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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | Purified alpha-CaMKII Holoenzymes | |||||||||
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![]() | CaMKII / calmodulin / tomography / segmentation / SIGNALING PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
![]() | Swulius MT | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Rapid Synthesis of Cryo-ET Data for Training Deep Learning Models. 著者: Purnell C / Heebner J / Hylton RH / Kabonick S / Grillo M / Grigoryev S / Heberle F / Waxham NM / Swulius MT | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 66 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 9.6 KB 9.6 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 225.9 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 3.4 KB | ||
その他 | ![]() | 785.3 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 439.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 439.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 2.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 5.4 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-追加マップ: #1
ファイル | emd_41263_additional_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : Purified alpha-CaMKII Holoenzyme
全体 | 名称: Purified alpha-CaMKII Holoenzyme |
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要素 |
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-超分子 #1: Purified alpha-CaMKII Holoenzyme
超分子 | 名称: Purified alpha-CaMKII Holoenzyme / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 詳細: Weighted Back-projection and Greyscale Segmentation |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 電子線トモグラフィー法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 6.8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
切片作成 | その他: NO SECTIONING |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 1.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 5.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 5.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 使用した粒子像数: 60 |
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