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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | CryoET of VSV incubated with liposomes at pH 5.5 | |||||||||
![]() | Tomogram TS6074 from the 120s post-incubation dataset, pertaining to Fig. 2B. | |||||||||
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![]() | Virus / Liposome / Fusion / Class III Fusion / VSV / VSV G | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
![]() | Si Z / Xia X / Tang S / Milojevic L | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Capturing Intermediates and Membrane Remodeling during Class III Fusion 著者: Milojevic L / Si Z / Xia X / Chen L / He Y / Tang S / Luo M / Zhou ZH | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 375.1 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 10.4 KB 10.4 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 210.1 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.8 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 344.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 344.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Tomogram TS6074 from the 120s post-incubation dataset, pertaining to Fig. 2B. | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 8.16 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Vesicular stomatitis Indiana virus strain San Juan
全体 | 名称: ![]() |
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要素 |
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-超分子 #1: Vesicular stomatitis Indiana virus strain San Juan
超分子 | 名称: Vesicular stomatitis Indiana virus strain San Juan / タイプ: virus / ID: 1 / 親要素: 0 / NCBI-ID: 11285 生物種: Vesicular stomatitis Indiana virus strain San Juan ウイルスタイプ: VIRION / ウイルス・単離状態: OTHER / ウイルス・エンベロープ: Yes / ウイルス・中空状態: No |
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-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 5.5 |
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グリッド | モデル: PELCO Ultrathin Carbon with Lacey Carbon / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: LACEY |
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
切片作成 | その他: NO SECTIONING |
位置合わせマーカー | Manufacturer: Cell Microscopy Core, Department of Cell Biology, University Medical Center Utrecht 直径: 10 nm |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 100.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER / 最大 デフォーカス(公称値): 3.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 42 |
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