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- EMDB-4465: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, ... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4465
タイトルCryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
マップデータunsharpened map
試料
  • 複合体: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
    • 複合体: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
      • タンパク質・ペプチド: x 15種
    • 複合体: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
キーワードspindle assembly checkpoint / anaphase-promoting complex / cyclin / ubiquitination / CELL CYCLE
機能・相同性
機能・相同性情報


metaphase/anaphase transition of cell cycle / metaphase/anaphase transition of meiosis I / Inhibition of the proteolytic activity of APC/C required for the onset of anaphase by mitotic spindle checkpoint components / mitotic checkpoint complex / positive regulation of anaphase-promoting complex-dependent catabolic process / regulation of meiotic nuclear division / positive regulation of synapse maturation / Conversion from APC/C:Cdc20 to APC/C:Cdh1 in late anaphase / regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint / regulation of dendrite development ...metaphase/anaphase transition of cell cycle / metaphase/anaphase transition of meiosis I / Inhibition of the proteolytic activity of APC/C required for the onset of anaphase by mitotic spindle checkpoint components / mitotic checkpoint complex / positive regulation of anaphase-promoting complex-dependent catabolic process / regulation of meiotic nuclear division / positive regulation of synapse maturation / Conversion from APC/C:Cdc20 to APC/C:Cdh1 in late anaphase / regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint / regulation of dendrite development / Inactivation of APC/C via direct inhibition of the APC/C complex / APC/C:Cdc20 mediated degradation of mitotic proteins / : / cyclin A2-CDK1 complex / Phosphorylation of Emi1 / positive regulation of synaptic plasticity / anaphase-promoting complex / Aberrant regulation of mitotic exit in cancer due to RB1 defects / protein branched polyubiquitination / metaphase/anaphase transition of mitotic cell cycle / regulation of meiotic cell cycle / anaphase-promoting complex-dependent catabolic process / cell cycle G1/S phase transition / cellular response to luteinizing hormone stimulus / Phosphorylation of the APC/C / regulation of exit from mitosis / anaphase-promoting complex binding / positive regulation of mitotic metaphase/anaphase transition / positive regulation of dendrite morphogenesis / ubiquitin ligase activator activity / positive regulation of ubiquitin protein ligase activity / Transcription of E2F targets under negative control by p107 (RBL1) and p130 (RBL2) in complex with HDAC1 / cellular response to leptin stimulus / protein K11-linked ubiquitination / male pronucleus / female pronucleus / response to glucagon / cellular response to cocaine / regulation of mitotic metaphase/anaphase transition / cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity / positive regulation of DNA biosynthetic process / ubiquitin-ubiquitin ligase activity / mitotic sister chromatid cohesion / mitotic metaphase chromosome alignment / cellular response to insulin-like growth factor stimulus / mitotic spindle assembly checkpoint signaling / cyclin A2-CDK2 complex / cochlea development / G2 Phase / p53-Dependent G1 DNA Damage Response / microtubule organizing center / Regulation of APC/C activators between G1/S and early anaphase / regulation of DNA replication / cullin family protein binding / Transcriptional Regulation by VENTX / G0 and Early G1 / Telomere Extension By Telomerase / mitotic spindle assembly / enzyme-substrate adaptor activity / animal organ regeneration / positive regulation of axon extension / ubiquitin-like ligase-substrate adaptor activity / TP53 Regulates Transcription of Genes Involved in G1 Cell Cycle Arrest / protein K48-linked ubiquitination / heterochromatin / Cyclin A/B1/B2 associated events during G2/M transition / intercellular bridge / Cyclin A:Cdk2-associated events at S phase entry / cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex / cellular response to platelet-derived growth factor stimulus / Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal / Mitotic Prometaphase / EML4 and NUDC in mitotic spindle formation / APC/C:Cdc20 mediated degradation of Cyclin B / cellular response to nitric oxide / post-translational protein modification / APC-Cdc20 mediated degradation of Nek2A / nuclear periphery / Resolution of Sister Chromatid Cohesion / regulation of mitotic cell cycle / Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C / APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin / SCF-beta-TrCP mediated degradation of Emi1 / Assembly of the pre-replicative complex / Cdc20:Phospho-APC/C mediated degradation of Cyclin A / cellular response to estradiol stimulus / RHO GTPases Activate Formins / APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1 / brain development / DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence / kinetochore / CDK-mediated phosphorylation and removal of Cdc6 / SCF(Skp2)-mediated degradation of p27/p21 / spindle / G1/S transition of mitotic cell cycle / histone deacetylase binding / Orc1 removal from chromatin / positive regulation of fibroblast proliferation / spindle pole / neuron projection development
類似検索 - 分子機能
Anaphase-promoting complex subunit 15 / Anaphase-promoting complex subunit 15 / : / CDC20/Fizzy WD40 domain / The WD repeat Cdc20/Fizzy family / : / APC4, WD40 domain C-terminal half / Anaphase-promoting complex subunit 4, metazoa / Anaphase-promoting complex subunit 1, C-terminal / Anaphase-promoting complex subunit 1, middle domain ...Anaphase-promoting complex subunit 15 / Anaphase-promoting complex subunit 15 / : / CDC20/Fizzy WD40 domain / The WD repeat Cdc20/Fizzy family / : / APC4, WD40 domain C-terminal half / Anaphase-promoting complex subunit 4, metazoa / Anaphase-promoting complex subunit 1, C-terminal / Anaphase-promoting complex subunit 1, middle domain / : / : / : / Anaphase-promoting complex subunit 1 WD40 beta-propeller domain / Anaphase-promoting complex sub unit 1 C-terminal domain / Anaphase-promoting complex subunit 1 middle domain / APC1 beta sandwich domain / Anaphase-promoting complex subunit 5, N-terminal domain / Anaphase-promoting complex subunit 16 / Anaphase-promoting complex, subunit 16 / Cdc23 / Apc13 / Anaphase promoting complex subunit 8 / Cdc23 / Apc13p protein / Anaphase-promoting complex subunit 4 / Anaphase-promoting complex subunit 4 long domain / Anaphase-promoting complex subunit 1 / Anaphase-promoting complex subunit 5 domain / Anaphase-promoting complex subunit 5 / Anaphase-promoting complex subunit 5 / Anaphase-promoting complex, cyclosome, subunit 4 / Anaphase-promoting complex subunit APC10/Doc1 / Anaphase-promoting complex, subunit CDC26 / Anaphase-promoting complex APC subunit CDC26 / Anaphase-promoting complex subunit 11, RING-H2 finger / Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger / Anaphase-promoting complex subunit 2, C-terminal / Anaphase-promoting complex subunit 2 / Anaphase promoting complex (APC) subunit 2 / Anaphase promoting complex (APC) subunit 2 / APC10/DOC domain / Anaphase-promoting complex, subunit 10 (APC10) / DOC domain profile. / Anaphase-promoting complex, subunit 10 (APC10) / Anaphase-promoting complex, cyclosome, subunit 3 / TPR repeat / Anaphase-promoting complex subunit 4, WD40 domain / Cyclin-A, N-terminal APC/C binding region / Cyclin-A N-terminal APC/C binding region / Anaphase-promoting complex subunit 4 WD40 domain / : / Cyclin, C-terminal domain / Tetratricopeptide repeat / : / Cyclins signature. / Cyclin / : / Cyclin, C-terminal domain / Cyclin_C / Cullin / Cullin, N-terminal / Cullin homology domain / Cullin homology domain superfamily / Cullin family / Cullin family profile. / Tetratricopeptide repeat / Tetratricopeptide repeat / Cyclin, N-terminal / Cyclin, N-terminal domain / Tetratricopeptide repeat / Cyclin-like / domain present in cyclins, TFIIB and Retinoblastoma / Cyclin-like superfamily / TPR repeat region circular profile. / TPR repeat profile. / Tetratricopeptide repeats / Tetratricopeptide repeat / Galactose-binding-like domain superfamily / Zinc finger RING-type profile. / Zinc finger, RING-type / Armadillo-like helical / Tetratricopeptide-like helical domain superfamily / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type / Winged helix DNA-binding domain superfamily / Trp-Asp (WD) repeats signature. / Trp-Asp (WD) repeats profile. / Trp-Asp (WD) repeats circular profile. / WD40 repeats / WD40 repeat / WD40-repeat-containing domain superfamily / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Cyclin-A2 / Cell division cycle protein 27 homolog / Anaphase-promoting complex subunit 15 / Cell division cycle protein 20 homolog / Cell division cycle protein 16 homolog / Anaphase-promoting complex subunit CDC26 / Anaphase-promoting complex subunit 16 / Anaphase-promoting complex subunit 13 / Anaphase-promoting complex subunit 1 / Anaphase-promoting complex subunit 11 ...Cyclin-A2 / Cell division cycle protein 27 homolog / Anaphase-promoting complex subunit 15 / Cell division cycle protein 20 homolog / Cell division cycle protein 16 homolog / Anaphase-promoting complex subunit CDC26 / Anaphase-promoting complex subunit 16 / Anaphase-promoting complex subunit 13 / Anaphase-promoting complex subunit 1 / Anaphase-promoting complex subunit 11 / Cell division cycle protein 23 homolog / Anaphase-promoting complex subunit 7 / Anaphase-promoting complex subunit 5 / Anaphase-promoting complex subunit 4 / Anaphase-promoting complex subunit 2 / Anaphase-promoting complex subunit 10
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.2 Å
データ登録者Zhang S / Barford D
資金援助 英国, 2件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (United Kingdom)MC_UP_1021/6 英国
Cancer Research UKC576/A14109 英国
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2019
タイトル: Cyclin A2 degradation during the spindle assembly checkpoint requires multiple binding modes to the APC/C.
著者: Suyang Zhang / Thomas Tischer / David Barford /
要旨: The anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) orchestrates cell cycle progression by controlling the temporal degradation of specific cell cycle regulators. Although cyclin A2 and cyclin B1 are ...The anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C) orchestrates cell cycle progression by controlling the temporal degradation of specific cell cycle regulators. Although cyclin A2 and cyclin B1 are both targeted for degradation by the APC/C, during the spindle assembly checkpoint (SAC), the mitotic checkpoint complex (MCC) represses APC/C's activity towards cyclin B1, but not cyclin A2. Through structural, biochemical and in vivo analysis, we identify a non-canonical D box (D2) that is critical for cyclin A2 ubiquitination in vitro and degradation in vivo. During the SAC, cyclin A2 is ubiquitinated by the repressed APC/C-MCC, mediated by the cooperative engagement of its KEN and D2 boxes, ABBA motif, and the cofactor Cks. Once the SAC is satisfied, cyclin A2 binds APC/C-Cdc20 through two mutually exclusive binding modes, resulting in differential ubiquitination efficiency. Our findings reveal that a single substrate can engage an E3 ligase through multiple binding modes, affecting its degradation timing and efficiency.
履歴
登録2018年12月11日-
ヘッダ(付随情報) 公開2019年9月11日-
マップ公開2019年9月11日-
更新2024年5月15日-
現状2024年5月15日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.0085
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（半径に従い着色）
  • 表面レベル: 0.0085
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6q6g
  • 表面レベル: 0.0085
  • UCSF Chimeraによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4465.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4465.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈unsharpened map
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.05 Å/pix.
x 400 pix.
= 418.8 Å		1.05 Å/pix.
x 400 pix.
= 418.8 Å		1.05 Å/pix.
x 400 pix.
= 418.8 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.047 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.0085 / ムービー #1: 0.0085
最小 - 最大-0.012615975 - 0.036665246
平均 (標準偏差)-0.0000010633036 (±0.0014252267)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 418.80002 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.0471.0471.047
M x/y/z400400400
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z418.800418.800418.800
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS400400400
D min/max/mean-0.0130.037-0.000

