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基本情報
登録情報 | ![]() | ||||||||||||
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タイトル | Structure of a first level Sierpinski triangle formed by a citrate synthase | ||||||||||||
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![]() | Fractal complex / TRANSFERASE | ||||||||||||
機能・相同性 | ![]() citrate (Si)-synthase activity / tricarboxylic acid cycle / carbohydrate metabolic process / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() | ||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.93 Å | ||||||||||||
![]() | Lo YK / Bohn S / Sendker FL / Schuller JM / Hochberg G | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Evolution of a protein Sierpinski fractal 著者: Sendker LF / Lo YK / Heimerl T / Bohn S / Pfister P / Mais N / Sadowska W / Peterson L / Benesch JLP / Marklund E / Bange G / Erb TJ / Schuller JM / Hochberg GKA | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 154.3 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 13.8 KB 13.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 12.1 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 195.3 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.3 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 151.6 MB 151.6 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 861.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 861.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 20.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 26.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 8an1MC ![]() 8beiC M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.09 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_15529_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_15529_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : 18-meric fractal complex of citrate synthase from Synechococcus e...
全体 | 名称: 18-meric fractal complex of citrate synthase from Synechococcus elongatus PCC 7942 |
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要素 |
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-超分子 #1: 18-meric fractal complex of citrate synthase from Synechococcus e...
超分子 | 名称: 18-meric fractal complex of citrate synthase from Synechococcus elongatus PCC 7942 タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
-分子 #1: Citrate synthase
分子 | 名称: Citrate synthase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 18 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 44.367371 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MTAVSEFRPG LEGVPATLSS ISFVDGQRGV LEYRGISIEQ LAQQSSFLET AYLLIWGHLP TQQELTEFEH EIRYHRRIKF RIRDMMKCF PDSGHPMDAL QASAAALGLF YSRRALDDPE YIRAAVVRLL AKIPTMVAAF QLIRKGNDPI QPRDELDYAA N FLYMLTER ...文字列: MTAVSEFRPG LEGVPATLSS ISFVDGQRGV LEYRGISIEQ LAQQSSFLET AYLLIWGHLP TQQELTEFEH EIRYHRRIKF RIRDMMKCF PDSGHPMDAL QASAAALGLF YSRRALDDPE YIRAAVVRLL AKIPTMVAAF QLIRKGNDPI QPRDELDYAA N FLYMLTER EPDPVAARIF DICLTLHAEH TINASTFSAM VTASTLTDPY AVVASAVGTL AGPLHGGANE EVLDMLEAIG SV ENVEPYL DHCIATKTRI MGFGHRVYKV KDPRAVILQN LAEQLFDIFG HDPYYEIAVA VEKAAAERLS HKGIYPNVDF YSG LVYRKL GIPSDLFTPV FAIARVAGWL AHWKEQLNEN RIFRPTQIYT GSHNLDYTPI ADRDLAIESD LEHHHHHH UniProtKB: Citrate synthase |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 55.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 3.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.5 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |