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- EMDB-19038: Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-19038
タイトルStructure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex
マップデータOverall map filtered by local resolution
試料
  • 複合体: Pre-termination complex
    • 複合体: Integrator-PP2A complex and NELF
      • タンパク質・ペプチド: x 19種
    • 複合体: Nucleosome
      • タンパク質・ペプチド: x 5種
    • 複合体: RNA and DNA
      • DNA: x 2種
      • RNA: x 1種
    • 複合体: DNA-directed RNA Polymerase II
      • タンパク質・ペプチド: x 13種
    • 複合体: DSIF
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
  • リガンド: x 3種
キーワードIntegrator complex / Pre-termination complex / TRANSCRIPTION
機能・相同性
機能・相同性情報


U2 snRNA 3'-end processing / regulation of fertilization / NELF complex / meiotic spindle elongation / Integration of energy metabolism / NTRK3 as a dependence receptor / PP2A-mediated dephosphorylation of key metabolic factors / snRNA 3'-end processing / RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat S2 phosphatase activity / RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat S7 phosphatase activity ...U2 snRNA 3'-end processing / regulation of fertilization / NELF complex / meiotic spindle elongation / Integration of energy metabolism / NTRK3 as a dependence receptor / PP2A-mediated dephosphorylation of key metabolic factors / snRNA 3'-end processing / RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat S2 phosphatase activity / RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat S7 phosphatase activity / mitotic sister chromatid separation / MASTL Facilitates Mitotic Progression / negative regulation of DNA-templated transcription, elongation / protein phosphatase type 2A complex / protein serine/threonine phosphatase complex / regulation of meiotic cell cycle process involved in oocyte maturation / peptidyl-threonine dephosphorylation / meiotic sister chromatid cohesion, centromeric / snRNA processing / INTAC complex / RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat S5 phosphatase activity / protein localization to nuclear envelope / FAR/SIN/STRIPAK complex / Regulation of glycolysis by fructose 2,6-bisphosphate metabolism / DSIF complex / Inhibition of replication initiation of damaged DNA by RB1/E2F1 / female meiotic nuclear division / eye development / regulation of transcription elongation by RNA polymerase II / protein phosphatase regulator activity / GABA receptor binding / flagellated sperm motility / integrator complex / APC truncation mutants have impaired AXIN binding / AXIN missense mutants destabilize the destruction complex / Truncations of AMER1 destabilize the destruction complex / protein antigen binding / Formation of RNA Pol II elongation complex / Formation of the Early Elongation Complex / Transcriptional regulation by small RNAs / RNA Polymerase II Pre-transcription Events / TP53 Regulates Transcription of DNA Repair Genes / FGFR2 alternative splicing / RNA polymerase II transcribes snRNA genes / mRNA Capping / mRNA Splicing - Minor Pathway / Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA / RNA Polymerase II Promoter Escape / RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening / RNA Polymerase II Transcription Initiation / RNA Polymerase II Transcription Elongation / RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance / RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE / Estrogen-dependent gene expression / Formation of TC-NER Pre-Incision Complex / Dual incision in TC-NER / Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER / mRNA Splicing - Major Pathway / ERKs are inactivated / negative regulation of stem cell differentiation / Initiation of Nuclear Envelope (NE) Reformation / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ / positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / Beta-catenin phosphorylation cascade / Signaling by GSK3beta mutants / CTNNB1 S33 mutants aren't phosphorylated / CTNNB1 S37 mutants aren't phosphorylated / CTNNB1 S45 mutants aren't phosphorylated / CTNNB1 T41 mutants aren't phosphorylated / RNA polymerase II transcription initiation surveillance / nuclear lumen / Co-stimulation by CD28 / regulation of growth / positive regulation of DNA-templated transcription, elongation / Disassembly of the destruction complex and recruitment of AXIN to the membrane / Abortive elongation of HIV-1 transcript in the absence of Tat / centrosome localization / nucleosomal DNA binding / negative regulation of epithelial to mesenchymal transition / inner cell mass cell proliferation / Co-inhibition by CTLA4 / Platelet sensitization by LDL / protein-serine/threonine phosphatase / transcription elongation-coupled chromatin remodeling / RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE during HIV infection / RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE / negative regulation of glycolytic process through fructose-6-phosphate / Formation of the Early Elongation Complex / Formation of the HIV-1 Early Elongation Complex / mRNA Capping / positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly / ERK/MAPK targets / mesoderm development / protein serine/threonine phosphatase activity / vascular endothelial cell response to oscillatory fluid shear stress / T cell homeostasis / regulation of cell differentiation / regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle / regulation of microtubule polymerization / maintenance of transcriptional fidelity during transcription elongation by RNA polymerase II
類似検索 - 分子機能
Domain of unknown function DUF3677 / Integrator complex subunit 10 / Integrator complex subunit 2, metazoa / Integrator complex subunit 15 / Integrator complex subunit 2 / Integrator complex subunit 7 / Integrator complex subunit 1 / Integrator complex subunit 14 / Integrator complex subunit 14, beta-barrel domain / Integrator complex subunit 14, C-terminal ...Domain of unknown function DUF3677 / Integrator complex subunit 10 / Integrator complex subunit 2, metazoa / Integrator complex subunit 15 / Integrator complex subunit 2 / Integrator complex subunit 7 / Integrator complex subunit 1 / Integrator complex subunit 14 / Integrator complex subunit 14, beta-barrel domain / Integrator complex subunit 14, C-terminal / : / : / : / : / : / : / Integrator complex subunit 1, RP2B-binding domain / Integrator complex subunit 2 / Integrator complex subunit 15 / Integrator complex subunit 14, beta-barrel domain / Integrator complex subunit 14, alpha-helical domain / Integrator subunit 10 / Integrator complex subunit 1, R3 domain / Integrator complex subunit 1, R4 domain / Integrator complex subunit 1, INTS2-binding domain / Integrator complex subunit 7, C-terminal domain / Integrator complex subunit 7, N-terminal / Integrator complex subunit 7 helical bundle / Cell cycle regulator Mat89Bb / Cell cycle and development regulator Mat89Bb / INTS6 beta-barrel domain / INTS6/SAGE1/DDX26B/CT45, C-terminal / : / INTS6/SAGE1/DDX26B/CT45 C-terminus / Integrator complex subunit 5, C-terminal / Integrator complex subunit 5, N-terminal / Integrator complex subunit 8 / Integrator complex subunit 5 / Integrator complex subunit 5 N-terminus / Integrator complex subunit 5 C-terminus / Cofactor of BRCA1 / : / Cofactor of BRCA1 (COBRA1) / INTS4 8 helical bundle domain / Integrator subunit 4 family C-terminal Ig-like domain / : / : / NELF-A N-terminal domain / TH1 protein / TH1 protein / Sister chromatid cohesion protein PDS5 protein / Integrator complex subunit 9 / Hepatitis delta antigen (HDAg) domain / : / Integrator IntS9, C-terminal domain / Hepatitis delta antigen (HDAg) domain profile. / Integrator complex subunit 11, MBL-fold / : / Integrator IntS11, C-terminal domain / Metallo-beta-lactamase superfamily domain / : / : / : / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Beta-Casp domain / Spt5, KOW domain repeat 6 / Transcription elongation factor SPT5, seventh KOW domain / Transcription elongation factor SPT5, sixth KOW domain / Zn-dependent metallo-hydrolase, RNA specificity domain / Zn-dependent metallo-hydrolase RNA specificity domain / Transcription elongation factor SPT5, second KOW domain / Transcription elongation factor SPT5, fifth KOW domain / Transcription elongation factor SPT5, KOWx domain / Transcription elongation factor SPT5, KOW1 domain / Transcription elongation factor SPT5, fourth KOW domain / HEAT repeat / Transcription elongation factor Spt5, eukaryote / Spt5 transcription elongation factor, N-terminal / Spt5, KOW domain repeat 2 / Spt5, KOW domain repeat 3 / Spt5, KOW domain repeat 5 / Spt5 transcription elongation factor, acidic N-terminal / NGN domain, eukaryotic / Spt5, KOW domain repeat 1 / Spt5, KOW domain repeat 4 / HEAT repeat / Spt5 C-terminal domain / Spt5 C-terminal nonapeptide repeat binding Spt4 / NGN domain / Transcription elongation factor SPT5 / Early transcription elongation factor of RNA pol II, NGN section / : / PPP2R1A-like HEAT repeat / Serine/threonine specific protein phosphatases signature. / Protein phosphatase 2A homologues, catalytic domain. / Serine/threonine-specific protein phosphatase/bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase / HEAT repeat profile. / HEAT, type 2 / von Willebrand factor type A domain
類似検索 - ドメイン・相同性
DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 / DNA-directed RNA polymerase subunit / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 / DNA-directed RNA polymerase subunit / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 / DNA-directed RNA polymerase subunit beta ...DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 / DNA-directed RNA polymerase subunit / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 / DNA-directed RNA polymerase subunit / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 / DNA-directed RNA polymerase subunit beta / DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 / Transcription elongation factor SPT5 / Histone H2A type 1 / Histone H2B type 1-J / Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform / DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 / Histone H4 / Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform / Integrator complex subunit 11 / Histone H3.3C / Integrator complex subunit 5 / Integrator complex subunit 8 / Negative elongation factor C/D / Integrator complex subunit 1 / Negative elongation factor B / Integrator complex subunit 4 / Integrator complex subunit 15 / Integrator complex subunit 14 / Integrator complex subunit 2 / Negative elongation factor A / Integrator complex subunit 9 / Integrator complex subunit 7 / Integrator complex subunit 13 / Integrator complex subunit 10 / Integrator complex subunit 6
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト) / Sus scrofa (ブタ) / Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / synthetic construct (人工物)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.1 Å
データ登録者Fianu I / Ochmann M / Walshe JL / Cramer P
資金援助 ドイツ, European Union, 3件
OrganizationGrant number国
German Research Foundation (DFG)SFB860 ドイツ
German Research Foundation (DFG)SFB1565 ドイツ
European Research Council (ERC)EXC 2067/1-390729940European Union
引用ジャーナル: Nature / 年: 2024
タイトル: Structural basis of Integrator-dependent RNA polymerase II termination.
著者: Isaac Fianu / Moritz Ochmann / James L Walshe / Olexandr Dybkov / Joseph Neos Cruz / Henning Urlaub / Patrick Cramer /
要旨: The Integrator complex can terminate RNA polymerase II (Pol II) in the promoter-proximal region of genes. Previous work has shed light on how Integrator binds to the paused elongation complex ...The Integrator complex can terminate RNA polymerase II (Pol II) in the promoter-proximal region of genes. Previous work has shed light on how Integrator binds to the paused elongation complex consisting of Pol II, the DRB sensitivity-inducing factor (DSIF) and the negative elongation factor (NELF) and how it cleaves the nascent RNA transcript, but has not explained how Integrator removes Pol II from the DNA template. Here we present three cryo-electron microscopy structures of the complete Integrator-PP2A complex in different functional states. The structure of the pre-termination complex reveals a previously unresolved, scorpion-tail-shaped INTS10-INTS13-INTS14-INTS15 module that may use its 'sting' to open the DSIF DNA clamp and facilitate termination. The structure of the post-termination complex shows that the previously unresolved subunit INTS3 and associated sensor of single-stranded DNA complex (SOSS) factors prevent Pol II rebinding to Integrator after termination. The structure of the free Integrator-PP2A complex in an inactive closed conformation reveals that INTS6 blocks the PP2A phosphatase active site. These results lead to a model for how Integrator terminates Pol II transcription in three steps that involve major rearrangements.
履歴
登録2023年12月5日-
ヘッダ(付随情報) 公開2024年2月7日-
マップ公開2024年2月7日-
更新2024年5月15日-
現状2024年5月15日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_19038.png

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_19038.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 476.8 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Overall map filtered by local resolution
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その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.05 Å/pix.
x 500 pix.
= 525. Å		1.05 Å/pix.
x 500 pix.
= 525. Å		1.05 Å/pix.
x 500 pix.
= 525. Å

表面

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ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.05 Å
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最小 - 最大-0.045693368 - 0.10492225
平均 (標準偏差)-0.000028854836 (±0.0024531495)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ500500500
Spacing500500500
セルA=B=C: 525.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_19038_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
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ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refined map around Pol II, DSIF, NELF and nucleic acids

ファイルemd_19038_additional_1.map
注釈Focused refined map around Pol II, DSIF, NELF and nucleic acids
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

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密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refined map around INTS5, INTS6, INTS8 and PP2A

ファイルemd_19038_additional_2.map
注釈Focused refined map around INTS5, INTS6, INTS8 and PP2A
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

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ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refined map around PP2A

ファイルemd_19038_additional_3.map
注釈Focused refined map around PP2A
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

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ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refined map around Integrator cleavage module (INTS4,...

ファイルemd_19038_additional_4.map
注釈Focused refined map around Integrator cleavage module (INTS4, INTS9 and INTS11)
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

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ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refined map around INTS1, INTS2 INTS7 and DSS1

ファイルemd_19038_additional_5.map
注釈Focused refined map around INTS1, INTS2 INTS7 and DSS1
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

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密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refined map around Integrator tail module (INTS10,...

ファイルemd_19038_additional_6.map
注釈Focused refined map around Integrator tail module (INTS10, INTS13 , INTS14 and INTS15)
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

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密度ヒストグラム

ヒストグラム

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_19038_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_19038_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Pre-termination complex

全体名称: Pre-termination complex
要素
  • 複合体: Pre-termination complex
    • 複合体: Integrator-PP2A complex and NELF
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 1
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 2
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 4
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 5
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 6
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 7
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 8
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 9
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 10
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 11
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 13
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 14
      • タンパク質・ペプチド: Integrator complex subunit 15
      • タンパク質・ペプチド: Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform
      • タンパク質・ペプチド: Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform
      • タンパク質・ペプチド: Negative elongation factor A
      • タンパク質・ペプチド: NELF-B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B
      • タンパク質・ペプチド: Negative elongation factor C/D
      • タンパク質・ペプチド: UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK
    • 複合体: Nucleosome
      • タンパク質・ペプチド: Histone H3.3C
      • タンパク質・ペプチド: Histone H4
      • タンパク質・ペプチド: Histone H2A type 1
      • タンパク質・ペプチド: Histone H2B type 1-J
      • タンパク質・ペプチド: Transcription elongation factor SPT5
    • 複合体: RNA and DNA
      • DNA: non-template DNA
      • RNA: RNA
      • DNA: Template DNA
    • 複合体: DNA-directed RNA Polymerase II
      • タンパク質・ペプチド: UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase subunit
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase subunit beta
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
      • タンパク質・ペプチド: RNA polymerase II subunit D
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit E
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
      • タンパク質・ペプチド: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a
      • タンパク質・ペプチド: RNA polymerase II subunit K
    • 複合体: DSIF
      • タンパク質・ペプチド: DSS1
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: MANGANESE (II) ION

+
超分子 #1: Pre-termination complex

超分子名称: Pre-termination complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#41
詳細: Integrator-PP2A, RNA Polymerase II, NELF, DSIF, nucleosome
分子量理論値: 1.8 MDa

+
超分子 #2: Integrator-PP2A complex and NELF

超分子名称: Integrator-PP2A complex and NELF / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #22-#36, #38-#41
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #3: Nucleosome

超分子名称: Nucleosome / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #14, #16, #18-#19, #21
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #5: RNA and DNA

超分子名称: RNA and DNA / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #15, #17, #20
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)

+
超分子 #4: DNA-directed RNA Polymerase II

超分子名称: DNA-directed RNA Polymerase II / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#13
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #6: DSIF

超分子名称: DSIF / タイプ: complex / ID: 6 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #37
由来(天然)生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)

+
分子 #1: UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK

分子名称: UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 698.854 Da
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #2: DNA-directed RNA polymerase subunit

分子名称: DNA-directed RNA polymerase subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-directed RNA polymerase
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 217.450078 KDa
配列文字列: MHGGGPPSGD SACPLRTIKR VQFGVLSPDE LKRMSVTEGG IKYPETTEGG RPKLGGLMDP RQGVIERTGR CQTCAGNMTE CPGHFGHIE LAKPVFHVGF LVKTMKVLRC VCFFCSKLLV DSNNPKIKDI LAKSKGQPKK RLTHVYDLCK GKNICEGGEE M DNKFGVEQ ...文字列:
MHGGGPPSGD SACPLRTIKR VQFGVLSPDE LKRMSVTEGG IKYPETTEGG RPKLGGLMDP RQGVIERTGR CQTCAGNMTE CPGHFGHIE LAKPVFHVGF LVKTMKVLRC VCFFCSKLLV DSNNPKIKDI LAKSKGQPKK RLTHVYDLCK GKNICEGGEE M DNKFGVEQ PEGDEDLTKE KGHGGCGRYQ PRIRRSGLEL YAEWKHVNED SQEKKILLSP ERVHEIFKRI SDEECFVLGM EP RYARPEW MIVTVLPVPP LSVRPAVVMQ GSARNQDDLT HKLADIVKIN NQLRRNEQNG AAAHVIAEDV KLLQFHVATM VDN ELPGLP RAMQKSGRPL KSLKQRLKGK EGRVRGNLMG KRVDFSARTV ITPDPNLSID QVGVPRSIAA NMTFAEIVTP FNID RLQEL VRRGNSQYPG AKYIIRDNGD RIDLRFHPKP SDLHLQTGYK VERHMCDGDI VIFNRQPTLH KMSMMGHRVR ILPWS TFRL NLSVTTPYNA DFDGDEMNLH LPQSLETRAE IQELAMVPRM IVTPQSNRPV MGIVQDTLTA VRKFTKRDVF LERGEV MNL LMFLSTWDGK VPQPAILKPR PLWTGKQIFS LIIPGHINCI RTHSTHPDDE DSGPYKHISP GDTKVVVENG ELIMGIL CK KSLGTSAGSL VHISYLEMGH DITRLFYSNI QTVINNWLLI EGHTIGIGDS IADSKTYQDI QNTIKKAKQD VIEVIEKA H NNELEPTPGN TLRQTFENQV NRILNDARDK TGSSAQKSLS EYNNFKSMVV SGAKGSKINI SQVIAVVGQQ NVEGKRIPF GFKHRTLPHF IKDDYGPESR GFVENSYLAG LTPTEFFFHA MGGREGLIDT AVKTAETGYI QRRLIKSMES VMVKYDATVR NSINQVVQL RYGEDGLAGE SVEFQNLATL KPSNKAFEKK FRFDYTNERA LRRTLQEDLV KDVLSNAHIQ NELEREFERM R EDREVLRV IFPTGDSKVV LPCNLLRMIW NAQKIFHINP RLPSDLHPIK VVEGVKELSK KLVIVNGDDP LSRQAQENAT LL FNIHLRS TLCSRRMAEE FRLSGEAFDW LLGEIESKFN QAIAHPGEMV GALAAQSLGE PATQMTLNTF HYAGVSAKNV TLG VPRLKE LINISKKPKT PSLTVFLLGQ SARDAERAKD ILCRLEHTTL RKVTANTAIY YDPNPQSTVV AEDQEWVNVY YEMP DFDVA RISPWLLRVE LDRKHMTDRK LTMEQIAEKI NAGFGDDLNC IFNDDNAEKL VLRIRIMNSD ENKMQEEEEV VDKMD DDVF LRCIESNMLT DMTLQGIEQI SKVYMHLPQT DNKKKIIITE DGEFKALQEW ILETDGVSLM RVLSEKDVDP VRTTSN DIV EIFTVLGIEA VRKALERELY HVISFDGSYV NYRHLALLCD TMTCRGHLMA ITRHGVNRQD TGPLMKCSFE ETVDVLM EA AAHGESDPMK GVSENIMLGQ LAPAGTGCFD LLLDAEKCKY GMEIPTNIPG LGAAGPTGMF FGSAPSPMGG ISPAMTPW N QGATPAYGAW SPSVGSGMTP GAAGFSPSAA SDASGFSPGY SPAWSPTPGS PGSPGPSSPY IPSPGGAMSP SYSPTSPAY EPRSPGGYTP QSPSYSPTSP SYSPTSPSYS PTSPNYSPTS PSYSPTSPSY SPTSPSYSPT SPSYSPTSPS YSPTSPSYSP TSPSYSPTS PSYSPTSPSY SPTSPSYSPT SPSYSPTSPS YSPTSPSYSP TSPSYSPTSP SYSPTSPNYS PTSPNYTPTS P SYSPTSPS YSPTSPNYTP TSPNYSPTSP SYSPTSPSYS PTSPSYSPSS PRYTPQSPTY TPSSPSYSPS SPSYSPTSPK YT PTSPSYS PSSPEYTPTS PKYSPTSPKY SPTSPKYSPT SPTYSPTTPK YSPTSPTYSP TSPVYTPTSP KYSPTSPTYS PTS PKYSPT SPTYSPTSPK GSTYSPTSPG YSPTSPTYSL TSPAISPDDS DEEN

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerase subunit

+
分子 #3: DNA-directed RNA polymerase subunit beta

分子名称: DNA-directed RNA polymerase subunit beta / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-directed RNA polymerase
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 134.041422 KDa
配列文字列: MYDADEDMQY DEDDDEITPD LWQEACWIVI SSYFDEKGLV RQQLDSFDEF IQMSVQRIVE DAPPIDLQAE AQHASGEVEE PPRYLLKFE QIYLSKPTHW ERDGAPSPMM PNEARLRNLT YSAPLYVDIT KTVIKEGEEQ LQTQHQKTFI GKIPIMLRST Y CLLNGLTD ...文字列:
MYDADEDMQY DEDDDEITPD LWQEACWIVI SSYFDEKGLV RQQLDSFDEF IQMSVQRIVE DAPPIDLQAE AQHASGEVEE PPRYLLKFE QIYLSKPTHW ERDGAPSPMM PNEARLRNLT YSAPLYVDIT KTVIKEGEEQ LQTQHQKTFI GKIPIMLRST Y CLLNGLTD RDLCELNECP LDPGGYFIIN GSEKVLIAQE KMATNTVYVF AKKDSKYAYT GECRSCLENS SRPTSTIWVS ML ARGGQGA KKSAIGQRIV ATLPYIKQEV PIIIVFRALG FVSDRDILEH IIYDFEDPEM MEMVKPSLDE AFVIQEQNVA LNF IGSRGA KPGVTKEKRI KYAKEVLQKE MLPHVGVSDF CETKKAYFLG YMVHRLLLAA LGRRELDDRD HYGNKRLDLA GPLL AFLFR GMFKNLLKEV RIYAQKFIDR GKDFNLELAI KTRIISDGLK YSLATGNWGD QKKAHQARAG VSQVLNRLTF ASTLS HLRR LNSPIGRDGK LAKPRQLHNT LWGMVCPAET PEGHAVGLVK NLALMAYISV GSQPSPILEF LEEWSMENLE EISPAA IAD ATKIFVNGCW VGIHKDPEQL MNTLRKLRRQ MDIIVSEVSM IRDIREREIR IYTDAGRICR PLLIVEKQKL LLKKRHI DQ LKEREYNNYS WQDLVASGVV EYIDTLEEET VMLAMTPDDL QEKEVAYCST YTHCEIHPSM ILGVCASIIP FPDHNQSP R NTYQSAMGKQ AMGVYITNFH VRMDTLAHVL YYPQKPLVTT RSMEYLRFRE LPAGINSIVA IASYTGYNQE DSVIMNRSA VDRGFFRSVF YRSYKEQESK KGFDQEEVFE KPTRETCQGM RHAIYDKLDD DGLIAPGVRV SGDDVIIGKT VTLPENEDEL EGTNRRYTK RDCSTFLRTS ETGIVDQVMV TLNQEGYKFC KIRVRSVRIP QIGDKFASRH GQKGTCGIQY RQEDMPFTCE G ITPDIIIN PHAIPSRMTI GHLIECLQGK VSANKGEIGD ATPFNDAVNV QKISNLLSDY GYHLRGNEVL YNGFTGRKIT SQ IFIGPTY YQRLKHMVDD KIHSRARGPI QILNRQPMEG RSRDGGLRFG EMERDCQIAH GAAQFLRERL FEASDPYQVH VCN LCGIMA IANTRTHTYE CRGCRNKTQI SLVRMPYACK LLFQELMSMS IAPRMMSV

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerase subunit beta

+
分子 #4: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 31.439074 KDa
配列文字列: MPYANQPTVR ITELTDENVK FIIENTDLAV ANSIRRVFIA EVPIIAIDWV QIDANSSVLH DEFIAHRLGL IPLTSDDIVD KLQYSRDCT CEEFCPECSV EFTLDVRCNE DQTRHVTSRD LISNSPRVIP VTSRNRDNDP SDYVEQDDIL IVKLRKGQEL R LRAYAKKG ...文字列:
MPYANQPTVR ITELTDENVK FIIENTDLAV ANSIRRVFIA EVPIIAIDWV QIDANSSVLH DEFIAHRLGL IPLTSDDIVD KLQYSRDCT CEEFCPECSV EFTLDVRCNE DQTRHVTSRD LISNSPRVIP VTSRNRDNDP SDYVEQDDIL IVKLRKGQEL R LRAYAKKG FGKEHAKWNP TAGVAFEYDP DNALRHTVYP KPEEWPKSEY SELDEDESQA PYDPNGKPER FYYNVESCGS LR PETIVLS ALSGLKKKLS DLQTQLSHEI QSDVLTIN

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

+
分子 #5: RNA polymerase II subunit D

分子名称: RNA polymerase II subunit D / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 16.331255 KDa
配列文字列:
MAAGGSDPRA GDVEEDASQL IFPKEFETAE TLLNSEVHML LEHRKQQNES AEDEQELSEV FMKTLNYTAR FSRFKNRETI ASVRSLLLQ KKLHKFELAC LANLCPETAE ESKALIPSLE GRFEDEELQQ ILDDIQTKRS FQY

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

+
分子 #6: DNA-directed RNA polymerase II subunit E

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit E / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 24.644318 KDa
配列文字列: MDDEEETYRL WKIRKTIMQL CHDRGYLVTQ DELDQTLEEF KAQFGDKPSE GRPRRTDLTV LVAHNDDPTD QMFVFFPEEP KVGIKTIKV YCQRMQEENI TRALIVVQQG MTPSAKQSLV DMAPKYILEQ FLQQELLINI TEHELVPEHV VMTKEEVTEL L ARYKLREN ...文字列:
MDDEEETYRL WKIRKTIMQL CHDRGYLVTQ DELDQTLEEF KAQFGDKPSE GRPRRTDLTV LVAHNDDPTD QMFVFFPEEP KVGIKTIKV YCQRMQEENI TRALIVVQQG MTPSAKQSLV DMAPKYILEQ FLQQELLINI TEHELVPEHV VMTKEEVTEL L ARYKLREN QLPRIQAGDP VARYFGIKRG QVVKIIRPSE TAGRYITYRL VQ

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

+
分子 #7: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

分子名称: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 14.477001 KDa
配列文字列:
MSDNEDNFDG DDFDDVEEDE GLDDLENAEE EGQENVEILP SGERPQANQK RITTPYMTKY ERARVLGTRA LQIAMCAPVM VELEGETDP LLIAMKELKA RKIPIIIRRY LPDGSYEDWG VDELIISD

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

+
分子 #8: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 19.314283 KDa
配列文字列:
MFYHISLEHE ILLHPRYFGP NLLNTVKQKL FTEVEGTCTG KYGFVIAVTT IDNIGAGVIQ PGRGFVLYPV KYKAIVFRPF KGEVVDAVV TQVNKVGLFT EIGPMSCFIS RHSIPSEMEF DPNSNPPCYK TMDEDIVIQQ DDEIRLKIVG TRVDKNDIFA I GSLMDDYL GLVS

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerase subunit

+
分子 #9: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

分子名称: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 17.162273 KDa
配列文字列:
MAGILFEDIF DVKDIDPEGK KFDRVSRLHC ESESFKMDLI LDVNIQIYPV DLGDKFRLVI ASTLYEDGTL DDGEYNPTDD RPSRADQFE YVMYGKVYRI EGDETSTEAA TRLSAYVSYG GLLMRLQGDA NNLHGFEVDS RVYLLMKKLA F

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

+
分子 #10: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 14.541221 KDa
配列文字列:
MEPDGTYEPG FVGIRFCQEC NNMLYPKEDK ENRILLYACR NCDYQQEADN SCIYVNKITH EVDELTQIIA DVSQDPTLPR TEDHPCQKC GHKEAVFFQS HSARAEDAMR LYYVCTAPHC GHRWTE

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

+
分子 #11: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

分子名称: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 7.655123 KDa
配列文字列:
MIIPVRCFTC GKIVGNKWEA YLGLLQAEYT EGDALDALGL KRYCCRRMLL AHVDLIEKLL NYAPLEK

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

+
分子 #12: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a

分子名称: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 13.310284 KDa
配列文字列:
MNAPPAFESF LLFEGEKKIT INKDTKVPNA CLFTINKEDH TLGNIIKSQL LKDPQVLFAG YKVPHPLEHK IIIRVQTTPD YSPQEAFTN AITDLISELS LLEERFRVAI KDKQEGIE

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a

+
分子 #13: RNA polymerase II subunit K

分子名称: RNA polymerase II subunit K / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 7.018244 KDa
配列文字列:
MDTQKDVQPP KQQPMIYICG ECHTENEIKS RDPIRCRECG YRIMYKKRTK RLVVFDAR

UniProtKB: DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4

+
分子 #14: Histone H3.3C

分子名称: Histone H3.3C / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.350021 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MARTKQTARK STGGKAPRKQ LATKAARKST PSTCGVKPHR YRPGTVALRE IRRYQKSTEL LIRKLPFQRL VREIAQDFKT DLRFQSSAV MALQEASEAY LVGLLEDTNL CAIHAKRVTI MPKDIQLARR IRGERA