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添付データ

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追加マップ: sharpened map with B factor -30 and lowpass filtered to 4A

ファイルemd_4465_additional.map
注釈sharpened map with B factor -30 and lowpass filtered to 4A
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: halfmap1

ファイルemd_4465_half_map_1.map
注釈halfmap1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: halfmap2

ファイルemd_4465_half_map_2.map
注釈halfmap2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, ...

全体名称: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
要素
  • 複合体: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
    • 複合体: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
      • タンパク質・ペプチド: Cell division cycle protein 20 homolog
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 10
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 15
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 1,Anaphase-promoting complex subunit 1
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 2
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 4
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 5
      • タンパク質・ペプチド: Cell division cycle protein 16 homolog
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 11
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit CDC26
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 13
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 16
      • タンパク質・ペプチド: Cell division cycle protein 27 homolog
      • タンパク質・ペプチド: Anaphase-promoting complex subunit 7
      • タンパク質・ペプチド: Cell division cycle protein 23 homolog
    • 複合体: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
      • タンパク質・ペプチド: Cyclin-A2

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超分子 #1: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, ...

超分子名称: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
分子量理論値: 1.3 MDa

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超分子 #2: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, ...

超分子名称: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1, #3-#16
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

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超分子 #3: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, ...

超分子名称: Cryo-EM structure of the APC/C-Cdc20-Cdk2-cyclinA2-Cks2 complex, the D1 box class
タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

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分子 #1: Cell division cycle protein 20 homolog

分子名称: Cell division cycle protein 20 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 54.796508 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MAQFAFESDL HSLLQLDAPI PNAPPARWQR KAKEAAGPAP SPMRAANRSH SAGRTPGRTP GKSSSKVQTT PSKPGGDRYI PHRSAAQME VASFLLSKEN QPENSQTPTK KEHQKAWALN LNGFDVEEAK ILRLSGKPQN APEGYQNRLK VLYSQKATPG S SRKTCRYI ...文字列:
MAQFAFESDL HSLLQLDAPI PNAPPARWQR KAKEAAGPAP SPMRAANRSH SAGRTPGRTP GKSSSKVQTT PSKPGGDRYI PHRSAAQME VASFLLSKEN QPENSQTPTK KEHQKAWALN LNGFDVEEAK ILRLSGKPQN APEGYQNRLK VLYSQKATPG S SRKTCRYI PSLPDRILDA PEIRNDYYLN LVDWSSGNVL AVALDNSVYL WSASSGDILQ LLQMEQPGEY ISSVAWIKEG NY LAVGTSS AEVQLWDVQQ QKRLRNMTSH SARVGSLSWN SYILSSGSRS GHIHHHDVRV AEHHVATLSG HSQEVCGLRW APD GRHLAS GGNDNLVNVW PSAPGEGGWV PLQTFTQHQG AVKAVAWCPW QSNVLATGGG TSDRHIRIWN VCSGACLSAV DAHS QVCSI LWSPHYKELI SGHGFAQNQL VIWKYPTMAK VAELKGHTSR VLSLTMSPDG ATVASAAADE TLRLWRCFEL DPARR RERE KASAAKSSLI HQGIR

