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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | masked histone region in the catalytic core of human telomerase holoenzyme | |||||||||
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生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.97 Å | |||||||||
![]() | Wan F / Ding Y / Yang L / Wu Z / Wu J / Lei M | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Zipper head mechanism of telomere synthesis by human telomerase. 著者: Futang Wan / Yongbo Ding / Yuebin Zhang / Zhenfang Wu / Shaobai Li / Lin Yang / Xiangyu Yan / Pengfei Lan / Guohui Li / Jian Wu / Ming Lei / ![]() 要旨: Telomerase, a multi-subunit ribonucleoprotein complex, is a unique reverse transcriptase that catalyzes the processive addition of a repeat sequence to extend the telomere end using a short fragment ...Telomerase, a multi-subunit ribonucleoprotein complex, is a unique reverse transcriptase that catalyzes the processive addition of a repeat sequence to extend the telomere end using a short fragment of its own RNA component as the template. Despite recent structural characterizations of human and Tetrahymena telomerase, it is still a mystery how telomerase repeatedly uses its RNA template to synthesize telomeric DNA. Here, we report the cryo-EM structure of human telomerase holoenzyme bound with telomeric DNA at resolutions of 3.5 Å and 3.9 Å for the catalytic core and biogenesis module, respectively. The structure reveals that a leucine residue Leu980 in telomerase reverse transcriptase (TERT) catalytic subunit functions as a zipper head to limit the length of the short primer-template duplex in the active center. Moreover, our structural and computational analyses suggest that TERT and telomerase RNA (hTR) are organized to harbor a preformed active site that can accommodate short primer-template duplex substrates for catalysis. Furthermore, our findings unveil a double-fingers architecture in TERT that ensures nucleotide addition processivity of human telomerase. We propose that the zipper head Leu980 is a structural determinant for the sequence-based pausing signal of DNA synthesis that coincides with the RNA element-based physical template boundary. Functional analyses unveil that the non-glycine zipper head plays an essential role in both telomerase repeat addition processivity and telomere length homeostasis. In addition, we also demonstrate that this zipper head mechanism is conserved in all eukaryotic telomerases. Together, our study provides an integrated model for telomerase-mediated telomere synthesis. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 253.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 12.3 KB 12.3 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 146.7 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 316.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 316.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.1 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Catalytic core
全体 | 名称: Catalytic core |
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要素 |
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-超分子 #1: Catalytic core
超分子 | 名称: Catalytic core / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Telomerase reverse transcriptase
