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- EMDB-15867: Cryo-EM structure of cytochrome c oxidase dimer (complex IV) from... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-15867
タイトルCryo-EM structure of cytochrome c oxidase dimer (complex IV) from respiratory supercomplex of Tetrahymena thermophila
マップデータ
試料
  • 複合体: Cytochrome c oxidase dimer (complex-IV) from respiratory supercomplex of Tetrahymena thermophila
    • タンパク質・ペプチド: x 53種
  • リガンド: x 15種
機能・相同性
機能・相同性情報


thiosulfate transmembrane transporter activity / oxaloacetate transmembrane transporter activity / malate transmembrane transporter activity / protein maturation by [2Fe-2S] cluster transfer / succinate transmembrane transporter activity / sulfate transmembrane transporter activity / mitochondrial cytochrome c oxidase assembly / phosphate ion transmembrane transport / mitochondrial respiratory chain complex IV / シトクロムcオキシダーゼ ...thiosulfate transmembrane transporter activity / oxaloacetate transmembrane transporter activity / malate transmembrane transporter activity / protein maturation by [2Fe-2S] cluster transfer / succinate transmembrane transporter activity / sulfate transmembrane transporter activity / mitochondrial cytochrome c oxidase assembly / phosphate ion transmembrane transport / mitochondrial respiratory chain complex IV / シトクロムcオキシダーゼ / antiporter activity / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / cytochrome-c oxidase activity / Golgi organization / transmembrane transporter activity / electron transport coupled proton transport / endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / ATP synthesis coupled electron transport / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / protein transport / ミトコンドリア内膜 / copper ion binding / DNA-binding transcription factor activity / heme binding / 小胞体 / ミトコンドリア / 生体膜 / metal ion binding / 細胞核
類似検索 - 分子機能
Surfeit locus 1/Shy1 / Surfeit locus 1/4 / TraB/PryY-like / SURF1 family / SURF1 family profile. / CTF transcription factor/nuclear factor 1, DNA-binding domain / CTF/NF-I DNA-binding domain profile. / Tim10-like / Tim10-like domain superfamily / Tim10/DDP family zinc finger ...Surfeit locus 1/Shy1 / Surfeit locus 1/4 / TraB/PryY-like / SURF1 family / SURF1 family profile. / CTF transcription factor/nuclear factor 1, DNA-binding domain / CTF/NF-I DNA-binding domain profile. / Tim10-like / Tim10-like domain superfamily / Tim10/DDP family zinc finger / Mitochondrial substrate/solute carrier / Mitochondrial carrier domain superfamily / Mitochondrial carrier protein / Solute carrier (Solcar) repeat profile. / Iron-binding zinc finger, CDGSH type / MitoNEET, CDGSH iron-sulfur domain / CDGSH-type zinc finger. Function unknown. / Regulator of chromosome condensation (RCC1) repeat / Regulator of chromosome condensation, RCC1 / Regulator of chromosome condensation (RCC1) repeat profile. / Regulator of chromosome condensation 1/beta-lactamase-inhibitor protein II / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding region signature. / Cytochrome c oxidase, subunit Vb / Cytochrome c oxidase, subunit Vb superfamily / Cytochrome c oxidase subunit Vb / Cytochrome c oxidase subunit Vb, zinc binding domain profile. / Cytochrome c/quinol oxidase subunit II / Cytochrome c oxidase, subunit I, copper-binding site / Heme-copper oxidase catalytic subunit, copper B binding region signature. / Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain / Cytochrome oxidase subunit I profile. / Cytochrome c oxidase subunit I / Cytochrome c oxidase-like, subunit I superfamily / Cytochrome C and Quinol oxidase polypeptide I / Cytochrome C oxidase subunit II, periplasmic domain / Cytochrome c oxidase subunit II-like C-terminal / Cytochrome oxidase subunit II copper A binding domain profile. / Cupredoxin / Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
類似検索 - ドメイン・相同性
Oxoglutarate/malate translocator protein, putative / 膜貫通型タンパク質 / SURF1-like protein / Uncharacterized protein / 膜貫通型タンパク質 / Transmembrane protein, putative / SURF1-like protein / 膜貫通型タンパク質 / Iron-binding zinc finger CDGSH type protein / Uncharacterized protein ...Oxoglutarate/malate translocator protein, putative / 膜貫通型タンパク質 / SURF1-like protein / Uncharacterized protein / 膜貫通型タンパク質 / Transmembrane protein, putative / SURF1-like protein / 膜貫通型タンパク質 / Iron-binding zinc finger CDGSH type protein / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / 膜貫通型タンパク質 / 膜貫通型タンパク質 / Transmembrane protein, putative / 膜貫通型タンパク質 / Uncharacterized protein / CTF/NF-I domain-containing protein / Transmembrane protein, putative / Protein phosphatase 2C, putative / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein / Transmembrane protein, putative / Carrier protein / Uncharacterized protein / Tim10/DDP family zinc finger protein / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein, putative / TraB family protein / Transmembrane protein, putative / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Cytochrome C oxidase subunit Vb protein / 2-oxoglutarate/malate carrier protein / Transmembrane protein, putative / Transmembrane protein, putative / Uncharacterized protein / Uncharacterized protein / Ymf70 / Cytochrome c oxidase subunit 1 / Ymf68 / Ymf67 / Cytochrome c oxidase polypeptide II / Ymf75 / Transmembrane protein, putative / 膜貫通型タンパク質 / Mitochondrial import inner membrane translocase subunit / Uncharacterized protein / Transmembrane protein, putative / Tim10/DDP family zinc finger protein
類似検索 - 構成要素
生物種Tetrahymena thermophila (真核生物) / Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.6 Å
データ登録者Muhleip A / Kock Flygaard R / Amunts A
資金援助 スウェーデン, European Union, 4件
OrganizationGrant number国
The Swedish Foundation for Strategic ResearchFFL15:0325 スウェーデン
Cancerfonden2017/1041 スウェーデン
European Research Council (ERC)ERC-2018-StG-805230European Union
Knut and Alice Wallenberg Foundation2018.0080 スウェーデン
引用
ジャーナル: Nature / 年: 2023
タイトル: Structural basis of mitochondrial membrane bending by the I-II-III-IV supercomplex.
著者: Alexander Mühleip / Rasmus Kock Flygaard / Rozbeh Baradaran / Outi Haapanen / Thomas Gruhl / Victor Tobiasson / Amandine Maréchal / Vivek Sharma / Alexey Amunts /
要旨: Mitochondrial energy conversion requires an intricate architecture of the inner mitochondrial membrane. Here we show that a supercomplex containing all four respiratory chain components contributes ...Mitochondrial energy conversion requires an intricate architecture of the inner mitochondrial membrane. Here we show that a supercomplex containing all four respiratory chain components contributes to membrane curvature induction in ciliates. We report cryo-electron microscopy and cryo-tomography structures of the supercomplex that comprises 150 different proteins and 311 bound lipids, forming a stable 5.8-MDa assembly. Owing to subunit acquisition and extension, complex I associates with a complex IV dimer, generating a wedge-shaped gap that serves as a binding site for complex II. Together with a tilted complex III dimer association, it results in a curved membrane region. Using molecular dynamics simulations, we demonstrate that the divergent supercomplex actively contributes to the membrane curvature induction and tubulation of cristae. Our findings highlight how the evolution of protein subunits of respiratory complexes has led to the I-II-III-IV supercomplex that contributes to the shaping of the bioenergetic membrane, thereby enabling its functional specialization.
#1: ジャーナル: Biorxiv / 年: 2022
タイトル: Structural basis of mitochondrial membrane bending by I-II-III2-IV2 supercomplex
著者: Muhleip A / Flygaard RK / Haapanen O / Baradaran R / Gruhl T / Tobiasson V / Marechal A / Sharma V / Amunts A
履歴
登録2022年9月27日-
ヘッダ(付随情報) 公開2023年3月29日-
マップ公開2023年3月29日-
更新2023年4月12日-
現状2023年4月12日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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ファイルダウンロード / ファイル: emd_15867.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 421.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
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最小 - 最大-3.7738361 - 7.0050597
平均 (標準偏差)0.004270913 (±0.5386689)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ480480480
Spacing480480480
セルA=B=C: 600.912 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_15867_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_15867_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

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密度ヒストグラム

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ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_15867_half_map_2.map
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試料の構成要素

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全体 : Cytochrome c oxidase dimer (complex-IV) from respiratory supercom...

全体名称: Cytochrome c oxidase dimer (complex-IV) from respiratory supercomplex of Tetrahymena thermophila
要素
  • 複合体: Cytochrome c oxidase dimer (complex-IV) from respiratory supercomplex of Tetrahymena thermophila
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 1シトクロムcオキシダーゼ
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Ymf68
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome C oxidase subunit Vb proteinシトクロムcオキシダーゼ
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Structural proteinタンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: CTF/NF-I domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Ymf67
    • タンパク質・ペプチド: Protein phosphatase 2C, putative
    • タンパク質・ペプチド: SURF1-like protein
    • タンパク質・ペプチド: TraB family protein
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Oxoglutarate/malate translocator protein, putative
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: 2-oxoglutarate/malate carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: SURF1-like protein
    • タンパク質・ペプチド: COXTT9
    • タンパク質・ペプチド: COXTT10
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L9, mitochondrialリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: COXTT12,Transmembrane protein,Transmembrane protein
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: COXTT27
    • タンパク質・ペプチド: Ymf75
    • タンパク質・ペプチド: Mobilization protein動員
    • タンパク質・ペプチド: Iron-binding zinc finger CDGSH type protein
    • タンパク質・ペプチド: COXTT28
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Decapping nuclease
    • タンパク質・ペプチド: Complex III subunit VIIユビキノール-シトクロムcレダクターゼ
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: COXTT22
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Phage proteinファージ
    • タンパク質・ペプチド: Transmembrane protein, putative膜貫通型タンパク質
    • タンパク質・ペプチド: Lysozymeリゾチーム
    • タンパク質・ペプチド: Ymf70
    • タンパク質・ペプチド: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: ABC transporterATP-binding cassette transporter
    • タンパク質・ペプチド: YflT domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Cullin domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Annexin
    • タンパク質・ペプチド: Transposase
    • タンパク質・ペプチド: Tim10/DDP family zinc finger protein
    • タンパク質・ペプチド: COXBP,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein
  • リガンド: HEME-A
  • リガンド: COPPER (II) ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
  • リガンド: 2-(HEXADECANOYLOXY)-1-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]ETHYL HEXADECANOATE
  • リガンド: CALCIUM IONカルシウム
  • リガンド: DINUCLEAR COPPER ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: POTASSIUM IONカリウム
  • リガンド: Ubiquinone-8ユビキノン
  • リガンド: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

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超分子 #1: Cytochrome c oxidase dimer (complex-IV) from respiratory supercom...

超分子名称: Cytochrome c oxidase dimer (complex-IV) from respiratory supercomplex of Tetrahymena thermophila
タイプ: complex / ID: 1 / キメラ: Yes / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#53
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila (真核生物)
分子量理論値: 3.2 MDa

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分子 #1: Cytochrome c oxidase subunit 1

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 80.578977 KDa
配列文字列: MWVDFIDQTK SLKVSVNNYF YYLDRIKKLF TYLNDLRKHI LKKYVYTINH KRIAINYLYF SMVTGLSGAA LATMIRLELA HPGSPFFKG DSLRYLQVVT AHGLIMVFFV VVPILFGGFA NFLIPYHVGS KDVAYPRLNS IGFWIQPCGY ILLAKIGFLR P QFWRYYDK ...文字列:
MWVDFIDQTK SLKVSVNNYF YYLDRIKKLF TYLNDLRKHI LKKYVYTINH KRIAINYLYF SMVTGLSGAA LATMIRLELA HPGSPFFKG DSLRYLQVVT AHGLIMVFFV VVPILFGGFA NFLIPYHVGS KDVAYPRLNS IGFWIQPCGY ILLAKIGFLR P QFWRYYDK TSFSFPFLEK MKYNQYKEYK NDYLFYLDFL KKEITDDHSF FWKARKVIKL PQYSVFSFVP LKLMMWKTMI NY PESFWYA ASRVVQSRRK KVFVTKCSAR TLTTAGWTFI TPFSSNIKYT AVGSQDILIL SVVFAGISTT ISFTNLLITR RTL AMPGLR HRRVLMPFVT ISIFLTLRML ATITPVLGAA VIMMAFDRHW QTTFFEYAYG GDPILSQHLF WFFGHPEVYV LIIP TFGFI NMIVPHNNTR RVASKHHMIW AIYVMAYMGY LVWGHHMYLV GLDHRSRTMY STITIMISMP ATIKVVNWTL SLVNG ALKI DLPFLFSMSF LLLFLVAGFT GMWLSHVSLN VSMHDTFYVV AHFHIMLSGA AMTGIFSGIY YYFNALFGVK YSRMFG YMH LIYYSGGQWV AFVPLFYLGF SGMPRRIHDY PVVFMGWHSM STTGHFITLV GIIFFFLMMF DSHIERRAST STTLGLP RW YKRISYYIFK IRYLQHTKSK MNGIPGSTVR LMLINRHFVE YEVYEK

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分子 #2: Cytochrome c oxidase subunit 2

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 72.388883 KDa
配列文字列: MWGNLWTEAS YQLNFNIGFS SLRSDVLIHL AQWQYWWWFW FALIWSFYYF IILKVARFRV LKMRPKISTS YRPHGKWGDF LACIIPLIW CINILTNSNL ILRLIEWQNE SSLFTVRVRA RQWYWIYKFE LKNFTDILST PKNIGNNRWQ INTFGELQTA D DYLHVLQL ...文字列:
MWGNLWTEAS YQLNFNIGFS SLRSDVLIHL AQWQYWWWFW FALIWSFYYF IILKVARFRV LKMRPKISTS YRPHGKWGDF LACIIPLIW CINILTNSNL ILRLIEWQNE SSLFTVRVRA RQWYWIYKFE LKNFTDILST PKNIGNNRWQ INTFGELQTA D DYLHVLQL RSQNKWVKNY WNRSLQETGK TNKAHVISPQ EQLRLSLINQ YKSLNLSSSI KHNAPFINRD LYVFDDLFSY NL GDITTKK SLFNDKNSFL TSYSYLNNNS WNNNEFDLID NLPFTTLFDN NDLFNNYKSF FQDSIFNSPK KQLSSDSKQL FKH IIYRSI KNNIIQDYTK LVKHEDFDEY SRWIKRSPGE VLPLRIIKYP LGLETIHNNI FENTNNEGNV ELFRLRFNSN SSKM QHKLV QDTIYLTLKQ KRYNRKKVVA PQIKYYKDDN GNKTDLVKYT GKPYLSNDKL LKQSIYDQTT QYKLIKKNKK RGELI PVTL ARRILRTKKT LVLPAHVNIT LITNSYDIVH SWFIPGLGIK LDCVPGRSTH HTFFIDNVGF YYGQCAEICG RYHHHM PIR VCALPFEHFL LWWNTFGLPK MLNTVSRKRF ETHYELRKYS W

+
分子 #3: Ymf68

分子名称: Ymf68 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 72.782539 KDa
配列文字列: MLICNFLMYS NFSRIYWFDF NGTVNENLPL NYNVLKICRN EINKLEKLNE NNLGTQKNPI KLNLSFEDKH YNTNNLVLDL NSYETFNSK NFISSIFDKT FESLNTVLMA PIYSFLEFKL KLSSTKINTN HYYVINGKLY ITYNDSFKLF TTINDYFNDL N ELSNTKLF ...文字列:
MLICNFLMYS NFSRIYWFDF NGTVNENLPL NYNVLKICRN EINKLEKLNE NNLGTQKNPI KLNLSFEDKH YNTNNLVLDL NSYETFNSK NFISSIFDKT FESLNTVLMA PIYSFLEFKL KLSSTKINTN HYYVINGKLY ITYNDSFKLF TTINDYFNDL N ELSNTKLF FLYRSFNIYN IKLNSLVDFV FLKLILFIHL LYLKSTNYNR FDYRLKQTDW GFYINNNSNY IQNIFSGLKY IW RGLRFWI IGLLLGLSSI YYLMYVRLLP FNKIIFAWIL VAMFLYWLLS GFVFFVKKYQ YSKFTAAIQR FWKRTYIIFW VIE AGTFSV FFYLTLNASS EPVYMYDQIK IYKTHLFSWR WFLIKLLPSV SIILLGYYLQ LTLKWNLFNK QNTIVLLITL LLLY ILWLE FYQFYHILSF YGNINWAFDY DEYIWTLELD TRRTRLANNY IAICLFAKFW HFVFIFLFWV FFVLRINELG RIRYP LLVA NVQNFIIIYI MSWAYMYPWL KFIFRKYLDV PYYWFYLNGR ELGIRVFFTD LKLFFYGITN RLFDFNPSSI KFEKYP FYY WINSSQLTEF NQYRKFVIRD SIIYSLNNYI I

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分子 #4: Cytochrome C oxidase subunit Vb protein

分子名称: Cytochrome C oxidase subunit Vb protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 75.431312 KDa
配列文字列: MKKQKRTQGK QNTKQIKQEK LSSKRKANNQ KEGKKKVKQE DYKEIKQKGK RMLSKIVKAS FSSKGFNLAN AVNTVKSTLN APIKHIKRN IEPTGSNYSR MTNTTEEAFD EVSHEWQALV TSNPFDLNVF NYLENTQTSN FGTVDNPLVV FTSETPFRYV G CTGQMNED ...文字列:
MKKQKRTQGK QNTKQIKQEK LSSKRKANNQ KEGKKKVKQE DYKEIKQKGK RMLSKIVKAS FSSKGFNLAN AVNTVKSTLN APIKHIKRN IEPTGSNYSR MTNTTEEAFD EVSHEWQALV TSNPFDLNVF NYLENTQTSN FGTVDNPLVV FTSETPFRYV G CTGQMNED DYEGHELLFF LLREGSLQRC MGCGQVFKLV RLRNEYSPEM DYYLSNFHPY EMQEMGESDT TVLMSPYKYA SH YEYTQFE TPSNMVYSMV NPDEHDRLLV DPAYRMERTK ALEEKYKVYT SSLREVEKQF EERYGRAGQI NISKVTYSTL IDV EKAVLK MDRLFRKVAK FENRAFIDRA NHSRREKRML ERAQQRWDSN YSFFTGSLTE EEQKYRDYYE (TPO)ELEAYPEDE GIEQQLDQQ EVLLSGRYDP KLYDFQEGYT KNPEDDQTSL IEKKAFKFRY RLANETSETF QRRNNRMVER QIKRFQQPQY K HAFEQLQK NIAISSNSGN ALHSEYGYLE LLSNESVQLY KDYYE(SEP)DAEE DFKVFENLSS KEKLVMIANF ENNLLPKY D RSEVHLIPKR QWEPAFGVWE NFLYDITEYA SFIAPRGKEI AADYQIQSAI PLTKEELIEA GLYKETIEKK VEPKLEAKK QTKSE

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分子 #5: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 15.618258 KDa
配列文字列:
MIWKYLQRTN RGNIIQAGLQ HRKFENLPFK QNFDNLTKAY DLRMWYISNS PHEAKNLEYV NELEALHNEL NYQNSRQFLF RTVSFLLGW ALFYQFYELP KTYDWQDTQE PKHQVPAYGD LEEGGDEGGD D

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分子 #6: Structural protein

分子名称: Structural protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 27.946445 KDa
配列文字列: MSSAVEKKDL PADYGKMPAG YNFLTRGKDW REYDKDFILR TDAVWEKFQL EHFFRNYMKC FFFDHGLKKY QMFEPEDMYT VVFEGWALD DLITFPGFTP TGRTNSYQIG LSPRQRTVVP TQTFYQMQDY YMLCGLRFER WFRCDLVYHD QRHTKFDQVK N QKNYKTYP ...文字列:
MSSAVEKKDL PADYGKMPAG YNFLTRGKDW REYDKDFILR TDAVWEKFQL EHFFRNYMKC FFFDHGLKKY QMFEPEDMYT VVFEGWALD DLITFPGFTP TGRTNSYQIG LSPRQRTVVP TQTFYQMQDY YMLCGLRFER WFRCDLVYHD QRHTKFDQVK N QKNYKTYP CYREYYEAQY ACQDDMFDFL MELAYARRAA DNFESDFASH ELTTLPTFYD TPKAAERKTY TY

+
分子 #7: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 12.786321 KDa
配列文字列:
MGSVWFRNRY WWYRSLYDDY VAREAKLAFG IAAFIWLPHY YWGIHLNRAF EVNFSHRNYA HEWGPRRNRL AHSLEFEQFD MILENWQDL EDEYAQRGDG MLKK

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分子 #8: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 16.427672 KDa
配列文字列:
(AME)NRFFKVSSK YQYYKYLEQY DAAFLRKYQS ETHWYLGRRG AWKNLVIKYA GDHISLEEEH NVKYKTHLSF VYLSYR LAW VLFAYVLIYN HFLLGDIGKT FNVGEWDHRL KPSAERDYPT RYESLYILDR TQKW

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分子 #9: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 28.666662 KDa
配列文字列: MISKYRYLHC ARKLVKQSVQ AFGGGHHHHE YDWRDDPKVN KDIEEDIRDR GWHPETYDFP YTKKHDDWVF DVTMPSQNYQ TDLTVNIHP ENKKMHVMKQ VMRQSYWDAE HDMAHEYDYE (SEP)EDLDFQCES FKSQHFRKKG PISQYLILGL LPILYFG TE ...文字列:
MISKYRYLHC ARKLVKQSVQ AFGGGHHHHE YDWRDDPKVN KDIEEDIRDR GWHPETYDFP YTKKHDDWVF DVTMPSQNYQ TDLTVNIHP ENKKMHVMKQ VMRQSYWDAE HDMAHEYDYE (SEP)EDLDFQCES FKSQHFRKKG PISQYLILGL LPILYFG TE FFYNHYPDED YWRVAHPPPL DYPDTDDTDD TETFKDYKSF TGRRMVDTGI VDPLWYDIRE GKKVYYDWAG VNQPMEDI

+
分子 #10: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 26.601174 KDa
配列文字列: MSLSLFGVKN NWHKNGIWWF SKILNKTVGE ERYDALRVQR RIWSMRFYYA RQQCLYELFV DHPDLAQWTG TYPKVDSSHG FPFYSTYEM YRDFQENTLN SDGSFAQWIT LVCGIYVIHV IYNYMIPYYW VSTPLKNDEF TRLRMKDYIA STVLEEVYGI S YAEWGWLP ...文字列:
MSLSLFGVKN NWHKNGIWWF SKILNKTVGE ERYDALRVQR RIWSMRFYYA RQQCLYELFV DHPDLAQWTG TYPKVDSSHG FPFYSTYEM YRDFQENTLN SDGSFAQWIT LVCGIYVIHV IYNYMIPYYW VSTPLKNDEF TRLRMKDYIA STVLEEVYGI S YAEWGWLP HDFAYNRMRG LAGYMHPDDP RAMCTSTFHR KHKYIEHEVE KVGDYHHMTY PK

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分子 #11: CTF/NF-I domain-containing protein

分子名称: CTF/NF-I domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 116.81275 KDa
配列文字列: MNKSQDEVKE DYFSIKKKKY NSLDCVLSPI VTRKKQESIN SFQAGLQEDQ NSTAVPESPF IRNCSETLNR SQHKILDHYF EYDYSLKKK IEKIKISLQN KTGTDSSQSL VQKRLDDLRK KTLIYKQFNI QKNNNNINNT GQFFIEKDKQ NNLNLSQPHQ I IKSKQGHK ...文字列:
MNKSQDEVKE DYFSIKKKKY NSLDCVLSPI VTRKKQESIN SFQAGLQEDQ NSTAVPESPF IRNCSETLNR SQHKILDHYF EYDYSLKKK IEKIKISLQN KTGTDSSQSL VQKRLDDLRK KTLIYKQFNI QKNNNNINNT GQFFIEKDKQ NNLNLSQPHQ I IKSKQGHK RSFTNTLYCS SNDKKIFNIS SQKQNIKTVK QSNNSSMYEE QIKNDQNKKQ NFNKQAKSER KQAEFCDLFY ES MQKDAER QFKSNSDKSK SITQILENNC ENAIVLLNHL IQILTDSIPI SKNSILLDEK LSQCVNLSNN SKISQLMLVI QKL QGKISY YYNDFLKCIR MMKICKNFCQ LFGTLKFKIS CYKYIGLGFQ RLNKPKVALV YFVKMLRQSW FLKQEDQEIN SYDF IGMSY FYLGSIDKAY QYHQMMIDGI KADEEVKKIS NIMLKNRKYS NYPTLQNIRI IQETSDGQPL QKTIRKSKII NPQFQ LTQQ EWGENISSSE DEFELPQMQI AVKNAEEQTF QKKFLSTPWN DRFIQAQIHK LEIAQELNYN KFPIGLVFKN QSVLNF PNS SNQPQLVVGP YANKIYNQEL SSTYSSRQRI SHQTPNREFF NYHSQLQQVK EQTQLNQMKQ QYNQIVDSIE LANHLIV LK NLKKVKDLFQ NLIPYLNEKY YNIKQQNTKS LKQQQNSFDA QNSNQSFLGL QNYSIQINGI LNINNQTDEY VNNQSDRS Y QQQSDKLKLL IKSKSRNHSK EINMTQNYFK SPSNESKQIK NLRVIVDNSN KKKAQQKLNQ EFSMNFCESP KYDNSILSL FINKLSQESA LRLEIRQIGS ASRYQRKKQQ KGKQRKEKYQ KKQEENKLNI KQYKKERYNM ALFFMANTAI SVPSVLDTSP CMKQMLAYE DCVLDANVPQ QEVIHPQWPT IWPRLLTDGK LLEFDKVPFH PENIYNYTYM RPLTKKNKQY LYECEEERFV F KACLRKVI SLKKTDKHTS WDTAEVANLQ LT

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分子 #12: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 57.814465 KDa
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MLSKVTRRFL NYNQIYCFAS QHGAEHHKLT ASDEAYLNEV RQRYVTPDME KWAYLDYKKH PSTTLSHYDH KSKDYVESER DDYNADVAT NSHNKLIDDF KRNLQMQRKV HDILQKMDRP YLRGVPGVTK NISAGLQDYS APVSKKSQSD PNDFYRDAYR N ENRWIDQS VFTPKTSKMT HYDVEWPKEL ASRPVTKKFH HDKGYKYDVT TPYDQRYNYV ADRLGHPEIL GNPFERLMRL EG DIYHPNY LDQPFVKVPN ANPNASLNFE EGEVLYENTR LLEWAKFWNY SVVVGYLWCA YFVPYNIFFK THMPLEHAYD NLF FPYFQH THFLWDNNAL HIPTVGGVAI YATYIALSYI NNIWKDYVVR AQFSKDKELL FVTRVSPFGT TEEEVYEVAH LEHL PPSVR SGVKDLSAQD ADGLVDVTCM SSQRSLVFYK GDQYWNPKVY NDFINQTSNL WTRNYTGYNR LEVQNSVEQV KIGFS HSSQ PKLEKK

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分子 #13: Ymf67

分子名称: Ymf67 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 54.538531 KDa
配列文字列: MTALFLHILW SISYIIINIL YIFLSLLLSN NNEKIKQYNS NYFIKILLVL FYNKNLSFYK NLLSEDEISK IEFERLKNYP TLVLIHSNL NKLEKRNKII NSFINFKTKY RFYKFISTNF NLQTIIKNCN DKIIFSTLLY IVNLNYSFFY KTIKNTDLIV Y LLANKFSI ...文字列:
MTALFLHILW SISYIIINIL YIFLSLLLSN NNEKIKQYNS NYFIKILLVL FYNKNLSFYK NLLSEDEISK IEFERLKNYP TLVLIHSNL NKLEKRNKII NSFINFKTKY RFYKFISTNF NLQTIIKNCN DKIIFSTLLY IVNLNYSFFY KTIKNTDLIV Y LLANKFSI LNDNIIVSKF NISKFNDYIK YINNTNSIDT YLENQIILGL NNNTNSNITK NINTKLLNSY SNLKNLVNIT NN TFYLKKI NDNYNTVINS EFLTYLKSNY KISFSASNIV KYLSDKSVNN SVILYLRKNK IFNKSRYSRN RQTYRTGAYW CLY VNIIAV VAFYFWFYKF TMNFGYLWWL LYSLILSFFF SRALKHRFYN PLNVMTEFKN GFMWFIIILI NIFKPLLKLL ENNY INLYN HLVIKYYQSF ICNTLINKKK LEFNYILSSF KFIKELNNII IISLNKLF

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分子 #14: Protein phosphatase 2C, putative

分子名称: Protein phosphatase 2C, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 53.011297 KDa
配列文字列: MFRRIISNGA LLSTQTQRWQ DLSKFACLRA SLNKESEKAF QELAKKNNVS PQELVELSKI VSMNLDVLKQ NINSEQFLLE KESTLKRYR QSSIGTRGHL QTVNEAVNTK YPTLAEGLGQ VAGYKEAYQA LREIFVHPSI SVNNLRQGSY GQQFAVDFRT R ADEYVKAL ...文字列:
MFRRIISNGA LLSTQTQRWQ DLSKFACLRA SLNKESEKAF QELAKKNNVS PQELVELSKI VSMNLDVLKQ NINSEQFLLE KESTLKRYR QSSIGTRGHL QTVNEAVNTK YPTLAEGLGQ VAGYKEAYQA LREIFVHPSI SVNNLRQGSY GQQFAVDFRT R ADEYVKAL LKDHSSNPQA VQTIQEIQHT LHQIIKNYEQ NPASIYARIL TVLQTRGVNT LPVSKTADQK AVATIQKTST PS LTIDQLT VPVQERVQTQ TVFDAELAFI KEANEMIQQN TGNLPWDGGK KKIFQGQANK YLETPYYLLA ALSGLGLLYF LYS GDAKYK TLVLTPVVGI AAFVLLRRNQ ILNRVPTLTE LFLHKDGKFV DAVVSVNGQL ISKNDIPVST LKLYRGDHTV KVNL NDFED ASAKKFLAQQ SGQEGVINVH FSKLRNLAAR NGQVLNLGDT EVVVPFENQA NRIILKQIFK GVEVLPSS

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分子 #15: SURF1-like protein

分子名称: SURF1-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 47.087973 KDa
配列文字列: MYEGRWKMVN QIKQDVQNDI ELILRQMNER IHAMKKKKYN ELKGKIKQKC IDLLIDYAKQ KIGKKNKIKK EGNNIRHNKQ KKLKNIQKK IFKIISTRML QTTLSAFRPR GSNVTGKVAL ATLGALTGYG AFYHYNQYLN LSARWQQIQE NIAKDQPFDV D GFDAKVYP ...文字列:
MYEGRWKMVN QIKQDVQNDI ELILRQMNER IHAMKKKKYN ELKGKIKQKC IDLLIDYAKQ KIGKKNKIKK EGNNIRHNKQ KKLKNIQKK IFKIISTRML QTTLSAFRPR GSNVTGKVAL ATLGALTGYG AFYHYNQYLN LSARWQQIQE NIAKDQPFDV D GFDAKVYP WVRENNVNDW EYKLVKMRGY FKDQRFFVRR KRDGKEGFLV FAPFVTAVER VNHRLKQKDL LPVEYSVFVN LG WVPVENK KDVELGGEVC PPMDAPTDST LFVNDTFTGF NPDPANPEDT EQVTLTEITG IVRRGEQQDI LARRRNWNKE GIY NWVDLD YMGKIFRLFN LDAINTAYIE RVVPSFEEGE EGLYPIPATK DTFERPLNTP ERHSTFFNFY AATSALSFIS MLLL RR

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分子 #16: TraB family protein

分子名称: TraB family protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 45.064949 KDa
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(AME)ISARAVHRF LRNPNLETGA AFRAGTRFDP FKNTLTVLKD PQNGRTLYLI GTTNSSTLLA NRTKDLVQKE KPDAVF VQT NKEWWNLAKN IQDVKCQQEL NRYNDLLSQA YTLSLDNTIR NLVFKAKFYS WLFVINWFKA FPDDFHPFIP GLEMKFA IE EANKQNIPVV LGGLEVDDVT LSALKVEPRL DPFSQLYYGY RALHNSFWRR EHFDNYATLD VVGGEAYAES MDRFRTNW F VKYFEKLAPY QKKIIVDQKD LDLFYALYRD TPGKKIVAVV NQWHVPGIEN HWKSATNTHE PLKAINPIGD MDINKYMES QLVNDTLRAF VSKVGKTEPA TWKNYSTIYH KDNYEAERVR HVAFVDHKDP HMYHGLPQDY DDNIKPKHH

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分子 #17: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 41.307387 KDa
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MRYLKIEKEK LVSCKKQEQE VQRIRRRKGN QKLNSIAKQQ RVKRRDYQQN IKQNKEVKNP KKLIKQQIIN KVKKRKKMFR GLTKFNKVF ALNSFKNSLV AVPKANLNHV QNMLEENLKY DAQKYNDEVA VIQKTSRIYK PTYTIEFNRE GEVLVYSADP I KNSVVYFK YPYVLYEAAI PLFIWAWIYN PLELSKNAVN SLLIYPNIAW IPRMWYWRSL QYKIQKMYLL RGGKVAKIET QS LAGDRFT SWVETYQFHP LTQDQKNFDN QDNAEFLEDE GQLKYELGVQ LDNLQEMGTT SQDIVINFMK EGTVHHPELF EAI VKGYNI DTSDYVINTA NNLRAREGNH NH

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分子 #18: Oxoglutarate/malate translocator protein, putative

分子名称: Oxoglutarate/malate translocator protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 40.43427 KDa
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(AME)FFELEDIKR RHSLYWDIYN VQGWVRRPDS TLYNNVKRGV TAGVVASLVQ ENITALVENC KLLATKYEKP QNLRQA ATF MKEVFKLENY RKAVWNRSQY ALCIGTFDIG ARLATFRWLN NGWQRVFAGF EFNFVRKIPT TMLAALFTAP FSVPFEL AR MAYYGDKTFP KELQRGYSSY LSALARIPFE EGPYFLFKNS FPLIIRNFFQ TFTLFYTYDF LKDKASFAWR VGEQNEYA C KMIIAGISTY LAAVFSYPWM VTREMVDFWP KVPGAPCTFN GNYRKAAVWI WYHEFSGNYF AGFFTKYFWK ASPGMFLTL MLADKVGLFD QTTVDNFGGA GNNSWEDTFV

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分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 37.55298 KDa
配列文字列: MFLNRLVKET SKAKRLFSMA QNNFARAGPY NPNRYKDYYI PRTLPKNEEI VEFVQSQHSV PASPIRNQRH INPVRESGPL PSYDGTYTM EDIRAVFYNT TVGRDYCYCQ MDPEEIMRRV PGITRKEAEF ITKLGLSPQE QVDFAYIAYN IGLDIFYFTN Q MFVARQVV ...文字列:
MFLNRLVKET SKAKRLFSMA QNNFARAGPY NPNRYKDYYI PRTLPKNEEI VEFVQSQHSV PASPIRNQRH INPVRESGPL PSYDGTYTM EDIRAVFYNT TVGRDYCYCQ MDPEEIMRRV PGITRKEAEF ITKLGLSPQE QVDFAYIAYN IGLDIFYFTN Q MFVARQVV TNSKGEKVEV LWNAQCYEDI AQLNVGFAPV LESVDYHWEI FLWADPPIKP NNDFDLNVPC TWFEYEQEWW ME SCIQEDQ FNLPEDERPY NTPRNPHCRK ELWRSQDALQ EEELMVNENW YPKNTQYNIY NQPDFIKPKS GSGAAADDIR I

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分子 #20: Carrier protein

分子名称: Carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 37.095141 KDa
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MANFVIPYLK PVADFWNSLC IDQHQDSLFQ FKGQTGSLGT DWTSKYLRSE QDVYNHKYLQ YHKRVHEAPE LTDVISDNVY RLTLFAGVE RVLSVRQAQA ILKTQFAGAT ENISGAFQTV LNGGIFRRGY FRGALLNLLQ FCGAPYQSLI WSRNSGITNQ V IVSSIFEA FFYPLDTVKT LIYNDVQGKY KGAFHCASQV VQNAGWSRLY AGIFQKLIFN SALIFHLNQV WDGSSQQWAS LA LVAAAYP LLVLKTRFQV AGTPLALATS NEVLKVNRKT LYAGLVPYLI FNTLFAYEFA AWHSSTAQER VIGGLQNAMK QFS SPAAEQ VWSS

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分子 #21: 2-oxoglutarate/malate carrier protein

分子名称: 2-oxoglutarate/malate carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 36.132316 KDa
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(AME)NYSYKRYWE PSTAEVIGLS LSVNTISAAL TYPIEFVKVR SQIRTEGVGI RSKNLYMGIN PNKVFREIHA TGNGLR GFY QGFESHLIGR LSYLFIRNLT YKIIYDRTKP VKAHNDLSHR EKGVIAGFAG GLAAFLTSPA DLVNTRTIAE GGKPKEW RW GYKGLMDGIN KIAATEGGNA ALFRGSYANV LRAVILNISL TGPFDYLNEK IWITFGDMTW NKYAALLWAS FWGSVATL P FDNIRTRLYA QNADPTKNRL TYSGWADAAK KLIQHEGISG FYVGFYAFYI RTFLYAWTTV FITDKITSDW KRKAGLKEW QI

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分子 #22: SURF1-like protein

分子名称: SURF1-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 35.794367 KDa
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MLQQVFGKSK GGEVTNSHLT PKVLNKAQEA EKLASQIQAQ RFSNRLVAFS SQYPRAKLFF AGIGIGTLLY GANQSSKARE NKVATETRK ERMAKPTIQL TGADSQNPPF TEKNINDWLY KTVSITGRPI HGKGMMIPAK SYGLHGFEYL VPFVTKENED G SVQEGLIL NLGFIPREYA PIWARARVEN VEEQTFTCVV TDGKHLSEQG GLFASNKPCE NQWEYADLDQ LAKHTGFVNQ EQ VRSCILE HVNTETPNDE RDCRHIDICS DYKEDYPYKF TRSGVLQQPG QMYWDLNKSA SYYSLLGLGC SVFSALLFLA K

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分子 #23: COXTT9

分子名称: COXTT9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 29.865686 KDa
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MVYHLFERIC NPDNFKLSGE AARVRTLIAA GFSKEEAEQV AWLQNHQVNG KILGLFTGGF ALYCCNNYFH YFERYFPRLR YQPFTKFLA QAATVYFFFK IGDYYFTSRR YGSNDARMNG LMYSNTYYST NKEALIQNFE PLNRKFTEEE VEQFLRNEGR S QEEKRNWI YNPHIHGSTE GEWKADIHEK FDSGKAPWER EHVKAKILET NKAKIDAGEE IQLKPFKTLN HLDKTGLLHR LH PFIWTNN WTLLG

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分子 #24: COXTT10

分子名称: COXTT10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 28.101486 KDa
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MSSFIQYEFL KIYQGNQKIK NYYKRKRLIF QQKKVLKKKQ KEIQMSTNNL RLKPWFHWTD EERSHAIFSA YEKRILKSED LPSFLRANR INNVSTWVFP LIALPLFNQS IFKLGFAQRI LLTRPAIEWH CFKIATVAAS WLAWLNFSPF YRKLENEKEY L LDTLESRI GINVLDLNDA LPRWTTSQEY NRRTQQLYNQ RNGFFAGLLY PQEESSRPLV DIASFPKNLH KEKLTK

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分子 #25: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 27.034711 KDa
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分子 #26: COXTT12,Transmembrane protein,Transmembrane protein

分子名称: COXTT12,Transmembrane protein,Transmembrane protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 25.953754 KDa
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MYVLFVCLID SMNVEEGKQI KEMILPHNNR QLARQYFDSL PENDINRKYY EGLKYETPKT FFGRFLNQFN IDAKLDTLSK FYTYQKTIR ATQAELQEDR KSYLTNSLLF TAVSWFSIYQ FARKGAVLPV LREYGRYFGT HRLFRQYLHT LVLPLLYTEY A LNQKYYTH MEHLWTVHVN RLNQKILEDP LYTFYPQELN VPKHNIIVPT IFRDTPQ

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分子 #27: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 24.701131 KDa
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MKKGTASEEE LKKLYDPNTF YEHGDNPAFK QFMNIAVENL REGKLTDHRT YVVDTYKKWM YARNWDDFLQ RDCKAITFPR AFALWIVGT LGMATASKWC RQILPVGSHG ITKISQTQFF HQFGPLGTLG AVGFYGLTAY LYYKTTIFTV KKFYSHCILQ E REWIFEQE RQNPGYGEYF FKDVPLSAEE HFNDLARGEM AKKKFEKPNH EF

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分子 #28: COXTT27

分子名称: COXTT27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 23.368416 KDa
配列文字列: MSALLKEILA LTVKSEAALW KGAEQKVLSG LNNLAKTELV QITHHFGVNK QGSEALWSQL DKAAVGAFPE LSVDETLQLI DGFGECPDS YTLSHDLNQR LLVSWEQLGK LNFQKLKETN PYFASDIVNQ LDAAAAEFIK VRPAAESEAG GFLNSLGVSS S FNTTKNDI ...文字列:
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分子 #29: Ymf75

分子名称: Ymf75 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 23.325801 KDa
配列文字列: MFLGIFKDVI KLLNKKVVPV YFWFFLYCFL STMDTNIFVS SCSFLKVEVF GKDENTTLVL LFYVFYSLFN FYLSRIKNKN NYLVRKHLY TTELLIELIL FKYKLIILKF SSIKYILNFN VRKFILFNLF LINNYKAYKI NTFFLYIYIY LNNLNIIWYP I FKAYSIFG ...文字列:
MFLGIFKDVI KLLNKKVVPV YFWFFLYCFL STMDTNIFVS SCSFLKVEVF GKDENTTLVL LFYVFYSLFN FYLSRIKNKN NYLVRKHLY TTELLIELIL FKYKLIILKF SSIKYILNFN VRKFILFNLF LINNYKAYKI NTFFLYIYIY LNNLNIIWYP I FKAYSIFG YYKSTRLNFI DTKNENIKRI KY

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分子 #30: Mobilization protein

分子名称: Mobilization protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 23.25766 KDa
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MKEKIFNELT RKMKRKEISA KIQREENKQI LIRQRNNKKY IQSIQGIQQE RKKGKLYLVE MATQNVEEMD TIQKMNYEAT VNMGRQDLI TREYTFYSDY EFIPIQEDRK QQMEDALNNL HKIIHPTVTQ LKKKANVQEI QDRVFRKLQG WEGELNTCVF S AKNVRDSN FCADRFTNRI NTEGVEFVKQ ILREY

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分子 #31: Iron-binding zinc finger CDGSH type protein

分子名称: Iron-binding zinc finger CDGSH type protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 21.476887 KDa
配列文字列:
MSAILKRAAK YKRVSSILCE GEAHLRDPFT PPPVILKPPA PRKDKKPDDI TDFPAQKLIP LPESIPYQEG KYRPASIPMV AGFFPYNCY LQQGKVYSWC SCGISQSGPW CDGLCNSVVT RCRPVVFNVS QSGYYKICNC KFSANAPFCN NTHRKMVRYH H QTHRGFYE IWGAALFVLG WVYMGFNYYT

+
分子 #32: COXTT28

分子名称: COXTT28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 11.121555 KDa
配列文字列:
MAARDFEYNN QDVNQLNGAF ISLVEDEKIG FWVGVGGFAY SQFIMRKFVK STNIFASVTS LFAGAALANL YTHQSRASYA RVAARANRN ASLALNKLME Y

+
分子 #33: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 20.388264 KDa
配列文字列:
(AME)DNNYHFWGN GDRQDVSLSY EDYYSILDCL LDEKLSPQGL MKFKNLHEVS MYGVSYVPLY CFPVAYGISH MLTGKV RRG HSGYRNLFSL MSVVLPFTCW YAYTTPIPRR LYTEIICSNN ADGAYVRNRI KQQKPGIWRK LSQQLYNKNF RFPELNQ DL TATEFPLDYV APHKF

+
分子 #34: Transmembrane protein

分子名称: Transmembrane protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 20.025109 KDa
配列文字列:
MVFEFLFYNQ QHKTRNGYFI NHDNLMLASL EERKKLIFYF IANQVPEKLD PVDRVKFNEE LSDNLSTKAR LIGSLTGLIG LVGFPYIST RIYSRPVLNI GLSLLICPFL YYVGNQLTYS VWEPKFIANN NTVCELSKKY NFTVFDFAQA KKEAHLKALR T ELVSDNLL YSPGI

+
分子 #35: Decapping nuclease

分子名称: Decapping nuclease / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 10.242719 KDa
配列文字列:
(AME)EVKYRGPSD DKLECEFLEN NLLSCLREKS VQDNVAKMTC RPEFLVWFFL ECPTKAAVYH DPKGLRNIFI QDKIKQ KGS DDGVLSKDD

+
分子 #36: Complex III subunit VII

分子名称: Complex III subunit VII / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 19.882758 KDa
配列文字列:
MAIRNFVFKI SNQIQNLAAK RSLAYLNQID SQSVPSRATI NMKDQVTQMQ REIDNMANVI RAQIPDEDRA EFEILKKYYV TGQHDSLVD PQDVLLQLDR IQVLKNLKMI ELNEEAYDPE LVRLEKLKAR VLLEEEGALL EYAHFISKRP YNKPYEKWGV S EEHVKQQI LG

+
分子 #37: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 18.801604 KDa
配列文字列:
MGFETVVPAP PTRDDELRMI KATEEQFLQQ PRYKLYMNEA HRIAKMNHGD RHNNIRAHFW SNFALGLLIT GPIFIIPFGK AFRNLRSGV PYYFRPKYVF TQKNQYNQDR NWGAMKKQIP LWLGLSTAYA YWFTDFSIND DEWLEKGKVI YPHQTIKVL

+
分子 #38: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 18.600445 KDa
配列文字列:
MSCTTRRFID EKEKLEYSRG YNQQELEASK LRKDFVKKYI VDFDTTLYKT QVERDWAYIA KREYRYEVQL KSIGYGGALA NAVLLWRIY ANKKMVFWPI PIVGALGYLY FQPVFFQKSN KRFFDMCNVG EEYYLGRERN KILRECNKIL NVEDF

+
分子 #39: COXTT22

分子名称: COXTT22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 17.701115 KDa
配列文字列:
MGKDQLDFSH FDKAFENKYD IVAPEFGDLH QKRAEFIAKN QGTYRPVPLV PNNIKGLIPK TCRLPATRNW YRRTSSFERN GFFNIHTPV LNTKMIPWLL FIVLTWGWSS FQIGGYNYER FDDNGERRNT LYWKLSPVEF PQSKLWNRPS

+
分子 #40: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 15.588598 KDa
配列文字列:
MVFHYTNFVQ ETNAWWLRRV RPVYCTVLAY YGWWLYDRYY LFGKNATQDI RKDTTEVWEK RAALNKRNWG YNAHYKPELE RSMKKVLYA DPNYKFPIEW PERYMAETKT LEQVMDEEEN WEYYK

+
分子 #41: Phage protein

分子名称: Phage protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 14.740897 KDa
配列文字列:
MMQNLKKFMS KTIQVQPVSF NQIPKAFYNF PEYRTGGVQA NPGITAKRII KCIGERLRKY DPARWENVPI TFKTHFRDEN GYSDVATSI QIHDALEREF GIDIKDRLAL VTDVETAFYI VMSHHDPL

+
分子 #42: Transmembrane protein, putative

分子名称: Transmembrane protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 14.344524 KDa
配列文字列:
(AME)EPFGTDERN WTHEEKDIIT RFLKYDKHVN LKTAEMVYSA EVESAYFGKA GALAGGVISA LFFNFPIVRN LPIIRR SVI GVLPFLYCYT WGKNTQEELR WLKTFAAYQR FVVYHGQHCK LWV

+
分子 #43: Lysozyme

分子名称: Lysozyme / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 12.273913 KDa
配列文字列:
MAQTAHQNRY QGGLCYAQCN ELFSFWNPSI QQCWKGCDFG VGRVNDPEGR IEAQQMCKRW AAELYWTYKG ELDTIKDLRV HADMYPTTP QNVYRACLAG VRRQKF

+
分子 #44: Ymf70

分子名称: Ymf70 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 10.89192 KDa
配列文字列:
MFRWLFLYWY NSTDTPSAIA KVNLWSYINL RLFKARLSSS IAYYILGLNN LELKKLKIFY KNTYFDYIYL KSIPCLFLII FFTNLYLFL

+
分子 #45: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein

分子名称: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 10.435701 KDa
配列文字列:
MSTRKIFDSE EQSFIRLVDK FYLGLSLTKL CAQSCNLLRN DISGSALTQK EKDCLSICYN NIEKTQSAFY AKVKTTMNLP AVEDDGEEG GDDE

+
分子 #46: ABC transporter

分子名称: ABC transporter / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 10.418697 KDa
配列文字列:
MSSDPFKKVE RDYHNERSVH KHFASYPLKF WWGLNKFETI QGIHSILGNA ADLVVSTLSF IPGVQGRNNA SYIENSIRVT RFRGFDDKT Q

+
分子 #47: YflT domain-containing protein

分子名称: YflT domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 19.97932 KDa
配列文字列:
MNNTFKFLHQ VISKLTLKAQ VPNYGQYSHS LKRPINPKVV VFGNSSRAYE LISSQFRNFN HVNGLELKGQ EDNIQANKVA QSVLSINDG FQDGYYITDF PQNSKQAERL DLITDGVNLA LYIKDPSDKV TVTRQQEAID YYRKTGALVE FEVDPRGDLE E QVKQLSNQ VLNGYKH

+
分子 #48: Cullin domain-containing protein

分子名称: Cullin domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 8.965917 KDa
配列文字列:
MEDNYAADVQ RQFNRTAFDS LYKICYNSLV QKNGSTIDFQ KQIDCHQRLI QVFAKIAPIV VKVEQDAASS GGAAAGGEDE E

+
分子 #49: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein

分子名称: Zf-Tim10_DDP domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 8.354574 KDa
配列文字列:
MSDKRKIQHE GIIALINYST LCAQKCDVLK GHDDKITDTE EQCLRVCAEK IRQTFEFTND IYLKNPNLTK PN

+
分子 #50: Annexin

分子名称: Annexin / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 8.15536 KDa
配列文字列:
MDPVLGDVIA TRIYKACFKH VYGKNMKAYS EKDEAKFDQC LTSYVESYKS VTNHFITYLG QLPKKGLSLD GS

+
分子 #51: Transposase

分子名称: Transposase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 8.081111 KDa
配列文字列:
MEQNTTQVFS DLAYKVCFKV INDKNKPFVL HDEQRLANCL TRYVEAFNVT SEYFFRERAG ETKVTEKQ

+
分子 #52: Tim10/DDP family zinc finger protein

分子名称: Tim10/DDP family zinc finger protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 8.00899 KDa
配列文字列:
MDTEVSNHNY TQAVAYLNRA TSSCVKKCDS LNNNGSLSSK QESCLKTCAE NHAIATKIHA EYIRKLAESK YL

+
分子 #53: COXBP,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chrom...

分子名称: COXBP,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein,Chromosome condensation regulator RCC1 repeat protein
タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Tetrahymena thermophila SB210 (真核生物)
分子量理論値: 58.69782 KDa
配列文字列: MYLFMHLCMC FCMISSSQKK EKLNKGKNKQ IKLNKKKEKQ NKKIEIIKKE KERRSNPQMI SKTQAFARLF QLSSKSFSTV KGGNLYTWG QYASGTGFET ASAVPRKVDY FSGNVSKVAM GPYHTAVITN DGSLYTFGWG QNGALGNGAK EFQLSPSGNL Y TWGQYASG ...文字列:
MYLFMHLCMC FCMISSSQKK EKLNKGKNKQ IKLNKKKEKQ NKKIEIIKKE KERRSNPQMI SKTQAFARLF QLSSKSFSTV KGGNLYTWG QYASGTGFET ASAVPRKVDY FSGNVSKVAM GPYHTAVITN DGSLYTFGWG QNGALGNGAK EFQLSPSGNL Y TWGQYASG TGFETASAVP RKVDYFSGNV SKVAMGPYHT AVITNDGSLY TFGWGQNGAL GNGAKEFQLS PSPVSFFNDK KL KVKDVVV GESYTIAVTE NGEVYSWGYG GEPSSKINLD FFRNAILPQR CGALGSGDNK NRLTPQQIAN LKADGYKNIS GGD NFATLV NQSGEVINWG TGLFGSLGNG SDYPLFTPEV NAYFKHLKEH EGLTVQSIKS AGHFSAALLS NGKLYTFGVN TQGQ LGIRE NLGHNTDQNA RLPTPVVDRH FVGQKVVDFE VGENTLVFLT DKNEVFFSGL ELAYQPIRWE IPTDKKIVKL AASKD TFAA VTETGKIYQF NEFVGVSTNE VGNDYNVADS KAFEGKVVDL GGSYGIRFAI VN

+
分子 #54: HEME-A

分子名称: HEME-A / タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 4 / 式: HEA
分子量理論値: 852.837 Da
Chemical component information

ChemComp-HEA:
HEME-A / Heme A

+
分子 #55: COPPER (II) ION

分子名称: COPPER (II) ION / タイプ: ligand / ID: 55 / コピー数: 2 / 式: CU
分子量理論値: 63.546 Da
Chemical component information

ChemComp-CU:
COPPER (II) ION / 銅

+
分子 #56: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 56 / コピー数: 2 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #57: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 57 / コピー数: 118 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM / Cardiolipin

+
分子 #58: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 54 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM / ホスファチジルコリン

+
分子 #59: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine

分子名称: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 34 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da
Chemical component information

ChemComp-3PE:
1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / DSPE / リン脂質*YM / ホスファチジルエタノールアミン

+
分子 #60: 2-(HEXADECANOYLOXY)-1-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]ETHYL HEXADECANOATE

分子名称: 2-(HEXADECANOYLOXY)-1-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]ETHYL HEXADECANOATE
タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 8 / 式: LPP
分子量理論値: 648.891 Da
Chemical component information

ChemComp-LPP:
2-(HEXADECANOYLOXY)-1-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]ETHYL HEXADECANOATE / ジパルミトイルホスファチジン酸 / リン脂質*YM

+
分子 #61: CALCIUM ION

分子名称: CALCIUM ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 2 / 式: CA
分子量理論値: 40.078 Da

+
分子 #62: DINUCLEAR COPPER ION

分子名称: DINUCLEAR COPPER ION / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 2 / 式: CUA
分子量理論値: 127.092 Da
Chemical component information

ChemComp-CUA:
DINUCLEAR COPPER ION

+
分子 #63: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 63 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #64: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 64 / コピー数: 1 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #65: Ubiquinone-8

分子名称: Ubiquinone-8 / タイプ: ligand / ID: 65 / コピー数: 8 / 式: UQ8
分子量理論値: 727.109 Da
Chemical component information

ChemComp-UQ8:
Ubiquinone-8 / ユビキノン8

+
分子 #66: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

分子名称: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / タイプ: ligand / ID: 66 / コピー数: 2 / 式: HEM
分子量理論値: 616.487 Da
Chemical component information

ChemComp-HEM:
PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / Heme B

+
分子 #67: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 67 / コピー数: 4 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #68: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 68 / コピー数: 2 / 式: ATP
分子量理論値: 507.181 Da
Chemical component information

ChemComp-ATP:
ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / ATP, エネルギー貯蔵分子*YM / アデノシン三リン酸

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.6 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.6 µm
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)
平均電子線量: 25.66 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 138746
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る