UniProtKB: Cell division cycle protein 20 homolog

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分子 #2: Cyclin-A2

分子名称: Cyclin-A2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 44.944344 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MLGNSAPGPA TREAGSALLA LQQTALQEDQ ENINPEKAAP VQQPRTRAAL AVLKSGNPRG LAQQQAFTIH VDEAEKEAQK KPAESQKIE REDALAFNSA ISLPGPRKPL VPLDYPMDGS FESPHTMDMS IILEDEKPVS VNEVPDYHED IHTYLREMEV K CKPKVGYM ...文字列:
MLGNSAPGPA TREAGSALLA LQQTALQEDQ ENINPEKAAP VQQPRTRAAL AVLKSGNPRG LAQQQAFTIH VDEAEKEAQK KPAESQKIE REDALAFNSA ISLPGPRKPL VPLDYPMDGS FESPHTMDMS IILEDEKPVS VNEVPDYHED IHTYLREMEV K CKPKVGYM KKQPDITNSM RAILVDWLVE VGEEYKLQNE TLHLAVNYID RFLSSMSVLR GKLQLVGTAA MLLASKFEEI YP PEVAEFV YITDDTYTKK QVLRMEHLVL KVLTFDLAAP TVNQFLTQYF LHQQPANCKV ESLAMFLGEL SLIDADPYLK YLP SVIAGA AFHLALYTVT GQSWPESLIR KTGYTLESLK PCLMDLHQTY LKAPQHAQQS IREKYKNSKY HGVSLLNPPE TLNL

UniProtKB: Cyclin-A2

+
分子 #3: Anaphase-promoting complex subunit 10

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 21.282143 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列:
MTTPNKTPPG ADPKQLERTG TVREIGSQAV WSLSSCKPGF GVDQLRDDNL ETYWQSDGSQ PHLVNIQFRR KTTVKTLCIY ADYKSDESY TPSKISVRVG NNFHNLQEIR QLELVEPSGW IHVPLTDNHK KPTRTFMIQI AVLANHQNGR DTHMRQIKIY T PVEESSIG KFPRCTTIDF MMYRSIR

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 10

+
分子 #4: Anaphase-promoting complex subunit 15

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 14.286727 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列:
MSTLFPSLFP RVTETLWFNL DRPCVEETEL QQQEQQHQAW LQSIAEKDNN LVPIGKPASE HYDDEEEEDD EDDEDSEEDS EDDEDMQDM DEMNDYNESP DDGEVNEVDM EGNEQDQDQW MI

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 15

+
分子 #5: Anaphase-promoting complex subunit 1,Anaphase-promoting complex s...

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 1,Anaphase-promoting complex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 207.282328 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MSNFYEERTT MIAARDLQEF VPFGRDHCKH HPNALNLQLR QLQPASELWS SDGAAGLVGS LQEVTIHEKQ KESWQLRKGV SEIGEDVDY DEELYVAGNM VIWSKGSKSQ ALAVYKAFTV DSPVQQALWC DFIISQDKSE KAYSSNEVEK CICILQSSCI N MHSIEGKD ...文字列:
MSNFYEERTT MIAARDLQEF VPFGRDHCKH HPNALNLQLR QLQPASELWS SDGAAGLVGS LQEVTIHEKQ KESWQLRKGV SEIGEDVDY DEELYVAGNM VIWSKGSKSQ ALAVYKAFTV DSPVQQALWC DFIISQDKSE KAYSSNEVEK CICILQSSCI N MHSIEGKD YIASLPFQVA NVWPTKYGLL FERSASSHEV PPGSPREPLP TMFSMLHPLD EITPLVCKSG SLFGSSRVQY VV DHAMKIV FLNTDPSIVM TYDAVQNVHS VWTLRRVKSE EENVVLKFSE QGGTPQNVAT SSSLTAHLRL APETEPIVPE LCI DHLWTE TITNIREKNS QASKVFITSD LCGQKFLCFL VESQLQLRCV KFQESNDKTQ LIFGSVTNIP AKDAAPVEKI DTML VLEGS GNLVLYTGVV RVGKVFIPGL PAPSLTMSNT MPRPSTPLDG VSTPKPLSKL LGSLDEVVLL SPVPELRDSS KLHDS LYNE DCTFQQLGTY IHSIRDPVHN RVTLELSNGS MVRITIPEIA TSELVQTCLQ AIKFILPKEI AVQMLVKWYN VHSAPG GPS YHSEWNLFVT CLMNMMGYNT DRLAWTRNFD FEGSLSPVIA PKKARPSETG SDDDWEYLLN SDYHQNVESH LLNRSLC LS PSEASQMKDE DFSQNLSLDS STLLFTHIPA IFFVLHLVYE ELKLNTLMGE GICSLVELLV QLARDLKLGP YVDHYYRD Y PTLVRTTGQV CTIDPGQTGF MHHPSFFTSE PPSIYQWVSS CLKGEGMPPY PYLPGICERS RLVVLSIALY ILGDESLVS DESSQYLTRI TIAPQKLQVE QEENRFSFRH STSVSSLAER LVVWMTNVGF TLRDLETLPF GIALPIRDAI YHCREQPASD WPEAVCLLI GRQDLSKQAC EGNLPKGKSV LSSDVPSGTE TEEEDDGMND MNHEVMSLIW SEDLRVQDVR RLLQSAHPVR V NVVQYPEL SDHEFIEEKE NRLLQLCQRT MALPVGRGMF TLFSYHPVPT EPLPIPKLNL TGRAPPRNTT VDLNSGNIDV PP NMTSWAS FHNGVAAGLK IAPASQIDSA WIVYNKPKHA ELANEYAGFL MALGLNGHLT KLATLNIHDY LTKGHEMTSI GLL LGVSAA KLGTMDMSIT RLLSIHIPAL LPPTSTELDV PHNVQVAAVV GIGLVYQGTA HRHTAEVLLA EIGRPPGPEM EYCT DRESY SLAAGLALGM VCLGHGSNLI GMSDLNVPEQ LYQYMVGGHR RFQTGMHREK HKSPSYQIKE GDTINVDVTC PGATL ALAM IYLKTNNRSI ADWLRAPDTM YLLDFVKPEF LLLRTLARCL ILWDDILPNS KWVDSNVPQI IRENSISLSE IELPCS EDL NLETLSQAHV YIIAGACLSL GFRFAGSENL SAFNCLHKFA KDFMTYLSAP NASVTGPHNL ETCLSVVLLS LAMVMAG SG NLKVLQLCRF LHMKTGGEMN YGFHLAHHMA LGLLFLGGGR YSLSTSNSSI AALLCALYPH FPAHSTDNRY HLQALRHL Y VLAAEPRLLV PVDVDTNTPC YALLEVTYKG TQWYEQTKEE LMAPTLLPEL HLLKQIKVKG PRYWELLIDL SKGTQHLKS ILSKDGVLYV KLRAGQLSYK EDPMGWQSLL AQTVANRNSE ARAFKPETIS AFTSDPALLS FAEYFCKPTV NMGQKQEILD LFSSVLYEC VTQETPEMLP AYIAMDQAIR RLGRREMSET SELWQIKLVL EFFSSRSHQE RLQNHPKRGL FMNSEFLPVV K CTIDNTLD QWLQVGGDMC VHAYLSGQPL EESQLSMLAC FLVYHSVPAP QHLPPIGLEG STSFAELLFK FKQLKMPVRA LL RLAPLLL GNPQPMVM

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 1, Anaphase-promoting complex subunit 1

+
分子 #6: Anaphase-promoting complex subunit 2

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 93.938977 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MAAAVVVAEG DSDSRPGQEL LVAWNTVSTG LVPPAALGLV SSRTSGAVPP KEEELRAAVE VLRGHGLHSV LEEWFVEVLQ NDLQANISP EFWNAISQCE NSADEPQCLL LLLDAFGLLE SRLDPYLRSL ELLEKWTRLG LLMGTGAQGL REEVHTMLRG V LFFSTPRT ...文字列:
MAAAVVVAEG DSDSRPGQEL LVAWNTVSTG LVPPAALGLV SSRTSGAVPP KEEELRAAVE VLRGHGLHSV LEEWFVEVLQ NDLQANISP EFWNAISQCE NSADEPQCLL LLLDAFGLLE SRLDPYLRSL ELLEKWTRLG LLMGTGAQGL REEVHTMLRG V LFFSTPRT FQEMIQRLYG CFLRVYMQSK RKGEGGTDPE LEGELDSRYA RRRYYRLLQS PLCAGCSSDK QQCWCRQALE QF HQLSQVL HRLSLLERVS AEAVTTTLHQ VTRERMEDRC RGEYERSFLR EFHKWIERVV GWLGKVFLQD GPARPASPEA GNT LRRWRC HVQRFFYRIY ASLRIEELFS IVRDFPDSRP AIEDLKYCLE RTDQRQQLLV SLKAALETRL LHPGVNTCDI ITLY ISAIK ALRVLDPSMV ILEVACEPIR RYLRTREDTV RQIVAGLTGD SDGTGDLAVE LSKTDPASLE TGQDSEDDSG EPEDW VPDP VDADPGKSSS KRRSSDIISL LVSIYGSKDL FINEYRSLLA DRLLHQFSFS PEREIRNVEL LKLRFGEAPM HFCEVM LKD MADSRRINAN IREEDEKRPA EEQPPFGVYA VILSSEFWPP FKDEKLEVPE DIRAALEAYC KKYEQLKAMR TLSWKHT LG LVTMDVELAD RTLSVAVTPV QAVILLYFQD QASWTLEELS KAVKMPVALL RRRMSVWLQQ GVLREEPPGT FSVIEEER P QDRDNMVLID SDDESDSGMA SQADQKEEEL LLFWTYIQAM LTNLESLSLD RIYNMLRMFV VTGPALAEID LQELQGYLQ KKVRDQQLVY SAGVYRLPKN CS

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 2

+
分子 #7: Anaphase-promoting complex subunit 4

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 92.219227 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MLRFPTCFPS FRVVGEKQLP QEIIFLVWSP KRDLIALANT AGEVLLHRLA SFHRVWSFPP NENTGKEVTC LAWRPDGKLL AFALADTKK IVLCDVEKPE SLHSFSVEAP VSCMHWMEVT VESSVLTSFY NAEDESNLLL PKLPTLPKNY SNTSKIFSEE N SDEIIKLL ...文字列:
MLRFPTCFPS FRVVGEKQLP QEIIFLVWSP KRDLIALANT AGEVLLHRLA SFHRVWSFPP NENTGKEVTC LAWRPDGKLL AFALADTKK IVLCDVEKPE SLHSFSVEAP VSCMHWMEVT VESSVLTSFY NAEDESNLLL PKLPTLPKNY SNTSKIFSEE N SDEIIKLL GDVRLNILVL GGSSGFIELY AYGMFKIARV TGIAGTCLAL CLSSDLKSLS VVTEVSTNGA SEVSYFQLET NL LYSFLPE VTRMARKFTH ISALLQYINL SLTCMCEAWE EILMQMDSRL TKFVQEKNTT TSVQDEFMHL LLWGKASAEL QTL LMNQLT VKGLKKLGQS IESSYSSIQK LVISHLQSGS ESLLYHLSEL KGMASWKQKY EPLGLDAAGI EEAITAVGSF ILKA NELLQ VIDSSMKNFK AFFRWLYVAM LRMTEDHVLP ELNKMTQKDI TFVAEFLTEH FNEAPDLYNR KGKYFNVERV GQYLK DEDD DLVSPPNTEG NQWYDFLQNS SHLKESPLLF PYYPRKSLHF VKRRMENIID QCLQKPADVI GKSMNQAICI PLYRDT RSE DSTRRLFKFP FLWNNKTSNL HYLLFTILED SLYKMCILRR HTDISQSVSN GLIAIKFGSF TYATTEKVRR SIYSCLD AQ FYDDETVTVV LKDTVGREGR DRLLVQLPLS LVYNSEDSAE YQFTGTYSTR LDEQCSAIPT RTMHFEKHWR LLESMKAQ Y VAGNGFRKVS CVLSSNLRHV RVFEMDIDDE WELDESSDEE EEASNKPVKI KEEVLSESEA ENQQAGAAAL APEIVIKVE KLDPELDS

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 4

+
分子 #8: Anaphase-promoting complex subunit 5

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 85.179766 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MASVHESLYF NPMMTNGVVH ANVFGIKDWV TPYKIAVLVL LNEMSRTGEG AVSLMERRRL NQLLLPLLQG PDITLSKLYK LIEESCPQL ANSVQIRIKL MAEGELKDME QFFDDLSDSF SGTEPEVHKT SVVGLFLRHM ILAYSKLSFS QVFKLYTALQ Q YFQNGEKK ...文字列:
MASVHESLYF NPMMTNGVVH ANVFGIKDWV TPYKIAVLVL LNEMSRTGEG AVSLMERRRL NQLLLPLLQG PDITLSKLYK LIEESCPQL ANSVQIRIKL MAEGELKDME QFFDDLSDSF SGTEPEVHKT SVVGLFLRHM ILAYSKLSFS QVFKLYTALQ Q YFQNGEKK TVEDADMELT SRDEGERKME KEELDVSVRE EEVSCSGPLS QKQAEFFLSQ QASLLKNDET KALTPASLQK EL NNLLKFN PDFAEAHYLS YLNNLRVQDV FSSTHSLLHY FDRLILTGAE SKSNGEEGYG RSLRYAALNL AALHCRFGHY QQA ELALQE AIRIAQESND HVCLQHCLSW LYVLGQKRSD SYVLLEHSVK KAVHFGLPYL ASLGIQSLVQ QRAFAGKTAN KLMD ALKDS DLLHWKHSLS ELIDISIAQK TAIWRLYGRS TMALQQAQML LSMNSLEAVN AGVQQNNTES FAVALCHLAE LHAEQ GCFA AASEVLKHLK ERFPPNSQHA QLWMLCDQKI QFDRAMNDGK YHLADSLVTG ITALNSIEGV YRKAVVLQAQ NQMSEA HKL LQKLLVHCQK LKNTEMVISV LLSVAELYWR SSSPTIALPM LLQALALSKE YRLQYLASET VLNLAFAQLI LGIPEQA LS LLHMAIEPIL ADGAILDKGR AMFLVAKCQV ASAASYDQPK KAEALEAAIE NLNEAKNYFA KVDCKERIRD VVYFQARL Y HTLGKTQERN RCAMLFRQLH QELPSHGVPL INHL