分子 | 名称: Telomerase reverse transcriptase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MPRAPRCRAV RSLLRSHYRE VLPLATFVRR LGPQGWRLVQ RGDPAAFRAL VAQCLVCVPW DARPPPAAPS FRQVSCLKE LVARVLQRLC ERGAKNVLAF GFALLDGARG GPPEAFTTSV RSYLPNTVTD ALRGSGAWGL L LRRVGDDV LVHLLARCAL FVLVAPSCAY ...文字列: MPRAPRCRAV RSLLRSHYRE VLPLATFVRR LGPQGWRLVQ RGDPAAFRAL VAQCLVCVPW DARPPPAAPS FRQVSCLKE LVARVLQRLC ERGAKNVLAF GFALLDGARG GPPEAFTTSV RSYLPNTVTD ALRGSGAWGL L LRRVGDDV LVHLLARCAL FVLVAPSCAY QVCGPPLYQL GAATQARPPP HASGPRRRLG CERAWNHSVR EA GVPLGLP APGARRRGGS ASRSLPLPKR PRRGAAPEPE RTPVGQGSWA HPGRTRGPSD RGFCVVSPAR PAE EATSLE GALSGTRHSH PSVGRQHHAG PPSTSRPPRP WDTPCPPVYA ETKHFLYSSG DKEQLRPSFL LSSL RPSLT GARRLVETIF LGSRPWMPGT PRRLPRLPQR YWQMRPLFLE LLGNHAQCPY GVLLKTHCPL RAAVT PAAG VCAREKPQGS VAAPEEEDTD PRRLVQLLRQ HSSPWQVYGF VRACLRRLVP PGLWGSRHNE RRFLRN TKK FISLGKHAKL SLQELTWKMS VRDCAWLRRS PGVGCVPAAE HRLREEILAK FLHWLMSVYV VELLRSF FY VTETTFQKNR LFFYRKSVWS KLQSIGIRQH LKRVQLRELS EAEVRQHREA RPALLTSRLR FIPKPDGL R PIVNMDYVVG ARTFRREKRA ERLTSRVKAL FSVLNYERAR RPGLLGASVL GLDDIHRAWR TFVLRVRAQ DPPPELYFVK VDVTGAYDTI PQDRLTEVIA SIIKPQNTYC VRRYAVVQKA AHGHVRKAFK SHVSTLTDLQ PYMRQFVAH LQETSPLRDA VVIEQSSSLN EASSGLFDVF LRFMCHHAVR IRGKSYVQCQ GIPQGSILST L LCSLCYGD MENKLFAGIR RDGLLLRLVD DFLLVTPHLT HAKTFLRTLV RGVPEYGCVV NLRKTVVNFP VE DEALGGT AFVQMPAHGL FPWCGLLLDT RTLEVQSDYS SYARTSIRAS LTFNRGFKAG RNMRRKLFGV LRL KCHSLF LDLQVNSLQT VCTNIYKILL LQAYRFHACV LQLPFHQQVW KNPTFFLRVI SDTASLCYSI LKAK NAGMS LGAKGAAGPL PSEAVQWLCH QAFLLKLTRH RVTYVPLLGS LRTAQTQLSR KLPGTTLTAL EAAAN PALP SDFKTILD |
-分子 #2: Histone H2A type 1-B/E
分子 | 名称: Histone H2A type 1-B/E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: SGRGKQGGKA RAKAKTRSSR AGLQFPVGRV HRLLRKGNYS ERVGAGAPVY LAAVLEYLTA EILELAGNA ARDNKKTRII PRHLQLAIRN DEELNKLLGR VTIAQGGVLP NIQAVLLPKK TESHHKAKGK |
-分子 #3: Histone H2B type 1-K
分子 | 名称: Histone H2B type 1-K / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: PEPAKSAPAP KKGSKKAVTK AQKKDGKKRK RSRKESYSVY VYKVLKQVHP DTGISSKAMG IMNSFVNDI FERIAGEASR LAHYNKRSTI TSREIQTAVR LLLPGELAKH AVSEGTKAVT KYTSAK |
-分子 #4: Telomerase RNA component
分子 | 名称: Telomerase RNA component / タイプ: rna / ID: 4 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: GGGUUGCGGA GGGUGGGCCU GGGAGGGGUG GUGGCCAUUU UUUGUCUAAC CCUAACUGAG AAGGGCGUAG GCGCCGUGC UUUUGCUCCC CGCGCGCUGU UUUUCUCGCU GACUUUCAGC GGGCGGAAAA GCCUCGGCCU G CCGCCUUC CACCGUUCAU UCUAGAGCAA ...文字列: GGGUUGCGGA GGGUGGGCCU GGGAGGGGUG GUGGCCAUUU UUUGUCUAAC CCUAACUGAG AAGGGCGUAG GCGCCGUGC UUUUGCUCCC CGCGCGCUGU UUUUCUCGCU GACUUUCAGC GGGCGGAAAA GCCUCGGCCU G CCGCCUUC CACCGUUCAU UCUAGAGCAA ACAAAAAAUG UCAGCUGCUG GCCCGUUCGC CCCUCCCGGG GA CCUGCGG CGGGUCGCCU GCCCAGCCCC CGAACCCCGC CUGGAGGCCG CGGUCGGCCC GGGGCUUCUC CGG AGGCAC CCACUGCCAC CGCGAAGAGU UGGGCUCUGU CAGCCGCGGG UCUCUCGGGG GCGAGGGCGA GGUU CAGGC CUUUCAGGCC GCAGGAAGAG GAACGGAGCG AGUCCCCGCG CGCGGCGCGA UUCCCUGAGC UGUGG GACG UGCACCCAGG ACUCGGCUCA CACAUGC |
-分子 #5: Primer DNA
分子 | 名称: Primer DNA / タイプ: dna / ID: 5 / 分類: DNA |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT AGGG |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.9 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 62.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.97 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 50600 |
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初期 角度割当 | タイプ: COMMON LINE |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |