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万見
- EMDB-12238: Sample bin4 tomogram for the VPS34 complex II on Rab5a coupled li... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-12238
タイトルSample bin4 tomogram for the VPS34 complex II on Rab5a coupled lipid vesicles
マップデータSample tomogram before ctf correction. This is one of the tomograms used in END-12214 subtomogram average reconstruction.
試料
  • 複合体: human VPS34 complex II (VPS34-VPS15-Beclin1-UVRAG) bound to human Rab5a on lipid vesicles
    • タンパク質・ペプチド: UV radiation resistance-associated gene protein
    • タンパク質・ペプチド: Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3
    • タンパク質・ペプチド: Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: Beclin-1
    • タンパク質・ペプチド: Ras-related protein Rab-5A
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法電子線トモグラフィー法 / クライオ電子顕微鏡法
データ登録者Tremel S / Ohashi Y / Morado DR / Bertram J / Perisic O / Brandt LTL / von Wrisberg M-K / Chen ZA / Maslen SL / Kovtun O ...Tremel S / Ohashi Y / Morado DR / Bertram J / Perisic O / Brandt LTL / von Wrisberg M-K / Chen ZA / Maslen SL / Kovtun O / Skehel M / Rappsilber J / Lang K / Munro S / Briggs JAG / Williams RL
資金援助 英国, ドイツ, 9件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MC_U105184308 英国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MC_U10517878 英国
Medical Research Council (MRC, United Kingdom)MC_UP_1201/16 英国
Cancer Research UKC14801/A21211 英国
European Research Council (ERC)ERC-CoG-648432 英国
German Research Foundation (DFG)Sonderforschungsbereich 1035, project number 201302640, project B10 ドイツ
German Research Foundation (DFG)392923329 ドイツ
Wellcome Trust103139 英国
Wellcome Trust203149 英国
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2021
タイトル: Structural basis for VPS34 kinase activation by Rab1 and Rab5 on membranes.
著者: Shirley Tremel / Yohei Ohashi / Dustin R Morado / Jessie Bertram / Olga Perisic / Laura T L Brandt / Marie-Kristin von Wrisberg / Zhuo A Chen / Sarah L Maslen / Oleksiy Kovtun / Mark Skehel / ...著者: Shirley Tremel / Yohei Ohashi / Dustin R Morado / Jessie Bertram / Olga Perisic / Laura T L Brandt / Marie-Kristin von Wrisberg / Zhuo A Chen / Sarah L Maslen / Oleksiy Kovtun / Mark Skehel / Juri Rappsilber / Kathrin Lang / Sean Munro / John A G Briggs / Roger L Williams /
要旨: The lipid phosphatidylinositol-3-phosphate (PI3P) is a regulator of two fundamental but distinct cellular processes, endocytosis and autophagy, so its generation needs to be under precise temporal ...The lipid phosphatidylinositol-3-phosphate (PI3P) is a regulator of two fundamental but distinct cellular processes, endocytosis and autophagy, so its generation needs to be under precise temporal and spatial control. PI3P is generated by two complexes that both contain the lipid kinase VPS34: complex II on endosomes (VPS34/VPS15/Beclin 1/UVRAG), and complex I on autophagosomes (VPS34/VPS15/Beclin 1/ATG14L). The endosomal GTPase Rab5 binds complex II, but the mechanism of VPS34 activation by Rab5 has remained elusive, and no GTPase is known to bind complex I. Here we show that Rab5a-GTP recruits endocytic complex II to membranes and activates it by binding between the VPS34 C2 and VPS15 WD40 domains. Electron cryotomography of complex II on Rab5a-decorated vesicles shows that the VPS34 kinase domain is released from inhibition by VPS15 and hovers over the lipid bilayer, poised for catalysis. We also show that the GTPase Rab1a, which is known to be involved in autophagy, recruits and activates the autophagy-specific complex I, but not complex II. Both Rabs bind to the same VPS34 interface but in a manner unique for each. These findings reveal how VPS34 complexes are activated on membranes by specific Rab GTPases and how they are recruited to unique cellular locations.
履歴
登録2021年1月24日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年6月16日-
マップ公開2021年6月16日-
更新2021年6月16日-
現状2021年6月16日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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添付画像

emd_12238.png

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_12238.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 1.4 GB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Sample tomogram before ctf correction. This is one of the tomograms used in END-12214 subtomogram average reconstruction.
ボクセルのサイズX=Y=Z: 8.532 Å
密度
最小 - 最大-9405.448 - 8169.91
平均 (標準偏差)63.60837 (±538.5632)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin0-20942
サイズ14401023250
Spacing10231440250
セルA: 8728.235 Å / B: 12286.079 Å / C: 2133.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z8.53199902248298.53199930555568.532
M x/y/z10231440250
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z8728.23512286.0792133.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ696888
NX/NY/NZ828048
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS-209042
NC/NR/NS10231440250
D min/max/mean-9405.4488169.91063.608

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : human VPS34 complex II (VPS34-VPS15-Beclin1-UVRAG) bound to human...

全体名称: human VPS34 complex II (VPS34-VPS15-Beclin1-UVRAG) bound to human Rab5a on lipid vesicles
要素
  • 複合体: human VPS34 complex II (VPS34-VPS15-Beclin1-UVRAG) bound to human Rab5a on lipid vesicles
    • タンパク質・ペプチド: UV radiation resistance-associated gene protein
    • タンパク質・ペプチド: Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3
    • タンパク質・ペプチド: Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: Beclin-1
    • タンパク質・ペプチド: Ras-related protein Rab-5A

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超分子 #1: human VPS34 complex II (VPS34-VPS15-Beclin1-UVRAG) bound to human...

超分子名称: human VPS34 complex II (VPS34-VPS15-Beclin1-UVRAG) bound to human Rab5a on lipid vesicles
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
詳細: The subunits were expressed using transient transfection in HEK293T cells. Cells were transfected with three plasmids: pYO1025 (encoding VPS34 and VPS15 in a pCAG backbone), pYO1124 (encoding ...詳細: The subunits were expressed using transient transfection in HEK293T cells. Cells were transfected with three plasmids: pYO1025 (encoding VPS34 and VPS15 in a pCAG backbone), pYO1124 (encoding UVGRAG 1-464 fused to the BATS of ATG14, residues 413-492 in pVAG) and pYO1006 (Beclin1 in pCAG)
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 392.16 KDa

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分子 #1: UV radiation resistance-associated gene protein

分子名称: UV radiation resistance-associated gene protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 詳細: Human UVRAG / 光学異性体: LEVO / EC番号: phosphatidylinositol 3-kinase
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSASASVGGP VPQPPPGPAA ALPPGSAARA LHVELPSQQR RLRHLRNIAA RNIVNRNGHQ LLDTYFTLHL CSTEKIYKEF YRSEVIKNS LNPTWRSLDF GIMPDRLDTS VSCFVVKIWG GKENIYQLLI EWKVCLDGLK YLGQQIHARN QNEIIFGLND G YYGAPFEH ...文字列:
MSASASVGGP VPQPPPGPAA ALPPGSAARA LHVELPSQQR RLRHLRNIAA RNIVNRNGHQ LLDTYFTLHL CSTEKIYKEF YRSEVIKNS LNPTWRSLDF GIMPDRLDTS VSCFVVKIWG GKENIYQLLI EWKVCLDGLK YLGQQIHARN QNEIIFGLND G YYGAPFEH KGYSNAQKTI LLQVDQNCVR NSYDVFSLLR LHRAQCAIKQ TQVTVQKIGK EIEEKLRLTS TSNELKKKSE CL QLKILVL QNELERQKKA LGREVALLHK QQIALQDKGS AFSAEHLKLQ LQKESLNELR KECTAKRELF LKTNAQLTIR CRQ LLSELS YIYPIDLNEH KDYFVCGVKL PNSEDFQAKD DGSIAVALGY TAHLVSMISF FLQVPLRYPI IHKGSRSTIK DNIN DKLTE KEREFPLYPK GGEKLQFDYG VYLLNKNIAQ LRYQHGLGTP DLRQTLPNLK NFMEHGLMVR CDRHHTSSAI PVPKR QSSI FGGADVGFSG GIPSPDKGHR KRASSENERL QYKTPPPSYN SALAQPVTTV PSMGETERKI TSLSSSLDTS LDFSKE NKK KGEDLVGSLN GGHANVHPSQ EQGEALSGHR ATVNGTLLPS EQAGSASVQL PGEFHPVSEA ELCCTVEQAE EIIGLEA TG FASGDQLEAF NCIPVDSAVA VECDEQVLGE FEEFSRRIYA LNENVSSFRR PRRSSDK

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分子 #2: Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3

分子名称: Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / 詳細: human vps34 / 光学異性体: LEVO / EC番号: phosphatidylinositol 3-kinase
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MGEAEKFHYI YSCDLDINVQ LKIGSLEGKR EQKSYKAVLE DPMLKFSGLY QETCSDLYVT CQVFAEGKPL ALPVRTSYKA FSTRWNWNE WLKLPVKYPD LPRNAQVALT IWDVYGPGKA VPVGGTTVSL FGKYGMFRQG MHDLKVWPNV EADGSEPTKT P GRTSSTLS ...文字列:
MGEAEKFHYI YSCDLDINVQ LKIGSLEGKR EQKSYKAVLE DPMLKFSGLY QETCSDLYVT CQVFAEGKPL ALPVRTSYKA FSTRWNWNE WLKLPVKYPD LPRNAQVALT IWDVYGPGKA VPVGGTTVSL FGKYGMFRQG MHDLKVWPNV EADGSEPTKT P GRTSSTLS EDQMSRLAKL TKAHRQGHMV KVDWLDRLTF REIEMINESE KRSSNFMYLM VEFRCVKCDD KEYGIVYYEK DG DESSPIL TSFELVKVPD PQMSMENLVE SKHHKLARSL RSGPSDHDLK PNAATRDQLN IIVSYPPTKQ LTYEEQDLVW KFR YYLTNQ EKALTKFLKC VNWDLPQEAK QALELLGKWK PMDVEDSLEL LSSHYTNPTV RRYAVARLRQ ADDEDLLMYL LQLV QALKY ENFDDIKNGL EPTKKDSQSS VSENVSNSGI NSAEIDSSQI ITSPLPSVSS PPPASKTKEV PDGENLEQDL CTFLI SRAC KNSTLANYLY WYVIVECEDQ DTQQRDPKTH EMYLNVMRRF SQALLKGDKS VRVMRSLLAA QQTFVDRLVH LMKAVQ RES GNRKKKNERL QALLGDNEKM NLSDVELIPL PLEPQVKIRG IIPETATLFK SALMPAQLFF KTEDGGKYPV IFKHGDD LR QDQLILQIIS LMDKLLRKEN LDLKLTPYKV LATSTKHGFM QFIQSVPVAE VLDTEGSIQN FFRKYAPSEN GPNGISAE V MDTYVKSCAG YCVITYILGV GDRHLDNLLL TKTGKLFHID FGYILGRDPK PLPPPMKLNK EMVEGMGGTQ SEQYQEFRK QCYTAFLHLR RYSNLILNLF SLMVDANIPD IALEPDKTVK KVQDKFRLDL SDEEAVHYMQ SLIDESVHAL FAAVVEQIHK FAQYWRK

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分子 #3: Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4

分子名称: Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MGNQLAGIAP SQILSVESYF SDIHDFEYDK SLGSTRFFKV ARAKHREGLV VVKVFAIQDP TLPLTSYKQE LEELKIRLNS AQNCLPFQK ASEKASEKAA MLFRQYVRDN LYDRISTRPF LNNIEKRWIA FQILTAVDQA HKSGVRHGDI KTENVMVTSW N WVLLTDFA ...文字列:
MGNQLAGIAP SQILSVESYF SDIHDFEYDK SLGSTRFFKV ARAKHREGLV VVKVFAIQDP TLPLTSYKQE LEELKIRLNS AQNCLPFQK ASEKASEKAA MLFRQYVRDN LYDRISTRPF LNNIEKRWIA FQILTAVDQA HKSGVRHGDI KTENVMVTSW N WVLLTDFA SFKPTYLPED NPADFNYFFD TSRRRTCYIA PERFVDGGMF ATELEYMRDP STPLVDLNSN QRTRGELKRA MD IFSAGCV IAELFTEGVP LFDLSQLLAY RNGHFFPEQV LNKIEDHSIR ELVTQMIHRE PDKRLEAEDY LKQQRGNAFP EIF YTFLQP YMAQFAKETF LSADERILVI RKDLGNIIHN LCGHDLPEKA EGEPKENGLV ILVSVITSCL QTLKYCDSKL AALE LILHL APRLSVEILL DRITPYLLHF SNDSVPRVRA EALRTLTKVL ALVKEVPRND INIYPEYILP GIAHLAQDDA TIVRL AYAE NIALLAETAL RFLELVQLKN LNMENDPNNE EIDEVTHPNG NYDTELQALH EMVQQKVVTL LSDPENIVKQ TLMENG ITR LCVFFGRQKA NDVLLSHMIT FLNDKNDWHL RGAFFDSIVG VAAYVGWQSS SILKPLLQQG LSDAEEFVIV KALYALT CM CQLGLLQKPH VYEFASDIAP FLCHPNLWIR YGAVGFITVV ARQISTADVY CKLMPYLDPY ITQPIIQIER KLVLLSVL K EPVSRSIFDY ALRSKDITSL FRHLHMRQKK RNGSLPDCPP PEDPAIAQLL KKLLSQGMTE EEEDKLLALK DFMMKSNKA KANIVDQSHL HDSSQKGVID LAALGITGRQ VDLVKTKQEP DDKRARKHVK QDSNVNEEWK SMFGSLDPPN MPQALPKGSD QEVIQTGKP PRSESSAGIC VPLSTSSQVP EVTTVQNKKP VIPVLSSTIL PSTYQIRITT CKTELQQLIQ QKREQCNAER I AKQMMENA EWESKPPPPG WRPKGLLVAH LHEHKSAVNR IRVSDEHSLF ATCSNDGTVK IWNSQKMEGK TTTTRSILTY SR IGGRVKT LTFCQGSHYL AIASDNGAVQ LLGIEASKLP KSPKIHPLQS RILDQKEDGC VVDMHHFNSG AQSVLAYATV NGS LVGWDL RSSSNAWTLK HDLKSGLITS FAVDIHQCWL CIGTSSGTMA CWDMRFQLPI SSHCHPSRAR IRRLSMHPLY QSWV IAAVQ GNNEVSMWDM ETGDRRFTLW ASSAPPLSEL QPSPHSVHGI YCSPADGNPI LLTAGSDMKI RFWDLAYPER SYVVA GSTS SPSVSYYRKI IEGTEVVQEI QNKQKVGPSD DTPRRGPESL PVGHHDIITD VATFQTTQGF IVTASRDGIV KVWKSR PTT ASENLYFQ

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分子 #4: Beclin-1

分子名称: Beclin-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / 詳細: Beclin1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEGSKTSNNS TMQVSFVCQR CSQPLKLDTS FKILDRVTIQ ELTAPLLTTA QAKPGETQEE ETNSGEEPFI ETPRQDGVSR RFIPPARMM STESANSFTL IGEASDGGTM ENLSRRLKVT GDLFDIMSGQ TDVDHPLCEE CTDTLLDQLD TQLNVTENEC Q NYKRCLEI ...文字列:
MEGSKTSNNS TMQVSFVCQR CSQPLKLDTS FKILDRVTIQ ELTAPLLTTA QAKPGETQEE ETNSGEEPFI ETPRQDGVSR RFIPPARMM STESANSFTL IGEASDGGTM ENLSRRLKVT GDLFDIMSGQ TDVDHPLCEE CTDTLLDQLD TQLNVTENEC Q NYKRCLEI LEQMNEDDSE QLQMELKELA LEEERLIQEL EDVEKNRKIV AENLEKVQAE AERLDQEEAQ YQREYSEFKR QQ LELDDEL KSVENQMRYA QTQLDKLKKT NVFNATFHIW HSGQFGTINN FRLGRLPSVP VEWNEINAAW GQTVLLLHAL ANK MGLKFQ RYRLVPYGNH SYLESLTDKS KELPLYCSGG LRFFWDNKFD HAMVAFLDCV QQFKEEVEKG ETRFCLPYRM DVEK GKIED TGGSGGSYSI KTQFNSEEQW TKALKFMLTN LKWGLAWVSS QFYNK

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分子 #5: Ras-related protein Rab-5A

分子名称: Ras-related protein Rab-5A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / 光学異性体: LEVO / EC番号: small monomeric GTPase
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
NKISQFKLVL LGESAVGKSS LVLRFVKGQF HEFQESTIGA AFLTQTVSLD DTTVKFEIWD TAGLERYHSL APMYYRGAQA AIVVYDITN EESFARAKNW VKELQRQASP NIVIALSGNK ADLANKRAVD FQEAQSYADD NSLLFMETSA KTSMNVNEIF M AIAKKLPK

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析電子線トモグラフィー法
試料の集合状態3D array

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試料調製

濃度6.2 mg/mL
緩衝液pH: 8
構成要素:
濃度式名称
50.0 mMHEPESHEPES
200.0 mMNaClNaCl
0.5 mMTCEPTCEP
グリッドモデル: Quantifoil / 材質: GOLD / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY ARRAY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 雰囲気: AIR / 詳細: Quorum SC7620
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 316 K / 装置: FEI VITROBOT MARK I / 詳細: blot force was 20, with a blot time of 6 s.
詳細Large unilamellar lipid vesicles containing lipid-modified Rab5A to which VPS34 complex II is bound. 50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 6 mg/ml lipid vesicles.
Cryo protectantNone
切片作成その他: NO SECTIONING
位置合わせマーカーManufacturer: BBI Solutions EM / 直径: 10 nm

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / デジタル化 - サイズ - 横: 6000 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4000 pixel / デジタル化 - サンプリング間隔: 2.133 µm / 撮影したグリッド数: 1 / 平均露光時間: 0.55 sec. / 平均電子線量: 2.99 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 5.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 2.0 µm / 倍率（公称値）: 81000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

最終 再構成アルゴリズム: SIMULTANEOUS ITERATIVE (SIRT) / ソフトウェア - 名称: IMOD (ver. 4.10) / 使用した粒子像数: 41
CTF補正ソフトウェア - 名称: NOVACTF

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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