UniProtKB: Histone H3.3C

+
分子 #16: Histone H4

分子名称: Histone H4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 11.394426 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MSGRGKGGKG LGKGGAKRHR KVLRDNIQGI TKPAIRRLAR RGGVKRISGL IYEETRGVLK VFLENVIRDA VTYTEHAKRK TVTAMDVVY ALKRQGRTLY GFGG

UniProtKB: Histone H4

+
分子 #18: Histone H2A type 1

分子名称: Histone H2A type 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18
詳細: MSGRGKQGGKARAKAKSRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGKVTIAQGGVLPNIQAVLLPKKTESHHKAKGK
コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 14.093484 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MSGRGKQGGK ARAKAKSRSS RAGLQFPVGR VHRLLRKGNY AERVGAGAPV YLAAVLEYLT AEILELAGNA ARDNKKTRII PRHLQLAVR NDEELNKLLG KVTIAQGGVL PNIQAVLLPK KTESHHKAKG K

UniProtKB: Histone H2A type 1

+
分子 #19: Histone H2B type 1-J

分子名称: Histone H2B type 1-J / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 13.981267 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MPEPSKSAPA PKKGSKKAIT KAQKKDGKKR KRSRKESYSI YVYKVLKQVH PDTGISSKAM GIMNSFVNDI FERIAGEASR LAHYNKRST ITSREIQTAV RLLLPGELAK HAVSEGTKAV TKYTSSK

UniProtKB: Histone H2B type 1-J

+
分子 #21: Transcription elongation factor SPT5

分子名称: Transcription elongation factor SPT5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 121.145477 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: MSDSEDSNFS EEEDSERSSD GEEAEVDEER RSAAGSEKEE EPEDEEEEEE EEEYDEEEEE EDDDRPPKKP RHGGFILDEA DVDDEYEDE DQWEDGAEDI LEKEEIEASN IDNVVLDEDR SGARRLQNLW RDQREEELGE YYMKKYAKSS VGETVYGGSD E LSDDITQQ ...文字列:
MSDSEDSNFS EEEDSERSSD GEEAEVDEER RSAAGSEKEE EPEDEEEEEE EEEYDEEEEE EDDDRPPKKP RHGGFILDEA DVDDEYEDE DQWEDGAEDI LEKEEIEASN IDNVVLDEDR SGARRLQNLW RDQREEELGE YYMKKYAKSS VGETVYGGSD E LSDDITQQ QLLPGVKDPN LWTVKCKIGE ERATAISLMR KFIAYQFTDT PLQIKSVVAP EHVKGYIYVE AYKQTHVKQA IE GVGNLRL GYWNQQMVPI KEMTDVLKVV KEVANLKPKS WVRLKRGIYK DDIAQVDYVE PSQNTISLKM IPRIDYDRIK ARM SLKDWF AKRKKFKRPP QRLFDAEKIR SLGGDVASDG DFLIFEGNRY SRKGFLFKSF AMSAVITEGV KPTLSELEKF EDQP EGIDL EVVTESTGKE REHNFQPGDN VEVCEGELIN LQGKILSVDG NKITIMPKHE DLKDMLEFPA QELRKYFKMG DHVKV IAGR FEGDTGLIVR VEENFVILFS DLTMHELKVL PRDLQLCSET ASGVDVGGQH EWGELVQLDP QTVGVIVRLE RETFQV LNM YGKVVTVRHQ AVTRKKDNRF AVALDSEQNN IHVKDIVKVI DGPHSGREGE IRHLFRSFAF LHCKKLVENG GMFVCKT RH LVLAGGSKPR DVTNFTVGGF APMSPRISSP MHPSAGGQRG GFGSPGGGSG GMSRGRGRRD NELIGQTVRI SQGPYKGY I GVVKDATEST ARVELHSTCQ TISVDRQRLT TVGSRRPGGM TSTYGRTPMY GSQTPMYGSG SRTPMYGSQT PLQDGSRTP HYGSQTPLHD GSRTPAQSGA WDPNNPNTPS RAEEEYEYAF DDEPTPSPQA YGGTPNPQTP GYPDPSSPQV NPQYNPQTPG TPAMYNTDQ FSPYAAPSPQ GSYQPSPSPQ SYHQVAPSPA GYQNTHSPAS YHPTPSPMAY QASPSPSPVG YSPMTPGAPS P GGYNPHTP GSGIEQNSSD WVTTDIQVKV RDTYLDTQVV GQTGVIRSVT GGMCSVYLKD SEKVVSISSE HLEPITPTKN NK VKVILGE DREATGVLLS IDGEDGIVRM DLDEQLKILN LRFLGKLLEA

UniProtKB: Transcription elongation factor SPT5

+
分子 #22: Integrator complex subunit 1

分子名称: Integrator complex subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 244.776078 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNMNRAKPTT VRRPSAAAKP SGHPPPGDFI ALGSKGQANE SKTASTLLKP APSGLPSERK RDAAAALSSA SALTGLTKRP KLSSTPPLS ALGRLAEAAV AEKRAISPSI KEPSVVPIEV LPTVLLDEIE AAELEGNDDR IEGVLCGAVK QLKVTRAKPD S TLYLSLMY ...文字列:
SNMNRAKPTT VRRPSAAAKP SGHPPPGDFI ALGSKGQANE SKTASTLLKP APSGLPSERK RDAAAALSSA SALTGLTKRP KLSSTPPLS ALGRLAEAAV AEKRAISPSI KEPSVVPIEV LPTVLLDEIE AAELEGNDDR IEGVLCGAVK QLKVTRAKPD S TLYLSLMY LAKIKPNIFA TEGVIEALCS LLRRDASINF KAKGNSLVSV LACNLLMAAY EEDENWPEIF VKVYIEDSLG ER IWVDSPH CKTFVDNIQT AFNTRMPPRS VLLQGEAGRV AGDLGAGSSP HPSLTEEEDS QTELLIAEEK LSPEQEGQLM PRY EELAES VEEYVLDMLR DQLNRRQPID NVSRNLLRLL TSTCGYKEVR LLAVQKLEMW LQNPKLTRPA QDLLMSVCMN CNTH GSEDM DVISHLIKIR LKPKVLLNHF MLCIRELLSA HKDNLGTTIK LVIFNELSSA RNPNNMQVLY TALQHSSELA PKFLA MVFQ DLLTNKDDYL RASRALLREI IKQTKHEINF QAFCLGLMQE RKEPQYLEME FKERFVVHIT DVLAVSMMLG ITAQVK EAG IAWDKGEKRN LEVLRSFQNQ IAAIQRDAVW WLHTVVPSIS KLAPKDYVHC LHKVLFTEQP ETYYKWDNWP PESDRNF FL RLCSEVPILE DTLMRILVIG LSRELPLGPA DAMELADHLV KRAAAVQADD VEVLKVGRTQ LIDAVLNLCT YHHPENIQ L PPGYQPPNLA ISTLYWKAWP LLLVVAAFNP ENIGLAAWEE YPTLKMLMEM VMTNNYSYPP CTLTDEETRT EMLNRELQT AQREKQEILA FEGHLAAAST KQTITESSSL LLSQLTSLDP QGPPRRPPPH ILDQVKSLNQ SLRLGHLLCR SRNPDFLLHI IQRQASSQS MPWLADLVQS SEGSLDVLPV QCLCEFLLHD AVDDAASGEE DDEGESKEQK AKKRQRQQKQ RQLLGRLQDL L LGPKADEQ TTCEVLDYFL RRLGSSQVAS RVLAMKGLSL VLSEGSLRDG EEKEPPMEED VGDTDVLQGY QWLLRDLPRL PL FDSVRST TALALQQAIH METDPQTISA YLIYLSQHTP VEEQAQHSDL ALDVARLVVE RSTIMSHLFS KLSPSAASDA VLS ALLSIF SRYVRRMRQS KEGEEVYSWS ESQDQVFLRW SSGETATMHI LVVHAMVILL TLGPPRADDS EFQALLDIWF PEEK PLPTA FLVDTSEEAL LLPDWLKLRM IRSEVLRLVD AALQDLEPQQ LLLFVQSFGI PVSSMSKLLQ FLDQAVAHDP QTLEQ NIMD KNYMAHLVEV QHERGASGGQ TFHSLLTASL PPRRDSTEAP KPKSSPEQPI GQGRIRVGTQ LRVLGPEDDL AGMFLQ IFP LSPDPRWQSS SPRPVALALQ QALGQELARV VQGSPEVPGI TVRVLQALAT LLSSPHGGAL VMSMHRSHFL ACPLLRQ LC QYQRCVPQDT GFSSLFLKVL LQMLQWLDSP GVEGGPLRAQ LRMLASQASA GRRLSDVRGG LLRLAEALAF RQDLEVVS S TVRAVIATLR SGEQCSVEPD LISKVLQGLI EVRSPHLEEL LTAFFSATAD AASPFPACKP VVVVSSLLLQ EEEPLAGGK PGADGGSLEA VRLGPSSGLL VDWLEMLDPE VVSSCPDLQL RLLFSRRKGK GQAQVPSFRP YLLTLFTHQS SWPTLHQCIR VLLGKSREQ RFDPSASLDF LWACIHVPRI WQGRDQRTPQ KRREELVLRV QGPELISLVE LILAEAETRS QDGDTAACSL I QARLPLLL SCCCGDDESV RKVTEHLSGC IQQWGDSVLG RRCRDLLLQL YLQRPELRVP VPEVLLHSEG AASSSVCKLD GL IHRFITL LADTSDSRAL ENRGADASMA CRKLAVAHPL LLLRHLPMIA ALLHGRTHLN FQEFRQQNHL SCFLHVLGLL ELL QPHVFR SEHQGALWDC LLSFIRLLLN YRKSSRHLAA FINKFVQFIH KYITYNAPAA ISFLQKHADP LHDLSFDNSD LVML KSLLA GLSLPSRDDR TDRGLDEEGE EESSAGSLPL VSVSLFTPLT AAEMAPYMKR LSRGQTVEDL LEVLSDIDEM SRRRP EILS FFSTNLQRLM SSAEECCRNL AFSLALRSMQ NSPSIAAAFL PTFMYCLGSQ DFEVVQTALR NLPEYALLCQ EHAAVL LHR AFLVGMYGQM DPSAQISEAL RILHMEAVM

UniProtKB: Integrator complex subunit 1

+
分子 #23: Integrator complex subunit 2

分子名称: Integrator complex subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 134.451625 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MKDQQTVIMT ECTSLQFVSP FAFEAMQKVD VVCLASLSDP ELRLLLPCLV RMALCAPADQ SQSWAQDKKL ILRLLSGVEA VNSIVALLS VDFHALEQDA SKEQQLRHKL GGGSGESILV SQLQHGLTLE FEHSDSPRRL RLVLSELLAI MNKVSESNGE F FFKSSELF ...文字列:
MKDQQTVIMT ECTSLQFVSP FAFEAMQKVD VVCLASLSDP ELRLLLPCLV RMALCAPADQ SQSWAQDKKL ILRLLSGVEA VNSIVALLS VDFHALEQDA SKEQQLRHKL GGGSGESILV SQLQHGLTLE FEHSDSPRRL RLVLSELLAI MNKVSESNGE F FFKSSELF ESPVYLEEAA DVLCILQAEL PSLLPIVDVA EALLHVRNGA WFLCLLVANV PDSFNEVCRG LIKNGERQDE ES LGGRRRT DALRFLCKMN PSQALKVRGM VVEECHLPGL GVALTLDHTK NEACEDGVSD LVCFVSGLLL GTNAKVRTWF GTF IRNGQQ RKRETSSSVL WQMRRQLLLE LMGILPTVRS TRIVEEADVD MEPNVSVYSG LKEEHVVKAS ALLRLYCALM GIAG LKPTE EEAEQLLQLM TSRPPATPAG VRFVSLSFCM LLAFSTLVST PEQEQLMVVW LSWMIKEEAY FESTSGVSAS FGEML LLVA MYFHSNQLSA IIDLVCSTLG MKIVIKPSSL SRMKTIFTQE IFTEQVVTAH AVRVPVTSNL SANITGFLPI HCIYQL LRS RSFTKHKVSI KDWIYRQLCE TSTPLHPQLL PLIDVYINSI LTPASKSNPE ATNQPVTEQE ILNIFQGVIG GDNIRLN QR FSITAQLLVL YYILSYEEAL LANTKTLAAM QRKPKSYSSS LMDQIPIKFL IRQAQGLQQE LGGLHSALLR LLATNYPH L CIVDDWICEE EITGTDALLR RMLLTNNAKN HSPKQLQEAF SAVPVNNTQV MQIIEHLTLL SASELIPYAE VLTSNMSQL LNSGVPRRIL QTVNKLWMVL NTVMPRRLWV MTVNALQPSI KFVRQQKYTQ NDLMIDPLIV LRCDQRVHRC PPLMDITLHM LNGYLLASK AYLSAHLKET EQDRPSQNNT IGLVGQTDAP EVTREELKNA LLAAQDSAAV QILLEICLPT EEEKANGVNP D SLLRNVQS VITTSAPNKG MEEGEDNLLC NLREVQCLIC CLLHQMYIAD PNIAKLVHFQ GYPCELLPLT VAGIPSMHIC LD FIPELIA QPELEKQIFA IQLLSHLCIQ YALPKSLSVA RLAVNVMGTL LTVLTQAKRY AFFMPTLPSL VSFCRAFPPL YED IMSLLI QIGQVCASDV ATQTRDIDPI ITRLQQIKEK PSGWSQICKD SSYKNGSRDT GSMDPDVQLC HCIERTVIEI INMS VSGI

UniProtKB: Integrator complex subunit 2

+
分子 #24: Integrator complex subunit 4

分子名称: Integrator complex subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 108.306758 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MAAHLKKRVY EEFTKVVQPQ EEIATKKLRL TKPSKSAALH IDLCKATSPA DALQYLLQFA RKPVEAESVE GVVRILLEHY YKENDPSVR LKIASLLGLL SKTAGFSPDC IMDDAINILQ NEKSHQVLAQ LLDTLLAIGT KLPENQAIQM RLVDVACKHL T DTSHGVRN ...文字列:
MAAHLKKRVY EEFTKVVQPQ EEIATKKLRL TKPSKSAALH IDLCKATSPA DALQYLLQFA RKPVEAESVE GVVRILLEHY YKENDPSVR LKIASLLGLL SKTAGFSPDC IMDDAINILQ NEKSHQVLAQ LLDTLLAIGT KLPENQAIQM RLVDVACKHL T DTSHGVRN KCLQLLGNLG SLEKSVTKDA EGLAARDVQK IIGDYFSDQD PRVRTAAIKA MLQLHERGLK LHQTIYNQAC KL LSDDYEQ VRSAAVQLIW VVSQLYPESI VPIPSSNEEI RLVDDAFGKI CHMVSDGSWV VRVQAAKLLG SMEQVSSHFL EQT LDKKLM SDLRRKRTAH ERAKELYSSG EFSSGRKWGD DAPKEEVDTG AVNLIESGAC GAFVHGLEDE MYEVRIAAVE ALCM LAQSS PSFAEKCLDF LVDMFNDEIE EVRLQSIHTM RKISNNITLR EDQLDTVLAV LEDSSRDIRE ALHELLCCTN VSTKE GIHL ALVELLKNLT KYPTDRDSIW KCLKFLGSRH PTLVLPLVPE LLSTHPFFDT AEPDMDDPAY IAVLVLIFNA AKTCPT MPA LFSDHTFRHY AYLRDSLSHL VPALRLPGRK LVSSAVSPSI IPQEDPSQQF LQQSLERVYS LQHLDPQGAQ ELLEFTI RD LQRLGELQSE LAGVADFSAT YLRCQLLLIK ALQEKLWNVA APLYLKQSDL ASAAAKQIME ETYKMEFMYS GVENKQVV I IHHMRLQAKA LQLIVTARTT RGLDPLFGMC EKFLQEVDFF QRYFIADLPH LQDSFVDKLL DLMPRLMTSK PAEVVKILQ TMLRQSAFLH LPLPEQIHKA SATIIEPAGE SDNPLRFTSG LVVALDVDAT LEHVQDPQNT VKVQVLYPDG QAQMIHPKPA DFRNPGPGR HRLITQVYLS HTAWTEACQV EVRLLLAYNS SARIPKCPWM EGGEMSPQVE TSIEGTIPFS KPVKVYIMPK P ARR

UniProtKB: Integrator complex subunit 4

+
分子 #25: Integrator complex subunit 5

分子名称: Integrator complex subunit 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 108.316422 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNMSALCDPP GAPGPPGPAP ATHGPAPLSA QELSQEIKAF LTGVDPILGH QLSAREHARC GLLLLRSLPP ARAAVLDHLR GVFDESVRA HLAALDETPV AGPPHLRPPP PSHVPAGGPG LEDVVQEVQQ VLSEFIRANP KAWAPVISAW SIDLMGQLSS T YSGQHQRV ...文字列:
SNMSALCDPP GAPGPPGPAP ATHGPAPLSA QELSQEIKAF LTGVDPILGH QLSAREHARC GLLLLRSLPP ARAAVLDHLR GVFDESVRA HLAALDETPV AGPPHLRPPP PSHVPAGGPG LEDVVQEVQQ VLSEFIRANP KAWAPVISAW SIDLMGQLSS T YSGQHQRV PHATGALNEL LQLWMGCRAT RTLMDIYVQC LSALIGSCPD ACVDALLDTS VQHSPHFDWV VAHIGSSFPG TI ISRVLSC GLKDFCVHGG AGGGAGSSGG SSSQTPSTDP FPGSPAIPAE KRVPKIASVV GILGHLASRH GDSIRRELLR MFH DSLAGG SGGRSGDPSL QATVPFLLQL AVMSPALLGT VSGELVDCLK PPAVLSQLQQ HLQGFPREEL DNMLNLAVHL VSQA SGAGA YRLLQFLVDT AMPASVITTQ GLAVPDTVRE ACDRLIQLLL LHLQKLVHHR GGSPGEGVLG PPPPPRLVPF LDALK NHVG ELCGETLRLE RKRFLWQHQL LGLLSVYTRP SCGPEALGHL LSRARSPEEL SLATQLYAGL VVSLSGLLPL AFRSCL ARV HAGTLQPPFT ARFLRNLALL VGWEQQGGEG PAALGAHFGE SASAHLSDLA PLLLHPEEEV AEAAASLLAI CPFPSEA LS PSQLLGLVRA GVHRFFASLR LHGPPGVASA CQLLTRLSQT SPAGLKAVLQ LLVEGALHRG NTELFGGQVD GDNETLSV V SASLASASLL DTNRRHTAAV PGPGGIWSVF HAGVIGRGLK PPKFVQSRNQ QEVIYNTQSL LSLLVHCCSA PGGTECGEC WGAPILSPEA AKAVAVTLVE SVCPDAAGAE LAWPPEEHAR ATVERDLRIG RRFREQPLLF ELLKLVAAAP PALCYCSVLL RGLLAALLG HWEASRHPDT THSPWHLEAS CTLVAVMAEG SLLPPALGNM HEVFSQLAPF EVRLLLLSVW GFLREHGPLP Q KFIFQSER GRFIRDFSRE GGGEGGPHLA VLHSVLHRNI DRLGLFSGRF QAPSPSTLLR QGT

UniProtKB: Integrator complex subunit 5

+
分子 #26: Integrator complex subunit 6

分子名称: Integrator complex subunit 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 100.72825 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNMPILLFLI DTSASMNQRS HLGTTYLDTA KGAVETFMKL RARDPASRGD RYMLVTFEEP PYAIKAGWKE NHATFMNELK NLQAEGLTT LGQSLRTAFD LLNLNRLVTG IDNYGQGRNP FFLEPAIIIT ITDGSKLTTT SGVQDELHLP LNSPLPGSEL T KEPFRWDQ ...文字列:
SNMPILLFLI DTSASMNQRS HLGTTYLDTA KGAVETFMKL RARDPASRGD RYMLVTFEEP PYAIKAGWKE NHATFMNELK NLQAEGLTT LGQSLRTAFD LLNLNRLVTG IDNYGQGRNP FFLEPAIIIT ITDGSKLTTT SGVQDELHLP LNSPLPGSEL T KEPFRWDQ RLFALVLRLP GTMSVESEQL TGVPLDDSAI TPMCEVTGGR SYSVCSPRML NQCLESLVQK VQSGVVINFE KA GPDPSPV EDGQPDISRP FGSQPWHSCH KLIYVRPNPK TGVPIGHWPV PESFWPDQNS PTLPPRTSHP VVKFSCTDCE PMV IDKLPF DKYELEPSPL TQFILERKSP QTCWQVYVSN SAKYSELGHP FGYLKASTAL NCVNLFVMPY NYPVLLPLLD DLFK VHKAK PTLKWRQSFE SYLKTMPPYY LGPLKKAVRM MGAPNLIADS MEYGLSYSVI SYLKKLSQQA KIESDRVIGS VGKKV VQET GIKVRSRSHG LSMAYRKDFQ QLLQGISEDV PHRLLDLNMK EYTGFQVALL NKDLKPQTFR NAYDIPRRNL LDHLTR MRS NLLKSTRRFL KGQDEDQVHS VPIAQMGNYQ EYLKQVPSPL RELDPDQPRR LHTFGNPFKL DKKGMMIDEA DEFVAGP QN KHKRPGEPNM QGIPKRRRCM SPLLRGRQQN PVVNNHIGGK GPPAPTTQAQ PDLIKPLPLH KISETTNDSI IHDVVENH V ADQLSSDITP NAMDTEFSAS SPASLLERPT NHMEALGHDH LGTNDLTVGG FLENHEEPRD KEQCAEENIP ASSLNKGKK LMHCRSHEEV NTELKAQIMK EIRKPGRKYE RIFTLLKHVQ GSLQTRLIFL QNVIKEASRF KKRMLIEQLE NFLDEIHRRA NQINHINSN

UniProtKB: Integrator complex subunit 6

+
分子 #27: Integrator complex subunit 7

分子名称: Integrator complex subunit 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 107.153805 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNMASNSTKS FLADAGYGEQ ELDANSALME LDKGLRSGKL GEQCEAVVRF PRLFQKYPFP ILINSAFLKL ADVFRVGNNF LRLCVLKVT QQSEKHLEKI LNVDEFVKRI FSVIHSNDPV ARAITLRMLG SLASIIPERK NAHHSIRQSL DSHDNVEVEA A VFAAANFS ...文字列:
SNMASNSTKS FLADAGYGEQ ELDANSALME LDKGLRSGKL GEQCEAVVRF PRLFQKYPFP ILINSAFLKL ADVFRVGNNF LRLCVLKVT QQSEKHLEKI LNVDEFVKRI FSVIHSNDPV ARAITLRMLG SLASIIPERK NAHHSIRQSL DSHDNVEVEA A VFAAANFS AQSKDFAVGI CNKISEMIQG LATPVDLKLK LIPILQHMHH DAILASSARQ LLQQLVTSYP STKMVIVSLH TF TLLAASS LVDTPKQIQL LLQYLKNDPR KAVKRLAIQD LKLLANKTPH TWSRENIQAL CECALQTPYD SLKLGMLSVL STL SGTIAI KHYFSIVPGN VSSSPRSSDL VKLAQECCYH NNRGIAAHGV RVLTNITVSC QEKDLLALEQ DAVFGLESLL VLCS QDDSP GAQATLKIAL NCMVKLAKGR PHLSQSVVET LLTQLHSAQD AARILMCHCL AAIAMQLPVL GDGMLGDLME LYKVI GRSA TDKQQELLVS LATVIFVASQ KALSVESKAV IKQQLESVSN GWTVYRIARQ ASRMGNHDMA KELYQSLLTQ VASEHF YFW LNSLKEFSHA EQCLTGLQEE NYSSALSCIA ESLKFYHKGI ASLTAASTPL NPLSFQCEFV KLRIDLLQAF SQLICTC NS LKTSPPPAIA TTIAMTLGND LQRCGRISNQ MKQSMEEFRS LASRYGDLYQ ASFDADSATL RNVELQQQSC LLISHAIE A LILDPESASF QEYGSTGTAH ADSEYERRMM SVYNHVLEEV ESLNRKYTPV SYMHTACLCN AIIALLKVPL SFQRYFFQK LQSTSIKLAL SPSPRNPAEP IAVQNNQQLA LKVEGVVQHG SKPGLFRKIQ SVCLNVSSTL QSKSGQDYKI PIDNMTNEME QRVEPHNDY FSTQFLLNFA ILGTHNITVE SSVKDANGIV WKTGPRTTIF VKSLEDPYSQ QIRLQQQQAQ QPLQQQQQRN A YTRF

UniProtKB: Integrator complex subunit 7

+
分子 #28: Integrator complex subunit 8

分子名称: Integrator complex subunit 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 113.219859 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MSAEAADREA ATSSRPCTPP QTCWFEFLLE ESLLEKHLRK PCPDPAPVQL IVQFLEQASK PSVNEQNQVQ PPPDNKRNRI LKLLALKVA AHLKWDLDIL EKSLSVPVLN MLLNELLCIS KVPPGTKHVD MDLATLPPTT AMAVLLYNRW AIRTIVQSSF P VKQAKPGP ...文字列:
MSAEAADREA ATSSRPCTPP QTCWFEFLLE ESLLEKHLRK PCPDPAPVQL IVQFLEQASK PSVNEQNQVQ PPPDNKRNRI LKLLALKVA AHLKWDLDIL EKSLSVPVLN MLLNELLCIS KVPPGTKHVD MDLATLPPTT AMAVLLYNRW AIRTIVQSSF P VKQAKPGP PQLSVMNQMQ QEKELTENIL KVLKEQAADS ILVLEAALKL NKDLYVHTMR TLDLLAMEPG MVNGETESST AG LKVKTEE MQCQVCYDLG AAYFQQGSTN SAVYENAREK FFRTKELIAE IGSLSLHCTI DEKRLAGYCQ ACDVLVPSSD STS QQLTPY SQVHICLRSG NYQEVIQIFI EDNLTLSLPV QFRQSVLREL FKKAQQGNEA LDEICFKVCA CNTVRDILEG RTIS VQFNQ LFLRPNKEKI DFLLEVCSRS VNLEKASESL KGNMAAFLKN VCLGLEDLQY VFMISSHELF ITLLKDEERK LLVDQ MRKR SPRVNLCIKP VTSFYDIPAS ASVNIGQLEH QLILSVDPWR IRQILIELHG MTSERQFWTV SNKWEVPSVY SGVILG IKD NLTRDLVYIL MAKGLHCSTV KDFSHAKQLF AACLELVTEF SPKLRQVMLN EMLLLDIHTH EAGTGQAGER PPSDLIS RV RGYLEMRLPD IPLRQVIAEE CVAFMLNWRE NEYLTLQVPA FLLQSNPYVK LGQLLAATCK ELPGPKESRR TAKDLWEV V VQICSVSSQH KRGNDGRVSL IKQRESTLGI MYRSELLSFI KKLREPLVLT IILSLFVKLH NVREDIVNDI TAEHISIWP SSIPNLQSVD FEAVAITVKE LVRYTLSINP NNHSWLIIQA DIYFATNQYS AALHYYLQAG AVCSDFFNKA VPPDVYTDQV IKRMIKCCS LLNCHTQVAI LCQFLREIDY KTAFKSLQEQ NSHDAMDSYY DYIWDVTILE YLTYLHHKRG ETDKRQIAIK A IGQTELNA SNPEEVLQLA AQRRKKKFLQ AMAKLYF

UniProtKB: Integrator complex subunit 8

+
分子 #29: Integrator complex subunit 9

分子名称: Integrator complex subunit 9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 73.891219 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MKLYCLSGHP TLPCNVLKFK STTIMLDCGL DMTSTLNFLP LPLVQSPRLS NLPGWSLKDG NAFLDKELKE CSGHVFVDSV PEFCLPETE LIDLSTVDVI LISNYHCMMA LPYITEHTGF TGTVYATEPT VQIGRLLMEE LVNFIERVPK AQSASLWKNK D IQRLLPSP ...文字列:
MKLYCLSGHP TLPCNVLKFK STTIMLDCGL DMTSTLNFLP LPLVQSPRLS NLPGWSLKDG NAFLDKELKE CSGHVFVDSV PEFCLPETE LIDLSTVDVI LISNYHCMMA LPYITEHTGF TGTVYATEPT VQIGRLLMEE LVNFIERVPK AQSASLWKNK D IQRLLPSP LKDAVEVSTW RRCYTMQEVN SALSKIQLVG YSQKIELFGA VQVTPLSSGY ALGSSNWIIQ SHYEKVSYVS GS SLLTTHP QPMDQASLKN SDVLVLTGLT QIPTANPDGM VGEFCSNLAL TVRNGGNVLV PCYPSGVIYD LLECLYQYID SAG LSSVPL YFISPVANSS LEFSQIFAEW LCHNKQSKVY LPEPPFPHAE LIQTNKLKHY PSIHGDFSND FRQPCVVFTG HPSL RFGDV VHFMELWGKS SLNTVIFTEP DFSYLEALAP YQPLAMKCIY CPIDTRLNFI QVSKLLKEVQ PLHVVCPEQY TQPPP AQSH RMDLMIDCQP PAMSYRRAEV LALPFKRRYE KIEIMPELAD SLVPMEIKPG ISLATVSAVL HTKDNKHLLQ PPPRPA QPT SGKKRKRVSD DVPDCKVLKP LLSGSIPVEQ FVQTLEKHGF SDIKVEDTAK GHIVLLQEAE TLIQIEEDST HIICDND EM LRVRLRDLVL KFLQKF

UniProtKB: Integrator complex subunit 9

+
分子 #30: Integrator complex subunit 10

分子名称: Integrator complex subunit 10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 82.339867 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
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MSAQGDCEFL VQRARELVPQ DLWAAKAWLI TARSLYPADF NIQYEMYTIE RNAERTATAG RLLYDMFVNF PDQPVVWREI SIITSALRN DSQDKQTQFL RSLFETLPGR VQCEMLLKVT EQCFNTLERS EMLLLLLRRF PETVVQHGVG LGEALLEAET I EEQESPVN CFRKLFVCDV LPLIINNHDV RLPANLLYKY LNKAAEFYIN YVTRSTQIEN QHQGAQDTSD LMSPSKRSSQ KY IIEGLTE KSSQIVDPWE RLFKILNVVG MRCEWQMDKG RRSYGDILHR MKDLCRYMNN FDSEAHAKYK NQVVYSTMLV FFK NAFQYV NSIQPSLFQG PNAPSQVPLV LLEDVSNVYG DVEIDRNKHI HKKRKLAEGR EKTMSSDDED CSAKGRNRHI VVNK AELAN STEVLESFKL ARESWELLYS LEFLDKEFTR ICLAWKTDTW LWLRIFLTDM IIYQGQYKKA IASLHHLAAL QGSIS QPQI TGQGTLEHQR ALIQLATCHF ALGEYRMTCE KVLDLMCYMV LPIQDGGKSQ EEPSKVKPKF RKGSDLKLLP CTSKAI MPY CLHLMLACFK LRAFTDNRDD MALGHVIVLL QQEWPRGENL FLKAVNKICQ QGNFQYENFF NYVTNIDMLE EFAYLRT QE GGKIHLELLP NQGMLIKHHT VTRGITKGVK EDFRLAMERQ VSRCGENLMV VLHRFCINEK ILLLQTLT

UniProtKB: Integrator complex subunit 10

+
分子 #31: Integrator complex subunit 11

分子名称: Integrator complex subunit 11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 67.95675 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
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SNMPEIRVTP LGAGQDVGRS CILVSIAGKN VMLDCGMHMG FNDDRRFPDF SYITQNGRLT DFLDCVIISH FHLDHCGALP YFSEMVGYD GPIYMTHPTQ AICPILLEDY RKIAVDKKGE ANFFTSQMIK DCMKKVVAVH LHQTVQVDDE LEIKAYYAGH V LGAAMFQI KVGSESVVYT GDYNMTPDRH LGAAWIDKCR PNLLITQSTY ATTIRDSKRC RERDFLKKVH ETVERGGKVL IP VFALGRA QELCILLETF WERMNLKVPI YFSTGLTEKA NHYYKLFIPW TNQKIRKTFV QRNMFEFKHI KAFDRAFADN PGP MVVFAT PGMLHAGQSL QIFRKWAGNE KNMVIMPGYC VQGTVGHKIL SGQRKLEMEG RQVLEVKMQV EYMSFSAHAD AKGI MQLVG QAEPESVLLV HGEAKKMEFL KQKIEQELRV NCYMPANGET VTLPTSPSIP VGISLGLLKR EMAQGLLPEA KKPRL LHGT LIMKDSNFRL VSSEQALKEL GLAEHQLRFT CRVHLHDTRK EQETALRVYS HLKSVLKDHC VQHLPDGSVT VESVLL QAA APSEDPGTKV LLVSWTYQDE ELGSFLTSLL KKGLPQAPS

UniProtKB: Integrator complex subunit 11

+
分子 #32: Integrator complex subunit 13

分子名称: Integrator complex subunit 13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 80.34518 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MKIFSESHKT VFVVDHCPYM AESCRQHVEF DMLVKNRTQG IIPLAPISKS LWTCSVESSM EYCRIMYDIF PFKKLVNFIV SDSGAHVLN SWTQEDQNLQ ELMAALAAVG PPNPRADPEC CSILHGLVAA VETLCKITEY QHEARTLLME NAERVGNRGR I ICITNAKS ...文字列:
MKIFSESHKT VFVVDHCPYM AESCRQHVEF DMLVKNRTQG IIPLAPISKS LWTCSVESSM EYCRIMYDIF PFKKLVNFIV SDSGAHVLN SWTQEDQNLQ ELMAALAAVG PPNPRADPEC CSILHGLVAA VETLCKITEY QHEARTLLME NAERVGNRGR I ICITNAKS DSHVRMLEDC VQETIHEHNK LAANSDHLMQ IQKCELVLIH TYPVGEDSLV SDRSKKELSP VLTSEVHSVR AG RHLATKL NILVQQHFDL ASTTITNIPM KEEQHANTSA NYDVELLHHK DAHVDFLKSG DSHLGGGSRE GSFKETITLK WCT PRTNNI ELHYCTGAYR ISPVDVNSRP SSCLTNFLLN GRSVLLEQPR KSGSKVISHM LSSHGGEIFL HVLSSSRSIL EDPP SISEG CGGRVTDYRI TDFGEFMREN RLTPFLDPRY KIDGSLEVPL ERAKDQLEKH TRYWPMIISQ TTIFNMQAVV PLASV IVKE SLTEEDVLNC QKTIYNLVDM ERKNDPLPIS TVGTRGKGPK RDEQYRIMWN ELETLVRAHI NNSEKHQRVL ECLMAC RSK PPEEEERKKR GRKREDKEDK SEKAVKDYEQ EKSWQDSERL KGILERGKEE LAEAEIIKDS PDSPEPPNKK PLVEMDE TP QVEKSKGPVS LLSLWSNRIN TANSRKHQEF AGRLNSVNNR AELYQHLKEE NGMETTENGK ASRQ

UniProtKB: Integrator complex subunit 13

+
分子 #33: Integrator complex subunit 14

分子名称: Integrator complex subunit 14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 57.526547 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
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MPTVVVMDVS LSMTRPVSIE GSEEYQRKHL AAHGLTMLFE HMATNYKLEF TALVVFSSLW ELMVPFTRDY NTLQEALSNM DDYDKTCLE SALVGVCNIV QQEWGGAIPC QVVLVTDGCL GIGRGSLRHS LATQNQRSES NRFPLPFPFP SKLYIMCMAN L EELQSTDS LECLERLIDL NNGEGQIFTI DGPLCLKNVQ SMFGKLIDLA YTPFHAVLKC GHLTADVQVF PRPEPFVVDE EI DPIPKVI NTDLEIVGFI DIADISSPPV LSRHLVLPIA LNKEGDEVGT GITDDNEDEN SANQIAGKIP NFCVLLHGSL KVE GMVAIV QLGPEWHGML YSQADSKKKS NLMMSLFEPG PEPLPWLGKM AQLGPISDAK ENPYGEDDNK SPFPLQPKNK RSYA QNVTV WIKPSGLQTD VQKILRNARK LPEKTQTFYK ELNRLRKAAL AFGFLDLLKG VADMLERECT LLPETAHPDA AFQLT HAAQ QLKLASTGTS EYAAYDQNIT PLHTDFSGSS TERI

UniProtKB: Integrator complex subunit 14

+
分子 #34: Integrator complex subunit 15

分子名称: Integrator complex subunit 15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 50.303582 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNMSDIRHSL LRRDALSAAK EVLYHLDIYF SSQLQSAPLP IVDKGPVELL EEFVFQVPKE RSAQPKRLNS LQELQLLEIM CNYFQEQTK DSVRQIIFSS LFSPQGNKAD DSRMSLLGKL VSMAVAVCRI PVLECAASWL QRTPVVYCVR LAKALVDDYC C LVPGSIQT ...文字列:
SNMSDIRHSL LRRDALSAAK EVLYHLDIYF SSQLQSAPLP IVDKGPVELL EEFVFQVPKE RSAQPKRLNS LQELQLLEIM CNYFQEQTK DSVRQIIFSS LFSPQGNKAD DSRMSLLGKL VSMAVAVCRI PVLECAASWL QRTPVVYCVR LAKALVDDYC C LVPGSIQT LKQIFSASPR FCCQFITSVT ALYDLSSDDL IPPMDLLEMI VTWIFEDPRL ILITFLNTPI AANLPIGFLE LT PLVGLIR WCVKAPLAYK RKKKPPLSNG HVSNKVTKDP GVGMDRDSHL LYSKLHLSVL QVLMTLQLHL TEKNLYGRLG LIL FDHMVP LVEEINRLAD ELNPLNASQE IELSLDRLAQ ALQVAMASGA LLCTRDDLRT LCSRLPHNNL LQLVISGPVQ QSPH AALPP GFYPHIHTPP LGYGAVPAHP AAHPALPTHP GHTFISGVTF PFRPIR

UniProtKB: Integrator complex subunit 15

+
分子 #35: Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit...

分子名称: Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform
タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 65.579531 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNMAAADGDD SLYPIAVLID ELRNEDVQLR LNSIKKLSTI ALALGVERTR SELLPFLTDT IYDEDEVLLA LAEQLGTFTT LVGGPEYVH CLLPPLESLA TVEETVVRDK AVESLRAISH EHSPSDLEAH FVPLVKRLAG GDWFTSRTSA CGLFSVCYPR V SSAVKAEL ...文字列:
SNMAAADGDD SLYPIAVLID ELRNEDVQLR LNSIKKLSTI ALALGVERTR SELLPFLTDT IYDEDEVLLA LAEQLGTFTT LVGGPEYVH CLLPPLESLA TVEETVVRDK AVESLRAISH EHSPSDLEAH FVPLVKRLAG GDWFTSRTSA CGLFSVCYPR V SSAVKAEL RQYFRNLCSD DTPMVRRAAA SKLGEFAKVL ELDNVKSEII PMFSNLASDE QDSVRLLAVE ACVNIAQLLP QE DLEALVM PTLRQAAEDK SWRVRYMVAD KFTELQKAVG PEITKTDLVP AFQNLMKDCE AEVRAAASHK VKEFCENLSA DCR ENVIMS QILPCIKELV SDANQHVKSA LASVIMGLSP ILGKDNTIEH LLPLFLAQLK DECPEVRLNI ISNLDCVNEV IGIR QLSQS LLPAIVELAE DAKWRVRLAI IEYMPLLAGQ LGVEFFDEKL NSLCMAWLVD HVYAIREAAT SNLKKLVEKF GKEWA HATI IPKVLAMSGD PNYLHRMTTL FCINVLSEVC GQDITTKHML PTVLRMAGDP VANVRFNVAK SLQKIGPILD NSTLQS EVK PILEKLTQDQ DVDVKYFAQE ALTVLSLA

UniProtKB: Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform

+
分子 #36: Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha i...