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 5

+
分子 #9: Cell division cycle protein 16 homolog

分子名称: Cell division cycle protein 16 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 71.747516 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MNLERLRKRV RQYLDQQQYQ SALFWADKVA SLSREEPQDI YWLAQCLYLT AQYHRAAHAL RSRKLDKLYE ACRYLAARCH YAAKEHQQA LDVLDMEEPI NKRLFEKYLK DESGFKDPSS DWEMSQSSIK SSICLLRGKI YDALDNRTLA TYSYKEALKL D VYCFEAFD ...文字列:
MNLERLRKRV RQYLDQQQYQ SALFWADKVA SLSREEPQDI YWLAQCLYLT AQYHRAAHAL RSRKLDKLYE ACRYLAARCH YAAKEHQQA LDVLDMEEPI NKRLFEKYLK DESGFKDPSS DWEMSQSSIK SSICLLRGKI YDALDNRTLA TYSYKEALKL D VYCFEAFD LLTSHHMLTA QEEKELLESL PLSKLCNEEQ ELLRFLFENK LKKYNKPSET VIPESVDGLQ ENLDVVVSLA ER HYYNCDF KMCYKLTSVV MEKDPFHASC LPVHIGTLVE LNKANELFYL SHKLVDLYPS NPVSWFAVGC YYLMVGHKNE HAR RYLSKA TTLEKTYGPA WIAYGHSFAV ESEHDQAMAA YFTAAQLMKG CHLPMLYIGL EYGLTNNSKL AERFFSQALS IAPE DPFVM HEVGVVAFQN GEWKTAEKWF LDALEKIKAI GNEVTVDKWE PLLNNLGHVC RKLKKYAEAL DYHRQALVLI PQNAS TYSA IGYIHSLMGN FENAVDYFHT ALGLRRDDTF SVTMLGHCIE MYIGDSEAYI GADIKDKLKC YDFDVHTMKT LKNIIS PPW DFREFEVEKQ TAEETGLTPL ETSRKTPDSR PSLEETFEIE MNESDMMLET SMSDHST

UniProtKB: Cell division cycle protein 16 homolog

+
分子 #10: Anaphase-promoting complex subunit 11

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 9.854647 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列:
MKVKIKCWNG VATWLWVAND ENCGICRMAF NGCCPDCKVP GDDCPLVWGQ CSHCFHMHCI LKWLHAQQVQ QHCPMCRQEW KFKE

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 11

+
分子 #11: Anaphase-promoting complex subunit CDC26

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit CDC26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 9.793999 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列:
MLRRKPTRLE LKLDDIEEFE NIRKDLETRK KQKEDVEVVG GSDGEGAIGL SSDPKSREQM INDRIGYKPQ PKPNNRSSQF GSLEF

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit CDC26

+
分子 #12: Anaphase-promoting complex subunit 13

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 8.528309 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列:
MDSEVQRDGR ILDLIDDAWR EDKLPYEDVA IPLNELPEPE QDNGGTTESV KEQEMKWTDL ALQYLHENVP PIGN

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 13

+
分子 #13: Anaphase-promoting complex subunit 16

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 11.677995 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列:
MAASSSSSSA GGVSGSSVTG SGFSVSDLAP PRKALFTYPK GAGEMLEDGS ERFLCESVFS YQVASTLKQV KHDQQVARME KLAGLVEEL EADEWRFKPI EQLLGFTPSS G

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 16

+
分子 #14: Cell division cycle protein 27 homolog

分子名称: Cell division cycle protein 27 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 91.973125 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MTVLQEPVQA AIWQALNHYA YRDAVFLAER LYAEVHSEEA LFLLATCYYR SGKAYKAYRL LKGHSCTTPQ CKYLLAKCCV DLSKLAEGE QILSGGVFNK QKSHDDIVTE FGDSACFTLS LLGHVYCKTD RLAKGSECYQ KSLSLNPFLW SPFESLCEIG E KPDPDQTF ...文字列:
MTVLQEPVQA AIWQALNHYA YRDAVFLAER LYAEVHSEEA LFLLATCYYR SGKAYKAYRL LKGHSCTTPQ CKYLLAKCCV DLSKLAEGE QILSGGVFNK QKSHDDIVTE FGDSACFTLS LLGHVYCKTD RLAKGSECYQ KSLSLNPFLW SPFESLCEIG E KPDPDQTF KFTSLQNFSN CLPNSCTTQV PNHSLSHRQP ETVLTETPQD TIELNRLNLE SSNSKYSLNT DSSVSYIDSA VI SPDTVPL GTGTSILSKQ VQNKPKTGRS LLGGPAALSP LTPSFGILPL ETPSPGDGSY LQNYTNTPPV IDVPSTGAPS KKS VARIGQ TGTKSVFSQS GNSREVTPIL AQTQSSGPQT STTPQVLSPT ITSPPNALPR RSSRLFTSDS STTKENSKKL KMKF PPKIP NRKTKSKTNK GGITQPNIND SLEITKLDSS IISEGKISTI TPQIQAFNLQ KAAAEGLMSL LREMGKGYLA LCSYN CKEA INILSHLPSH HYNTGWVLCQ IGRAYFELSE YMQAERIFSE VRRIENYRVE GMEIYSTTLW HLQKDVALSV LSKDLT DMD KNSPEAWCAA GNCFSLQREH DIAIKFFQRA IQVDPNYAYA YTLLGHEFVL TEELDKALAC FRNAIRVNPR HYNAWYG LG MIYYKQEKFS LAEMHFQKAL DINPQSSVLL CHIGVVQHAL KKSEKALDTL NKAIVIDPKN PLCKFHRASV LFANEKYK S ALQELEELKQ IVPKESLVYF LIGKVYKKLG QTHLALMNFS WAMDLDPKGA NNQIKEAIDK RYLPDDEEPI TQEEQIMGT DESQESSMTD ADDTQLHAAE SDEF

