルA=B=C: 400.32 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Nipah Virus RdRp Complex in actively replicating state.

全体名称: Nipah Virus RdRp Complex in actively replicating state.
要素
  • 複合体: Nipah Virus RdRp Complex in actively replicating state.
    • 複合体: Nipah Virus RdRp Complex
      • タンパク質・ペプチド: Phosphoprotein
      • タンパク質・ペプチド: RNA-directed RNA polymerase L
    • 複合体: RNA
      • RNA: RNA (5'-R(P*AP*CP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*A)-3')
      • RNA: RNA (5'-R(P*CP*CP*CP*UP*UP*GP*UP*UP*UP*GP*GP*U)-3')
  • リガンド: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION

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超分子 #1: Nipah Virus RdRp Complex in actively replicating state.

超分子名称: Nipah Virus RdRp Complex in actively replicating state.
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#4
分子量理論値: 570 KDa

+
超分子 #2: Nipah Virus RdRp Complex

超分子名称: Nipah Virus RdRp Complex / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1, #4
由来(天然)生物種: Henipavirus nipahense (ウイルス)

+
超分子 #3: RNA

超分子名称: RNA / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2-#3
由来(天然)生物種: Henipavirus nipahense (ウイルス)

+
分子 #1: Phosphoprotein

分子名称: Phosphoprotein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 4 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Henipavirus nipahense (ウイルス)
分子量理論値: 78.39032 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MDKLELVNDG LNIIDFIQKN QKEIQKTYGR SSIQQPSIKD QTKAWEDFLQ CTSGESEQVE GGMSKDDGDV ERRNLEDLSS TSPTDGTIG KRVSNTRDWA EGSDDIQLDP VVTDVVYHDH GGECTGYGFT SSPERGWSDY TSGANNGNVC LVSDAKMLSY A PEIAVSKE ...文字列:
MDKLELVNDG LNIIDFIQKN QKEIQKTYGR SSIQQPSIKD QTKAWEDFLQ CTSGESEQVE GGMSKDDGDV ERRNLEDLSS TSPTDGTIG KRVSNTRDWA EGSDDIQLDP VVTDVVYHDH GGECTGYGFT SSPERGWSDY TSGANNGNVC LVSDAKMLSY A PEIAVSKE DRETDLVHLE NKLSTTGLNP TAVPFTLRNL SDPAKDSPVI AEHYYGLGVK EQNVGPQTSR NVNLDSIKLY TS DDEEADQ LEFEDEFAGS SSEVIVGISP EDEEPSSVGG KPNESIGRTI EGQSIRDNLQ AKDNKSTDVP GAGPKDSAVK EEP PQKRLP MLAEEFECSG SEDPIIRELL KENSLINCQQ GKDAQPPYHW SIERSISPDK TEIVNGAVQT ADRQRPGTPM PKSR GIPIK KGTDAKYPSA GTENVPGSKS GATRHVRGSP PYQEGKSVNA ENVQLNASTA VKETDKSEVN PVDDNDSLDD KYIMP SDDF SNTFFPHDTD RLNYHADHLG DYDLETLCEE SVLMGVINSI KLINLDMRLN HIEEQVKEIP KIINKLESID RVLAKT NTA LSTIEGHLVS MMIMIPGKGK GERKGKNNPE LKPVIGRDIL EQQSLFSFDN VKNFRDGSLT NEPYGAAVQL REDLILP EL NFEETNASQF VPMADDSSRD VIKTLIRTHI KDRELRSELI GYLNKAENDE EIQEIANTVN DIIDGNI

UniProtKB: Phosphoprotein

+
分子 #4: RNA-directed RNA polymerase L

分子名称: RNA-directed RNA polymerase L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: RNA-directed RNA polymerase
由来(天然)生物種: Henipavirus nipahense (ウイルス)
分子量理論値: 257.706219 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNAADELSIS DIIYPECHLD SPIVSGKLIS AIEYAQLRHN QPSDDKRLSE NIRLNLHGKR KSLYILRQSK QGDYIRNNIK NLKEFMHIA YPECNNILFS ITSQGMTSKL DNIMKKSFKA YNIISKKVIG MLQNITRNLI TQDRRDEIIN IHECRRLGDL G KNMSQSKW ...文字列:
SNAADELSIS DIIYPECHLD SPIVSGKLIS AIEYAQLRHN QPSDDKRLSE NIRLNLHGKR KSLYILRQSK QGDYIRNNIK NLKEFMHIA YPECNNILFS ITSQGMTSKL DNIMKKSFKA YNIISKKVIG MLQNITRNLI TQDRRDEIIN IHECRRLGDL G KNMSQSKW YECFLFWFTI KTEMRAVIKN SQKPKFRSDS CIIHMRDKST EIILNPNLIC IFKSDKTGKK CYYLTPEMVL MY CDVLEGR MMMETTVKSD IKYQPLISRS NALWGLIDPL FPVMGNRIYN IVSMIEPLVL ALLQLKDEAR ILRGAFLHHC IKE MHQELS ECGFTDQKIR SMFIDDLLSI LNIDNIHLLA EFFSFFRTFG HPILEAKVAA EKVREHMLAD KVLEYAPIMK AHAI FCGTI INGYRDRHGG AWPPLYLPAH ASKHIIRLKN SGESLTIDDC VKNWESFCGI QFDCFMELKL DSDLSMYMKD KALSP IKDE WDSVYPREVL SYTPPKSTEP RRLVDVFVND ENFDPYNMLE YVLSGAYLED EQFNVSYSLK EKETKQAGRL FAKMTY KMR ACQVIAEALI ASGVGKYFKE NGMVKDEHEL LKTLFQLSIS SVPRGNSQGN DPQSINNIER DFQYFKGVTT NVKDKKN NS FNKVKSALNN PCQADGVHHN MSPNTRNRYK CSNTSKSFLD YHTEFNPHNH YKSDNTEAAV LSRYEDNTGT KFDTVSAF L TTDLKKFCLN WRYESMAIFA ERLDEIYGLP GFFNWMHKRL ERSVIYVADP NCPPNIDKHM ELEKTPEDDI FIHYPKGGI EGYSQKTWTI ATIPFLFLSA YETNTRIAAI VQGDNESIAI TQKVHPNLPY KVKKEICAKQ AQLYFERLRM NLRALGHNLK ATETIISTH LFIYSKKIHY DGAVLSQALK SMSRCCFWSE TLVDETRSAC SNISTTIAKA IENGLSRNVG YCINILKVIQ Q LLISTEFS INETLTLDVT SPISNNLDWL ITAALIPAPI GGFNYLNLSR IFVRNIGDPV TASLADLKRM IDHSIMTESV LQ KVMNQEP GDASFLDWAS DPYSGNLPDS QSITKTIKNI TARTILRNSP NPMLKGLFHD KSFDEDLELA SFLMDRRVIL PRA AHEILD NSLTGAREEI AGLLDTTKGL IRSGLRKSGL QPKLVSRLSH HDYNQFLILN KLLSNRRQND LISSNTCSVD LARA LRSHM WRELALGRVI YGLEVPDALE AMVGRYITGS LECQICEQGN TMYGWFFVPR DSQLDQVDRE HSSIRVPYVG SSTDE RSDI KLGNVKRPTK ALRSAIRIAT VYTWAYGDNE ECWYEAWYLA SQRVNIDLDV LKAITPVSTS NNLSHRLRDK STQFKF AGS VLNRVSRYVN ISNDNLDFRI EGEKVDTNLI YQQAMLLGLS VLEGKFRLRL ETDDYNGIYH LHVKDNCCVK EVADVGQ VD AELPIPEYTE VDNNHLIYDP DPVSEIDCSR LSNQESKSRE LDFPLWSTEE LHDVLAKTVA QTVLEIITKA DKDVLKQH L AIDSDDNINS LITEFLIVDP ELFALYLGQS ISIKWAFEIH HRRPRGRHTM VDLLSDLVSN TSKHTYKVLS NALSHPRVF KRFVNCGLLL PTQGPYLHQQ DFEKLSQNLL VTSYMIYLMN WCDFKKSPFL IAEQDETVIS LREDIITSKH LCVIIDLYAN HHKPPWIID LNPQEKICVL RDFISKSRHV DTSSRSWNTS DLDFVIFYAS LTYLRRGIIK QLRIRQVTEV IDTTTMLRDN I IVENPPIK TGVLDIRGCI IYNLEEILSM NTKSASKKIF NLNSRPSVEN HKYRRIGLNS SSCYKALNLS PLIQRYLPSG AQ RLFIGEG SGSMMLLYQS TLGQSISFYN SGIDGDYIPG QRELKLFPSE YSIAEEDPSL TGKLKGLVVP LFNGRPETTW IGN LDSYEY IINRTAGRSI GLVHSDMESG IDKNVEEILV EHSHLISIAI NVMMEDGLLV SKIAYTPGFP ISRLFNMYRS YFGL VLVCF PVYSNPDSTE VYLLCLQKTV KTIVPPQKVL EHSNLHDEVN DQGITSVIFK IKNSQSKQFH DDLKKYYQID QPFFV PTKI TSDEQVLLQA GLKLNGPEIL KSEISYDIGS DINTLRDTII IMLNEAMNYF DDNRSPSHHL EPYPVLERTR IKTIMN CVT KKVIVYSLIK FKDTKSSELY HIKNNIRRKV LILDFRSKLM TKTLPKGMQE RREKNGFKEV WIVDLSNREV KIWWKII GY ISII

UniProtKB: RNA-directed RNA polymerase L

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分子 #2: RNA (5'-R(P*AP*CP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*A)-3')

分子名称: RNA (5'-R(P*AP*CP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*A)-3') / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Henipavirus nipahense (ウイルス)
分子量理論値: 2.845823 KDa
配列文字列:
ACCAAACAA

+
分子 #3: RNA (5'-R(P*CP*CP*CP*UP*UP*GP*UP*UP*UP*GP*GP*U)-3')

分子名称: RNA (5'-R(P*CP*CP*CP*UP*UP*GP*UP*UP*UP*GP*GP*U)-3') / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Henipavirus nipahense (ウイルス)
分子量理論値: 3.7432 KDa
配列文字列:
CCCUUGUUUG GU

+
分子 #5: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER

分子名称: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 5 / コピー数: 1 / 式: GNP
分子量理論値: 522.196 Da
Chemical component information

ChemComp-GNP:
PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / Gpp(NH)p / GppNHp, GMPPNP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

+
分子 #6: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 6 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #7: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 7 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 8
詳細: 50 mM HEPES pH 8.0, 150 mM NaCl, 6 mM MgCl2, 10% glycerol, 5 mM DTT, 0.01% Tween 20
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 95 % / チャンバー内温度: 277.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

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電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均露光時間: 2.14 sec. / 平均電子線量: 52.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm / 倍率（公称値）: 105000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 9886170
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 5.0) / 使用した粒子像数: 330750
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 5.0)
最終 3次元分類クラス数: 4 / 平均メンバー数/クラス: 600000 / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC
FSC曲線 (解像度の算出)

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原子モデル構築 1

初期モデルChain - Source name: AlphaFold / Chain - Initial model type: in silico model
精密化空間: REAL / プロトコル: AB INITIO MODEL
得られたモデル

PDB-9gju:
Structure of replicating Nipah Virus RNA Polymerase Complex - RNA-bound state

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る