分子名称: Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 35.836348 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNMDEKVFTK ELDQWIEQLN ECKQLSESQV KSLCEKAKEI LTKESNVQEV RCPVTVCGDV HGQFHDLMEL FRIGGKSPDT NYLFMGDYV NRGYYSVETV TLLVALKVRY RERITILRGN HESRQITQVY GFYDECLRKY GNANVWKYFT DLFDYLPLTA L VDGQIFCL ...文字列:
SNMDEKVFTK ELDQWIEQLN ECKQLSESQV KSLCEKAKEI LTKESNVQEV RCPVTVCGDV HGQFHDLMEL FRIGGKSPDT NYLFMGDYV NRGYYSVETV TLLVALKVRY RERITILRGN HESRQITQVY GFYDECLRKY GNANVWKYFT DLFDYLPLTA L VDGQIFCL HGGLSPSIDT LDHIRALDRL QEVPHEGPMC DLLWSDPDDR GGWGISPRGA GYTFGQDISE TFNHANGLTL VS RAHQLVM EGYNWCHDRN VVTIFSAPNY CYRCGNQAAI MELDDTLKYS FLQFDPAPRR GEPHVTRRTP DYFL

UniProtKB: Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform

+
分子 #37: DSS1

分子名称: DSS1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
分子量理論値: 3.558796 KDa
配列文字列:
DVSVWEENWE DDIVQDDFNQ QLRLEMFR

+
分子 #38: Negative elongation factor A

分子名称: Negative elongation factor A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 57.343598 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: MASMRESDTG LWLHNKLGAT DELWAPPSIA SLLTAAVIDN IRLCFHGLSS AVKLKLLLGT LHLPRRTVDE MKGALMEIIQ LASLDSDPW VLMVADILKS FPDTGSLNLE LEEQNPNVQD ILGELREKVG ECEASAMLPL ECQYLNKNAL TTLAGPLTPP V KHFQLKRK ...文字列:
MASMRESDTG LWLHNKLGAT DELWAPPSIA SLLTAAVIDN IRLCFHGLSS AVKLKLLLGT LHLPRRTVDE MKGALMEIIQ LASLDSDPW VLMVADILKS FPDTGSLNLE LEEQNPNVQD ILGELREKVG ECEASAMLPL ECQYLNKNAL TTLAGPLTPP V KHFQLKRK PKSATLRAEL LQKSTETAQQ LKRSAGVPFH AKGRGLLRKM DTTTPLKGIP KQAPFRSPTA PSVFSPTGNR TP IPPSRTL LRKERGVKLL DISELDMVGA GREAKRRRKT LDAEVVEKPA KEETVVENAT PDYAAGLVST QKLGSLNNEP ALP STSYLP STPSVVPASS YIPSSETPPA PSSREASRPP EEPSAPSPTL PAQFKQRAPM YNSGLSPATP TPAAPTSPLT PTTP PAVAP TTQTPPVAMV APQTQAPAQQ QPKKNLSLTR EQMFAAQEMF KTANKVTRPE KALILGFMAG SRENPCQEQG DVIQI KLSE HTEDLPKADG QGSTTMLVDT VFEMNYATGQ WTRFKKYKPM TNVS

UniProtKB: Negative elongation factor A

+
分子 #39: NELF-B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B,...

分子名称: NELF-B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B,Negative elongation factor B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 68.58768 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)MFAGL QDLGVANGED ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)MFAGL QDLGVANGED LKETLTNCTE PLKAIEQFQT ENGVLLPSLQ SALPFLDLHG TPRLEFHQSV FDELRDKLLE RVSAIASEG KAEERYKKLE DLLEKSFSLV KMPSLQPVVM CVMKHLPKVP EKKLKLVMAD KELYRACAVE VKRQIWQDNQ A LFGDEVSP LLKQYILEKE SALFSTELSV LHNFFSPSPK TRRQGEVVQR LTRMVGKNVK LYDMVLQFLR TLFLRTRNVH YC TLRAELL MSLHDLDVGE ICTVDPCHKF TWCLDACIRE RFVDSKRARE LQGFLDGVKK GQEQVLGDLS MILCDPFAIN TLA LSTVRH LQELVGQETL PRDSPDLLLL LRLLALGQGA WDMIDSQVFK EPKMEVELIT RFLPMLMSFL VDDYTFNVDQ KLPA EEKAP VSYPNTLPES FTKFLQEQRM ACEVGLYYVL HITKQRNKNA LLRLLPGLVE TFGDLAFGDI FLHLLTGNLA LLADE FALE DFCSSLFDGF FLTASPRKEN VHRHALRLLI HLHPRVAPSK LEALQKALEP TGQSGEAVKE LYSQLGEKLE QLDHRK PSP AQAAETPALE LPLPSVPAPA PL

UniProtKB: Negative elongation factor B

+
分子 #40: Negative elongation factor C/D

分子名称: Negative elongation factor C/D / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 65.748586 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列: SNMDEDYYGS AAEWGDEADG GQQEDDSGEG EDDAEVQQEC LHKFSTRDYI MEPSIFNTLK RYFQAGGSPE NVIQLLSENY TAVAQTVNL LAEWLIQTGV EPVQVQETVE NHLKSLLIKH FDPRKADSIF TEEGETPAWL EQMIAHTTWR DLFYKLAEAH P DCLMLNFT ...文字列:
SNMDEDYYGS AAEWGDEADG GQQEDDSGEG EDDAEVQQEC LHKFSTRDYI MEPSIFNTLK RYFQAGGSPE NVIQLLSENY TAVAQTVNL LAEWLIQTGV EPVQVQETVE NHLKSLLIKH FDPRKADSIF TEEGETPAWL EQMIAHTTWR DLFYKLAEAH P DCLMLNFT VKLISDAGYQ GEITSVSTAC QQLEVFSRVL RTSLATILDG GEENLEKNLP EFAKMVCHGE HTYLFAQAMM SV LAQEEQG GSAVRRIAQE VQRFAQEKGH DASQITLALG TAASYPRACQ ALGAMLSKGA LNPADITVLF KMFTSMDPPP VEL IRVPAF LDLFMQSLFK PGARINQDHK HKYIHILAYA ASVVETWKKN KRVSINKDEL KSTSKAVETV HNLCCNENKG ASEL VAELS TLYQCIRFPV VAMGVLKWVD WTVSEPRYFQ LQTDHTPVHL ALLDEISTCH QLLHPQVLQL LVKLFETEHS QLDVM EQLE LKKTLLDRMV HLLSRGYVLP VVSYIRKCLE KLDTDISLIR YFVTEVLDVI APPYTSDFVQ LFLPILENDS IAGTIK TEG EHDPVTEFIA HCKSNFIMVN

UniProtKB: Negative elongation factor C/D

+
分子 #41: UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-U...

分子名称: UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK-UNK
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 1.890321 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)

+
分子 #15: non-template DNA

分子名称: non-template DNA / タイプ: dna / ID: 15 / コピー数: 1 / 分類: DNA
由来(天然)生物種: synthetic construct (人工物)
分子量理論値: 45.938262 KDa
配列文字列: (DG)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG) (DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG) (DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC) (DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG) (DG) (DG)(DA)(DG)(DT)(DA) ...文字列:
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+
分子 #20: Template DNA

分子名称: Template DNA / タイプ: dna / ID: 20 / コピー数: 1 / 分類: DNA
由来(天然)生物種: synthetic construct (人工物)
分子量理論値: 56.757223 KDa
配列文字列: (DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC) (DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG) (DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA) (DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG) (DA) (DC)(DA)(DG)(DC)(DT) ...文字列:
(DA)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC) (DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG) (DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA) (DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DA)(DG) (DA) (DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA) (DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DT)(DA) (DA)(DA) (DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT) (DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC) (DC)(DC)(DC) (DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT) (DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC)(DA) (DA)(DG)(DG)(DG) (DG)(DA)(DT)(DT)(DA) (DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC) (DT)(DC)(DC)(DA)(DG) (DG)(DC)(DA)(DC) (DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA) (DT)(DA)(DT)(DA)(DC)(DA) (DT)(DC)(DG) (DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DA) (DC)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DA) (DG)(DA) (DC)(DA)(DC)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA)(DA)(DC) (DA)(DC)(DA)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA) (DG) (DT)(DG)(DA)(DT)

+
分子 #17: RNA

分子名称: RNA / タイプ: rna / ID: 17 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: synthetic construct (人工物)
分子量理論値: 5.549278 KDa
配列文字列:
GUGUGUCUGG GUGGUGG

+
分子 #42: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 42 / コピー数: 10 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #43: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 43 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #44: MANGANESE (II) ION

分子名称: MANGANESE (II) ION / タイプ: ligand / ID: 44 / コピー数: 2 / 式: MN
分子量理論値: 54.938 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度0.3 mg/mL
緩衝液pH: 7.4
グリッドモデル: Qu / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 40.44 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 80717
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

7pks


Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model
得られたモデル

PDB-8rbx:
Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex

-
原子モデル構築 2

初期モデルPDB ID:

7ohc


Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model
得られたモデル

PDB-8rbx:
Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex

-
原子モデル構築 3

初期モデルPDB ID:

6sn1


Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model
得られたモデル

PDB-8rbx:
Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex

-
原子モデル構築 4

初期モデルChain - Source name: AlphaFold / Chain - Initial model type: in silico model
得られたモデル

PDB-8rbx:
Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る