UniProtKB: Cell division cycle protein 27 homolog

+
分子 #15: Anaphase-promoting complex subunit 7

分子名称: Anaphase-promoting complex subunit 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 66.929367 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MDPGDAAILE SSLRILYRLF ESVLPPLPAA LQSRMNVIDH VRDMAAAGLH SNVRLLSSLL LTMSNNNPEL FSPPQKYQLL VYHADSLFH DKEYRNAVSK YTMALQQKKA LSKTSKVRPS TGNSASTPQS QCLPSEIEVK YKMAECYTML KQDKDAIAIL D GIPSRQRT ...文字列:
MDPGDAAILE SSLRILYRLF ESVLPPLPAA LQSRMNVIDH VRDMAAAGLH SNVRLLSSLL LTMSNNNPEL FSPPQKYQLL VYHADSLFH DKEYRNAVSK YTMALQQKKA LSKTSKVRPS TGNSASTPQS QCLPSEIEVK YKMAECYTML KQDKDAIAIL D GIPSRQRT PKINMMLANL YKKAGQERPS VTSYKEVLRQ CPLALDAILG LLSLSVKGAE VASMTMNVIQ TVPNLDWLSV WI KAYAFVH TGDNSRAIST ICSLEKKSLL RDNVDLLGSL ADLYFRAGDN KNSVLKFEQA QMLDPYLIKG MDVYGYLLAR EGR LEDVEN LGCRLFNISD QHAEPWVVSG CHSFYSKRYS RALYLGAKAI QLNSNSVQAL LLKGAALRNM GRVQEAIIHF REAI RLAPC RLDCYEGLIE CYLASNSIRE AMVMANNVYK TLGANAQTLT LLATVCLEDP VTQEKAKTLL DKALTQRPDY IKAVV KKAE LLSREQKYED GIALLRNALA NQSDCVLHRI LGDFLVAVNE YQEAMDQYSI ALSLDPNDQK SLEGMQKMEK EESPTD ATQ EEDVDDMEGS GEEGDLEGSD SEAAQWADQE QWFGMQ

UniProtKB: Anaphase-promoting complex subunit 7

+
分子 #16: Cell division cycle protein 23 homolog

分子名称: Cell division cycle protein 23 homolog / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 68.921031 KDa
組換発現生物種: unidentified baculovirus (ウイルス)
配列文字列: MAASTSMVPV AVTAAVAPVL SINSDFSDLR EIKKQLLLIA GLTRERGLLH SSKWSAELAF SLPALPLAEL QPPPPITEED AQDMDAYTL AKAYFDVKEY DRAAHFLHGC NSKKAYFLYM YSRYLSGEKK KDDETVDSLG PLEKGQVKNE ALRELRVELS K KHQARELD ...文字列:
MAASTSMVPV AVTAAVAPVL SINSDFSDLR EIKKQLLLIA GLTRERGLLH SSKWSAELAF SLPALPLAEL QPPPPITEED AQDMDAYTL AKAYFDVKEY DRAAHFLHGC NSKKAYFLYM YSRYLSGEKK KDDETVDSLG PLEKGQVKNE ALRELRVELS K KHQARELD GFGLYLYGVV LRKLDLVKEA IDVFVEATHV LPLHWGAWLE LCNLITDKEM LKFLSLPDTW MKEFFLAHIY TE LQLIEEA LQKYQNLIDV GFSKSSYIVS QIAVAYHNIR DIDKALSIFN ELRKQDPYRI ENMDTFSNLL YVRSMKSELS YLA HNLCEI DKYRVETCCV IGNYYSLRSQ HEKAALYFQR ALKLNPRYLG AWTLMGHEYM EMKNTSAAIQ AYRHAIEVNK RDYR AWYGL GQTYEILKMP FYCLYYYRRA HQLRPNDSRM LVALGECYEK LNQLVEAKKC YWRAYAVGDV EKMALVKLAK LHEQL TESE QAAQCYIKYI QDIYSCGEIV EHLEESTAFR YLAQYYFKCK LWDEASTCAQ KCCAFNDTRE EGKALLRQIL QLRNQG ETP TTEVPAPFFL PASLSANNTP TRRVSPLNLS SVTP

UniProtKB: Cell division cycle protein 23 homolog

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度0.15 mg/mL
緩衝液pH: 8 / 詳細: 20mM Hepes, 150mM NaCl, 0.5mM TCEP
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 28.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

4g04

最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0) / 使用した粒子像数: 176826
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
FSC曲線 (解像度の算出)

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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